Kyanofág N-1 - Cyanophage N-1

Kyanofág N-1
Klasifikace virů
Skupina:
Skupina I (dsDNA )
Objednat:
Caudovirales
Rodina:
Myoviridae
Rod:
Cyanomyovirus (navrhovaný)
Druh:
Kyanofág N-1

Kyanofág N-1 je myovirus bakteriofág který infikuje sladkovodní vlákno sinice z Nostoc rod.[1] Virus poprvé izolovali Kenneth Adolph a Robert Haselkorn v roce 1971 v USA z USA fixace dusíkem sinice, Nostoc muscorum.[2][3] N-1 úzce souvisí s kyanofágem A-1, ale jen vzdáleně s ostatními kyanofágy sladkovodního nebo mořského původu.[1]

Struktura

Virus má polyedrickou hlavu o průměru kolem 61 nm. Kontraktilní ocas je dlouhý 100 nm a je připojen k hlavě pomocí ocasního kapitálu. Oblast krku nese vlákna. Zralá virová částice obsahuje alespoň 19 proteinů.[2][4][5]

Genom

Lineární dvouvláknová DNA genom je 64 960 párů bází dlouhý - jen poloviční velikost většiny fágů s kontraktilními ocasy, které obvykle spadají do rozmezí 161–231 kb. Má to Obsah GC 35,4%. Z 91 otevřené čtecí rámce (ORF), pouze 33 vykazuje podobnost s jinými známými sekvencemi. Pozoruhodné je, že genom cyanofága N1 kóduje funkční CRISPR pole, které bylo navrženo k ochraně hostitele před infekcí konkurenčními viry.[1]

Životní cyklus a interakce s hostitelem

Optimální pH pro virová adsorpce na N. muscorum je 7.6–8.1. Rychlost adsorpce se snižuje s rostoucím věkem hostitelských buněk. Virální latentní období je 7 hodin, což je podobné jako u kyanofágů LPP-1 skupina. Velikost série je 100jednotky tvořící plaky na buňku.[6]

Hostitel fotosyntéza je nutný pro replikaci viru, přičemž fotosyntéza je nutná během celého životního cyklu, nikoli v určitém konkrétním bodě. Virová replikace využívá technologii cyklická fotofosforylace a použití uhlohydrát obchody; fotosystém II aktivita není vyžadována.[7][8] Infekce cyanofága N-1 N. muscorum je spojena s několika změnami v uhlíkovém a dusíkatém metabolismu hostitele, včetně zvýšení glukóza-6-fosfátdehydrogenáza koncentrace enzymu a pokles glutamin syntetáza aktivita.[9]

Reference

  1. ^ A b C Chénard C, Wirth JF, Suttle CA (2016), „Viry infikující sladkovodní vláknité sinice (Nostoc sp.) kódují funkční pole CRISPR a proteobakteriální DNA polymerázu B ", mBio, 7: e00667-16, doi:10,1 128 / mBio.00667-16, PMC  4916379, PMID  27302758
  2. ^ A b Adolph KW, Haselkorn R (1971), „Izolace a charakterizace viru infikujícího modrozelenou řasu Nostoc muscorum", Virologie, 46: 200–208, doi:10.1016/0042-6822(71)90023-7
  3. ^ Sarma 2012, s. 420, 423
  4. ^ Sarma 2012, s. 423
  5. ^ Adolph KW, Haselkorn R (1973), „Modrozelený virus řas N-1: Fyzikální vlastnosti a demontáž na konstrukční části“, Virologie, 53: 427–40, doi:10.1016/0042-6822(73)90222-5
  6. ^ Sarma 2012, s. 427, 429
  7. ^ Sarma 2012, s. 430
  8. ^ Calendar 2006, str. 524
  9. ^ Sarma 2012, s. 433

Zdroje