Kandidátská divize SR1 a kód gracilibacteria - Candidate division SR1 and gracilibacteria code - Wikipedia

The kandidátská divize SR1 a kód gracilibacteria (překladová tabulka 25) se používá ve dvou skupinách (zatím) neobdělávaných bakterie nachází se mimo jiné v mořském a sladkovodním prostředí a ve střevech a ústních dutinách savců.[1] Rozdíl oproti standardu a bakteriálnímu kódu spočívá v tom, že UGA představuje další glycinový kodon a nekóduje ukončení.[2]

Kód

   AA = FFLLSSSSYY ** CCGWLLLLPPPPHHQQRRRRIIIMTTTTNNKKSSRRVVVVAAAADDEEGGGG
Začíná = --- M ------------------------------- M ------------- --M ------------
 Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGGGG
Base2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGG
Base3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG

Základny: adenin (A), cytosin (C), guanin (G) a tymin (T) nebo uracil (U).

Aminokyseliny: Alanin (Ala, A), Arginin (Arg, R), Asparagin (Asn, N), Kyselina asparagová (Asp, D), Cystein (Cys, C), Kyselina glutamová (Glu, E), Glutamin (Gln, Q), Glycin (Gly, G), Histidin (Jeho, H), Isoleucin (Ile, I), Leucin (Leu, L), Lysin (Lys, K), Methionin (Met, M), Fenylalanin (Phe, F), Prolin (Pro, P), Serine (Ser, S), Threonin (Thr, T), Tryptofan (Trp, W), Tyrosin (Tyr, Y) a Valine (Val, V).

Rozdíl od standardního kódu

Kodon DNAKodon RNATento kód (25)Standardní kód (1)
TGAUGAGly (G)STOP = Ter (*)

Iniciační kodony

  • AUG, GUG, UUG

Systematický rozsah

Viz také

Reference

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.[3]

  1. ^ Davis, James P .; Youssef, Noha H .; Elshahed, Mostafa S. (červen 2009). „Hodnocení rozmanitosti, hojnosti a ekologického rozložení členů kandidátské divize SR1 odhaluje vysokou úroveň fylogenetické rozmanitosti, ale omezenou morfototypovou rozmanitost“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 75 (12): 4139–4148. doi:10.1128 / AEM.00137-09. ISSN  1098-5336. PMC  2698373. PMID  19395567.
  2. ^ J. H. Campbell; O'P. Donoghue; A. G. Campbell; P. Schwientek; A. Sczyrba; T. Woyke; D. Söll; M. Podar (2. dubna 2013). „UGA je další kodon glycinu v nekultivovaných bakteriích SR1 z lidské mikrobioty“. Proc Natl Acad Sci U S A. 110 (14): 5540–5. doi:10.1073 / pnas.1303090110. PMC  3619370. PMID  23509275.
  3. ^ Elzanowski A, Ostell J, Leipe D, Soussov V. „Genetické kódy“. Prohlížeč taxonomie. National Center for Biotechnology Information (NCBI), USA National Library of Medicine. Citováno 19. března 2016.

externí odkazy