Integrin beta 7 - Integrin beta 7

ITGB7
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2BRQ, 3V4P, 3V4V
Identifikátory
Aliasy	ITGB7, integrinová podjednotka beta 7
Externí ID	OMIM: 147559 MGI: 96616 HomoloGene: 20247 Genové karty: ITGB7
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	53,207,282 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	102,231,944 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita virového receptoru; • vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba molekul buněčné adheze; • integrinová vazba; • aktivita signálního receptoru;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána; • receptorový komplex; • buněčná membrána; • povrch buňky; • komplex integrinu; • extracelulární exosom; • komplex integrin alfa4-beta7; • ohnisková adheze;
Biologický proces	• Migrace T buněk; • heterotypická adheze mezi buňkami; • adheze buňka-matice podílející se na migraci ameboidních buněk; • organizace extracelulární matice; • shlukování receptorů; • buněčná adheze; • regulace imunitní odpovědi; • uvázání nebo válcování leukocytů; • integrinem zprostředkovaná signální dráha; • virový vstup; • šíření buněk závislé na adhezi; • buněčná matice adheze; • migrace leukocytů; • migrace buněk; • buněčná adheze zprostředkovaná integrinem;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3695
	16421
	ENSG00000139626
	ENSMUSG00000001281
	P26010
	P26011
	NM_000889
	NM_013566
	NP_000880
	NP_038594
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Integrin beta-7 je integrin protein že u lidí je kódován ITGB7 gen.^[5]^[6] Může se spárovat s ITGA4 (CD49d) k vytvoření heterodimerní integrin receptor α₄β₇, nebo s ITGAE (CD103) za vzniku α_Eβ₇.^[7]

Struktura

Stejně jako všechny integrinové podjednotky, β₇ je vysoce flexibilní extracelulární protein vázaný na membránu, který se kvůli stabilitě musí spárovat s α podjednotkou. Flexibilita molekuly jí umožňuje dynamicky regulovat její afinitu k ligand prostřednictvím konformačních změn.^[8] Počínaje vrcholovým koncem proteinu, nejdále od buněčné membrány, β₇ se skládá z hlavy a horních končetin, souhrnně označovaných jako hlavice, dolní končetiny, a transmembránová doména a a cytoplazmatický ocas. Horní část hlavy je doména podobná I, někdy nazývaná doména βI, která v kombinaci s podjednotkou α váže ligand. Těsně pod tímto je hybridní doména, jejíž část je N-terminál do domény I-like. Pod hybridní doménou je doména PSI, která dotváří hlavu. Dolní končetiny se skládají z EGF domény 1-4 a p koncová doména. Konečně existuje transmembránová doména a C-terminál cytoplazmatický ocas.^[9]

Interakce

ITGB7 bylo prokázáno komunikovat s EED.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000139626 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001281 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Erle DJ, Rüegg C, Sheppard D, Pytela R (červen 1991). "Kompletní aminokyselinová sekvence integrinové beta podjednotky (beta 7) identifikovaná v leukocytech". The Journal of Biological Chemistry. 266 (17): 11009–16. PMID 2040616.
^ „Entrez Gene: ITGB7 integrin, beta 7“.
^ Byron A, Humphries JD, Askari JA, Craig SE, Mold AP, Humphries MJ (listopad 2009). "Anti-integrinové monoklonální protilátky". Journal of Cell Science. 122 (Pt 22): 4009–11. doi:10,1242 / jcs.056770. PMC 3329622. PMID 19910492.
^ Carman CV, Springer TA (říjen 2003). „Regulace avidity integrinu: jsou zdůrazněny změny afinity a konformace?“. Současný názor na buněčnou biologii. 15 (5): 547–56. doi:10.1016 / j.ceb.2003.08.003. PMID 14519389.
^ Yu Y, Zhu J, Mi LZ, Walz T, Sun H, Chen J, Springer TA (leden 2012). „Strukturální specializace α (4) β (7), integrinu, který zprostředkovává valivou adhezi“. The Journal of Cell Biology. 196 (1): 131–46. doi:10.1083 / jcb.201110023. PMC 3255974. PMID 22232704.
^ Rietzler M, Bittner M, Kolanus W, Schuster A, Holzmann B (říjen 1998). „Lidský protein WD opakování WAIT-1 specificky interaguje s cytoplazmatickými konci beta7-integrinů“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (42): 27459–66. doi:10.1074 / jbc.273.42.27459. PMID 9765275.

Další čtení

Rüegg C, Postigo AA, Sikorski EE, Butcher EC, Pytela R, Erle DJ (duben 1992). „Role integrinu alfa 4 beta 7 / alfa 4 beta P v adherenci lymfocytů k fibronektinu a VCAM-1 a v homotypickém shlukování buněk“. The Journal of Cell Biology. 117 (1): 179–89. doi:10.1083 / jcb.117.1.179. PMC 2289398. PMID 1372909.
Chan BM, Elices MJ, Murphy E, Hemler ME (duben 1992). "Adheze k vaskulární buněčné adhezní molekule 1 a fibronektinu. Srovnání alfa 4 beta 1 (VLA-4) a alfa 4 beta 7 na lidské B buněčné linii JY". The Journal of Biological Chemistry. 267 (12): 8366–70. PMID 1373725.
Jiang WM, Jenkins D, Yuan Q, Leung E, Choo KH, Watson JD, Krissansen GW (září 1992). "Genová organizace lidské podjednotky beta 7, běžná beta podjednotka leukocytových integrinů HML-1 a LPAM-1". Mezinárodní imunologie. 4 (9): 1031–40. doi:10.1093 / intimm / 4.9.1031. PMID 1382574.
Baker E, Sutherland GR, Jiang WM, Yuan Q, Leung E, Watson JD, Krissansen GW (1992). "Mapování genu lidského integrinu beta 7 (ITG beta 7) na 12q13.13 neizotopovou in situ hybridizací". Savčí genom. 2 (4): 272–3. doi:10.1007 / BF00355438. PMID 1543919. S2CID 30346801.
Yuan QA, Jiang WM, Krissansen GW, Watson JD (prosinec 1991). „Klonování a sekvenční analýza nového transkriptu integrinu souvisejícího s beta 2 z T lymfocytů: homologie opakování bohatých na integrin cystein s doménou III řetězců lamininu B“. Mezinárodní imunologie. 3 (12): 1373–4. doi:10.1093 / intimm / 3.12.1373. PMID 1777426.
Yuan QA, Jiang WM, Krissansen GW, Watson JD (1991). „Klonování a sekvenční analýza nového transkriptu integrinu souvisejícího s beta 2 z T lymfocytů: homologie opakování bohatých na integrin cystein s doménou III řetězců lamininu B“. Mezinárodní imunologie. 2 (11): 1097–108. doi:10.1093 / intimm / 2.11.1097. PMID 2083230.
Erle DJ, Brown T, Christian D, Aris R (březen 1994). "Plicní epiteliální výstelky podskupin T buněk definovaných odlišnými vzory exprese integrinu beta 7 a beta 1". American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology. 10 (3): 237–44. doi:10.1165 / ajrcmb.10.3.7509610. PMID 7509610.
Postigo AA, Sánchez-Mateos P, Lazarovits AI, Sánchez-Madrid F, de Landázuri MO (září 1993). „Integrin alfa 4 beta 7 zprostředkovává vazbu B buněk na fibronektin a adhezní molekulu vaskulárních buněk-1. Exprese a funkce alfa 4 integrinů na lidských B lymfocytech“. Journal of Immunology. 151 (5): 2471–83. PMID 7689608.
Shaw SK, Cepek KL, Murphy EA, Russell GJ, Brenner MB, Parker CM (únor 1994). „Molekulární klonování podjednotky alfa E integrinu lidského mukózního lymfocytu. Neobvyklá struktura a omezená distribuce RNA“. The Journal of Biological Chemistry. 269 (8): 6016–25. PMID 8119947.
Tidswell M, Pachynski R, Wu SW, Qiu SQ, Dunham E, Cochran N, Briskin MJ, Kilshaw PJ, Lazarovits AI, Andrew DP, Butcher EC, Yednock TA, Erle DJ (srpen 1997). "Strukturně-funkční analýza podjednotky integrinu beta 7: identifikace domén zapojených do adheze k MAdCAM-1". Journal of Immunology. 159 (3): 1497–505. PMID 9233649.
Tan K, Casasnovas JM, Liu JH, Briskin MJ, Springer TA, Wang JH (červen 1998). „Struktura domén nadrodiny imunoglobulinů 1 a 2 MAdCAM-1 odhaluje nové rysy důležité pro rozpoznávání integrinu“. Struktura. 6 (6): 793–801. doi:10.1016 / S0969-2126 (98) 00080-X. PMID 9655832.
Rietzler M, Bittner M, Kolanus W, Schuster A, Holzmann B (říjen 1998). „Lidský protein WD opakování WAIT-1 specificky interaguje s cytoplazmatickými konci beta7-integrinů“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (42): 27459–66. doi:10.1074 / jbc.273.42.27459. PMID 9765275.
Taraszka KS, Higgins JM, Tan K, Mandelbrot DA, Wang JH, Brenner MB (květen 2000). "Molekulární základ pro adhezi leukocytů integrinu alfa (E) beta (7) k epiteliálnímu (E) -kadherinu". The Journal of Experimental Medicine. 191 (9): 1555–67. doi:10.1084 / jem.191.9.1555. PMC 2213439. PMID 10790430.
Higgins JM, Cernadas M, Tan K, Irie A, Wang J, Takada Y, Brenner MB (srpen 2000). „Role alfa a beta řetězců v rozpoznávání ligandu integriny beta 7“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (33): 25652–64. doi:10,1074 / jbc.M001228200. PMID 10837471.
Puig-Kröger A, Sanz-Rodríguez F, Longo N, Sánchez-Mateos P, Botella L, Teixidó J, Bernabéu C, Corbí AL (říjen 2000). „Exprese a funkce integrinu CD49d závislá na zrání na lidských dendritických buňkách odvozených od monocytů“. Journal of Immunology. 165 (8): 4338–45. doi:10,4049 / jimmunol.165.8.4338. PMID 11035069.
Guilliano MJ, Foxx-Orenstein AE, Lebman DA (únor 2001). „Mikroprostředí lidských Peyerových náplastí inhibuje zvýšení exprese CD38 spojené s reakcí germinálního centra“. Journal of Immunology. 166 (4): 2179–85. doi:10,4049 / jimmunol.166.4.2179. PMID 11160270.
Calderwood DA, Huttenlocher A, Kiosses WB, Rose DM, Woodside DG, Schwartz MA, Ginsberg MH (prosinec 2001). „Zvýšená vazba filaminu na cytoplazmatické domény beta-integrinu inhibuje migraci buněk“. Přírodní buněčná biologie. 3 (12): 1060–8. doi:10.1038 / ncb1201-1060. PMID 11781567. S2CID 6459957.
Calderwood DA, Fujioka Y, de Pereda JM, García-Alvarez B, Nakamoto T, Margolis B, McGlade CJ, Liddington RC, Ginsberg MH (březen 2003). „Interakce cytoplazmatické domény integrinu beta s doménami vázajícími fosfotyrosin: strukturální prototyp rozmanitosti signalizace integrinu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (5): 2272–7. doi:10.1073 / pnas.262791999. PMC 151330. PMID 12606711.

externí odkazy

ITGB7 Informace s odkazy v Brána pro migraci buněk

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000139626 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001281 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid2040616-5] Erle DJ, Rüegg C, Sheppard D, Pytela R (červen 1991). "Kompletní aminokyselinová sekvence integrinové beta podjednotky (beta 7) identifikovaná v leukocytech". The Journal of Biological Chemistry. 266 (17): 11009–16. PMID 2040616.

[entrez-6] „Entrez Gene: ITGB7 integrin, beta 7“.

[pmid19910492-7] Byron A, Humphries JD, Askari JA, Craig SE, Mold AP, Humphries MJ (listopad 2009). "Anti-integrinové monoklonální protilátky". Journal of Cell Science. 122 (Pt 22): 4009–11. doi:10,1242 / jcs.056770. PMC 3329622. PMID 19910492.

[pmid14519389-8] Carman CV, Springer TA (říjen 2003). „Regulace avidity integrinu: jsou zdůrazněny změny afinity a konformace?“. Současný názor na buněčnou biologii. 15 (5): 547–56. doi:10.1016 / j.ceb.2003.08.003. PMID 14519389.

[pmid22232704-9] Yu Y, Zhu J, Mi LZ, Walz T, Sun H, Chen J, Springer TA (leden 2012). „Strukturální specializace α (4) β (7), integrinu, který zprostředkovává valivou adhezi“. The Journal of Cell Biology. 196 (1): 131–46. doi:10.1083 / jcb.201110023. PMC 3255974. PMID 22232704.

[pmid9765275-10] Rietzler M, Bittner M, Kolanus W, Schuster A, Holzmann B (říjen 1998). „Lidský protein WD opakování WAIT-1 specificky interaguje s cytoplazmatickými konci beta7-integrinů“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (42): 27459–66. doi:10.1074 / jbc.273.42.27459. PMID 9765275.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]