Galectin-4 - Galectin-4

LGALS4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1X50, 4YLZ, 4RM0, 4YM1, 4YM2, 4YM3, 5CBL, 5DUW, 4XZP, 5 DUX, 5 DUU, 5DUV
Identifikátory
Aliasy	LGALS4, GAL4, L36LBP, galektin 4
Externí ID	OMIM: 602518 MGI: 107536 HomoloGene: 21239 Genové karty: LGALS4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	38,812,945 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	28,841,708 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba galaktosidu; • vázání sacharidů;
Buněčná složka	• cytosol; • buněčná membrána; • extracelulární; • extracelulární matrix obsahující kolagen;
Biologický proces	• buněčná adheze;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3960
	16855
	ENSG00000171747; ENSG00000282992
	ENSMUSG00000053964
	P56470
	Q8K419
	NM_006149
	NM_010706
	NP_006140
	NP_034836
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Galectin -4 je protein že u lidí je kódován LGALS4 gen.^[5]^[6]

Galektiny jsou rodinou proteinů vázajících beta-galaktosidy, které se podílejí na modulaci interakcí mezi buňkami a buňkami a matricemi. LGALS4 je lektin typu S, který je silně podexprimován u kolorektálního karcinomu. 323-aminokyselinový protein LGALS4 obsahuje dvě homologní, přibližně 150-aminokyselinové rozpoznávací domény sacharidů a všechny aminokyseliny obvykle konzervované v galektinech.^[6]

Struktura

Gal 4 patří do rodiny galektin. Mezi různé struktury galektinů jako dimerní, tandem nebo chiméra, Gal-4 je ve své struktuře tandemový, takže obsahuje alespoň dva odlišné uhlohydrát rozpoznávání domén (CRD) v rámci jedné polypeptid, tedy se říká, že jsou skutečně dvojmocný. CRD jsou spojeny s malým peptid doména.^[7]

Název proteinu

Doporučený název: Galectin-4, zkrácený název: Gal-4 Alternativní název (názvy):^[8]

Antigen NY-CO-27L-36 protein vázající laktózu, zkrácený název: L36L lektin vázající laktózu 4

Místo (v lidském těle)

Gal-4 se obecně nachází v žaludek a střevo.

Funkce

Gal-4 má vazebnou schopnost s vysokou afinita na lipid vory naznačující roli v protein dodání do buněk

Navíc mohou provádět následující Fyziologické funkce:

Gal-4 zvyšuje stabilizaci lipidového voru

Gal-4 se účastní apikální obchodování

Gal-4 má baktericidní aktivitu proti bakterie vyjadřování krevní skupina antigen

Gal-4 podporuje střevní rána léčení

Gal-4 podporuje růst axon a myelinizace v neuron^[9]

Klinický význam

Gal-4 a rakovina

Gal-4, který byl detekován u mnoha rakovina se podílí na vývoji a sledu karcinom pankreatu, hepatocelulární karcinom, Kolorektální karcinom (CRC), karcinom prsu, rakovina žaludku, a rakovina plic (Rechreche et al., 1997; Hippo et al., 2001; Hayashi et al., 2013; Belo et al., 2013; Cai et al., 2014). Nakonec to hraje rozporuplný role v různých typech rakovinná buňka. Kromě toho byl nalezen v sérum některých pacientů s rakovinou (Kim et al., 2013; Cai et al., 2014; Barrow et al., 2011; Barrow et al., 2013). Dosud, navzdory řadě publikovaných údajů týkajících se exprese galektinu-4 u rakoviny, zůstávají dostupné informace velmi omezené. Z těchto druhů rakoviny byla výslovně odhalena pouze role galektinu-4 ve vývoji CRC.

Užitečnost CEA (karcinoembryonální antigen) a CA19-9 jako kolorektálního karcinomu (CRC) markery je omezený a vývoj dalších spolehlivých značek je předmětem šetření. Cirkulující hladiny galektinu-1 / -3 / -4 v CRC pacientů byly významně vyšší ve srovnání s kontrolami. Hladiny Gal-1 a gal-4 se významně snížily chirurgická operace (P <0,01) a hladina gal-4 u většiny pacientů klesla pod mezní hodnotu. Úrovně cirkulujícího gal-4 se významně zvýšily nádor stádium postupovalo (P <0,001), zatímco u galektinu-1 byly od raného stadia relativně vysoké. Kombinované použití gal-4 s CEA a / nebo CA19-9 výrazně zvýšilo podíl pacientů s CRC, kteří byli pozitivní na nádorové markery (z 33,3 na 59,0% pro CEA a ze 17,1 na 51,4% pro CA19-9). Naše data ukazují, že galectin-4 může být nádorovým markerem pro použití při sledování pacientů, zatímco galectin-1 by mohl být použit pro screening nádoru. Zejména galectin-4 může být užitečný jako a doplňkový marker v kombinaci s CEA / CA19-9 ke zlepšení sledování CRC^[10]

.

Gal-4 a střevní zánět

Bylo prokázáno, že Gal-4 zhoršuje stav střevního zánětu přímou indukcí CD4 + T buňky (shluk diferenciace 4) produkovat IL-6 (Interleukin) TCR (Receptor T-buněk) model mutační kolitidy (Hokama et al., 2004). IL-6, dobře známý zánětlivý cytokin, mohl zhoršovat střevní zánět v přítomnosti postižených slizniční bariéra nebo zranění na sliznici. Dále bylo potvrzeno, že IL-6 zvyšuje expresi B-buněčný lymfom -2 (Bcl-2) a extra velký lymfom B-buněk (Bcl-xl) aktivací STAT3 (Převodník signálu a aktivátor transkripce) signální dráhy, čímž inhibuje apoptózu CD4 + T buněk a vede k udržitelnému rozvoji IBD (Atreya et al., 2000; Allocca et al., 2013; Waldner a Neurath, 2014). Gal-4 může přímo interagovat s CD4 + T buňkami prostřednictvím vazby na imunologické synapse, což je specifický aktivátor protein kináza C. (PKC) θ-sdružená signalizace kaskáda v lipidovém voru (Hokama et al., 2004; Nagahama et al., 2008). Prostřednictvím aktivace PKC -asociovaná dráha, galektin-4 stimuluje produkci IL-6, a proto zhoršuje střevní zánět. Každopádně není jisté, který receptor konkrétně na intestinálních CD4 + T buňkách křížové odkazy s gal-4. Bylo zjištěno, že indukovatelný glycit asociovaný s kolitidou (CAG), který obsahuje nezralý (nesialylovaný) core-10 O-glykan exprimovaný CD4 + T buňkami, byl identifikován jako ligand gal-4 za střevních zánětlivých stavů (Nishida et al., 2012). Gal-4 tedy může aktivovat PKCθ vazbou na CAG a poté přispívat ke zhoršení kolitidy. V souladu s tím bylo prokázáno, že gal-4, který vykazuje vysokou afinitu k nezralému O-glykanu (Ideo a kol., 2002; Blixt a kol., 2004), zhoršuje experimentální chronickou kolitidu (Hokama a kol., 2004). Paclik D a kol. prokázali, že gal-4 může indukovat apoptózu T buněk vazbou na CD3 epitop na povrchu T buněk na modelu kolitidy divokého typu. Jakmile se gal-4 naváže na tento epitop, podporuje apoptózu T buněk způsobem závislým na kalpainu a snižuje sekreci cytokinů včetně IL-6, IL-8, IL-10, a IL-17 a poté vylepšit zánět (Paclik et al., 2008a). Další výzkum zjistil, že role gal-4 se u různých experimentálních modelů kolitidy lišila (Mathieu et al., 2008). Na základě stávajících údajů můžeme konstatovat, že gal-4 může zhoršit střevní zánět v modelu TCR mutační kolitidy, zatímco zmírnit střevní zánět v modelu divokého typu kolitidy^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000282992 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000171747, ENSG00000282992 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000053964 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Barondes SH, Cooper DN, Gitt MA, Leffler H (září 1994). "Galektiny. Struktura a funkce velké rodiny zvířecích lektinů". J Biol Chem. 269 (33): 20807–10. PMID 8063692.
^ ^A ^b „Entrez Gene: LGALS4 lektin, vázající galaktosid, rozpustný, 4 (galectin 4)“.
^ Cao, Zhan-Qi; Guo, Xiu-Li (květen 2016). „Role galektinu-4 ve fyziologii a nemocech“. Protein & Cell. 7 (5): 314–324. doi:10.1007 / s13238-016-0262-9. ISSN 1674-800X. PMC 4853315. PMID 27017379.
^ Cao, Zhan-Qi; Guo, Xiu-Li (květen 2016). „Role galektinu-4 ve fyziologii a nemocech“. Protein & Cell. 7 (5): 314–324. doi:10.1007 / s13238-016-0262-9. ISSN 1674-800X. PMC 4853315. PMID 27017379.
^ Nishimura (01.05.2011). „Klinický význam cirkulujících galektinů jako markerů kolorektálního karcinomu“. Zprávy o onkologii. 25 (5). doi:10.3892 / nebo 2011.1198. ISSN 1021-335X. PMID 21369702.
^ Nishimura (01.05.2011). „Klinický význam cirkulujících galektinů jako markerů kolorektálního karcinomu“. Zprávy o onkologii. 25 (5). doi:10.3892 / nebo 2011.1198. ISSN 1021-335X. PMID 21369702.
^ Nishimura (01.05.2011). „Klinický význam cirkulujících galektinů jako markerů kolorektálního karcinomu“. Zprávy o onkologii. 25 (5). doi:10.3892 / nebo 2011.1198. ISSN 1021-335X. PMID 21369702.

Další čtení

Huflejt ME, Jordan ET, Gitt MA a kol. (1997). „Překvapivě odlišná lokalizace galektinu-3 a galektinu-4 v lidských buňkách T84 adenokarcinomu tlustého střeva. Galektin-4 je lokalizován v místech buněčné adheze“. J. Biol. Chem. 272 (22): 14294–303. doi:10.1074 / jbc.272.22.14294. PMID 9162064.
Rechreche H, Mallo GV, Montalto G a kol. (1997). „Klonování a exprese mRNA lidského galectinu-4, lektinu typu S down-regulovaného u kolorektálního karcinomu“. Eur. J. Biochem. 248 (1): 225–30. doi:10.1111 / j.1432-1033.1997.00225.x. PMID 9310382.
Ideo H, Seko A, Ohkura T a kol. (2002). „Vysokoafinitní vazba rekombinantního lidského galectinu-4 na SO (3) (-) -> 3Galbeta1 -> 3GalNAc pyranosid“. Glykobiologie. 12 (3): 199–208. doi:10.1093 / glycob / 12.3.199. PMID 11971864.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Ideo H, Seko A, Yamashita K (2005). „Galectin-4 se váže na sulfátované glykosfingolipidy a karcinoembryonální antigen ve skvrnách na buněčném povrchu buněk lidského adenokarcinomu tlustého střeva“. J. Biol. Chem. 280 (6): 4730–7. doi:10,1074 / jbc.M410362200. PMID 15546874.
Delacour D, Gouyer V, Zanetta JP a kol. (2005). „Galectin-4 a sulfatidy v apikálním přenosu membrány v buňkách podobných enterocytům“. J. Cell Biol. 169 (3): 491–501. doi:10.1083 / jcb.200407073. PMC 2171948. PMID 15883199.
Stowell SR, Karmakar S, Stowell CJ a kol. (2007). „Lidský galectin-1, -2 a -4 indukuje povrchovou expozici fosfatidylserinu v aktivovaných lidských neutrofilech, ale nikoli v aktivovaných T buňkách.“. Krev. 109 (1): 219–27. doi:10.1182 / krev-2006-03-007153. PMC 1785076. PMID 16940423.
Ideo H, Seko A, Yamashita K (2007). "Rozpoznávací mechanismus galektinu-4 pro cholesterol 3-sulfát". J. Biol. Chem. 282 (29): 21081–9. doi:10,1074 / jbc.M703770200. PMID 17545668.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000282992 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000171747, ENSG00000282992 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000053964 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8063692-5] Barondes SH, Cooper DN, Gitt MA, Leffler H (září 1994). "Galektiny. Struktura a funkce velké rodiny zvířecích lektinů". J Biol Chem. 269 (33): 20807–10. PMID 8063692.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: LGALS4 lektin, vázající galaktosid, rozpustný, 4 (galectin 4)“.

[7] Cao, Zhan-Qi; Guo, Xiu-Li (květen 2016). „Role galektinu-4 ve fyziologii a nemocech“. Protein & Cell. 7 (5): 314–324. doi:10.1007 / s13238-016-0262-9. ISSN 1674-800X. PMC 4853315. PMID 27017379.

[8] Cao, Zhan-Qi; Guo, Xiu-Li (květen 2016). „Role galektinu-4 ve fyziologii a nemocech“. Protein & Cell. 7 (5): 314–324. doi:10.1007 / s13238-016-0262-9. ISSN 1674-800X. PMC 4853315. PMID 27017379.

[9] Nishimura (01.05.2011). „Klinický význam cirkulujících galektinů jako markerů kolorektálního karcinomu“. Zprávy o onkologii. 25 (5). doi:10.3892 / nebo 2011.1198. ISSN 1021-335X. PMID 21369702.

[10] Nishimura (01.05.2011). „Klinický význam cirkulujících galektinů jako markerů kolorektálního karcinomu“. Zprávy o onkologii. 25 (5). doi:10.3892 / nebo 2011.1198. ISSN 1021-335X. PMID 21369702.

[11] Nishimura (01.05.2011). „Klinický význam cirkulujících galektinů jako markerů kolorektálního karcinomu“. Zprávy o onkologii. 25 (5). doi:10.3892 / nebo 2011.1198. ISSN 1021-335X. PMID 21369702.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]