Antigen lymfocytů 96 - Lymphocyte antigen 96

LY96
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2E56, 2E59, 2Z65, 3FXI, 3ULA, 4G8A
Identifikátory
Aliasy	LY96, ESOP-1, MD-2, MD2, ly-96, lymfocytární antigen 96
Externí ID	OMIM: 605243 MGI: 1341909 HomoloGene: 9109 Genové karty: LY96
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	74,029,079 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	16,709,611 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita coreceptoru; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita lipopolysacharidového receptoru; • vázání lipopolysacharidů; • Vazba na receptor 4 podobný Toll;
Buněčná složka	• vnitřní složka plazmatické membrány; • buněčná membrána; • extracelulární oblast; • komplex lipopolysacharidového receptoru; • endosomová membrána; • extracelulární;
Biologický proces	• signální dráha podobná mýtnému receptoru 4; • proces imunitního systému; • MyD88 závislá signální dráha receptoru podobného mýtnému; • pozitivní regulace lipopolysacharidem zprostředkované signální dráhy; • Signální dráha mýtného receptoru závislá na TRIF; • buněčná obranná odpověď; • signální dráha receptoru buněčného povrchu; • reakce na lipopolysacharid; • pozitivní regulace produkce faktoru nekrózy nádorů; • zánětlivá reakce; • buněčná odpověď na lipopolysacharid; • detekce lipopolysacharidu; • Signalizace I-kappaB kinázy / NF-kappaB; • MyD88 nezávislá signální dráha receptoru podobného mýtnému; • lipopolysacharidem zprostředkovaná signální dráha; • negativní regulace signální dráhy receptoru podobného mýtnému nezávislému na MyD88; • vrozený imunitní systém; • GO: 0060554, GO: 0060555 nekroptóza; • apoptotická signální cesta; • signální dráha podobná mýtnému receptoru;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	23643
	17087
	ENSG00000154589
	ENSMUSG00000025779
	Q9Y6Y9
	Q9JHF9
	NM_001195797; NM_015364
	NM_001159711; NM_016923
	NP_001182726; NP_056179
	NP_001153183; NP_058619
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Antigen lymfocytů 96, také známý jako "Myeloidní diferenciační faktor 2 (MD-2)," je protein že u lidí je kódován LY96 gen.^[5]^[6]^[7]^[8]

The protein kódovaný tímto genem se účastní vazby lipopolysacharid s Receptor podobný mýtnému (TLR4).

Funkce

Zdá se, že protein MD-2 se asociuje s toll-like receptorem 4 na buněčném povrchu a propůjčuje odezvu na lipopolysacharid (LPS), čímž poskytuje spojení mezi receptorem a signalizací LPS.^[7] To znamená, že primární rozhraní mezi TLR4 a MD-2 je vytvořeno před navázáním LPS a dimerizační rozhraní je indukováno navázáním LPS.^[8]

Struktura

MD-2 má strukturu skládání β-pohárku složenou ze dvou antiparalelních β listů tvořících velkou hydrofobní kapsu pro vazbu ligandu.^[9]^[10]

Interakce

Ukázalo se, že lymfocytární antigen 96 komunikovat s TLR 4.^[5]^[11]

Když se LPS váže na hydrofobní kapsu v MD-2, přímo zprostředkovává dimerizaci dvou komplexů TLR4-MD-2. MD-2 tedy tvoří heterodimer, který rozpoznává společný vzor ve strukturně rozmanitých molekulách LPS. Tyto interakce umožňují TLR4 rozpoznat LPS.^[8]

LPS je extrahován z bakteriální membrány a přenesen do TLR4-MD-2 dvěma doplňkovými proteiny, proteinem vázajícím LPS a CD14, aby se indukovala vrozená imunitní odpověď.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000154589 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025779 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Shimazu R, Akashi S, Ogata H, Nagai Y, Fukudome K, Miyake K, Kimoto M (červen 1999). „MD-2, molekula, která uděluje lipopolysacharidovou odezvu na Toll-like receptor 4“. The Journal of Experimental Medicine. 189 (11): 1777–82. doi:10.1084 / jem.189.11.1777. PMC 2193086. PMID 10359581.
^ Abreu MT, Vora P, Faure E, Thomas LS, Arnold ET, Arditi M (srpen 2001). „Snížená exprese Toll-like receptoru-4 a MD-2 koreluje s ochranou střevních epiteliálních buněk před dysregulovanou prozánětlivou genovou expresí v reakci na bakteriální lipopolysacharid“. Journal of Immunology. 167 (3): 1609–16. doi:10,4049 / jimmunol.167.3.1609. PMID 11466383.
^ ^A ^b "Entrez Gene: LY96 lymfocytární antigen 96".
^ ^A ^b ^C ^d Park BS, Song DH, Kim HM, Choi BS, Lee H, Lee JO (duben 2009). "Strukturní základ rozpoznávání lipopolysacharidů komplexem TLR4-MD-2". Příroda. 458 (7242): 1191–5. doi:10.1038 / nature07830. PMID 19252480. S2CID 4396446.
^ Kim HM, Park BS, Kim JI, Kim SE, Lee J, Oh SC a kol. (Září 2007). "Krystalová struktura komplexu TLR4-MD-2 s navázaným antagonistou endotoxinu Eritoran". Buňka. 130 (5): 906–17. doi:10.1016 / j.cell.2007.08.002. PMID 17803912. S2CID 18948568.
^ Ohto U, Fukase K, Miyake K, Satow Y (červen 2007). "Krystalové struktury lidského MD-2 a jeho komplexu s antiendotoxickým lipidem IVa". Věda. 316 (5831): 1632–4. doi:10.1126 / science.1139111. PMID 17569869. S2CID 37539892.
^ Re F, Strominger JL (červen 2002). „Monomerní rekombinantní MD-2 se pevně váže na toll-like receptor 4 a uděluje lipopolysacharidovou odezvu“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (26): 23427–32. doi:10,1074 / jbc.M202554200. PMID 11976338.

Další čtení

Kato K, Morrison AM, Nakano T, Tashiro K, Honjo T (červenec 2000). „ESOP-1, vylučovaný protein exprimovaný v hematopoetickém, nervovém a reprodukčním systému embryonálních a dospělých myší“. Krev. 96 (1): 362–4. doi:10.1182 / krev.V96.1.362. PMID 10891475.
Dziarski R, Wang Q, Miyake K, Kirschning CJ, Gupta D (únor 2001). „MD-2 umožňuje reakce zprostředkované Toll receptorem 2 (TLR2) na lipopolysacharid a zvyšuje odpovědi zprostředkované TLR2 na grampozitivní a gramnegativní bakterie a jejich složky buněčné stěny“. Journal of Immunology. 166 (3): 1938–44. doi:10,4049 / jimmunol.166.3.1938. PMID 11160242.
Schromm AB, Lien E, Henneke P, Chow JC, Yoshimura A, Heine H, Latz E, Monks BG, Schwartz DA, Miyake K, Golenbock DT (červenec 2001). „Molekulárně genetická analýza mutantní buněčné linie neodpovídající na endotoxin: bodová mutace v konzervované oblasti MD-2 ruší endotoxinem indukovanou signalizaci“. The Journal of Experimental Medicine. 194 (1): 79–88. doi:10.1084 / jem.194.1.79. PMC 2193443. PMID 11435474.
Visintin A, Mazzoni A, Spitzer JA, Segal DM (říjen 2001). „Sekretovaný MD-2 je velký polymerní protein, který účinně uděluje citlivost lipopolysacharidů na Toll-like receptor 4“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 98 (21): 12156–61. doi:10.1073 / pnas.211445098. PMC 59784. PMID 11593030.
Akashi S, Nagai Y, Ogata H, Oikawa M, Fukase K, Kusumoto S, Kawasaki K, Nishijima M, Hayashi S, Kimoto M, Miyake K (prosinec 2001). "Lidský MD-2 se uděluje na myším Toll-like receptoru 4 druhově specifické lipopolysacharidové rozpoznávání". Mezinárodní imunologie. 13 (12): 1595–9. doi:10.1093 / intimm / 13.12.1595. PMID 11717200.
Abreu MT, Arnold ET, Thomas LS, Gonsky R, Zhou Y, Hu B, Arditi M (červen 2002). „Exprese TLR4 a MD-2 je regulována imunitně zprostředkovanými signály v lidských intestinálních epiteliálních buňkách“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (23): 20431–7. doi:10,1074 / jbc.M110333200. PMID 11923281.
Re F, Strominger JL (červen 2002). „Monomerní rekombinantní MD-2 se pevně váže na toll-like receptor 4 a uděluje lipopolysacharidovou odezvu“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (26): 23427–32. doi:10,1074 / jbc.M202554200. PMID 11976338.
Latz E, Visintin A, Lien E, Fitzgerald KA, Monks BG, Kurt-Jones EA, Golenbock DT, Espevik T (prosinec 2002). „Lipopolysacharid rychle přenáší do az Golgiho aparátu komplex mýtného receptoru 4-MD-2-CD14 v procesu, který je odlišný od zahájení signální transdukce“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (49): 47834–43. doi:10,1074 / jbc.M207873200. PMID 12324469.
Schröder NW, Morath S, Alexander C, Hamann L, Hartung T, Zähringer U, Göbel UB, Weber JR, Schumann RR (květen 2003). „Kyselina lipoteichoová (LTA) Streptococcus pneumoniae a Staphylococcus aureus aktivuje imunitní buňky prostřednictvím Toll-like receptoru (TLR) -2, proteinu vázajícího lipopolysacharid (LBP) a CD14, zatímco TLR-4 a MD-2 nejsou zahrnuty.“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (18): 15587–94. doi:10,1074 / jbc.M212829200. PMID 12594207.
Mullen GE, Kennedy MN, Visintin A, Mazzoni A, Leifer CA, Davies DR, Segal DM (duben 2003). „Role disulfidových vazeb při sestavování a fungování MD-2“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (7): 3919–24. doi:10.1073 / pnas.0630495100. PMC 153023. PMID 12642668.
Ohnishi T, Muroi M, Tanamoto K (květen 2003). „MD-2 je nezbytný pro toll-like protein receptoru 4, aby podstoupil glykosylaci nezbytnou pro jeho translokaci na buněčný povrch“. Klinická a diagnostická laboratorní imunologie. 10 (3): 405–10. doi:10.1128 / cdli.10.3.405-410.2003. PMC 154975. PMID 12738639.
Thompson PA, Tobias PS, Viriyakosol S, Kirkland TN, Kitchens RL (srpen 2003). „Protein vázající lipopolysacharid (LPS) inhibuje reakce na LPS vázaný na buňky“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (31): 28367–71. doi:10,1074 / jbc.M302921200. PMID 12754215.
Visintin A, Latz E, Monks BG, Espevik T, Golenbock DT (listopad 2003). „Lysiny 128 a 132 umožňují lipopolysacharidovou vazbu na MD-2, což vede k agregaci Toll-like receptoru-4 a signální transdukci“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (48): 48313–20. doi:10,1074 / jbc.M306802200. PMID 12960171.
Re F, Strominger JL (listopad 2003). „Samostatné funkční domény lidského MD-2 zprostředkovávají vazbu na receptor 4 podobného Toll a lipopolysacharidovou odezvu“. Journal of Immunology. 171 (10): 5272–6. doi:10,4049 / jimmunol.171.10.5272. PMID 14607928.
Hamann L, Kumpf O, Müller M, Visintin A, Eckert J, Schlag PM, Schumann RR (červen 2004). „Kódující mutace v prvním exonu lidského genu MD-2 má za následek sníženou lipopolysacharidem indukovanou signalizaci“. Geny a imunita. 5 (4): 283–8. doi:10.1038 / sj.gene.6364068. PMID 15057266.
Gruber A, Mancek M, Wagner H, Kirschning CJ, Jerala R (červenec 2004). „Strukturální model MD-2 a funkční role jeho základních shluků aminokyselin podílejících se na rozpoznávání buněčných lipopolysacharidů“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (27): 28475–82. doi:10,1074 / jbc.M400993200. PMID 15111623.
Cario E, Golenbock DT, Visintin A, Rünzi M, Gerken G, Podolsky DK (duben 2006). „Trypsin-senzitivní modulace intestinálního epitelu MD-2 jako mechanismus tolerance vůči lipopolysacharidům“. Journal of Immunology. 176 (7): 4258–66. doi:10,4049 / jimmunol.176.7.4258. PMID 16547263.
Jia HP, Kline JN, Penisten A, Apicella MA, Gioannini TL, Weiss J, McCray PB (srpen 2004). „Endotoxinová odezva epitelu lidských dýchacích cest je omezena nízkou expresí MD-2“. American Journal of Physiology. Plicní buněčná a molekulární fyziologie. 287 (2): L428-37. doi:10.1152 / ajplung.00377.2003. PMID 15121639. S2CID 13203884.

Signální dráha mýtných receptorů. Přerušované šedé čáry představují neznámé asociace

externí odkazy

lymfocyt + antigen + 96, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000154589 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025779 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10359581-5] A ^b Shimazu R, Akashi S, Ogata H, Nagai Y, Fukudome K, Miyake K, Kimoto M (červen 1999). „MD-2, molekula, která uděluje lipopolysacharidovou odezvu na Toll-like receptor 4“. The Journal of Experimental Medicine. 189 (11): 1777–82. doi:10.1084 / jem.189.11.1777. PMC 2193086. PMID 10359581.

[pmid11466383-6] Abreu MT, Vora P, Faure E, Thomas LS, Arnold ET, Arditi M (srpen 2001). „Snížená exprese Toll-like receptoru-4 a MD-2 koreluje s ochranou střevních epiteliálních buněk před dysregulovanou prozánětlivou genovou expresí v reakci na bakteriální lipopolysacharid“. Journal of Immunology. 167 (3): 1609–16. doi:10,4049 / jimmunol.167.3.1609. PMID 11466383.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: LY96 lymfocytární antigen 96".

[:0-8] A ^b ^C ^d Park BS, Song DH, Kim HM, Choi BS, Lee H, Lee JO (duben 2009). "Strukturní základ rozpoznávání lipopolysacharidů komplexem TLR4-MD-2". Příroda. 458 (7242): 1191–5. doi:10.1038 / nature07830. PMID 19252480. S2CID 4396446.

[9] Kim HM, Park BS, Kim JI, Kim SE, Lee J, Oh SC a kol. (Září 2007). "Krystalová struktura komplexu TLR4-MD-2 s navázaným antagonistou endotoxinu Eritoran". Buňka. 130 (5): 906–17. doi:10.1016 / j.cell.2007.08.002. PMID 17803912. S2CID 18948568.

[10] Ohto U, Fukase K, Miyake K, Satow Y (červen 2007). "Krystalové struktury lidského MD-2 a jeho komplexu s antiendotoxickým lipidem IVa". Věda. 316 (5831): 1632–4. doi:10.1126 / science.1139111. PMID 17569869. S2CID 37539892.

[pmid11976338-11] Re F, Strominger JL (červen 2002). „Monomerní rekombinantní MD-2 se pevně váže na toll-like receptor 4 a uděluje lipopolysacharidovou odezvu“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (26): 23427–32. doi:10,1074 / jbc.M202554200. PMID 11976338.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]