Doublecortin - Doublecortin

Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury

Doublecortin
	struktura řešení N-terminální dcx domény lidské kinázy podobné doublecortinu
Identifikátory
Symbol	DCX
Pfam	PF03607
InterPro	IPR003533
SCOP2	1 mil / Rozsah / SUPFAM
CDD	cd01617
Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury

DCX
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4ATU, 1 MJD, 2BQQ, 2XRP, 5 v 7, 5IOI, 5IKC, 5IP4, 5IO9
Identifikátory
Aliasy	DCX, DBCN, DC, LISX, SCLH, XLIS, doublecortin
Externí ID	OMIM: 300121 MGI: 1277171 HomoloGene: 7683 Genové karty: DCX
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	111,412,429 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	X chromozom (myš)
Konec	143,933,311 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba protein kinázy; • vazba mikrotubulů;
Buněčná složka	• buněčná projekce; • komplex spojený s mikrotubuly; • mikrotubuly; • cytoskelet; • cytosol; • neuronová projekce; • cytoplazma; • GO: 0035085 axoném;
Biologický proces	• diferenciace buněk; • vývoj nervového systému; • vývoj mnohobuněčných organismů; • vývoj centrálního nervového systému; • migrace neuronů; • GO: 0007243 transdukce intracelulárního signálu; • shromáždění axonému; • vývoj fotoreceptorových buněk; • vývoj sítnice v oku kamerového typu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1641
	13193
	ENSG00000077279
	ENSMUSG00000031285
	O43602
	O88809
NM_000555; NM_001195553; NM_178151; NM_178152; NM_178153;
	NM_001369370; NM_001369371; NM_001369372; NM_001369373; NM_001369374
	NM_001110222; NM_001110223; NM_001110224; NM_010025
NP_000546; NP_001182482; NP_835364; NP_835365; NP_835366;
	NP_001356299; NP_001356300; NP_001356301; NP_001356302; NP_001356303
	NP_001103692; NP_001103693; NP_001103694; NP_034155
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Neuronální migrační protein doublecortin, také známý jako doublin nebo lissencephalin-X je protein že u lidí je kódován DCX gen.^[5]

Funkce

Exprese doublecortinu u krysy zubatý gyrus, 21. den po porodu. Oomen a kol., 2009.^[6]

Doublecortin (DCX) je a mikrotubul - asociovaný protein exprimovaný neuronovými prekurzorovými buňkami a nezralý neurony v embryonálních a dospělých kortikálních strukturách. Neuronální prekurzorové buňky začnou exprimovat DCX, zatímco se aktivně dělí, a jejich neuronální dceřiné buňky pokračují v expresi DCX po dobu 2-3 týdnů, když buňky dozrávají do neuronů. Downregulace DCX začíná po 2 týdnech a nastává ve stejnou dobu, kdy tyto buňky začínají exprimovat NeuN, marker pro zralé neurony.^[7]

Kvůli téměř exkluzivní expresi DCX ve vývoji neuronů protein se stále více používá jako značka pro neurogeneze. Úroveň exprese DCX se skutečně zvyšuje v reakci na cvičení,^[8] a toto zvýšení nastává souběžně se zvýšením BrdU označování, což je v současné době „zlatý standard“ v měření neurogeneze.

Bylo zjištěno, že Doublecortin svázat do mikrotubul cytoskelet. In vivo a in vitro testy ukazují, že Doublecortin stabilizuje mikrotubuly a způsobuje shlukování.^[9] Doublecortin je a základní protein s izoelektrický bod 10 typických pro vazbu mikrotubulů bílkoviny.

Vyjměte myš

Dvouvrstvý hipokampus pozorovaný u Doublecortinu vyřazuje myši (pravý panel) ve srovnání s normálním hipokampem u myší divokého typu (levý panel). Obrázek extrahovaný z práce laboratoře Fiona Francis

U myší, kde byl gen Doublecortin vyřazen, kortikální vrstvy jsou stále správně vytvořeny. Nicméně hippocampi z těchto myší vykazuje dezorganizaci v oblasti CA3. Normálně jedna vrstva pyramidové buňky u mutantů je považována za dvojitou vrstvu. Tyto myši mají také odlišné chování než jejich spolužáci divokého typu a jsou epileptické.^[10]

Struktura

Podrobný sekvence analýza Doublecortinu a proteinů podobných Doublecortinu umožnila identifikaci tandemové repetice evolučně konzervované Doublecortin (DC) domén. Tyto domény se nacházejí v doméně N konec bílkovin a skládá se z tandemově opakovaných kopií přibližně 80 aminokyseliny kraj. Bylo navrženo, že se váže první DC doména Doublecortinu tubulin a zvyšuje polymeraci mikrotubulů.^[11]

Bylo prokázáno, že doublecortin ovlivňuje strukturu mikrotubulů. Mikrotubuly nukleované in vitro v přítomnosti Doublecortinu mají téměř výlučně 13 protofilament, zatímco mikrotubuly nukleované bez Doublecortinu jsou přítomny v různých velikostech.

Interakce

Bylo prokázáno, že Doublecortin komunikovat s PAFAH1B1.^[12]

Klinický význam

Doublecortin je mutovaný v X-vazbě lissencephaly a syndrom dvojité kůry a klinické projevy jsou spojeny se sexem. U mužů produkuje lissencefalie vázaná na X hladký mozek kvůli nedostatečné migraci nezralých neuronů, které normálně podporují skládání povrchu mozku. Syndrom dvojité kůry je charakterizován abnormální migrací nervové tkáně během vývoje, která má za následek dva pruhy nesprávně umístěných neuronů v subkortikální bílé, generující dvě kůry, které pojmenují syndrom; toto zjištění se obvykle vyskytuje u žen.^[13] Mutaci objevil Joseph Gleeson a Christopher A. Walsh v Bostonu.^[14]^[15]

Viz také

Lissencephaly

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000077279 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031285 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ EntrezGene 1641
^ Oomen CA, Girardi CE, Cahyadi R, Verbeek EC, Krugers H, Joëls M, Lucassen PJ (2009). „Opačné účinky časné mateřské deprivace na neurogenezi u krys samců versus samic“. PLOS ONE. 4 (1): e3675. Bibcode:2009PLoSO ... 4,3675O. doi:10,1371 / journal.pone 0003675. PMC 2629844. PMID 19180242.
^ Brown JP, Couillard-Després S, Cooper-Kuhn CM, Winkler J, Aigner L, Kuhn HG (prosinec 2003). "Přechodná exprese doublecortinu během neurogeneze dospělých". J. Comp. Neurol. 467 (1): 1–10. doi:10,1002 / kne.10874. PMID 14574675. S2CID 25315374.
^ Couillard-Despres S, vítěz B, Schaubeck S, Aigner R, Vroemen M, Weidner N, Bogdahn U, Winkler J, Kuhn HG, Aigner L (leden 2005). "Hladiny exprese doublecortinu v mozku dospělého odrážejí neurogenezi". Eur. J. Neurosci. 21 (1): 1–14. doi:10.1111 / j.1460-9568.2004.03813.x. PMID 15654838.
^ Horesh D, Sapir T, Francis F, Wolf SG, Caspi M, Elbaum M, Chelly J, Reiner O (září 1999). „Doublecortin, stabilizátor mikrotubulů“. Hučení. Mol. Genet. 8 (9): 1599–610. doi:10,1093 / hmg / 8.9.1599. PMID 10441322.
^ Nosten-Bertrand M, Kappeler C, Dinocourt C, Denis C, Germain J, Phan Dinh Tuy F, Verstraeten S, Alvarez C, Métin C, Chelly J, Giros B, Miles R, Depaulis A, Francis F (2008-06- 25). „Epilepsie u myší s knock-outem Dcx spojená s diskrétními defekty laminace a zvýšenou vzrušivostí v hipokampu“. PLOS ONE. 3 (6): e2473. Bibcode:2008PLoSO ... 3.2473N. doi:10,1371 / journal.pone.0002473. PMC 2429962. PMID 18575605.
^ Sapir T, Horesh D, Caspi M, Atlas R, Burgess HA, Wolf SG, Francis F, Chelly J, Elbaum M, Pietrokovski S, Reiner O (březen 2000). „Doublecortinové mutace klastrují v evolučně konzervovaných funkčních doménách“. Hučení. Mol. Genet. 9 (5): 703–12. doi:10,1093 / hmg / 9,5,703. PMID 10749977.
^ Caspi M, Atlas R, Kantor A, Sapir T, Reiner O (září 2000). „Interakce mezi LIS1 a doublecortinem, dvěma geny lissencephaly“. Hučení. Mol. Genet. 9 (15): 2205–13. doi:10.1093 / oxfordjournals.hmg.a018911. PMID 11001923.
^ Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM): Doublecortin - 300121
^ Gleeson JG, Allen KM, Fox JW, Lamperti ED, Berkovic S, Scheffer I, Cooper EC, Dobyns WB, Minnerath SR, Ross ME, Walsh CA (leden 1998). „Doublecortin, mozkově specifický gen mutovaný v lidské X-vázané lissencephaly a syndromu dvojité kůry, kóduje domnělý signální protein“. Buňka. 92 (1): 63–72. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80899-5. PMID 9489700.
^ Lowenstein DH (2011). „Záchvaty a epilepsie“. In Loscalzo J, Longo DL, Fauci AS, Kasper DL, Hauser SL (eds.). Harrisonovy principy interního lékařství (18. vydání). McGraw-Hill Professional. 3251–3269. ISBN 978-0-07-174889-6.

Další čtení

des Portes V, Pinard JM, Smadja D a kol. (1997). „Dominantní subkortikální laminární heterotopie a syndrom lissencephaly spojené s X (XSCLH / LIS): důkazy o výskytu mutace u mužů a mapování potenciálního lokusu v Xq22“. J. Med. Genet. 34 (3): 177–83. doi:10,1136 / jmg.34.3.177. PMC 1050888. PMID 9132485.
des Portes V, Pinard JM, Billuart P a kol. (1998). „Nový gen CNS potřebný pro migraci neuronů a zapojený do subkortikální laminární heterotopie a syndromu lissencephaly vázaného na X“. Buňka. 92 (1): 51–61. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80898-3. PMID 9489699.
Gleeson JG, Allen KM, Fox JW a kol. (1998). „Doublecortin, mozkově specifický gen mutovaný v lidské X-vázané lissencephaly a syndromu dvojité kůry, kóduje domnělý signální protein“. Buňka. 92 (1): 63–72. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80899-5. PMID 9489700.
des Portes V, Francis F, Pinard JM, et al. (1999). „doublecortin je hlavní gen způsobující X-vázanou subkortikální laminární heterotopii (SCLH)“. Hučení. Mol. Genet. 7 (7): 1063–70. doi:10,1093 / hmg / 7,7.1063. PMID 9618162.
Sossey-Alaoui K, Hartung AJ, Guerrini R a kol. (1998). „Lidský doublecortin (DCX) a homologní gen u myši kódují domnělý signální protein závislý na Ca2 +, který je mutován v lidských defektech migrace neuronů vázaných na X“. Hučení. Mol. Genet. 7 (8): 1327–32. doi:10,1093 / hmg / 7.8.1327. PMID 9668176.
Pilz DT, Matsumoto N, Minnerath S a kol. (1999). „Mutace LIS1 a XLIS (DCX) způsobují většinu klasických lissencefálií, ale různé vzorce malformací“. Hučení. Mol. Genet. 7 (13): 2029–37. doi:10,1093 / hmg / 7,13.2029. PMID 9817918.
Gleeson JG, Minnerath SR, Fox JW a kol. (1999). "Charakterizace mutací v genu pro dvojitý kortin u pacientů se syndromem dvojité kůry". Ann. Neurol. 45 (2): 146–53. doi:10.1002 / 1531-8249 (199902) 45: 2 <146 :: AID-ANA3> 3.0.CO; 2-N. PMID 9989615.
Kato M, Kimura T, Lin C a kol. (1999). „Nová mutace genu pro dvojitý kortin u japonských pacientů s lissencefalií vázanou na X a subkortikální pásovou heterotopií“. Hučení. Genet. 104 (4): 341–4. doi:10,1007 / s004390050963. PMID 10369164. S2CID 875280.
Gleeson JG, Lin PT, Flanagan LA, Walsh CA (1999). „Doublecortin je protein spojený s mikrotubuly a je široce exprimován migrujícími neurony“. Neuron. 23 (2): 257–71. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 80778-3. PMID 10399933.
Pilz DT, Kuc J, Matsumoto N a kol. (2000). „Subkortikální pásová heterotopie u vzácně postižených mužů může být způsobena missense mutacemi v DCX (XLIS) nebo LIS1“. Hučení. Mol. Genet. 8 (9): 1757–60. doi:10,1093 / hmg / 8.9.1757. PMID 10441340.
Sakamoto M, Ono J, Okada S a kol. (2000). „Genetická změna genu DCX u japonských pacientů se subkortikální laminární heterotopií nebo izolovanou lissencefální sekvencí“. J. Hum. Genet. 45 (3): 167–70. doi:10,1007 / s100380050204. PMID 10807542.
Caspi M, Atlas R, Kantor A a kol. (2001). „Interakce mezi LIS1 a doublecortinem, dvěma geny lissencephaly. Hučení. Mol. Genet. 9 (15): 2205–13. doi:10.1093 / oxfordjournals.hmg.a018911. PMID 11001923.
Matsumoto N, Leventer RJ, Kuc JA a kol. (2001). „Mutační analýza genu DCX a korelace genotypů / fenotypů v subkortikální pásové heterotopii“. Eur. J. Hum. Genet. 9 (1): 5–12. doi:10.1038 / sj.ejhg.5200548. PMID 11175293.
Demelas L, Serra G, Conti M a kol. (2001). "Neúplná penetrace s normální MRI u ženy s mutací zárodečné linie genu DCX". Neurologie. 57 (2): 327–30. doi:10.1212 / mn. 57.2.327. PMID 11468322. S2CID 6735445.
Friocourt G, Chafey P, Billuart P a kol. (2001). „Doublecortin interaguje s mu podjednotkami komplexů adaptéru clathrin ve vyvíjejícím se nervovém systému“. Mol. Buňka. Neurosci. 18 (3): 307–19. doi:10.1006 / mcne.2001.1022. PMID 11591131. S2CID 54264008.
Kato M, Kanai M, Soma O a kol. (2001). „Mutace genu pro dvojitý kortin u pacientů mužského pohlaví se syndromem dvojité kůry: somatický mozaicismus detekovaný analýzou vlasových kořenů“. Ann. Neurol. 50 (4): 547–51. doi:10.1002 / ana.1231. PMID 11601509. S2CID 18259219.
des Portes V, Abaoub L, Joannard A a kol. (2002). „Takzvané„ kryptogenní “parciální záchvaty vyplývající z jemné kortikální dysgeneze v důsledku mutace genu pro dvojitý kortin“. Záchvat: The Journal of the British Epilepsy Association. 11 (4): 273–7. doi:10.1053 / seiz.2001.0607. PMID 12027577.
Kizhatil K, Wu YX, Sen A, Bennett V (2002). „Nová aktivita dvojitého kortinu při rozpoznávání fosfo-FIGQY tyrosinu v cytoplazmatické doméně neurofascinu“. J. Neurosci. 22 (18): 7948–58. doi:10.1523 / JNEUROSCI.22-18-07948.2002. PMC 6758080. PMID 12223548.
D'Agostino MD, Bernasconi A, Das S a kol. (2002). „Subkortikální pásová heterotopie (SBH) u mužů: klinické, zobrazovací a genetické nálezy ve srovnání se ženami“. Mozek. 125 (Pt 11): 2507–22. doi:10.1093 / brain / awf248. PMID 12390976.
Meyer G, Perez-Garcia CG, Gleeson JG (2003). „Selektivní exprese doublecortinu a LIS1 ve vývoji lidské kůry naznačuje jedinečné způsoby pohybu neuronů“. Cereb. Kůra. 12 (12): 1225–36. doi:10.1093 / cercor / 12.12.1225. PMID 12427674.

externí odkazy

Média související s doublecortin na Wikimedia Commons
GeneReviews / NCBI / NIH / UW záznam o poruchách souvisejících s DCX
Položky OMIM týkající se poruch souvisejících s DCX
doublecortin + protein v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: O43602 (Neuronální migrační protein dvojitý kortin) na PDBe-KB.

Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR003533

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000077279 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031285 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] EntrezGene 1641

[pmid19180242-6] Oomen CA, Girardi CE, Cahyadi R, Verbeek EC, Krugers H, Joëls M, Lucassen PJ (2009). „Opačné účinky časné mateřské deprivace na neurogenezi u krys samců versus samic“. PLOS ONE. 4 (1): e3675. Bibcode:2009PLoSO ... 4,3675O. doi:10,1371 / journal.pone 0003675. PMC 2629844. PMID 19180242.

[pmid14574675-7] Brown JP, Couillard-Després S, Cooper-Kuhn CM, Winkler J, Aigner L, Kuhn HG (prosinec 2003). "Přechodná exprese doublecortinu během neurogeneze dospělých". J. Comp. Neurol. 467 (1): 1–10. doi:10,1002 / kne.10874. PMID 14574675. S2CID 25315374.

[pmid15654838-8] Couillard-Despres S, vítěz B, Schaubeck S, Aigner R, Vroemen M, Weidner N, Bogdahn U, Winkler J, Kuhn HG, Aigner L (leden 2005). "Hladiny exprese doublecortinu v mozku dospělého odrážejí neurogenezi". Eur. J. Neurosci. 21 (1): 1–14. doi:10.1111 / j.1460-9568.2004.03813.x. PMID 15654838.

[pmid10441322-9] Horesh D, Sapir T, Francis F, Wolf SG, Caspi M, Elbaum M, Chelly J, Reiner O (září 1999). „Doublecortin, stabilizátor mikrotubulů“. Hučení. Mol. Genet. 8 (9): 1599–610. doi:10,1093 / hmg / 8.9.1599. PMID 10441322.

[10] Nosten-Bertrand M, Kappeler C, Dinocourt C, Denis C, Germain J, Phan Dinh Tuy F, Verstraeten S, Alvarez C, Métin C, Chelly J, Giros B, Miles R, Depaulis A, Francis F (2008-06- 25). „Epilepsie u myší s knock-outem Dcx spojená s diskrétními defekty laminace a zvýšenou vzrušivostí v hipokampu“. PLOS ONE. 3 (6): e2473. Bibcode:2008PLoSO ... 3.2473N. doi:10,1371 / journal.pone.0002473. PMC 2429962. PMID 18575605.

[pmid10749977-11] Sapir T, Horesh D, Caspi M, Atlas R, Burgess HA, Wolf SG, Francis F, Chelly J, Elbaum M, Pietrokovski S, Reiner O (březen 2000). „Doublecortinové mutace klastrují v evolučně konzervovaných funkčních doménách“. Hučení. Mol. Genet. 9 (5): 703–12. doi:10,1093 / hmg / 9,5,703. PMID 10749977.

[pmid11001923-12] Caspi M, Atlas R, Kantor A, Sapir T, Reiner O (září 2000). „Interakce mezi LIS1 a doublecortinem, dvěma geny lissencephaly“. Hučení. Mol. Genet. 9 (15): 2205–13. doi:10.1093 / oxfordjournals.hmg.a018911. PMID 11001923.

[13] Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM): Doublecortin - 300121

[pmid9489700-14] Gleeson JG, Allen KM, Fox JW, Lamperti ED, Berkovic S, Scheffer I, Cooper EC, Dobyns WB, Minnerath SR, Ross ME, Walsh CA (leden 1998). „Doublecortin, mozkově specifický gen mutovaný v lidské X-vázané lissencephaly a syndromu dvojité kůry, kóduje domnělý signální protein“. Buňka. 92 (1): 63–72. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80899-5. PMID 9489700.

[isbn0-07-174889-X-15] Lowenstein DH (2011). „Záchvaty a epilepsie“. In Loscalzo J, Longo DL, Fauci AS, Kasper DL, Hauser SL (eds.). Harrisonovy principy interního lékařství (18. vydání). McGraw-Hill Professional. 3251–3269. ISBN 978-0-07-174889-6.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]