Dekarboxylázy závislé na pyridoxalu skupiny IV - Group IV pyridoxal-dependent decarboxylases - Wikipedia
| Dekarboxyláza závislá na pyridoxalu, vazebná doména pyridoxalu | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 krystalová struktura d, l-lysinového komplexu diaminopimelát dekarboxylázy | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Orn_Arg_deC_N | ||||||||
| Pfam | PF02784 | ||||||||
| Pfam klan | CL0036 | ||||||||
| InterPro | IPR022644 | ||||||||
| STRÁNKA | PDOC00685 | ||||||||
| SCOP2 | 1qu4 / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
| Dekarboxyláza závislá na pyridoxalu, doména C-terminálního listu | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 mutant dimerního rozhraní ornithin dekarboxylázy odhaluje strukturu meziproduktu drahokam diaminu | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Orn_DAP_Arg_deC | ||||||||
| Pfam | PF00278 | ||||||||
| InterPro | IPR022643 | ||||||||
| STRÁNKA | PDOC00685 | ||||||||
| SCOP2 | 1qu4 / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
V molekulární biologii pyridoxal-dependentní dekarboxylázy skupiny IV plocha rodina z enzymy zahrnující ornithin dekarboxyláza ES 4.1.1.17, lysin dekarboxyláza ES 4.1.1.18, arginin dekarboxyláza ES 4.1.1.19 a diaminopimelát dekarboxylázaES 4.1.1.20.[1] Je také známá jako skupina dekarboxylázy Orn / Lys / Arg třídy II.
Pyridoxal-5'-fosfát -závislý aminokyselina dekarboxylázy lze rozdělit na čtyři skupiny na základě aminokyselinová sekvence. Skupina IV zahrnuje eukaryotický ornitin a lysin dekarboxyláza a prokaryotický biosyntetický Typ arginin dekarboxyláza a diaminopimelát dekarboxyláza.[1]
Členové této rodiny, i když s největší pravděpodobností evoluční související, nesdílejte rozsáhlé oblasti podobností sekvencí. The bílkoviny obsahovat a konzervovaný lysin zbytek, který je známý v myš ODC je místem připojení pyridoxal-fosfátové skupiny.[2] The bílkoviny také obsahují úsek tří po sobě jdoucích glycin zbytky a bylo navrženo, aby byla součástí a Podklad -vázací oblast.[3]
Viz také
- Dekarboxylázy závislé na pyridoxalu skupiny I
- Dekarboxylázy závislé na pyridoxalu skupiny II
- Dekarboxylázy závislé na pyridoxalu skupiny III
Reference
- ^ A b Sandmeier E, Hale TI, Christen P (květen 1994). "Mnohočetný evoluční původ pyridoxal-5'-fosfát-dependentních aminokyselinových dekarboxyláz". Eur. J. Biochem. 221 (3): 997–1002. doi:10.1111 / j.1432-1033.1994.tb18816.x. PMID 8181483.
- ^ Poulin R, Lu L, Ackermann B, Bey P, Pegg AE (leden 1992). "Mechanismus ireverzibilní inaktivace myší ornithin dekarboxylázy alfa-difluormethylornithinem. Charakterizace sekvencí na inhibitoru a vazebných místech koenzymu". J. Biol. Chem. 267 (1): 150–8. PMID 1730582.
- ^ Moore RC, Boyle SM (srpen 1990). "Nukleotidová sekvence a analýza genu speA kódujícího biosyntetickou arginin dekarboxylázu v Escherichia coli". J. Bacteriol. 172 (8): 4631–40. doi:10.1128 / jb.172.8.4631-4640.1990. PMC 213298. PMID 2198270.