CDK5RAP3 - CDK5RAP3

CDK5RAP3
Identifikátory
Aliasy	CDK5RAP3, C53, HSF-27, IC53, LZAP, MST016, OK / SW-cl.114, PP1553, CDK5 regulační podjednotka asociovaný protein 3
Externí ID	OMIM: 608202 MGI: 1933126 HomoloGene: 12718 Genové karty: CDK5RAP3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	47,981,781 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	96,916,496 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba proteinů rodiny MDM2 / MDM4; • Vazba NF-kappaB; • mitogenem aktivovaná vazba proteinkinázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba ubikvitinového proteinu na ligázu; • vazba protein kinázy; • cyklinová vazba;
Buněčná složka	• cytoplazma; • centrosome; • membrána; • organizační centrum mikrotubulů; • jádro; • mikrotubuly; • cytoskelet; • endomembránový systém; • buněčné jádro; • cytosol; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• negativní regulace fosforylace bílkovin; • regulace neuronové diferenciace; • proteinová ufmylace; • pozitivní regulace přenosu signálu mediátorem třídy p53; • regulace aktivity fosfatázy; • endoplazmatické retikulum rozložilo proteinovou odpověď; • mitotický kontrolní bod přechodu G2 / M; • negativní regulace katabolického procesu buněčných bílkovin; • vývoj mozku; • apoptotické jaderné změny; • negativní regulace aktivity MAP kinázy; • pozitivní regulace ubikvitinace bílkovin zapojená do katabolického procesu proteinu závislého na ubikvitinu; • negativní regulace aktivity proteinkinázy regulací proteinové fosforylace; • negativní regulace aktivity proteinové serin / threonin kinázy; • buněčná proliferace; • kontrolní bod poškození mitotické G2 DNA; • negativní regulace aktivity transkripčního faktoru NF-kappaB; • pozitivní regulace ubikvitinace bílkovin; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace lokalizace proteinu do jádra; • regulace aktivity cyklin-dependentního proteinu serin / threonin kináza; • regulace mitotického buněčného cyklu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	80279
	80280
	ENSG00000108465
	ENSMUSG00000018669
	Q96JB5
	Q99LM2
NM_001278197; NM_001278198; NM_001278216; NM_001278217; NM_025197;
	NM_176095; NM_176096
	NM_030248; NM_001308183; NM_001363255; NM_001363256
	NP_001265126; NP_001265127; NP_001265145; NP_001265146; NP_788276
	NP_001295112; NP_084524; NP_001350184; NP_001350185
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein sdružený s regulační podjednotkou CDK5 3 je protein že u lidí je kódován CDK5RAP3 gen.^[5]^[6]

Neuronální CDC2 kináza, která se podílí na regulaci neuronální diferenciace, se skládá z katalytické podjednotky, CDK5 a aktivační podjednotka, p25NCK5A. Protein kódovaný tímto genem se váže na p25NCK5A, a proto může být zapojen do neuronální diferenciace. Kódovaný protein, který může být substrátem neuronové kinázy podobné CDC2, byl také nalezen ve vaskulárních endoteliálních buňkách, kde zprostředkovává proliferace buněk.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000108465 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018669 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ching YP, Qi Z, Wang JH (duben 2000). "Klonování tří nových neuronálních proteinů vázajících se na aktivátor Cdk5". Gen. 242 (1–2): 285–94. doi:10.1016 / S0378-1119 (99) 00499-0. PMID 10721722.
^ ^A ^b "Entrez Gene: CDK5RAP3 CDK5 regulační podjednotka asociovaný protein 3".

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Wang X, Ching YP, Lam WH a kol. (2000). "Identifikace společné asociační oblasti proteinu v neuronálním aktivátoru Cdk5". J. Biol. Chem. 275 (41): 31763–9. doi:10,1074 / jbc.M004358200. PMID 10915792.
Ching YP, Pang AS, Lam WH a kol. (2002). "Identifikace neuronálního proteinu vázajícího se na aktivátor Cdk5 jako inhibitoru Cdk5". J. Biol. Chem. 277 (18): 15237–40. doi:10,1074 / jbc.C200032200. PMID 11882646.
Chen J, Liu B, Liu Y a kol. (2002). „Nový gen IC53 stimuluje buněčnou proliferaci ECV304 a je upregulován v selhání srdce“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 294 (1): 161–6. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 00446-1. PMID 12054757.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Xie YH, He XH, Tang YT a kol. (2003). „Klonování a charakterizace lidského IC53-2, nového proteinu vázajícího aktivátor CDK5“. Cell Res. 13 (2): 83–91. doi:10.1038 / sj.cr.7290153. PMID 12737517. S2CID 22264922.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Cen H, Zheng S, Fang YM a kol. (2004). „Indukce exprese HSF1 je spojena se sporadickým kolorektálním karcinomem“. Svět J. Gastroenterol. 10 (21): 3122–6. doi:10,3748 / wjg.v10.i21.3122. PMC 4611254. PMID 15457556.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Jiang H, Luo S, Li H (2005). „Protein vázající se na aktivátor Cdk5 C53 reguluje apoptózu vyvolanou genotoxickým stresem prostřednictvím modulace kontrolního bodu poškození G2 / M DNA“. J. Biol. Chem. 280 (21): 20651–9. doi:10,1074 / jbc.M413431200. PMID 15790566.
Yin X, Warner DR, Roberts EA a kol. (2005). „Nová interakce mezi jaderným koaktivátorem CBP a proteinem vázajícím aktivátor CDK5 - C53“. Int. J. Mol. Med. 16 (2): 251–6. doi:10,3892 / ijmm.16.2.251. PMID 16012757.
Wang J, He X, Luo Y, Yarbrough WG (2006). „Nový protein vázající ARF (LZAP) mění regulaci ARF HDM2“. Biochem. J. 393 (Pt 2): 489–501. doi:10.1042 / BJ20050960. PMC 1360699. PMID 16173922.
Kim E, Chen F, Wang CC, Harrison LE (2006). „CDK5 je nový regulační protein v antiproliferaci indukované ligandem PPARgamma“. Int. J. Oncol. 28 (1): 191–4. doi:10.3892 / ijo.28.1.191. PMID 16327995.
Camargo LM, Collura V, Rain JC a kol. (2007). „Disrupted in Schizophrenia 1 Interactome: evidence for the close connectivity of risk genes and the potential synaptic basis for schizophrenia“. Mol. Psychiatrie. 12 (1): 74–86. doi:10.1038 / sj.mp.4001880. PMID 17043677.
Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
Stav D, Bar I, Sandbank J (2007). „Užitečnost genů CDK5RAP3, CCNB2 a RAGE pro diagnostiku adenokarcinomu plic“. Int. J. Biol. markery. 22 (2): 108–13. doi:10.5301 / jbm.2008.3142. PMID 17549666.
Wang J, An H, Mayo MW a kol. (2007). „LZAP, domnělý supresor nádoru, selektivně inhibuje NF-kappaB“. Rakovinová buňka. 12 (3): 239–51. doi:10.1016 / j.ccr.2007.07.002. PMID 17785205.

externí odkazy

Člověk CDK5RAP3 umístění genomu a CDK5RAP3 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000108465 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018669 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10721722-5] Ching YP, Qi Z, Wang JH (duben 2000). "Klonování tří nových neuronálních proteinů vázajících se na aktivátor Cdk5". Gen. 242 (1–2): 285–94. doi:10.1016 / S0378-1119 (99) 00499-0. PMID 10721722.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: CDK5RAP3 CDK5 regulační podjednotka asociovaný protein 3".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]