Contryphan - Contryphan

Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury
PDB	1dfy , 1dfz , 1dg0 , 1nxn , 1qfb

Contryphan
	NMR struktura Contryphan-Vn. Peptidový hlavní řetězec je znázorněn zakřivenou trubicí, zatímco aminokyselinové postranní řetězce jsou zastoupeny čepičkami. Atomy uhlíku jsou zbarveny šedě, atomy dusíku modré, atomy kyslíku červené a atomy síry žluté.; .
Identifikátory
Symbol	Contryphan_CS
Pfam	PF02950
InterPro	IPR011062
STRÁNKA	PS60027
SCOP2	2cco / Rozsah / SUPFAM
Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury
PDB	1dfy , 1dfz , 1dg0 , 1nxn , 1qfb

The kontryfans (ošiditnás + Snaž sevývodový hřídelphan) jsou rodinou peptidy které jsou aktivními složkami silné látky jed produkovaný šnek šnek (rod Conus ). Tyto dvě aminokyseliny cystein zbytky v contryphans jsou spojeny a disulfidová vazba. Contryphans navíc podstoupit neobvyklý stupeň posttranslační modifikace počítaje v to epimerizace z leucin a tryptofan, tryptofan bromace, amidace z C-konec, a hydroxylace prolinů.^[2] V širším schématu genetické konotoxin klasifikace, contryphans jsou členy "Conotoxin Superfamily O2."^[3]

Členové rodiny

Conus textil, který vyrábí contryphans

Mezi členy rodiny Contryphan patří:

Peptid	Sekvence	Druh	Odkaz
Des (Gly1) contryphan-R	COwEPWC-NH2	C. radiatus	^[4]
Contryphan-R	GCOwEPWC-NH2	Conus radiatus	^[4]
Bromokontyfan-R	GCOwEPXC-NH2	C. radiatus	^[5]
Contryphan-Sm	GCOwQPWC-NH2	Conus stercusmuscarum	^[6]
Contryphan-P	GCOwDPWC-NH₂	C. purpurascens	^[6]
Contryphan-R / Tx	GCOwEPWC-NH2	Conus textil	^[6]
Contryphan-Tx	GCOWQPYC-NH2	Conus textil	^[6]
Contryphan-Vn	GDCPwKPWC-NH₂	Conus ventricosus	^[7]
Leu-contryphan-P	GCVlLPWC-OH	Conus purpurascens	^[8]
Leu-contryphan-Tx	CVlYPWC-NH₂	Conus textil	^[6]
Glaconryphan-M	NγSγCPWHPWC-NH₂	Conus marmoreus	^[2]

Kde sekvence zkratky znamenají:

O = 4-trans-hydroxyprolin,
l = D-leucin, L = L-leucin,
w = D-tryptofan, W = L-tryptofan,
y = kyselina gama-karboxyglutamová,
NH₂ = C-koncová amidace

a zbývající písmena odkazují na normu jednopísmenné zkratky pro aminokyseliny.

Mechanismus toxicity

Jed kuželovitých hlemýžďů způsobuje ochrnutí jejich rybí kořisti. Molekulární cíl nebyl stanoven pro všechny kontryfanové peptidy, je však známo, že kontryfan-Vn je a Ca.²⁺-závislá K.⁺ kanál modulátor,^[7] zatímco glacontryphan-M je a Kalciový kanál typu L. blokátor.^[2]

Reference

^ PDB: 1NXN; Eliseo T, Cicero DO, Romeo C, Schininà ME, Massilia GR, Polticelli F, Ascenzi P, Paci M (červen 2004). „Struktura roztoku cyklického peptidu contryphan-Vn, Ca²⁺-závislá K.⁺ modulátor kanálu ". Biopolymery. 74 (3): 189–98. doi:10.1002 / bip.20025. PMID 15150794.
^ ^A ^b ^C Hansson K, Ma X, Eliasson L, Czerwiec E, Furie B, Furie BC, Rorsman P, Stenflo J (červenec 2004). „První kontryfan obsahující kyselinu gama-karboxyglutamovou. Selektivní blokátor vápníkových iontových kanálů typu L izolovaný z jedu Conus marmoreus“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (31): 32453–63. doi:10,1074 / jbc.M313825200. PMID 15155730.
^ Robinson SD, Norton RS (prosinec 2014). „Superrodiny genů pro konotoxin“. Marine Drugs. 12 (12): 6058–101. doi:10,3390 / md12126058. PMC 4278219. PMID 25522317.
^ ^A ^b Jimenéz EC, Olivera BM, Gray WR, Cruz LJ (listopad 1996). „Contryphan je peptid Conus obsahující D-tryptofan“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (45): 28002–5. doi:10.1074 / jbc.271.45.28002. PMID 8910408.
^ Jimenez EC, Craig AG, Watkins M, Hillyard DR, Gray WR, Gulyas J, Rivier JE, Cruz LJ, Olivera BM (únor 1997). "Bromkontryfan: posttranslační bromace tryptofanu". Biochemie. 36 (5): 989–94. doi:10.1021 / bi962840p. PMID 9033387.
^ ^A ^b ^C ^d ^E Jacobsen R, Jimenez EC, Grilley M, Watkins M, Hillyard D, Cruz LJ, Olivera BM (březen 1998). "Contryphans, D-tryptofan obsahující rodina peptidů Conus: vzájemná přeměna mezi konforméry". The Journal of Peptide Research. 51 (3): 173–9. doi:10.1111 / j.1399-3011.1998.tb01213.x. PMID 9531419.
^ ^A ^b Massilia GR, Schininà ME, Ascenzi P, Polticelli F (listopad 2001). „Contryphan-Vn: nový peptid z jedu středomořského šneka Conus ventricosus“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 288 (4): 908–13. doi:10.1006 / bbrc.2001.5833. PMID 11688995.
^ Jacobsen RB, Jimenez EC, De la Cruz RG, Gray WR, Cruz LJ, Olivera BM (srpen 1999). „Nový Conusův peptid obsahující D-leucin: různá konformační dynamika v rodině contryfanů“. The Journal of Peptide Research. 54 (2): 93–9. doi:10.1034 / j.1399-3011.1999.00093.x. PMID 10461743.

externí odkazy

Contryphan v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

[pmid15150794-1] PDB: 1NXN; Eliseo T, Cicero DO, Romeo C, Schininà ME, Massilia GR, Polticelli F, Ascenzi P, Paci M (červen 2004). „Struktura roztoku cyklického peptidu contryphan-Vn, Ca²⁺-závislá K.⁺ modulátor kanálu ". Biopolymery. 74 (3): 189–98. doi:10.1002 / bip.20025. PMID 15150794.

[pmid15155730-2] A ^b ^C Hansson K, Ma X, Eliasson L, Czerwiec E, Furie B, Furie BC, Rorsman P, Stenflo J (červenec 2004). „První kontryfan obsahující kyselinu gama-karboxyglutamovou. Selektivní blokátor vápníkových iontových kanálů typu L izolovaný z jedu Conus marmoreus“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (31): 32453–63. doi:10,1074 / jbc.M313825200. PMID 15155730.

[3] Robinson SD, Norton RS (prosinec 2014). „Superrodiny genů pro konotoxin“. Marine Drugs. 12 (12): 6058–101. doi:10,3390 / md12126058. PMC 4278219. PMID 25522317.

[pmid8910408-4] A ^b Jimenéz EC, Olivera BM, Gray WR, Cruz LJ (listopad 1996). „Contryphan je peptid Conus obsahující D-tryptofan“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (45): 28002–5. doi:10.1074 / jbc.271.45.28002. PMID 8910408.

[pmid9033387-5] Jimenez EC, Craig AG, Watkins M, Hillyard DR, Gray WR, Gulyas J, Rivier JE, Cruz LJ, Olivera BM (únor 1997). "Bromkontryfan: posttranslační bromace tryptofanu". Biochemie. 36 (5): 989–94. doi:10.1021 / bi962840p. PMID 9033387.

[pmid9531419-6] A ^b ^C ^d ^E Jacobsen R, Jimenez EC, Grilley M, Watkins M, Hillyard D, Cruz LJ, Olivera BM (březen 1998). "Contryphans, D-tryptofan obsahující rodina peptidů Conus: vzájemná přeměna mezi konforméry". The Journal of Peptide Research. 51 (3): 173–9. doi:10.1111 / j.1399-3011.1998.tb01213.x. PMID 9531419.

[pmid11688995-7] A ^b Massilia GR, Schininà ME, Ascenzi P, Polticelli F (listopad 2001). „Contryphan-Vn: nový peptid z jedu středomořského šneka Conus ventricosus“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 288 (4): 908–13. doi:10.1006 / bbrc.2001.5833. PMID 11688995.

[pmid10461743-8] Jacobsen RB, Jimenez EC, De la Cruz RG, Gray WR, Cruz LJ, Olivera BM (srpen 1999). „Nový Conusův peptid obsahující D-leucin: různá konformační dynamika v rodině contryfanů“. The Journal of Peptide Research. 54 (2): 93–9. doi:10.1034 / j.1399-3011.1999.00093.x. PMID 10461743.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]