Heliobakterie - Heliobacteria
Heliobakterie | |
---|---|
Vědecká klasifikace ![]() | |
Doména: | Bakterie |
Kmen: | Firmicutes |
Třída: | Clostridia |
Objednat: | Clostridiales |
Rodina: | Heliobacteriaceae |
Rody[1] | |
Candidatus Helioclostridium ♠ |
The heliobakterie jsou fototrofní: převádějí světelnou energii na chemickou pomocí a reakční centrum typu I..[2][3] Primární pigment zapojen je bakteriochlorofyl G, který je pro skupinu jedinečný a má jedinečný absorpční spektrum; to dává heliobakteriím jejich vlastní environmentální nika.[4] Fototrofie odehrává se v buněčná membrána, který netvoří záhyby ani přihrádky jako v fialové bakterie. Ačkoli jsou heliobakterie fototrofní, mohou růst bez světla kvašení z pyruvát.
RNA stromy řadí heliobakterie mezi Firmicutes, ale nezanechávají skvrny Gram-pozitivně.[4] Nemají žádnou vnější membránu a stejně jako některé další pevné látky (Clostridia ), jsou tepelně odolné endospory, které obsahují vysokou hladinu vápník a kyselina dipikolinová. Heliobakterie jsou jediné pevné látky, o nichž je známo, že jsou fototrofní.
Heliobakterie jsou fotoheterotrofní, které vyžadují zdroje organického uhlíku, a to jsou výhradně anaerobní.[4] Bakteriochlorofyl G je inaktivován přítomností kyslík, dělat je povinné anaeroby (nemohou přežít v aerobní podmínky ). Heliobakterie byly nalezeny v půdy,[5] horké prameny,[6] sodová jezera[7][8] a jsou zjevně rozšířené v podmáčených půdách neloupaná pole.[5] Jsou vášniví dusíkaté ustalovače, takže jsou pravděpodobně důležité pro úrodnost rýžových polí.[5]
Taxonomie
Heliobakterie by neměla být zaměňována s Helicobacter, což je rod bakterií se zcela odlišnými vlastnostmi.
Rodina Heliobacteriaceae[9][10]
- Candidatus Helioclostridium ♠ Girija a kol. 2006
- Candidatus Helioclostridium ananthapuram ♠ Girija a kol. 2006
- Heliorestis Bryantseva a kol. 2000
- H. baculata Bryantseva a kol. 2001
- H. convoluta♠ Asao a kol. 2005
- H. daurensis Bryantseva a kol. 2000
- Heliophilum Ormerod et al. 1996
- Heliophilum fasciatum Ormerod et al. 1996
- Heliobacillus Beer-Romero a Gest 1998
- Candidatus H. elongatus ♠ Girija a kol. 2006
- H. mobilis Beer-Romero a Gest 1998
- Heliobacterium Gest and Favinger 1985
- H. aridinosum♠ Girija a kol. 2006
- H. chlorum Gest and Favinger 1985
- H. gestii Ormerod et al. 1996
- H. modesticaldum Kimble a kol. 1996
- H. sulfidophilum Bryantseva a kol. 2001
- H. undosum Bryantseva a kol. 2001
Poznámky:
♠ Kmen nalezen na Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI), ale nemá postavení s Bakteriologický kód (1990 a následující revize), jak je podrobně uvedeno v Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN) v důsledku následujících důvodů:
• Žádná čistá kultura není izolovaná nebo dostupná pro prokaryoty.
• Není platně publikováno, protože efektivní publikace dokumentuje pouze uložení typového kmene v jedné uznávané sbírce kultur.
• Neschváleno a publikováno International Journal of Systematic Bacteriology nebo International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSB / IJSEM).
Reference
- ^ [Madigan M. T, Martinko J. M., Dunlap P. V., Clark D. P. (2009). Brock Biology of Microorganisms 12. vydání, str. 453-454].
- ^ Heinickel a Golbeck 2007
- ^ Gisriel, Christopher; Sarrou, Iosifina; Ferlez, Bryan; Golbeck, John H .; Redding, Kevin E .; Fromme, Raimund (2017-07-27). "Struktura symetrického fotosyntetického reakčního centra - fotosystému". Věda. 357 (6355): 1021–1025. Bibcode:2017Sci ... 357.1021G. doi:10.1126 / science.aan5611. ISSN 0036-8075. PMID 28751471.
- ^ A b C Blankenship, Robert (2014). Molekulární mechanismy fotosyntézy. Wiley-Blackwell. p. 19. ISBN 978-1405189750.
- ^ A b C Madigan, Michael T .; Ormerod, John G. (1995), Blankenship, Robert E .; Madigan, Michael T .; Bauer, Carl E. (eds.), "Taxonomy, Physiology and Ecology of Heliobacteria", Anoxygenní fotosyntetizující bakterie„Pokroky ve fotosyntéze a dýchání, Springer Nizozemsko, s. 17–30, doi:10.1007/0-306-47954-0_2, ISBN 9780306479540
- ^ Kimble, Linda K .; Mandelco, Linda; Woese, Carl R .; Madigan, Michael T. (01.04.1995). „Heliobacterium modesticaldum, sp. Nov., Termofilní heliobakterium horkých pramenů a vulkanických půd“. Archiv mikrobiologie. 163 (4): 259–267. doi:10.1007 / BF00393378. ISSN 1432-072X.
- ^ Asao, Marie; Jung, Deborah O .; Achenbach, Laurie A .; Madigan, Michael T. (10.10.2006). "Heliorestis convoluta sp. Nov., Stočený, alkalifilní heliobakterium z Wadi El Natroun, Egypt". Extremophiles. 10 (5): 403–410. doi:10.1007 / s00792-006-0513-4. ISSN 1433-4909. PMID 16628377.
- ^ Bryantseva, Irina A .; Gorlenko, Vladimir M .; Kompantseva, Elena I .; Achenbach, Laurie A .; Madigan, M. T. (01.08.1999). „Heliorestis daurensis, gen. Nov. Sp. Nov., Alkalifilní fototrofní heliobakterie ve tvaru tyče ke svinutí ze sibiřského sódového jezera“. Archiv mikrobiologie. 172 (3): 167–174. doi:10,1007 / s002030050756. ISSN 1432-072X. PMID 10460887.
- ^ Viz NCBI webová stránka o Heliobacteriaceae Data extrahovaná z „Prohlížeč taxonomie NCBI“. Národní centrum pro biotechnologické informace. Citováno 2011-06-05.
- ^ J.P.Euzéby. "Heliobacteriaceae". Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře. Archivovány od originál dne 27.01.2013. Citováno 2011-06-11.
Další čtení
- Gest H & Favinger J L (1983) Arch Microbiol 136: 11-16.
- Madigan M. T (1992) In Balows et al. (eds) The Prokaryotes str. 1981–1992 Springer New York.
- Madigan M T & Ormerod J G (1995) In Blankenship et al. (eds) Anoxygenic Photosynthetic Bacteria str. 17–30. Kluwer Academic Publishers New York.
- Ormerod J. G. a kol. (1996) Arch Microbiol 165: 226-234.
- Madigan M T, Martinko J M, Dunlap P V, Clark D P. (2009). Brock Biology of Microorganisms 12. vydání, str. 453-454
- Heinnickel M & Golbeck J H (2007) Photosynthesis Research 92: 35-53