Cyanophage - Cyanophage

Elektronový mikrofotografie negativně zbarvené Prochlorococcus myoviry

Kyanofágy jsou viry, které infikují sinice, také známý jako Cyanophyta nebo modrozelené řasy. Sinice jsou kmen bakterií, které získávají energii procesem fotosyntéza.[1][2] Ačkoli se sinice metabolizují fotoautotrofně jako eukaryotické rostliny mají prokaryotický buněčná struktura. Kyanofágy lze nalézt ve sladkovodním i mořském prostředí.[3] Mořské a sladkovodní kyanofágy mají icosahedral hlavy, které obsahují dvouvláknovou DNA, připojené k ocasu konektorovými proteiny.[4] Velikost hlavy a ocasu se u jednotlivých druhů kyanofágů liší. Cyanofágy infikují širokou škálu sinic a jsou klíčovými regulátory populací sinic ve vodním prostředí a mohou pomoci při prevenci květů sinic ve sladkovodních a mořských ekosystémech. Tyto květy mohou představovat nebezpečí pro člověka a další zvířata, zejména v eutrofní sladkovodní jezera. Infekce těmito viry je vysoce rozšířená v buňkách patřících k Synechococcus spp. v mořském prostředí, kde bylo hlášeno, že až 5% buněk patřících k mořským buňkám sinic obsahuje zralé částice fága.[5]

První kyanofág, LPP-1, byl objeven v roce 1963.[6] Kyanofágy jsou klasifikovány v rámci bakteriofág rodiny Myoviridae (např. AS-1, N-1 ), Podoviridae (např. LPP-1 ) a Siphoviridae (např. S-1 ).[6]

Kyanofágy jsou poprvé hlášeny Saffermanem a Morrisem v roce 1963. Podobně Hollings (1962) uvádí viry infikující kultivované houby a způsobující chorobu smrti. Viry napadající houby se nazývají mykoviry nebo mykofágy.

Nomenklatura

Následující tři rodiny kyanofágů byly uznány organizací Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV): Myoviridae, Siphoviridae a Podoviridae; všechny obsahují dvouvláknovou DNA.[7] Zpočátku byly kyanofágy pojmenovány podle svých hostitelů. Schopnost cyanofágů infikovat více hostitelů a nedostatek univerzálního systému pojmenování však může způsobit potíže s jejich taxonomickou klasifikací.[8] Mnoho dalších klasifikačních systémů používalo sérologické, morfologické nebo fyziologické vlastnosti.[9][10] V současné době je navrhovaný postup pojmenování kmenů následující: Cyanophage Xx-YYZaa, kde Xx jsou první dvě písmena rodových a druhových jmen hostitele, v nichž se nachází typový fág vzorku, YY je původ vzorku, Z je skupina virů a aa je referenční číslo viru.[3]

Morfologie

Jako všichni ostatní bakteriofágy cyanofágy mají ocas a protein kapsid okolní genetický materiál. Dvouvláknová DNA je dlouhá přibližně 45 kbp a v některých kyanofágech kóduje fotosyntetické geny, integrázu nebo geny zapojené do metabolismu fosfátů (fosfátem indukovatelné).[11] Ocas váže virus na hostitelskou buňku a po infekci přenáší virovou DNA do hostitelské buňky. Na základě morfologických charakteristik jsou kyanofágy umístěny do čeledí Myoviridae, Podovirida a Siphoviridae, a ačkoli to formálně neuznává Mezinárodní výbor pro taxonomii virů, historicky byly kyanofágy dále klasifikovány jako cyanomyovirus, cyanopodovirus nebo cyanostylovirus podle toho, ze které ze tří rodin jsou seskupeny.[8]

Cyanomyovirus

Typový druh pro cyanomyovirus rodiny Myoviridae je Cyanophage AS-1, který byl izolován z rybníka pro stabilizaci odpadu,[12] a byl také prvním rozpoznaným rodem.[13] Ocasy byly pozorovány buď jako kontraktilní nebo nekontraktivní s délkami 20 až 244 nm, šířkami 15 až 23 nm a zmenšujícím se rozsahem 93 nm.[14][3] Kyanofágy mají obecně izometrické šestihranné hlavy s průměrem v rozmezí od 55 do 90 nm.[14][3] V této skupině existují velké morfologické variace, což naznačuje, že infikují různé druhy hostitelů.[15] V místě připojení mezi dlouhým ocasem a hlavou je základní deska, kde jsou připevněny krátké čepy, kontraktilní obal a vnitřní jádro, podobně jako u jiných bakteriofágů v Myoviridae.[12]

Cyanopodovirus

Cyanopodovirus v rámci Podoviridae, jsou přítomny ve sladké i mořské vodě.[16] Typickým vzorkem cyanopodoviru je Cyanophage LPP-1, který infikuje Lyngbya, Plectonema a Phormidium.[17] Jejich kapsidy jsou mnohostěny, které se ve 2D zobrazují jako šestihranné.[14] Ocasy jsou duté se šestinásobnou radiální symetrií vyrobenou z prstenů šesti podjednotek s neznámou orientací.[14] Podobně jako cyanomyoviry se nacházejí v rybnících ke stabilizaci odpadu a mají izometrické kapsidy podobné velikosti, ale kratší ocasy.[3]

Cyanostylovirus

Cyanostylovirus patří do rodiny Siphoviridae, kde typovým druhem je Cyanophage S-1, o kterém je známo, že infikuje Synechococcus.[3] Cyanostyloviridae mají menší (průměr 50 nm) izometrické kapsidy než předchozí rody, ale delší ocasy (140 nm).[18] Jiné rody v této rodině mají ocasy o délce 200 až 300 nm.[15]

Hostitel

Anabaena circinalis[19]

Hostitelský rozsah kyanofágů je velmi složitý a má se za to, že hraje důležitou roli při kontrole sinice populace.[1] Bylo hlášeno, že sladkovodní kyanofágy infikují hostitele u více než jednoho rod i když to může také odrážet problémy v taxonomické klasifikaci jejich hostitelů. Byly nicméně rozděleny do tří hlavních skupin na základě taxonomie Jejich hostitel organismus.[1][3]

LPP skupina

První skupinou je LPP, který patří k cyanopodovirům.[1] Tato skupina virů zahrnuje původní izolát kyanofága, který infikoval „modrozelené řasy“.[13][3] Cyanofágy v této skupině lze snadno izolovat od okolního prostředí.[3] Nesou krátké nesmrtelné ocasy a způsobují lýza několika druhů ve třech rodech sinic: Lyngbya, Plectonema a Phormidium.[3] Název LPP byl tedy odvozen od tří rodů hostitelů, které infikují.[13] LPP-1 a LPP-2 jsou dva hlavní typy LPP kyanfágů.[20] Tato skupina kyanofágů má stejný hostitel stejný rozsah; jejich sérum a jiné tělesné tekutiny však nejsou stejné.[20]

Skupina AS a SM

Skupiny AS a SM představují třetí skupinu kyanofágů klasifikovanou podle rozsahu hostitele.[1] O této skupině virů se říká, že jsou „novými modrozelenými řasami“ a infikují jednobuněčné formy sinice.[3][21][12] The myovirus Infikuje AS-1 Anacystis nidulans, Synechococcus cedrorum, Synechococcus elongatus a Microcystis aeruginosa.[3] Podobně jednobuněčné modrozelené řasy Synechococcus elongatus a Microcystis aeruginosa jsou infikováni podovirem SM-1.[3][22] Existuje nová skupina SM virů, známá jako SM-2, která také lyžuje Microcystis aeruginosa[22].

Skupina A, AN, N a NP

Kyanofágy klasifikované ve skupinách A, AN, N a NP představují druhou skupinu cyanofágů klasifikovaných na základě rozsahu hostitele.[18][1][23][24] Hrají důležitou roli při infikování a způsobování lýzy členů rodů Nostoc, Anabaena a Plectonema.[1] Skupina A skupiny virus způsobuje lýzu a infikuje Anabaena druh.[3] Podobně rozsah hostitelů skupiny AN zahrnuje obojí Anabaena a Nostoc druh; zatímco skupina N virů infikuje Nostoc pouze druh a zahrnuje Kyanofág N-1.[3] Kyanofág N-1 je pozoruhodný v tom, že kóduje funkční CRISPR pole, které může hostiteli poskytovat imunitu proti infekci konkurenčními kyanofágy.[25] A konečně, sinice sinic Nostoc a Plectonema druhy jsou infikovány skupinou NP virů.[3] Tyto izoláty sinic úzce souvisí s taxonomickou skupinou Nostoc.[3] Všichni mají širokou škálu hostitelů a mutace jsou u těchto skupin virů patrné.[3]

Replikace

Replikace cyanofága má dva dominantní cykly: lytický cyklus a lysogenní cyklus. Za lytický cyklus se považuje replikace virové nukleové kyseliny a okamžitá syntéza proteinu kódovaného virem. Fágy jsou považovány za lytické, pokud mají pouze schopnost vstoupit do lytického cyklu; zatímco mírný fág může buď vstoupit do lytického cyklu, nebo se stabilně integrovat do genomu hostitele a vstoupit do lysogenního cyklu.[26] Aby uspokojily metabolickou poptávku po replikaci, získávají viry velké množství strategií k oddělování živin od svého hostitele. Jednou z takových technik je vyhladovění jejich hostitelské buňky. To se provádí inhibicí CO hostitelských buněk2 fixace, která umožňuje kyanofágu přijímat fotosynteticky vytvořené redox a ATP z hostitelské buňky, aby splňovaly jejich nukleotidovou a metabolickou odpověď.[27] Mnoho kyanofágů obsahuje geny známé jako virové pomocné metabolické geny (AMG), které kódují kritické kroky hostitelského organismu omezující rychlost.[27] AMG kódují geny pro pentózo-fosfátovou cestu, získávání fosfátů, metabolismus síry a zpracování DNA / RNA; tyto geny interferují s metabolismem hostitelské buňky. Metagenomická analýza vysoce podporuje představu, že tyto geny podporují replikaci virů degradací hostitelské DNA a RNA, jakož i posunem metabolismu hostitelských buněk k biosyntéze nukleotidů.[27] Cyanofágy také používají tyto geny k udržení hostitelské fotosyntézy prostřednictvím progrese infekce a převádějí energii pryč od fixace uhlíku k anabolismu, což virus využívá.[28] AMG také kódují proteiny, které pomáhají při opravách hostitelského fotosystému, který je citlivý na fotodegradaci.[28] Jedním takovým příkladem jsou proteiny D1, které v případě poškození nahradí protein D1 hostitelských buněk.[28] Virus reguluje fotosyntézu, což vede ke zvýšené rychlosti degradace proteinu D1, samotná hostitelská buňka nemůže tyto proteiny účinně nahradit, takže je cyanofág nahradí hostitelskou buňkou, což jí umožní pokračovat v poskytování energie pro cyklus replikace cyanofága.[28]

Je zřejmé, že replikace cyanofágů je silně závislá na dílo cyklu. Prvním krokem v infekčním cyklu je kontakt cyanofága a jeho navázání na sinice, tento adsorpční proces silně závisí na intenzitě světla.[29] Polní studie také ukazují, že infekce a replikace cyanofágů je přímo nebo nepřímo synchronizována s cyklem světlo-tma.[29]

Dodržování

Kyanofágy jako ostatní bakteriofágy spoléhat se na Brownův pohyb srazit se s bakteriemi a poté pomocí proteinů vázajících receptory rozpoznat proteiny buněčného povrchu, což vede k adherenci. Viry se kontraktilními ocasy se poté spoléhají na receptory nacházející se na jejich ocasech, aby rozpoznaly vysoce konzervované proteiny na povrchu hostitelské buňky.[30] Cyanofágy mají také několik povrchových proteinů s doménami podobnými Ig, které se používají k adherenci.[30]

Některé kyanofágy také produkují strukturu podobnou rohovi, která vyčnívá z vrcholu opačného ocasu.[31] O struktuře podobné rohovině se předpokládá, že napomáhá připojení k buňkám v přirozeném prostředí; to však nebylo potvrzeno.[31]

Lytický cyklus

Cyanofágy mohou projít jak lytickým, tak lysogenním cyklem v závislosti na virech a jejich prostředí.[32][33] V jedné studii o cyanomyovirech infikujících mořské Synechococcus sp., bylo prokázáno, že lytická fáze trvá přibližně 17 hodin, přičemž průměrný počet virů produkovaných pro každou buňku, která byla lyžována (velikost dávky), se pohybuje od 328 za vysokého světla do 151 za slabého světla.[34] Existují důkazy podporující předpoklad, že existuje korelace mezi intenzitou světla a velikostí série.[29] Studie ukazují, že replikace cyanofágů je poháněna energií z fotosyntetického metabolismu hostitelské buňky.[35] Lýza hostitelské buňky má tendenci nastat po dokončení replikace hostitelské DNA a bezprostředně před buněčným dělením.[35] To je způsobeno zvýšenou dostupností zdrojů pro replikaci virových částic.

Ekologický význam

Ekosystém

Určité cyanofágy infikují a praskají Prochlorococcus, nejmenší a nejhojnější producenti na světě.[36][11] Mořské cyanofágy rodiny Myoviridae pomáhají regulovat primární produkci hlavně prostřednictvím infekce Synechococcus spp.[3] Další dvě rodiny Podoviridae a Siphoviridae, se obvykle nacházejí ve sladkovodních ekosystémech.[3] V pobřežních oceánech hojnost infikovaných virů Synechococcus spp. může dosáhnout> 106 ml−1 a 105 G−1 v sedimentech.[3] Odhaduje se, že 3% Synechococcus jsou denně odstraňovány kyanofágy.[3] Kyanofágy jsou široce distribuovány jak ve vodním sloupci, tak geograficky.[3][36][37] Bylo zjištěno, že populace cyanofágů obývají mikrobiální rohože v Arktidě metagenomické analýza a hypersalinní laguny.[37][4] Odolávají teplotám v rozmezí 12-30 ° C a slanosti 18-70 ppt.[4] DNA kyanofágů je náchylná k degradaci UV zářením, ale může být obnovena v hostitelských buňkách pomocí procesu zvaného „fotoreaktivace ".[38] Viry se nemohou pohybovat samostatně a musí se při přenosu spoléhat na proudy, míchání a hostitelské buňky. Viry nemohou aktivně cílit na své hostitele a musí počkat, až se s nimi setkají. Vyšší pravděpodobnost srážky může vysvětlit, proč cyanofágy z Myoviridae rodina primárně infikuje jednu z nejhojnějších sinic, Synechoccocus.[3] Důkaz sezónní společné variace mezi fágy a hostiteli, kromě zvýšení počtu cyanofágů nad prahovou hodnotu 103 do 104 Synechococcus ml−1, může navrhnout „zabij vítěze „Dynamický.[3]

Biologický a fyzický dopad

Členové rodu Synechococcus přispívat ~ 25% k primární fotosyntetické produktivitě v oceánu, což má významný účinek zdola nahoru na vyšší trofické úrovně.[39] The rozpuštěná organická hmota (DOM) uvolněný z virové lýzy cyanofágy lze posunout do mikrobiální smyčka kde je recyklován nebo odmítnut heterotrofní bakterie za vzniku vzpurné hmoty, která je nakonec pohřbena v sedimentu.[39][40] Jedná se o důležitý krok v sekvestraci uhlíku v atmosféře, běžně označovaný jako biologické čerpadlo a údržba ostatních biogeochemické cykly.[39]

Sinice provádějí kyslíkovou fotosyntézu, která je považována za původ atmosférického kyslíku přibližně před 2,5 Ga.[41] Populace, a proto rychlost vývoje kyslíku, může být regulována kyanofágy. U některých druhů sinic, jako je např Trichodesmium které provádějí fixaci dusíku, jsou kyanofágy schopné zvýšit rychlost dodávky biologicky dostupného organického dusíku pomocí lýzy.[42][43]

Cyanofágy také infikují sinice vytvářející květ, které mohou být toxické pro zdraví lidí a jiných zvířat produkcí mikrocystin a příčina eutrofizace, vedoucí k minimální zóny kyslíku. Cyanofágy mohou infikovat a zabíjet čtyři běžné sinice vytvářející květ: Lyngbya birgei, Anabaena circinalis, Anabaena flosaquae, a Microcystis aeruginosa,[26] a tak může být schopen zabránit škodlivé květy řas za normálních podmínek. Květy způsobují problémy ekologicky, ekonomicky a ve sladkovodních systémech nepříznivě ovlivňují kvalitu pitné vody.[44] Výkyvy v populacích sinic jsou obvykle způsobeny nárůstem živin v důsledku úniku hnojiv, prachu a odpadních vod.[45] Zabíjením hostitelů mohou kyanofágy pomoci obnovit ekosystémy v jejich přirozené rovnováze.

Kromě regulace velikosti populace pravděpodobně ovlivňují i ​​kyanofágy fylogenetické složení tím, že umožní růst dalšímu fytoplanktonu normálně inhibovanému sinicemi.[45] Specifičnost, s jakou kyanofágy cílí na různé hostitele, také ovlivňuje strukturu komunity. Kvůli lysogenní fázi jejich replikačního cyklu se mohou cyanofágy chovat jako mobilní genetické prvky pro genetickou diverzifikaci svých hostitelů prostřednictvím horizontální přenos genů.[46][27] Předpokládá se, že to, zda v dané oblasti dominuje lytická nebo lysogenní fáze, závisí na eutrofních nebo oligotrofních podmínkách.[40] Zvýšení počtu setkání přímo souvisí se zvýšením míry infekce, což poskytuje více příležitostí pro selektivní tlak, což vede k pobřežím Synechococcus odolnější vůči virové infekci než jejich protějšky na moři.[3]

Reference

  1. ^ A b C d E F G Xia, Han; Li, Tianxian; Deng, Fei; Hu, Zhihong (01.10.2013). "Sladkovodní kyanofágy". Virologica Sinica. 28 (5): 253–259. doi:10.1007 / s12250-013-3370-1. ISSN  1674-0769. PMID  24132756.
  2. ^ Whitton, Brian A .; Potts, Malcolm (2000). Ekologie sinic: jejich rozmanitost v čase a prostoru. Boston: Kluwer Academic. 563–589. ISBN  978-0-7923-4735-4.
  3. ^ A b C d E F G h i j k l m n Ó p q r s t u proti w X y z Suttle, Curtis A. (2000-01-01). "Kyanofágy a jejich role v ekologii sinic". Ve Whittonu, Brian A .; Potts, Malcolm (eds.). Ekologie sinic. Springer Nizozemsko. 563–589. doi:10.1007/0-306-46855-7_20. ISBN  9780792347354.
  4. ^ A b C Suttle, Curtis A .; Chan, Amy M. (1993). "Mořské cyanofágy infikující oceánské a pobřežní kmeny Synechococcus: hojnost, morfologie, křížová infekčnost a růstové charakteristiky". Série pokroku v ekologii moří. 92: 99–109. Bibcode:1993MEPS ... 92 ... 99S. doi:10,3 354 / meps092099.
  5. ^ Proctor, Lita M .; Fuhrman, Jed A. (1990). "Virová úmrtnost mořských bakterií a sinic". Příroda. 343 (6253): 60–62. Bibcode:1990Natur.343 ... 60P. doi:10.1038 / 343060a0.
  6. ^ A b Sarma TA. „Kyanofágy“ v Příručka sinic (CRC Press; 2012) (ISBN  1466559411)
  7. ^ King, A.M.Q .; Lefkowitz, E .; Adams, M. J.; Carstens, E.B. (2012). Klasifikace a nomenklatura virů pro virovou taxonomii: Devátá zpráva Mezinárodního výboru pro taxonomii virů. Elsevier. ISBN  978-0-12-384684-6.
  8. ^ A b Safferman, R.S .; Cannon, R.E .; Desjardins, P.R .; Gromov, B.V .; Haselkorn, R .; Sherman, L.A .; Shilo, M. (1983). "Klasifikace a nomenklatura virů sinic". Intervirologie. 19 (2): 61–66. doi:10.1159/000149339. PMID  6408019.
  9. ^ Gibbs, Adrian J (2005). Molekulární základy evoluce virů. Cambridge University Press. ISBN  978-0-521-02289-7.
  10. ^ Stanier, R.Y. (1971). "Čištění a vlastnosti jednobuněčných modrozelených řas (řád Chroocococcales)" ". Bakteriologické recenze. 35 (2): 171–205. doi:10.1128 / MMBR.35.2.171-205.1971. PMC  378380. PMID  4998365.
  11. ^ A b Sullivan, Matthew B .; Coleman, Maureen L .; Weigele, Peter; Rohwer, les; Chisholm, Sallie W. (2005-04-19). „Tři prochlorococcus cyanofágové geny: podpisové rysy a ekologické interpretace“. PLOS Biology. 3 (5): e144. doi:10.1371 / journal.pbio.0030144. ISSN  1545-7885. PMC  1079782. PMID  15828858.
  12. ^ A b C Safferman, R.S .; Diener, T.O .; Desjardins, P.R .; Morris, M.E. (1972). „Izolace a charakterizace AS-1, fykoviru infikujícího modrozelené řasy, Anacystis nidulans a Synechococcus cedrorum". Virologie. 47 (1): 105–113. doi:10.1016/0042-6822(72)90243-7. PMID  4110125.
  13. ^ A b C Safferman, Robert S .; Morris, Mary-Ellen (1964). „Růstové charakteristiky modrozeleného viru řas LPP-1“. J. Bacteriol. 88 (3): 771–775. doi:10.1128 / JB.88.3.771-775.1964. PMC  277376. PMID  14208517.
  14. ^ A b C d Padan, E .; Shilo, M. (1973). „Kyanofágy - viry útočící na modrozelené řasy“. Bakteriologické recenze. 37 (3): 343–370. doi:10.1128 / MMBR.37.3.343-370.1973. PMC  413822. PMID  4202147.
  15. ^ A b Gromov, B.V. (1983). „Kyanofágy“. Annales de l'Institut Pasteur / Microbiologie. 134 (1): 43–59. doi:10.1016 / s0769-2609 (83) 80096-9. PMID  6416127.
  16. ^ Hu, Nien-Tai; Thiel, Teresa; Giddings, Thomas H .; Wolk, C. Peter (1981). "Nové kyanofágy Anabaena a Nostoc z čistíren odpadních vod". Virologie. 114 (1): 236–246. doi:10.1016/0042-6822(81)90269-5. PMID  6269286.
  17. ^ Schneider, I. R .; Diener, T. O .; Safferman, Robert S. (1964-05-29). „Modrozelený virus řas LPP-1: Čištění a částečná charakterizace“. Věda. 144 (3622): 1127–1130. Bibcode:1964Sci ... 144.1127S. doi:10.1126 / science.144.3622.1127. ISSN  0036-8075. PMID  14148431.
  18. ^ A b Adolph, Kenneth W .; Haselkorn, Robert (1973). „Izolace a charakterizace viru infikujícího modrozelenou řasu rodu Synechococcus". Virologie. 54 (1): 230–236. doi:10.1016/0042-6822(73)90132-3. PMID  4197413.
  19. ^ Bdcarl (2012-04-13). "Anabaena circinalis".
  20. ^ A b JOHNSON, DAVID W .; POTTS, MALCOLM (1985). "Hostitelský rozsah LPP kyanofágů". International Journal of Systematic Bacteriology. 35: 76–78. doi:10.1099/00207713-35-1-76.
  21. ^ SAFFERMAN, R.S; Schneider, I.R .; Steere, R.L .; MORRIS, M.E .; DIENER, T.O (1969). „Phycovirus SM-1: Virus infikující jednobuněčné modrozelené řasy“. Virologie. 37 (3): 386–397. doi:10.1016/0042-6822(69)90222-0. PMID  5777559.
  22. ^ A b Fox, John A .; Booth, S.J .; Martin, E.L. (1976). "Cyanophage SM-2: Nový virus modrozelených řas". Virologie. 73 (2): 557–560. doi:10.1016/0042-6822(76)90420-7. PMID  8869.
  23. ^ MURADOV, MM (1990). „SROVNÁVACÍ STUDIE KYANOFÁGŮ NP-1T, KTERÉ LYSOGENIZUJÍ BAKTERIE FIXUJÍCÍ DUSÍK GENERA NOSTOC A PLECTONEMA“. Mikrobiologie. 59 (5): 558–563.
  24. ^ Kozayakov, SYa (1977). „Kyanofágy řady A (L) specifické pro modrozelenou řasu Anabaena variabilis. V". Experimentální algologie: 151–171.
  25. ^ Chénard C, Wirth JF, Suttle CA (2016), „Viry infikující sladkovodní vláknité sinice (Nostoc sp.) kódují funkční pole CRISPR a proteobakteriální DNA polymerázu B ", mBio, 7 (3): e00667-16, doi:10,1 128 / mBio.00667-16, PMC  4916379, PMID  27302758
  26. ^ A b Jassim, Sabah A. A .; Limoges, Richard G. (01.10.2013). „Dopad vnějších sil na interakce kyanofága s hostitelem ve vodních ekosystémech“. World Journal of Microbiology and Biotechnology. 29 (10): 1751–1762. doi:10.1007 / s11274-013-1358-5. ISSN  0959-3993. PMID  23619821.
  27. ^ A b C d Kaplan, Aaron (2016). "Cyanophages: Hladovějící hostitel k náboru zdrojů". Buňka. 26 (12): R511 – R513. doi:10.1016 / j.cub.2016.04.030. PMID  27326715.
  28. ^ A b C d Frank, Jeremy A .; Lorimer, Don; Youle, Merry; Witte, Pam; Craig, Tim; Abendroth, Jan; Rohwer, les; Edwards, Robert A .; Segall, Anca M. (01.06.2013). "Struktura a funkce cyanofágem kódovaného peptidu deformylázy". Časopis ISME. 7 (6): 1150–1160. doi:10.1038 / ismej.2013.4. ISSN  1751-7362. PMC  3660681. PMID  23407310.
  29. ^ A b C Ni, Tianchi; Zeng, Qinglu (01.01.2016). "Diel infekce sinic cyanofágy". Frontiers in Marine Science. 2. doi:10.3389 / fmars.2015.00123.
  30. ^ A b Westbye, Alexander B .; Kuchinski, Kevin; Yip, Calvin K .; Beatty, J. Thomas (29.01.2016). „Agent pro přenos genů RcGTA obsahuje hroty hlavy potřebné k navázání na polysacharidovou buněčnou kapsli Rhodobacter capsulatus“. Journal of Molecular Biology. 428 (2, část B): 477–491. doi:10.1016 / j.jmb.2015.12.010. PMID  26711507.
  31. ^ A b Raytcheva, Desislava A .; Haase-Pettingell, Cameron; Piret, Jacqueline; Král, Jonathan A. (2014-02-15). „Dva nové proteiny Cyanophage Syn5 vytvářejí neobvyklou strukturu rohů“. Journal of Virology. 88 (4): 2047–2055. doi:10.1128 / JVI.02479-13. ISSN  0022-538X. PMC  3911526. PMID  24307583.
  32. ^ McDaniel, Lauren; Houchin, Lee A .; Williamson, Shannon J .; Paul, John P. (2002). „Plankton kvete - lysogeny v mořích Synechococcus". Příroda. 415 (6871): 496. Bibcode:2002 Natur.415..496M. doi:10.1038 / 415496a. PMID  11823851.
  33. ^ Ortmann, Alice C .; Lawrence, Janice E .; Suttle, Curtis A. (2002). „Produkce lysogeny a lytického viru během rozkvětu sinic Synechococcus spp ". Mikrobiální ekologie. 43 (2): 225–231. doi:10.1007 / s00248-001-1058-9. PMID  12023729.
  34. ^ Brigden, Sean (2003). Dynamika replikace cyanofága (MSc, botanika). University of British Columbia. doi:10.14288/1.0091069.
  35. ^ A b Ni, Tianchi; Zeng, Qinglu (01.01.2016). "Diel infekce sinic cyanofágy" (PDF). Frontiers in Marine Science. 2. doi:10.3389 / fmars.2015.00123. ISSN  2296-7745.
  36. ^ A b Partensky, F .; Hess, W. R .; Vaulot, D. (01.03.1999). "Prochlorococcus, mořský fotosyntetický prokaryot globálního významu ". Recenze mikrobiologie a molekulární biologie. 63 (1): 106–127. doi:10.1128 / MMBR.63.1.106-127.1999. ISSN  1092-2172. PMC  98958. PMID  10066832.
  37. ^ A b Varin, Thibault; Lovejoy, Connie; Jungblut, Anne D .; Vincent, Warwick F .; Corbeila, Jacques (2010). „Metagenomické profilování komunit arktických mikrobiálních mat jako systémy pohlcování a recyklace živin“. Limnologie a oceánografie. 55 (5): 1901–1911. Bibcode:2010LimOc..55.1901V. doi:10.4319 / lo.2010.55.5.1901. S2CID  55550366.
  38. ^ Cheng, Kai; Zhao, Yijun; Du, Xiuli; Zhang, Yaran; Lan, Shubin; Shi, Zhengli (2007-06-20). „Rozpad infekčnosti cyanofágů řízený slunečním zářením a fotoreaktivace cyanofága hostitelskými sinicemi“. Vodní mikrobiální ekologie. 48 (1): 13–18. doi:10.3354 / ame048013.
  39. ^ A b C Wang, Kui; Wommack, K. Eric; Chen, Feng (01.11.2011). "Hojnost a distribuce Synechococcus spp. a kyanofágy v zálivu Chesapeake “. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 77 (21): 7459–7468. doi:10.1128 / AEM.00267-11. ISSN  0099-2240. PMC  3209163. PMID  21821760.
  40. ^ A b Weinbauer, Markus (2011). „Virusem zprostředkovaná redistribuce a rozdělení uhlíku v globálních oceánech“. ResearchGate: 54–56.
  41. ^ Schirrmeister, Bettina E .; Antonelli, Alexandre; Bagheri, Homayoun C. (01.01.2011). „Původ mnohobuněčnosti u sinic“. BMC Evoluční biologie. 11: 45. doi:10.1186/1471-2148-11-45. ISSN  1471-2148. PMC  3271361. PMID  21320320.
  42. ^ Bergman, Birgitta; Sandh, Gustaf; Lin, Senjie; Larsson, John; Carpenter, Edward J. (01.05.2013). „Trichodesmium - rozšířená mořská sinice s neobvyklými vlastnostmi fixace dusíku“. Recenze mikrobiologie FEMS. 37 (3): 286–302. doi:10.1111 / j.1574-6976.2012.00352.x. ISSN  0168-6445. PMC  3655545. PMID  22928644.
  43. ^ Kashyap, A. K .; Rai, A. N .; Singh, Surendra (01.06.1988). „Vliv vývoje cyanofága N-1 na dusíkový metabolismus sinic Nostoc muscorum". Mikrobiologické dopisy FEMS. 51 (2–3): 145–148. doi:10.1111 / j.1574-6968.1988.tb02986.x. ISSN  0378-1097.
  44. ^ Beversdorf, Lucas J .; Miller, Todd R .; McMahon, Katherine D. (06.02.2013). „Role fixace dusíku v toxicitě květu sinic v mírném, eutrofním jezeře“. PLOS ONE. 8 (2): e56103. Bibcode:2013PLoSO ... 856103B. doi:10.1371 / journal.pone.0056103. ISSN  1932-6203. PMC  3566065. PMID  23405255.
  45. ^ A b Fuhrman, Jed A .; Suttle, Curtis A. (1993). "Viry v mořských planktonických systémech". Oceánografie. 6 (2): 51–63. doi:10.5670 / oceanog.1993.14.
  46. ^ Frost, Laura S .; Leplae, Raphael; Summers, Anne O .; Toussaint, Ariane (2005). "Mobilní genetické prvky: agenti evoluce open source". Příroda Recenze Mikrobiologie. 3 (9): 722–732. doi:10.1038 / nrmicro1235. PMID  16138100.

Další čtení

  1. Clokie MR, Mann NH (prosinec 2006). „Námořní kyanofágy a světlo“. Environ. Microbiol. 8 (12): 2074–82. doi:10.1111 / j.1462-2920.2006.01171.x. PMID  17107549. Citováno 10. července 2020.
  2. Mann NH (duben 2003). "Fágy mořských sinic pikofytoplanktonu". FEMS Microbiol. Rev. 27 (1): 17–34. doi:10.1016 / S0168-6445 (03) 00016-0. PMID  12697340.
  3. Paul JH, Sullivan MB (červen 2005). „Genomika mořských fágů: co jsme se naučili?“. Aktuální názor na biotechnologie. 16 (3): 299–307. doi:10.1016 / j.copbio.2005.03.007. PMID  15961031.
  4. Suttle, CA (2000). „Kapitola 20: Cyanofágy a jejich role v ekologii sinic“. V Whitton, BA; Potts, M (eds.). Ekologie sinic: jejich rozmanitost v čase a prostoru. Kluwer Academic Publishers. 563–589. ISBN  978-0-7923-4755-2.

externí odkazy