Epoxid hydroláza 3 - Epoxide hydrolase 3
EPHX3 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikátory | |||||||||||||||||||||||||
Aliasy | EPHX3, ABHD9, EH3, epoxid hydroláza 3 | ||||||||||||||||||||||||
Externí ID | OMIM: 617400 MGI: 1919182 HomoloGene: 69386 Genové karty: EPHX3 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortology | |||||||||||||||||||||||||
Druh | Člověk | Myš | |||||||||||||||||||||||
Entrez | |||||||||||||||||||||||||
Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
UniProt | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (protein) | |||||||||||||||||||||||||
Místo (UCSC) | Chr 19: 15,23 - 15,23 Mb | Chr 17: 32,18 - 32,19 Mb | |||||||||||||||||||||||
PubMed Vyhledávání | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
|
Epoxid hydroláza 3 (ABHD9, EH3, EPHX3), kódováno EPHX3 gen, je třetí definovaný isozym v sadě epoxid hydroláza isozymy, tj epoxidové hydrolázy. Tato sada obsahuje Mikrozomální epoxid hydroláza (také označovaná jako epoxid hydroláza 1, EPHX1, mEH a EH1); the epoxid hydroláza 2 (také nazývaná rozpustná epoxidhydroláza, EPHX2, sEH a EH2); a mnohem méně dobře definovaná enzymaticky epoxid hydroláza 4 (také označovaná jako ABHD7 a EH4). Všechny čtyři enzymy obsahují Skládání alfa / beta hydrolázy což naznačuje, že ano Hydrolýza aktivita. Ukázalo se, že EH1, EH2 a EH3 mají takovou aktivitu, že přidávají vodu epoxidy z nenasycené mastné kyseliny tvořit vicinální cis (viz cis-trans izomerismus ) produkty; aktivita EH4 nebyla hlášena. První tři EH se liší v subcelulárním umístění, vzorcích tkáňové exprese, preferencích substrátu a tím i funkcích. Mezi tyto funkce patří omezení biologického působení určitých epoxidů mastných kyselin, zvýšení toxicity jiných epoxidů mastných kyselin a přispívání k metabolismu léčiv a dalších látek. xenobiotika.
Dějiny
EH3 byl poprvé pojmenován ABHD9 kvůli jeho vlastnictví konkrétního Proteinová doména, Skládání alfa / beta hydrolázy nebo skládaná doména a / p hydrolázy. Tato doména se vyskytuje u více než 30 dalších lidí hydrolytické enzymy včetně čtyř epoxidových hydroláz. Gen pro EH3 (EPHX3) byl objeven na lokusu chromozomu 19p13.13 při sekvenování člověka.genom [5] Na základě své aminokyselinové sekvence se předpokládalo, že kóduje protein s doménou fold / α / p hydrolázy; kódovaný protein byl proto nazván ABHD9.[6] Asi o 10 let později byl definován ABHD9, který má schopnost hydrolyzovat určité epoxidy mastných kyselin.[7][8]
Výraz
Podobně jako mEH, ale na rozdíl od sEH je EH3 enzym vázaný na membránu. Na základě vyjádření jeho mRNA v myší tkáni má EH3 velmi odlišnou distribuci než mEH nebo sEH: exprese EH3 je vysoká v kůži, plicích, jazyku, jícnu a žaludku; meziprodukt v pankreatu a oku, viscerální tuk, lymfatické uzliny, slezina, klenba aorty a srdce; nízký obsah jater, ledvin, varlat, vaječníků a mozku; a velmi málo v kosterním svalu.[7][8] Jeho exprese v lidských tkáních dosud nebyla hlášena.
Činnost a funkce
ABHD9 nejprve upozornil na studie, které potvrdily, že jeho gen, EPHX3, byl hypermethylován CpG stránky v jeho Promotér (genetika) v lidských tkáních rakoviny prostaty, zejména v tkáních pokročilejších nebo na základě morfologických kritérií (tj. Gleason skóre ), agresivnější nemoci. To umožňuje, aby umlčení genů EPHX3 v důsledku hypermethylace promotoru může přispět k nástupu a / nebo progresi rakoviny prostaty.[9] Byly ověřeny podobné hypermethylace místa CpG v promotoru EPHX3 kolorektální adenokarcinomy.[10] Podobný methylační vzor promotoru, i když dosud nebyl ověřen, byl nalezen také u lidských maligních nádorů melanom papírové kapesníky[11] a lidské rakovina žaludku buněčné linie.[12] Tyto studie umožňují, ale rozhodně neprokazují, že umlčení EPHX (tj. Neschopnost vyjádřit se jako protein ABHD9) se podílí na vývoji a / nebo progresi určitých druhů rakoviny u lidí.
Nověji byl ABHD9 charakterizován jako mající aktivitu epoxyhydrolázy pro metabolizaci epoxyeikosatrienové kyseliny (EET) a epoxidy kyselina linolová (tj. vernolové kyseliny [také nazývané leukotoxiny] k jejich odpovídajícím diolům.[7] Například metabolizuje jeden konkrétní EET (kyselina 14,15-epoxy-5Z, 8Z, 11Z-eikosatrienová) následovně:
14,15-epoxy-5Z,8Z,11Zkyselina eikosatrienová + H2O → 14,15-dihydroxy-5Z,8Z,11Z-eikosatrienová kyselina
V této konkrétní reakci enzym inaktivuje EET a tím může fungovat tak, že omezí biologickou aktivitu tohoto i ostatních EET, na které působí, například při regulaci krevního tlaku (viz epoxyeikosatrienové kyseliny. Při hydrolýze jeden izomer kyseliny vernolové (kyselina 12S, 13R-epoxy-cis-9-oktadecenová)
12S,13R-epoxy-cis-9-oktadecenová kyselina + H2O → 12S,13R-dihydroxy-9Z-oktadecenové kyseliny
na diol však enzym zvyšuje svoji toxicitu například tím, že přispívá k akutní respirační tísňové syndromy (vidět kyselina vernolová ).[7][8] Enzym tak může fungovat tak, aby omezoval buněčná signalizace aktivita EET přesto přispívá k toxickému působení epoxidů kyseliny linolové.
Zatímco mEH a v menší míře sEH metabolizují léky, cizí toxické chemikálie a určité endogenní sloučeniny, které nejsou jednoduchými mastnými kyselinami (viz Mikrozomální epoxid hydroláza a epoxid hydroláza 2 ), aktivita EH3 na těchto substrátech, i když je pravděpodobná, dosud nebyla hlášena.
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000105131 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000037577 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Zpráva o symbolu EPHX3 | Výbor pro genovou nomenklaturu HUGO“. genenames.org. Citováno 2016-04-30.
- ^ Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS a kol. (Prosinec 2002). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- ^ A b C d Decker M, Adamska M, Cronin A, Di Giallonardo F, Burgener J, Marowsky A, Falck JR, Morisseau C, Hammock BD, Gruzdev A, Zeldin DC, Arand M (říjen 2012). „EH3 (ABHD9): první člen nové rodiny epoxidhydrolázy s vysokou aktivitou pro epoxidy mastných kyselin“. Journal of Lipid Research. 53 (10): 2038–45. doi:10.1194 / jlr.M024448. PMC 3435537. PMID 22798687.
- ^ A b C Morisseau C (leden 2013). „Role epoxidových hydroláz v metabolismu lipidů“. Biochimie. 95 (1): 91–5. doi:10.1016 / j.biochi.2012.06.011. PMC 3495083. PMID 22722082.
- ^ Stott-Miller M, Zhao S, Wright JL, Kolb S, Bibikova M, Klotzle B, Ostrander EA, Fan JB, Feng Z, Stanford JL (červenec 2014). „Validační studie genů s hypermethylovanými promotorovými oblastmi spojenými s recidivou rakoviny prostaty“. Epidemiologie rakoviny, biomarkery a prevence. 23 (7): 1331–9. doi:10.1158 / 1055-9965.EPI-13-1000. PMC 4082437. PMID 24718283.
- ^ Oster B, Thorsen K, Lamy P, Wojdacz TK, Hansen LL, Birkenkamp-Demtröder K, Sørensen KD, Laurberg S, Orntoft TF, Andersen CL (prosinec 2011). "Identifikace a validace vysoce časté hypermethylace ostrova CpG u kolorektálních adenomů a karcinomů". International Journal of Cancer. 129 (12): 2855–66. doi:10.1002 / ijc.25951. PMID 21400501. S2CID 35078536.
- ^ Furuta J, Nobeyama Y, Umebayashi Y, Otsuka F, Kikuchi K, Ushijima T (červen 2006). „Umlčení peroxiredoxinu 2 a aberantní methylace 33 CpG ostrovů v domnělých promotorových oblastech u lidských maligních melanomů“. Výzkum rakoviny. 66 (12): 6080–6. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-06-0157. PMID 16778180.
- ^ Yamashita S, Tsujino Y, Moriguchi K, Tatematsu M, Ushijima T (leden 2006). "Chemický genomový screening na methylací umlčené geny v buněčných liniích rakoviny žaludku pomocí ošetření 5-aza-2'-deoxycytidinem a oligonukleotidovým mikročipem". Cancer Science. 97 (1): 64–71. doi:10.1111 / j.1349-7006.2006.00136.x. PMID 16367923. S2CID 33738798.