Haploskupina O-M117 - Haplogroup O-M117

Haploskupina O-M117
Možná doba vzniku17 300 [95% CI 15 600 <-> 19 000] ybp (YFull[1])

Před 18 203 [95% CI 16 626 <-> 19 783] lety (Karmin 2015[2])
Koalescenční věk11 500 [95% CI 10 100 <-> 12 900] ybp (YFull[1])
Možné místo původupravděpodobně východní Asie nebo Jihovýchodní Asie[Citace je zapotřebí ]
PředekO-M134
PotomciO-M133
Definování mutacíM117, Page23, CTS899 / M1531, CTS1275 / M1536, CTS3251, CTS5128 / M1619, CTS6623 / M1638, CTS11742 / M1720, F141 / M1564, F144, F235 / M1587, F342 / M1627, F373 / M1636, F476 / F166, F476 M1692, F581, F584, F613 / M1702, F649[Citace je zapotřebí ]
Předpokládané rozdělení prostorové frekvence pro haploskupinu M117.[3]

Haploskupina O2a2b1a1-M117 (definováno také fylogeneticky ekvivalent mutace Strana23) je a subclade O2a2b1-M134 (a také subclade z haploskupina O2-M122 ), který se často vyskytuje v Číně a v sousedních zemích, jako je Nepál, Bhútán a Korea, zejména mezi Čínsko-tibetský jazyk mluvící lidé.

Ve vzorcích byl detekován O2-M117 Tamang (38/45 = 84.4%), Tibeťané (45/156 = 28,8% nebo 13/35 = 37,1%), Tharusi (57/171 = 33.3%), Han tchajwanský (40/183 = 21.9%), Newars (14/66 = 21,2%), obecná populace Káthmándú, Nepál (13/77 = 16.9%), Han Číňan (5/34 = 14.7% Čcheng-tu, 5/35 = 14.3% Harbin, 4/35 = 11.4% Meixian, 3/30 = 10.0% Lan-čou, 2/32 = 6,3% Yili), Tunguzické národy z ČLR (7/45 = 15,6% Hezhe, 4/26 = 15.4% Evenki, 5/35 = 14.3% Manchu, 2/41 = 4.9% Xibe, 1/31 = 3.2% Oroqen ), a Ujgurové (2/39 = 5,1% Yili, 1/31 = 3,2% Ürümqi ) (Xue et al. 2006, Gayden et al. 2007 a Fornarino et al. 2009).

Stejně jako O-M7 byl i O-M117 nalezen s velmi různou frekvencí v mnoha vzorcích Hmong-Mien - mluvící národy, jako např Mienické národy (7/20 = 35,0% Mountain Straggler Mien, 9/28 = 32,1% Blue Kimmun, 6/19 = 31,6% Flower Head Mien, 3/11 = 27,3% Top Board Mien, 3/11 = 27,3% Thin Board Mien, 11/47 = 23,4% Western Mien, 6/33 = 18,2% Northern Mien, 5/31 = 16,1% Lowland Yao, 5/35 = 14,3% Yao z Liannan, Guangdong, 5/37 = 13,5% Zaomin, 5/41 = 12,2% nížinný Kimmun, 3/41 = 7,3% domorodý Mien, 2/31 = 6,5% jižní Mien, 2/32 = 6,3% horský Kimmun, ale 0/35 Yao z Bama, Guangxi), She (6/34 = 17,6% She, 4/56 = 7,1% severní She) a Hmongic národy (9/100 = 9,0% Miao z Hunan, 4/51 = 7,8% Hmong Daw ze severu Laos, 3/49 = 6,1% Miao z Yunnan, 1/49 = 2,0% Miao od Guizhou, ale 0/36 Bunu z Guangxi ) (Cai et al. 2011 a Xue et al. 2006).

v Meghalaya, převážně kmenový stát Severovýchodní Indie, O-M133 byl nalezen u 19,7% (14/71) vzorku Tibeto-Burman- mluvení Garos, ale pouze v 6,2% (22/353, v rozmezí 0/32 Bhoi až 6/44 = 13,6% Pnar ) skupiny osmi vzorků sousedních Khasian - mluvící kmeny (Reddy et al. 2007).

Původ

Odhaduje se, že nejdříve doložené genealogické rozdělení uvnitř haploskupiny O-M117, mezi O-M133 a O-M117 (xM133), nastalo přibližně 11 900 [95% CI 10 600 <-> 13 200] ybp.[1] Členové O-M117 (xM133) jsou však mezi existujícími lidmi poměrně vzácní. O-M117 (xM133) byl pozorován u 2,2% (1/46) vzorku CHB (Han Chinese v Pekingu, Čína) vzorku Projekt 1000 genomů.[1] V komerčním testování byl O-MF1380 nebo O-CTS4960, který patří do O-M117 (xM133), nalezen u jednoho jedince, který ohlásil původ v Guangdong, jedna osoba, která ohlásila původ v Jiangsu, jedna osoba, která ohlásila původ v Čchung-čching, jeden jedinec, který ohlásil původ v Indonésii, a jeden jedinec, který ohlásil původ v Indonésii.[1] O-M117 (xM133) byl také nalezen v 1,5% (2/133) vzorku odebraného v Daejeon, Jižní Korea a u 1,0% (6/573) vzorku odebraného v roce 2006 Soul, Jižní Korea.[4]

Odhaduje se, že poslední společný předek všech existujících členů subkladu O-M133, který převládá mezi existujícími členy O-M117, žil v podstatně méně starověké éře: 7 200 [95% CI 6 500 <-> 7 900] ybp podle YFull,[1] Před 7 455 [95% CI 6 514 <-> 8 500] lety podle Karmina et al. 2015,[2] nebo před 7 500 nebo 6 400 lety (v závislosti na použitém odhadu rychlosti mutace) podle Pozniku et al. 2016.[5]

Rozdělení

Čína

Haploskupina O-M117 nebo O-M133 byla často nalezena ve vzorcích Han Číňan z různých částí Číny: 10/34 = 29,4% O-M133 Hakko v Tchaj-wan,[6] 57/258 = 22,1% O-M133 různí Han dobrovolníci v Tchaj-wan,[6] 4/19 = 21.1% Fujian (CHS ),[1] 12/60 = 20,0% O-M133 Minnan v Tchaj-wan,[6] 29/167 = 17.4% Východní Čína,[7] 21/129 = 16.3% Severní Čína,[7] 7/46 = 15.2% Peking (CHB ),[5] 5/34 = 14.7% Čcheng-tu,[8] 5/35 = 14.3% Harbin,[8] 9/65 = 13.8% Jižní Čína,[7] 7/55 = 12,7% O-M133 Fujian,[6] 4/35 = 11.4% Meixian,[8] 3/30 = 10.0% Lan-čou,[8] 2/32 = 6.3% Yili,[8] 1/37 = 2.7% Hunan (CHS ).[1]

Členové haploskupiny O-M117 byli také nalezeni mezi různými etnickými menšinami v Číně, například Tibeťané (13/35 = 37.1%,[8] 45/156 = 28.8%[9]), Dai (13/52 = 25.0% CDX nebo čínský Dai v Xishuangbanna ),[1] Ona lidi (6/34 = 17.6%[8]), Korejci (4/25 = 16,0% Korejců v ČLR[8]), Hezhe (7/45 = 15.6%[8]), Sudy (4/26 = 15.4%[8]), Manchu (5/35 = 14.3%[8]), Yao v Liannan, Guangdong (5/35 = 14.3%[8]), Mongolové (5/45 = 11,1% vnitřní mongolština[8]), Qiang (3/33 = 9.1%[8]), Daurs (3/39 = 7,7% Daur[8]), Hani (2/34 = 5.9%[8]), Xibe (2/41 = 4.9%[8]), Ujgurové (3/70 = 4.3%[8]), Oroqen (1/31 = 3.2%[8]), Buyi (1/35 = 2.9%[8]), a Hui (1/35 = 2.9%[8]).

Indie

Ve studii o DNA Adivasi populace ve státě Meghalaya, Reddy et al. (2007) našli O-M133 u 19,7% (14/71) Garo, 13,6% (6/44) Pnar, 11,1% (2/18) Nongtrai, 8,3% (5/60) Lyngngam, 6,9% (2/29) War-Khasi, 6,3% (4/64) Maram, 5,3% (1/19) War-Jaintia, 2,3% (2/87) Khynriam a 0% (0/32) Bhoi. Garo nativně mluví Garo jazyk zatímco všechny ostatní studované populace nativně mluví Khasic jazyky.[10]

V jiné studii, která zahrnovala populace v Meghalaya, Kumar et al. (2007) našli O-M133 u 9,8% (9/92) Khasi a 9,1% (3/33) Garo.[11]

Studie populací severozápadního Bengálska a Sikkimu publikovaná v roce 2011 zjistila O-M117 v 57,7% (15/26) Rabha, 47.4% (9/19) Mech, 43.1% (22/51) Rajbanshi, 41.7% (15/36) Dhimal a 7,4% (4/54) bengálský ze severní žebříčku Západní Bengálsko a v 9,1% (1/11) vzorku Lachungpa z Sikkim. O-M117 nebyl ve vzorcích této studie nalezen Kol (0/62), Santhal (0/51), Kharia (0/34) nebo Oraone (0/31) ze severní pásu Západního Bengálska.[12]

Japonsko

Studie publikovaná v roce 2000 zjistila O-M117 u 4,3% (1/23) vzorku představujícího Japonsko.[13] Ve studii publikované čínskými vědci v roce 2006 byl O-M117 nalezen s vysokou frekvencí (8/47 = 17,0%) ve vzorku Japonců nepopsaného zeměpisného původu (Xue et al. 2006). Ve studii publikované japonskými vědci v roce 2007 však byla nalezena stejná haploskupina s mnohem nižší frekvencí (11/263 = 4,2%) u většího vzorku Japonců z různých oblastí Japonska (Nonaka et al. 2007). O-M117 byl nalezen u 8,8% (5/57) vzorku JPT (Japonci v Tokiu, Japonsko) vzorku Projekt 1000 genomů.[5][14]

Korea

Mezi 11% a 15% mužů ve vzorcích odebraných v roce 2006 Jižní Korea bylo zjištěno, že patří do haploskupiny O-M117 nebo O-M133 (20/133 = 15,0% Korejců v Daejeon,[4] 70/573 = 12,2% Korejců v Soul,[4] 5/43 = 11,6% Korejců v Jižní Koreji,[8] 33/300 = 11,0% O-M133 Korejců[15]).

Mongolsko

Haploskupina O-M117 byla nalezena asi u 5% vzorků Mongolové v Mongolsko: 4/20 = 20,0% SV Mongolsko,[16] 1/18 = 5,6% střední Mongolsko,[16] 3/65 = 4,6% vnější mongolština,[8] 1/23 = 4,3% JV Mongolsko,[16] 3/97 = 3,1% SZ Mongolsko.[16]

Nepál

Haploskupina O-M117 byla nalezena u 84,4% (38/45) vzorku Tamang, 33,3% ze vzorku Tharu z Chitwan a Morang , 21,2% (14/66) ze vzorku Newar a 16,9% (13/77) vzorku běžné populace Káthmándú.[9]

Laos

Ve studii publikované v roce 2011 byla haploskupina O-M117 nalezena u 7,8% (4/51) vzorku Hmong Daw v Laosu a 5,1% (37/728) souboru etnických menšin, které mluví různými způsoby Austroasijské jazyky: 32.1% (9/28) Bit, 16.2% (6/37) Kataang, 14.0% (7/50) Mal, 13.7% (7/51) Khmu, 6.9% (2/29) Xinhmul, 3.3% (1/30) Alak, 2.94% (1/34) Inh, 2.86% (1/35) Talieng, 2,0% (1/50) Laven, 2,0% (1/50) Oy, 2,0% (1/50) Takže, 0% (0/28) Bo, 0% (0/32) Brau, 0% (0 / 32) Jeh, 0% (0/35) Lamet, 0% (0/35) Ngeq, 0% (0/38) Aheu, 0% (0/39) Suy a 0% (0/45) Katu .[17]

Kutanan et al. 2019 našel O-F8 / F42, který je v současné době považován za fylogeneticky ekvivalentní O-M133, u 25,0% (5/20) vzorku Laosané z Luang Prabang a 5,0% (1/20) vzorku Laosané z Vientiane.[18]

Thajsko

Ve studii publikované v roce 2014 byla haploskupina O-M133 nalezena u 13,3% (10/75) vzorku běžné populace Thajska a u 3,7% (1/27) vzorku Akka v Thajsku.[6]

Brunelli et al. (2017) našli O-M117 u 35,0% (7/20) z Shan, 22,4% (46/205) z Khon Mueang, 22,2% (4/18) z Pondělí, 20,0% (5/25) z Západní Lawa, 17,6% (16/91) z Tai Lue, 16,7% (4/24) z Tai Khuen, 13,6% (9/66) z Tai Yuan a 11,5% (3/26) z Tai Yong v Severní Thajsko a 31,6% (6/19) z Tai Yuan v Střední Thajsko.[19] Ve stejné studii však haploskupina O-M117 nebyla ve vzorku 25 pozorována Východní Lawa v severním Thajsku.[19]

Kutanan et al. (2019) našli O-F8 / F42 (ekvivalent O-M133) u 14,75% (131/888) souboru vzorků z Thajska, včetně 50,0% (9/18) Palaung v Severní Thajsko, 38.9% (7/18) Shan v severním Thajsku, 33,3% (20/60) Khon Mueang v severním Thajsku, 31,0% (13/42) Karen v severním Thajsku 28,6% (6/21) Nyahkur v Severovýchodní Thajsko, 23.5% (4/17) Kaleun, 17.1% (22/129) Thajština (siamská), 16.7% (5/30) Tai Lue v severním Thajsku, 16,7% (3/18) Nyaw v severovýchodním Thajsku, 16,7% (3/18) Blang v severním Thajsku, 15,4% (4/26) Tai Yuan, 14.3% (15/105) Pondělí, 14.3% (5/35) Phuan, 11.8% (2/17) Soa, 11.8% (2/17) Tai Khün, 9.4% (3/32) Západní Lawa, 8.3% (3/36) Black Tai, 6.5% (4/62) Lao Isan a 5,6% (1/18) Khmu.[18]

Vietnam

Haploskupina O-M133 byla nalezena v 4/46 = 8,7% KHV (Kinh v Ho Či Minovo Město, Vietnam) vzorek Projekt 1000 genomů.[5][1] Haploskupina O-M133 byla nalezena u 1/24 = 4,17% vzorku lidí v Hanoi, Vietnam.[6] Studie publikovaná v roce 2011 zjistila, že haploskupina O-M117 v 1/15 = 6,67% Kinh a 1/12 = 8,33% Muong.[17]

Subclades

Podle experimentálního stromu ISOGG ， se subclady O2ab1a1-M117 ukázaly níže (Owen Lu et al. 2016):

  • O2a2b1a1 (M117 / strana 23)
    • O2a2b1a1a (M133)
      • O2a2b1a1a1 (F438)
        • O2a2b1a1a1a (Y17728)
          • O2a2b1a1a1a1 (F155)
          • O2a2b1a1a1a2 (F1754)
            • O2a2b1a1a1a2a (F2137)
          • O2a2b1a1a1a3 (Z25907)
          • O2a2b1a1a2 (FGC23469)
            • O2a2b1a1a2a (F310)
              • O2a2b1a1a2a1 (F402)
                • O2a2b1a1a2a1a (F1531)
      • O2a2b1a1a3 (CTS7634)
        • O2a2b1a1a3a (F317)
          • O2a2b1a1a3a1 (F3039)
        • O2a2b1a1a3b (CTS5488)
      • O2a2b1a1a4 (Z25853)
        • O2a2b1a1a4a (CTS5492)
          • O2a2b1a1a4a1 (CTS6987)
      • O2a2b1a1a5 (CTS10738 / M1707)
        • O2a2b1a1a5a (CTS9678)
          • O2a2b1a1a5a1 (Z39663)
        • O2a2b1a1a5b (A9457)
      • O2a2b1a1a6 (CTS4658)
        • O2a2b1a1a6a (CTS5308)
        • O2a2b1a1a6b (Z25928)
          • O2a2b1a1a6b1 (SK1730)
            • O2a2b1a1a6b1a (Z26030)
            • O2a2b1a1a6b1b (Z26010)
          • O2a2b1a1a6b2 (A9462)
          • O2a2b1a1a6b3 (B456)
    • O2a2b1a1b (CTS4960)

Reference

Citace

  1. ^ A b C d E F G h i j Plná haploskupina YTree v6.03.46 k 31. červenci 2018
  2. ^ A b Karmin, Monika; Saag, Lauri; Vicente, Mário; et al. (2015). „Nedávné zúžení rozmanitosti chromozomů Y se shoduje s globální změnou kultury“. Výzkum genomu. 25 (4): 459–466. doi:10.1101 / gr.186684.114. PMC  4381518. PMID  25770088.
  3. ^ O'Rourke, Dennis; Cai, Xiaoyun; Qin, Zhendong; Wen, Bo; Xu, Shuhua; Wang, Yi; Lu, Yan; Wei, Lanhai; Wang, Chuanchao; Li, Shilin; Huang, Xingqiu; Jin, Li; Li, Hui (2011). „Lidská migrace přes úzká místa z jihovýchodní Asie do východní Asie během posledního glaciálního maxima odhaleného chromozomy Y“. PLOS ONE. 6 (8): e24282. Bibcode:2011PLoSO ... 624282C. doi:10.1371 / journal.pone.0024282. ISSN  1932-6203. PMC  3164178. PMID  21904623.
  4. ^ A b C Jin Park, Myung; Young Lee, Hwan; Ick Yang, Woo; Shin, Kyoung-Jin (2012). „Pochopení variace chromozomu Y v Koreji - význam kombinovaných analýz haploskupiny a haplotypu“. International Journal of Legal Medicine. 126 (4): 589–599. doi:10.1007 / s00414-012-0703-9. PMID  22569803. S2CID  27644576.
  5. ^ A b C d Poznik, G. David; Xue, Yali; Mendez, Fernando L .; et al. (Červen 2016). „Interpunkční výbuchy v lidské mužské demografii odvozeny z 1 244 celosvětových sekvencí Y-chromozomu. Genetika přírody. 48 (6): 593–599. doi:10.1038 / ng.3559. PMC  4884158. PMID  27111036.
  6. ^ A b C d E F Trejaut, Jean A; Poloni, Estella S; Yen, Ju-Chen; Lai, Ying-Hui; Loo, Jun-Hun; Lee, Chien-Liang; On, Chun-Lin; Lin, Marie (2014). „Varianta Y-chromozomální DNA na Tchaj-wanu a její vztah s ostrovem v jihovýchodní Asii“. Genetika BMC. 2014 (15): 77. doi:10.1186/1471-2156-15-77. PMC  4083334. PMID  24965575.
  7. ^ A b C Yan, Shi; Wang, Chuan-Chao; Li, Hui; Li, Shi-Lin; Jin, Li (2011). „Aktualizovaný strom Y-chromozomu haploskupiny O a revidované fylogenetické polohy mutací P164 a PK4“. European Journal of Human Genetics. 19 (9): 1013–1015. doi:10.1038 / ejhg.2011.64. PMC  3179364. PMID  21505448.
  8. ^ A b C d E F G h i j k l m n Ó str q r s t u proti w Xue, Yali; Zerjal, Tatiana; Bao, Weidong; Zhu, Suling; Shu, Qunfang; Xu, Jiujin; Du, Ruofu; Fu, Songbin; Li, Pu; Hurles, Matthew E .; Yang, Huanming; Tyler-Smith, Chris (duben 2006). „Demografie mužů ve východní Asii: kontrast mezi severem a jihem v dobách expanze lidské populace“. Genetika. 172 (4): 2431–2439. doi:10.1534 / genetika.105.054270. PMC  1456369. PMID  16489223.
  9. ^ A b Gayden, Tenzin; Cadenas, Alicia M .; Regueiro, Maria; Singh, Nanda B .; Zhivotovsky, Lev A .; Underhill, Peter A .; Cavalli-Sforza, Luigi L .; Herrera, Rene J. (2007). „Himálaj jako směrová bariéra toku plynu“. American Journal of Human Genetics. 80 (5): 884–894. doi:10.1086/516757. PMC  1852741. PMID  17436243.
  10. ^ Reddy, BM; Langstieh, BT; Kumar, V; Nagaraja, T; Reddy, ANS; et al. (2007). „Austro-asijské kmeny severovýchodní Indie poskytují dosud chybějící genetické spojení mezi jižní a jihovýchodní Asií“. PLOS ONE. 2 (11): e1141. Bibcode:2007PLoSO ... 2.1141R. doi:10.1371 / journal.pone.0001141. PMC  2065843. PMID  17989774.
  11. ^ Kumar, Vikrant; Reddy, Arimanda NS; Babu, Jagedeesh P; et al. (2007). „Důkazy chromozomu Y naznačují společné otcovské dědictví rakousko-asijských populací“. BMC Evoluční biologie. 2007 (7): 47. doi:10.1186/1471-2148-7-47. PMC  1851701. PMID  17389048.
  12. ^ Debnath, Monojit; Palanichamy, Malliya G; Mitra, Bikash; Jin, Jie-Qiong; Chaudhuri, Tapas K; Zhang, Ya-Ping (2011). „Diverzita haploskupin Y-chromozomu v populacích subhimálajských Terai a Duars ve východní Indii“. Journal of Human Genetics. 56 (11): 765–771. doi:10.1038 / jhg.2011.98. PMID  21900945.
  13. ^ Peter A. Underhill, Peidong Shen, Alice A. Lin et al.„Variace sekvence chromozomu Y a historie lidských populací,“ Genetika přírody • Svazek 26 • Listopad 2000
  14. ^ YFull Haplogroup YTree v5.08 dne 14. listopadu 2017
  15. ^ Jin Park, Myung; Young Lee, Hwan; Young Kim, Na; Young Lee, Eun; Ick Yang, Woo; Shin, Kyoung-Jin (2013). „Miniplexy Y-SNP pro stanovení východoasijské Y-chromozomální haploskupiny v degradované DNA“. Forensic Science International: Genetics. 7 (1): 75–81. doi:10.1016 / j.fsigen.2012.06.014. PMID  22818129.
  16. ^ A b C d Di Cristofaro, J; Pennarun, E; Mazières, S; Myres, NM; Lin, AA; et al. (2013). „Afghan Hindu Kush: Where Euroasian Sub-Continent Gene Flows Converge“. PLOS ONE. 8 (10): e76748. Bibcode:2013PLoSO ... 876748D. doi:10.1371 / journal.pone.0076748. PMC  3799995. PMID  24204668.
  17. ^ A b Cai, X; Qin, Z; Wen, B; Xu, S; Wang, Y; et al. (2011). „Lidská migrace přes úzká místa z jihovýchodní Asie do východní Asie během posledního glaciálního maxima odhaleného chromozomy Y“. PLOS ONE. 6 (8): e24282. Bibcode:2011PLoSO ... 624282C. doi:10.1371 / journal.pone.0024282. PMC  3164178. PMID  21904623.
  18. ^ A b Wibhu Kutanan, Jatupol Kampuansai, Metawee Srikummool, Andrea Brunelli, Silvia Ghirotto, Leonardo Arias, Enrico Macholdt, Alexander Hübner, Roland Schröder a Mark Stoneking (2019), „Kontrastní otcovské a mateřské genetické historie thajské a laoské populace.“
  19. ^ A b Brunelli, A; Kampuansai, J; Seielstad, M; Lomthaisong, K; Kangwanpong, D; Ghirotto, S; et al. (2017). „Y chromozomální důkazy o původu obyvatel severního Thajska“. PLOS ONE. 12 (7): e0181935. Bibcode:2017PLoSO..1281935B. doi:10.1371 / journal.pone.0181935. PMC  5524406. PMID  28742125.

Zdroje

Články v časopisech