Kobuvirus - Kobuvirus
| Kobuvirus | |
|---|---|
Klasifikace virů  | |
| (bez hodnocení): | Virus |
| Oblast: | Riboviria |
| Království: | Orthornavirae |
| Kmen: | Pisuviricota |
| Třída: | Pisoniviricetes |
| Objednat: | Picornavirales |
| Rodina: | Picornaviridae |
| Rod: | Kobuvirus |
| Zadejte druh | |
| Aichivirus A | |
Kobuvirus je rod viry v pořadí Picornavirales, v rodině Picornaviridae. Lidé a dobytek slouží jako přirození hostitelé. V současné době existuje šest druhů v tomto rodu, včetně druhů druhů Aichivirus A. Mezi nemoci spojené s tímto rodem patří: gastroenteritida.[1][2] Rod byl pojmenován kvůli kusovému vzhledu virových částic elektronovou mikroskopií; „kobu“ znamená v japonštině „knoflík“.[3]
Mezi tři druhy rodu patří Aichivirus A (dříve Virus Aichi), Aichivirus B (dříve Hovězí kobuvirus) a Aichivirus C. (dříve Prasečí kobuvirus) každý vlastnil jeden sérotyp. Psí kobuvirus patří k druhům Aichivirus A.[4] Virus Aichi infikuje lidi,[5][6] zatímco hovězí kobuvirus,[7] prasečí kobuvirus[8][9] a psí kobuvirus, jak naznačují jejich jména, infikuje dobytek, prasata, psy a kočky.
V roce 2014 byl po izolaci od korejské černé kozy charakterizován nový kozí kobuvirus.[10]
Jako detekční a genotypové metody kobuviru se používají převážně sekvenční analýza nukleových kyselin a RT-PCR, i když existují některé další techniky, jako je EM a ELISA.[11]
Virové částice
Viry v Kobuviru nejsou neobalené, s ikosahedrickou a sférickou geometrií a T = pseudo3 symetrií. Průměr je kolem 30 nm. Genomy jsou lineární a nesegmentované, mají délku přibližně 8,25 kB.[1] Molekulová hmotnost typické částice virionu tohoto rodu je obvykle osm až devět milionů. Viriony virů v tomto rodu se skládají z kapsidů o průměru 27 až 30 nm.[5] Předpokládá se, že kapsida sestává z 12 kapsomerů a struktura kapsidového obalu těchto virionů má monovrstevné složení.[5] Pomocí konvenční elektronové mikroskopie lze vizualizovat strukturu povrchu kapsidy.[5][6] Virové částice obsahují jeden druh ssRNA. Tyto viriony mají sedimentační koeficient 140–165 S20w. Částice jsou popsány jako „relativně stabilní“ in vitro (ve srovnání s jinými viry) a stabilní v kyselých podmínkách s pH 3,5.[6] Bylo také zjištěno, že jsou necitlivé na ošetření některými chemikáliemi, včetně chloroformu, etheru a neiontových detergentů.[6]
| Rod | Struktura | Symetrie | Capsid | Genomické uspořádání | Genomická segmentace |
|---|---|---|---|---|---|
| Kobuvirus | Icosahedral | Pseudo T = 3 | Neobalené | Lineární | Monopartitní |
Životní cyklus
Virová replikace je cytoplazmatická. Vstupu do hostitelské buňky se dosáhne připojením viru k hostitelským receptorům, které zprostředkovávají endocytózu. Replikace sleduje model replikace pozitivního řetězce RNA viru. Transkripce pozitivního řetězce RNA viru je metoda transkripce. Virus opouští hostitelskou buňku lýzou a viroporiny. Jako přirozený hostitel slouží člověk a dobytek. Přenosové cesty jsou fekální – orální.[1]
| Rod | Podrobnosti o hostiteli | Tkáňový tropismus | Vstupní údaje | Podrobnosti o vydání | Replikační web | Místo montáže | Přenos |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Kobuvirus | Lidé | Žádný | Endocytóza buněčných receptorů | Lyza | Cytoplazma | Cytoplazma | Orálně – fekální; krev |
Genetika
Viry v tomto rodu mají jednovláknové lineární nesegmentované genomy RNA s pozitivním smyslem o délce přibližně 8,2–8,3 kb.[6][7]
Reference
- ^ A b C „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 15. června 2015.
- ^ ICTV. „Virus Taxonomy: 2014 Release“. Citováno 15. června 2015.
- ^ Reuter G, Boros A, Pankovics P (leden 2011). „Kobuviry - komplexní přehled“. Recenze v lékařské virologii. 21 (1): 32–41. doi:10,1002 / rmv.677. PMID 21294214.
- ^ Carmona-Vicente N, Buesa J, Brown PA, Merga JY, Darby AC, Stavisky J, Sadler L, Gaskell RM, Dawson S, Radford AD (červen 2013). "Fylogeneze a prevalence kobuvirů u psů a koček ve Velké Británii". Veterinární mikrobiologie. 164 (3–4): 246–52. doi:10.1016 / j.vetmic.2013.02.014. PMC 7127238. PMID 23490561.
- ^ A b C d Yamashita T, Kobayashi S, Sakae K, Nakata S, Chiba S, Ishihara Y, Isomura S (listopad 1991). "Izolace cytopatických malých kulatých virů s buňkami BS-C-1 od pacientů s gastroenteritidou". The Journal of Infectious Diseases. 164 (5): 954–7. doi:10.1093 / infdis / 164.5.954. PMID 1658159.
- ^ A b C d E Yamashita T, Sakae K, Tsuzuki H, Suzuki Y, Ishikawa N, Takeda N, Miyamura T, Yamazaki S (říjen 1998). „Kompletní nukleotidová sekvence a genetická organizace viru Aichi, odlišného člena Picornaviridae spojeného s akutní gastroenteritidou u lidí“. Journal of Virology. 72 (10): 8408–12. doi:10.1128 / JVI.72.10.8408-8412.1998. PMC 110230. PMID 9733894.
- ^ A b Yamashita T, Ito M, Kabashima Y, Tsuzuki H, Fujiura A, Sakae K (listopad 2003). „Izolace a charakterizace nového druhu kobuviru spojeného s dobytkem“. The Journal of General Virology. 84 (Pt 11): 3069–3077. doi:10.1099 / vir.0.19266-0. PMID 14573811.
- ^ Reuter G, Boldizsár A, Kiss I, Pankovics P (prosinec 2008). „Kandidát na nový druh kobuviru u hostitelů prasat“. Vznikající infekční nemoci. 14 (12): 1968–70. doi:10,3201 / eid1412.080797. PMC 2634637. PMID 19046542.
- ^ Reuter G, Boldizsár A, Pankovics P (2009). "Kompletní nukleotidové a aminokyselinové sekvence a genetická organizace prasatového kobuviru, člena nového druhu rodu Kobuvirus, čeledi Picornaviridae". Archivy virologie. 154 (1): 101–8. doi:10.1007 / s00705-008-0288-2. PMID 19096904.
- ^ Oem JK, Lee MH, Lee KK, An DJ (srpen 2014). "Nové druhy kobuvirů identifikované u černé kozy s průjmem". Veterinární mikrobiologie. 172 (3–4): 563–7. doi:10.1016 / j.vetmic.2014.06.009. PMID 24984842.
- ^ Khamrin P, Maneekarn N, Okitsu S, Ushijima H (2014). "Epidemiologie lidských a zvířecích kobuvirů". Virová nemoc. 25 (2): 195–200. doi:10.1007 / s13337-014-0200-5. PMC 4188179. PMID 25674585.