Comovirinae - Comovirinae
Comovirinae | |
---|---|
![]() | |
Struktura viru mozaiky Cowpea založená na PDB 2BFU | |
Klasifikace virů ![]() | |
(bez hodnocení): | Virus |
Oblast: | Riboviria |
Království: | Orthornavirae |
Kmen: | Pisuviricota |
Třída: | Pisoniviricetes |
Objednat: | Picornavirales |
Rodina: | Secoviridae |
Podčeleď: | Comovirinae |
Rody | |
Comovirinae je podčeleď viry v pořadí Picornavirales, v rodině Secoviridae; jeho rody byly dříve klasifikovány v rodině Comoviridae. Rostliny slouží jako přirození hostitelé. V současné době existuje 62 druhů v této podčeledi, rozdělených mezi 3 rody.[1][2]
Taxonomie
Rody Comovirus, Nepovirus a Fabavirus byli zařazeni do rodiny Comoviridae v roce 1993. Tato rodina byla klasifikována jako součást řádu Picornavirales kdy byl tento řád vytvořen (2008) a jeho rody byly překlasifikovány jako podčeleď Comovirinae z rodiny Secoviridae v roce 2009.[3][4]
Skupina: ssRNA (+)
- Rodina: Secoviridae
- Podčeleď: Comovirinae
- Rod: Comovirus
- Virus skvrnitosti brambor andských
- Virus fazolového lusku
- Virus mozaiky fazole rugose
- Virus skvrnitých fazolí
- Pravý mozaikový virus
- Virus mozaiky Cowpea
- Cowpea těžký virus mozaiky
- Virus glycinové mozaiky
- Virus hrachové zelené skvrny
- Virus mírné mozaiky hrachu
- Virus mozaiky křepelky
- Virus mozaiky ředkvičky
- Virus červeného jetele
- Virus mozaiky squashu
- Virus Ullucus C.
- Rod: Nepovirus
- Virus Aeonium ringspot
- Meruňkový latentní virus ringspotů
- Virus mozaiky Arabis
- Virus Arracacha A
- Virus artyčoku Egejského ringspotu
- Italský latentní virus artyčoku
- Virus žlutého artyčoku ringspot
- Virus řepy ringspot
- Virus reverze černého rybízu
- Borůvkový latentní sférický virus
- Virus skvrnitosti listů borůvek
- Americký latentní virus manioku
- Virus skvrnitého manioku
- Virus třešňového listu
- Virus žluté skvrny čekanky
- Virus kakaové nekrózy
- Latentní virus Crimson Clover
- Cycas nekrotický stunt virus
- Grapevine Anatolian ringspot virus
- Vinný bulharský latentní virus
- Virus chromové mozaiky vinné révy
- Virus deformace vinné révy
- Virus révy vinné
- Virus tuniského ringspotu vinné révy
- Hibiscus latentní ringspot virus
- Lucernský australský latentní virus
- Meloun mírného viru skvrnitosti
- Virus související s listovým mozaikovým listem
- Virus moruše ringspot
- Virus latentního ringspotu Myrobalan
- Olivový latentní virus ringspot
- Virus mozaiky broskvové růžice
- Virus bramborového černého ringspotu
- Virus brambor B
- Virus brambor U
- Virus malinového ringspotu
- Latentní sférický virus sóji
- Virus tabákových ringspotů
- Virus rajčatového černého kruhu
- Virus rajčatového ringspotu
Struktura
Viry v Comovirinae jsou neobalené, s ikosahedrálními geometriemi a T = pseudo3 symetrie. Průměr je kolem 30 nm. Genomové segmenty jsou enkapsidovány samostatně do dvou různých typů částic podobných v sizenmu. Genomy jsou lineární a segmentované, bipartitní, o délce přibližně 24-7 kB.[1]
Rod | Struktura | Symetrie | Capsid | Genomické uspořádání | Genomická segmentace |
---|---|---|---|---|---|
Comovirus | Icosahedral | Pseudo T = 3 | Neobalené | Lineární | Segmentované |
Nepovirus | Icosahedral | Pseudo T = 3 | Neobalené | Lineární | Segmentované |
Fabavirus | Icosahedral | Pseudo T = 3 | Neobalené | Lineární | Segmentované |
Životní cyklus
Virová replikace je cytoplazmatická. Vstupu do hostitelské buňky se dosáhne penetrací do hostitelské buňky. Replikace následuje model replikace pozitivního řetězce viru RNA. Transkripce pozitivního řetězce viru rna je metodou transkripce. Virus opouští hostitelskou buňku virovým pohybem vedeným tubuly. Rostliny slouží jako přirozený hostitel. Přenosové cesty jsou mechanické.[1]
Rod | Podrobnosti o hostiteli | Tkáňový tropismus | Vstupní údaje | Podrobnosti o vydání | Replikační web | Místo montáže | Přenos |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Comovirus | Rostliny | Žádný | Virové hnutí; mechanické očkování | Virové hnutí | Cytoplazma | Cytoplazma | Mechanické očkování: brouci |
Nepovirus | Rostliny | Žádný | Virové hnutí; mechanické očkování | Virové hnutí | Cytoplazma | Cytoplazma | Hlístice; roztoči; třásněnky |
Fabavirus | Rostliny | Žádný | Virové hnutí; mechanické očkování | Virové hnutí | Cytoplazma | Cytoplazma | Mechanické očkování: mšice |
Reference
- ^ A b C „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 15. června 2015.
- ^ A b ICTV. „Virus Taxonomy: 2014 Release“. Citováno 15. června 2015.
- ^ Historie taxonomie ICTV pro Comoviridae, přístupné na lince 20. listopadu 2015.
- ^ Historie taxonomie ICTV pro Comovirinae, přístupné na lince 20. listopadu 2015.