Crinivirus - Crinivirus - Wikipedia

Crinivirus
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Riboviria
Království:Orthornavirae
Kmen:Kitrinoviricota
Třída:Alsuviricetes
Objednat:Martellivirales
Rodina:Closteroviridae
Rod:Crinivirus
Zadejte druh
Virus infekčních žlutých salátů
Druh

Viz text

3'-koncový pseudoknot v SPCSV
RF01091.png
Předpokládaná sekundární struktura 3'-koncového pseudoknotu v SPCSV
Identifikátory
RfamRF01091
Další údaje
RNA typCis-reg
DoményCrinivirus
PDB strukturPDBe

Crinivirus, dříve salátová skupina infekčních žlutých virů, je rod viry, v rodině Closteroviridae. Jsou to lineární, jednořetězcový pozitivní smysl RNA viry (a proto jsou skupina IV ).[1] V současné době existuje 14 druhů v tomto rodu, včetně druhů druhů Virus infekčních žlutých salátů. Mezi nemoci spojené s tímto rodem patří: zežloutnutí a nekróza, postihující zejména floém.[2][3]

Příklady druhů, jejichž celá genomy byly seřazeno které jsou v současné době zařazeny do rodu, zahrnují chlorotický trik virus sladké brambory (SPCSV) a virus infekčních žlutých salátů (LIYV).[4][5]

Genetika

Viry tohoto rodu mají segmentované bipartitní genomy, které tvoří až 7 500–19 500 nukleotidy v délce. Jejich genomy také kódují bílkoviny které netvoří část virionových částic ani strukturální proteiny. Univerzální virová databáze popisuje, že jejich genomové sekvence poblíž jejich 3'-konců jsou schopné tvorby vlásenkové smyčky a také věří, že jejich 5'-konce mohou mít methylované čepičky.[5] Každá z molekul virové RNA obsahuje čtyři vlasové struktury a a pseudoknot v 3'UTR. Pseudoknot je neobvyklý v tom, že obsahuje malý kmenová smyčka struktura uvnitř smyčky L1.[6] V příbuzném rodu Closterovirus Bylo zjištěno, že tyto sekundární struktury jsou důležité při replikaci virové RNA.[7]

Struktura

Viry v Criniviru jsou neobalené, s bipartitními vláknitými geometriemi. Průměr je kolem 10-13 nm, s délkou 700-900 nm. Genomy jsou lineární a bipartitní, dlouhé přibližně 17,6 kB.[2]

RodStrukturaSymetrieCapsidGenomické uspořádáníGenomická segmentace
CrinivirusVláknitéNeobalenéLineárníMonopartitní, bipartitní nebo tripartitní

Životní cyklus

Virová replikace je cytoplazmatická. Vstupu do hostitelské buňky se dosáhne penetrací do hostitelské buňky. Replikace sleduje model replikace pozitivního řetězce RNA viru. Transkripce pozitivního řetězce viru rna je metodou transkripce. Virus opouští hostitelskou buňku virovým pohybem vedeným tubuly. Rostliny slouží jako přirozený hostitel. Virus se přenáší prostřednictvím vektoru (bemisia tabaci). Trasa přenosu je mechanická.[2]

RodPodrobnosti o hostiteliTkáňový tropismusVstupní údajePodrobnosti o vydáníReplikační webMísto montážePřenos
CrinivirusRostlinyŽádnýVirové hnutí; mechanické očkováníVirové hnutíCytoplazmaCytoplazmaMechanické očkování: hmyz (molice)

Taxonomie

Skupina: ssRNA (+)

[3]

Reference

  1. ^ Správa ICTVdB (2006). 00.017.0.02. Crinivirus. In: ICTVdB — The Universal Virus Database, verze 4. Büchen-Osmond, C. (Ed), Columbia University, New York, USA
  2. ^ A b C „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 15. června 2015.
  3. ^ A b ICTV. „Virus Taxonomy: 2014 Release“. Citováno 15. června 2015.
  4. ^ Journal of Virology. 2002 září; 76 (18): 9260–9270
  5. ^ A b Správa ICTVdB (2006)
  6. ^ Livieratos IC, Eliasco E, Müller G a kol. (Červenec 2004). „Analýza RNA viru žluté žíly bramboru: důkazy o tripartitním genomu a konzervovaných 3'-terminálních strukturách mezi členy rodu Crinivirus“. J. Gen. Virol. 85 (Pt 7): 2065–75. doi:10.1099 / vir.0.79910-0. PMID  15218192.
  7. ^ Satyanarayana T, Gowda S, Ayllón MA, Albiach-Martí MR, Dawson WO (srpen 2002). "Mutační analýza replikačních signálů v 3'-nepřekládané oblasti viru citrus tristeza". Virologie. 300 (1): 140–52. doi:10.1006 / viro.2002.1550. PMID  12202214.

externí odkazy