HLA-A69 - HLA-A69 - Wikipedia

HLA-A69
(MHC třída I, A antigen na povrchu buňky)
Ilustrace HLA-A.png
HLA-A69
O
Proteintransmembránový receptor /ligand
Strukturaαβ heterodimer
PodjednotkyHLA-A *69--, β2-mikroglobulin
Starší jménaA28
Podtypy
Podtyp
alela
Dostupné struktury
A69*6901
{{{cNick2}}}* 69 {{{{cAllele2}}}
{{{{cNick3}}}* 69 {{{{cAllele3}}}
{{{cNick4}}}* 69 {{{{cAllele4}}}
Alleles link-out to IMGT / HLA databáze na EBI

HLA-A69 (A69) je a lidský leukocytový antigen sérotyp v rámci HLA-A sérotypová skupina. Sérotyp je určen rozpoznáním protilátky pomocí protilátky69 podmnožina α-řetězců HLA-A. U A69 je řetězec alfa „A“ kódován HLA-A*69 alelová skupina a β-řetězec jsou kódovány B2M místo.[1] V této skupině v současné době dominuje A * 6901. A69 a A*69 jsou významově téměř synonymní. A69 je a split antigen z široký antigen sérotyp A28. A69 je sesterský sérotyp A68.

Další informace: Historie a pojmenování lidských leukocytových antigenů

A69 je častější v Levant. A69 (A * 6901) je derivát alely A * 6801, který prošel genová konverze s A * 02. K rekombinaci došlo před více než 330 000 lety[2].

Sérotyp

Rozpoznání A69 některých genových produktů HLA A * 69[3]
A * 69A69A28A68A2Vzorek
alela%%%%velikost (N)
*690175636289

A69 je špatná, s nízkou specifickou detekcí, vysokou nespecifickou identifikací pomocí A28 a falešným rozpoznáním pomocí A68 a A2.

Rozdělení

Frekvence HLA A * 6901
frekvence
ref.Populace(%)
[4]North Isl. (Kapverdy)4.0
[5]Druse-Arab (Izrael)3.0
[4]Jižní ostrov (Kapverdy)2.4
[6]Mossi (Burkino Faso)1.9
[7]Bulharsko1.8
[8]Žid (Izrael)1.2
[9]Tunis (Tunisko)1.1
[10]Bergamo (Itálie)1.1
[11]N. Dillí (Indie)1.1
[12]Ammán (Jordon)1.0
[13]Sardinie (Itálie)1.0
[14]Střední Portugalsko1.0
[14]Šanghaj, Čína)0.7
[15]Girona (Katalánsko, Španělsko)0.6
[16]Baloch (Írán)0.6
[14]Řecko0.6
[14]čeština0.5
[14]SE Francie0.4
[17]Kampala (Uganda)0.3
[14]N. Řecko0.3
[14]Rumunsko0.3
[14]súdánský0.25
[14]U. Arab vzniká0.25
[14]Japonsko0.0
[14]Chorvatsko0.0
[14]Severní Irsko0.0
[14]Zambie0.0
[14]Luo (Keňa)0.0
[14]Nandi (Keňa)0.0
[14]Bandiagara (Mali)0.0

Distribuce uzlů A69 v uzlovém centru v Levant, ale vysoké úrovně v západní Afrika. Model lidského genetického původu umisťuje první migrace z východní Afriky. U mnoha východoafrických populací je však frekvence A69 nulová. Důslednějším modelem distribuce A69 je buď následná migrace ze západní Afriky, podporovaná A36 a HLA DR3-DQ2. Vyšší úrovně v Gaza Palestinci tuto hypotézu podporují.

Sdružení nemocí

A69 mohou být spojeny s sarkoidóza.[18]

Reference

  1. ^ Arce-Gomez B, Jones EA, Barnstable CJ, Solomon E, Bodmer WF (únor 1978). „Genetická kontrola antigenů HLA-A a B u hybridů somatických buněk: požadavek na beta2 mikroglobulin“. Tkáňové antigeny. 11 (2): 96–112. doi:10.1111 / j.1399-0039.1978.tb01233.x. PMID  77067.
  2. ^ Holmes N, Parham P (1985). „Exon míchání in vivo může generovat nové molekuly HLA třídy I“. EMBO J.. 4 (11): 2849–2854. PMC  554588. PMID  3877632.
  3. ^ Allele Dotazový formulář IMGT / HLA - Evropský bioinformatický institut
  4. ^ A b Spínola H, Bruges-Armas J, Middleton D, Brehm A (2005). „HLA polymorfismy v Cabo Verde a Guiné-Bissau byly odvozeny ze sekvenční typizace“. Hučení. Immunol. 66 (10): 1082–1092. doi:10.1016 / j.humimm.2005.09.001. PMID  16386651.
  5. ^ Sborník z IHW Workshop, Seattle 2002, via http://www.allelefrequencies.net přes Middleton, D .; Menchaca, L .; Rood, H .; Komerofsky, R. (2003). Msgstr "Nová databáze frekvencí alel: http://www.allelefrequencies.net". Tkáňové antigeny. 61 (5): 403–407. doi:10.1034 / j.1399-0039.2003.00062.x. PMID  12753660.
  6. ^ Modiano D, Luoni G, Petrarca V a kol. (2001). „HLA třída I ve třech západoafrických etnických skupinách: genetické vzdálenosti od subsaharské a kavkazské populace“. Tkáňové antigeny. 57 (2): 128–137. doi:10.1034 / j.1399-0039.2001.057002128.x. PMID  11260507.
  7. ^ Ivanova M, Rozemuller E, Tyufekchiev N, Michailova A, Tilanus M, Naumova E (2002). „HLA polymorfismus u Bulharů definovaný metodami psaní s vysokým rozlišením ve srovnání s jinými populacemi“. Tkáňové antigeny. 60 (6): 496–504. doi:10.1034 / j.1399-0039.2002.600605.x. PMID  12542743.
  8. ^ Maccabi Healthcare Services Histocompatibility Dept. Izrael, registr kostní dřeně, přes http://www.allelefrequencies.net
  9. ^ Hajjej A, Kâabi H, Sellami MH a kol. (2006). „Příspěvek alel a haplotypů HLA třídy I a II k vyšetřování evoluční historie Tunisanů“. Tkáňové antigeny. 68 (2): 153–162. doi:10.1111 / j.1399-0039.2006.00622.x. PMID  16866885.
  10. ^ DW, Gjertson; PI, Terasaki (1998). HLA 1998: sborník z dvanáctého mezinárodního workshopu a konference o histopatibilitě. ASHI. přes http://www.allelefrequencies.net
  11. ^ Rani R, Marcos C, Lazaro AM, Zhang Y, Stastny P (2007). "Molekulární diverzita alel HLA-A, -B a -C v severoindické populaci, jak je stanoveno pomocí PCR-SSOP". Int. J. Immunogenet. 34 (3): 201–208. doi:10.1111 / j.1744-313X.2007.00677.x. PMID  17504510.
  12. ^ Sánchez-Velasco P, Karadsheh NS, García-Martín A, Ruíz de Alegría C, Leyva-Cobián F (2001). "Molekulární analýza alelických frekvencí a haplotypů HLA u Jordánců a srovnání s jinými příbuznými populacemi". Hučení. Immunol. 62 (9): 901–909. doi:10.1016 / S0198-8859 (01) 00289-0. PMID  11543892.
  13. ^ Grimaldi MC, Crouau-Roy B, Amoros JP a kol. (2001). „Ostrovy západního Středomoří (Korsika, Baleárské ostrovy, Sardinie) a populace Baskicka: příspěvek molekulárních markerů HLA třídy I k jejich evoluční historii“. Tkáňové antigeny. 58 (5): 281–292. doi:10.1034 / j.1399-0039.2001.580501.x. PMID  11844138.
  14. ^ A b C d E F G h i j k l m n Ó str Middleton, D .; Menchaca, L .; Rood, H .; Komerofsky, R. (2003). Msgstr "Nová databáze frekvencí alel: http://www.allelefrequencies.net". Tkáňové antigeny. 61 (5): 403–407. doi:10.1034 / j.1399-0039.2003.00062.x. PMID  12753660.
  15. ^ Comas D, Mateu E, Calafell F a kol. (1998). "Typizace DNA HLA třídy I a II a původ Basků". Tkáňové antigeny. 51 (1): 30–40. doi:10.1111 / j.1399-0039.1998.tb02944.x. PMID  9459501.
  16. ^ Farjadian S, Naruse T, Kawata H, Ghaderi A, Bahram S, Inoko H (2004). "Molekulární analýza frekvencí a haplotypů alel HLA v Íránu Baloch ve srovnání s příbuznými populacemi Pákistánu". Tkáňové antigeny. 64 (5): 581–587. doi:10.1111 / j.1399-0039.2004.00302.x. PMID  15496201.
  17. ^ Cao K, Moormann AM, Lyke KE a kol. (2004). „Diferenciaci mezi africkými populacemi dokazuje rozmanitost alel a haplotypů lokusů HLA třídy I“. Tkáňové antigeny. 63 (4): 293–325. doi:10.1111 / j.0001-2815.2004.00192.x. PMID  15009803.
  18. ^ Bilir M, Sipahi S, Yilmaz E a kol. (2007). "Analýza HLA antigenů u pacientů s tureckou sarkoidózou". Jižní. Med. J. 100 (4): 356–359. doi:10.1097 / SMJ.0b013e31802f3763. PMID  17458393.