SADA bílkovin - Protein SET

SOUBOR
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2E50
Identifikátory
Aliasy	SOUBOR, 2PP2A, I2PP2A, IGAAD, IPP2A2, PHAPII, TAF-I, TAF-IBETA, SET nukleární protoonkogen, MRD58
Externí ID	OMIM: 600960 MGI: 1860267 HomoloGene: 55707 Genové karty: SOUBOR
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	128,696,400 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	30,072,577 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • histonová vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita inhibitoru proteinové fosfatázy; • aktivita regulátoru proteinové fosfatázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • nukleoplazma; • endoplazmatické retikulum; • perinukleární oblast cytoplazmy; • buněčné jádro; • lipidová kapička; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• negativní regulace neuronového apoptotického procesu; • shromáždění nukleosomů; • regulace stability mRNA; • replikace DNA; • demontáž nukleosomu; • nukleocytoplazmatický transport; • GO: virový proces 0022415; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • negativní regulace acetylace histonů; • GO: 0048553 negativní regulace katalytické aktivity; • GO: 0048552 regulace katalytické aktivity; • negativní regulace aktivity fosfoprotein fosfatázy; • regulace aktivity fosfoprotein fosfatázy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6418
	56086
	ENSG00000119335
	ENSMUSG00000054766
	Q01105
	Q9EQU5
	NM_001122821; NM_001248000; NM_001248001; NM_003011; NM_001374326
	NM_001204875; NM_023871
	NP_001116293; NP_001234929; NP_001234930; NP_003002; NP_001361255
	NP_001191804; NP_076360
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

SADA bílkovin je protein že u lidí je kódován SOUBOR gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

Protein SET bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000119335 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000054766 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ von Lindern M, van Baal S, Wiegant J, Raap A, Hagemeijer A, Grosveld G (srpen 1992). „Can, domnělý onkogen spojený s myeloidní leukemogenezí, může být aktivován fúzí jeho 3 'poloviny s různými geny: charakterizace nastaveného genu“. Molekulární a buněčná biologie. 12 (8): 3346–55. doi:10,1128 / mcb. 12.8.3346. PMC 364582. PMID 1630450.
^ Li M, Makkinje A, Damuni Z (květen 1996). „Protein SET spojený s myeloidní leukémií je silným inhibitorem proteinové fosfatázy 2A“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (19): 11059–62. doi:10.1074 / jbc.271.19.11059. PMID 8626647.
^ "Entrez Gene: SET SET translocation (myeloid leukemia-associated)".
^ ^A ^b Seo SB, McNamara P, Heo S, Turner A, Lane WS, Chakravarti D (leden 2001). "Regulace acetylace a transkripce histonu pomocí INHAT, lidského buněčného komplexu obsahujícího onkoprotein". Buňka. 104 (1): 119–30. doi:10.1016 / s0092-8674 (01) 00196-9. PMID 11163245. S2CID 11144887.
^ Fan Z, Beresford PJ, Zhang D, Lieberman J (duben 2002). „HMG2 interaguje s proteinem SET nukleosomu a je cílem cytotoxické T-lymfocytární proteázy granzymu A“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (8): 2810–20. doi:10.1128 / mcb.22.8.2810-2820.2002. PMC 133744. PMID 11909973.
^ Qu D, Li Q, Lim HY, Cheung NS, Li R, Wang JH, Qi RZ (březen 2002). „Protein SET váže neuronový aktivátor Cdk5 p35nck5a a moduluje aktivitu Cdk5 / p35nck5a“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (9): 7324–32. doi:10,1074 / jbc.M107270200. PMID 11741927.
^ Miyamoto S, Suzuki T, Muto S, Aizawa K, Kimura A, Mizuno Y, Nagino T, Imai Y, Adachi N, Horikoshi M, Nagai R (prosinec 2003). „Pozitivní a negativní regulace kardiovaskulárního transkripčního faktoru KLF5 pomocí p300 a onkogenního regulátoru SET prostřednictvím interakce a acetylace na doméně vázající DNA“. Molekulární a buněčná biologie. 23 (23): 8528–41. doi:10.1128 / mcb.23.23.8528-8541.2003. PMC 262669. PMID 14612398.
^ Fan Z, Beresford PJ, Oh DY, Zhang D, Lieberman J (březen 2003). „Nádorový supresor NM23-H1 je DNáza aktivovaná granzymem A během apoptózy zprostředkované CTL a protein SET nukleosomu je jeho inhibitorem“. Buňka. 112 (5): 659–72. doi:10.1016 / s0092-8674 (03) 00150-8. PMID 12628186. S2CID 14019153.

Další čtení

Nagata K, Kawase H, Handa H, Yano K, Yamasaki M, Ishimi Y, Okuda A, Kikuchi A, Matsumoto K (květen 1995). „Replikační faktor kódovaný domnělým onkogenem, množinou asociovanou s myeloidní leukemogenezí“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 92 (10): 4279–83. doi:10.1073 / pnas.92.10.4279. PMC 41927. PMID 7753797.
Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Adachi Y, Pavlakis GN, Copeland TD (březen 1994). "Identifikace in vivo fosforylačních míst SET, nukleárního fosfoproteinu kódovaného hraničním bodem translokace u akutní nediferencované leukémie". FEBS Dopisy. 340 (3): 231–5. doi:10.1016/0014-5793(94)80144-4. PMID 8131851. S2CID 36974869.
Vaesen M, Barnikol-Watanabe S, Götz H, Awni LA, Cole T, Zimmermann B, Kratzin HD, Hilschmann N (únor 1994). "Čištění a charakterizace dvou domnělých proteinů asociovaných s HLA třídy II: PHAPI a PHAPII". Biologická chemie Hoppe-Seyler. 375 (2): 113–26. doi:10.1515 / bchm3.1994.375.2.113. PMID 8192856.
Adachi Y, Pavlakis GN, Copeland TD (leden 1994). "Identifikace a charakterizace SET, jaderného fosfoproteinu kódovaného bodem zlomu translokace u akutní nediferencované leukémie". The Journal of Biological Chemistry. 269 (3): 2258–62. PMID 8294483.
Adler HT, Nallaseth FS, Walter G, Tkachuk DC (listopad 1997). „HRX leukemické fúzní proteiny tvoří heterocomplex s proteinem SET spojeným s leukémií a proteinovou fosfatázou 2A“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (45): 28407–14. doi:10.1074 / jbc.272.45.28407. PMID 9353299.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Carlson SG, Eng E, Kim EG, Perlman EJ, Copeland TD, Ballermann BJ (říjen 1998). "Exprese SET, inhibitoru proteinové fosfatázy 2A, ve vývoji ledvin a Wilmsova nádoru". Časopis Americké nefrologické společnosti. 9 (10): 1873–80. PMID 9773788.
Brennan CM, Gallouzi IE, Steitz JA (říjen 2000). „Proteinové ligandy k HuR modulují jeho interakci s cílovými mRNA in vivo“. The Journal of Cell Biology. 151 (1): 1–14. doi:10.1083 / jcb.151.1.1. PMC 2189805. PMID 11018049.
Shikama N, Chan HM, Krstic-Demonacos M, Smith L, Lee CW, Cairns W, La Thangue NB (prosinec 2000). „Funkční interakce mezi proteiny shromáždění nukleosomů a koaktivátory rodiny proteinů vázajících p300 / CREB“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (23): 8933–43. doi:10.1128 / MCB.20.23.8933-8943.2000. PMC 86548. PMID 11073993.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Výzkum genomu. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Seo SB, McNamara P, Heo S, Turner A, Lane WS, Chakravarti D (leden 2001). "Regulace acetylace a transkripce histonu pomocí INHAT, lidského buněčného komplexu obsahujícího onkoprotein". Buňka. 104 (1): 119–30. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00196-9. PMID 11163245. S2CID 11144887.
Minakuchi M, Kakazu N, Gorrin-Rivas MJ, Abe T, Copeland TD, Ueda K, Adachi Y (březen 2001). „Identifikace a charakterizace SEB, nového proteinu, který se váže na akutní nediferencovaný protein spojený s leukémií SET“ (PDF). European Journal of Biochemistry / FEBS. 268 (5): 1340–51. doi:10.1046 / j.1432-1327.2001.02000.x. hdl:2433/150179. PMID 11231286.
Beresford PJ, Zhang D, Oh DY, Fan Z, Greer EL, Russo ML, Jaju M, Lieberman J (listopad 2001). „Granzym A aktivuje na endoplazmatickém retikulu asociovanou nukleázu nezávislou na kaspáze za účelem vyvolání jednořetězcových vniknutí DNA“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (46): 43285–93. doi:10,1074 / jbc.M108137200. PMID 11555662.
Qu D, Li Q, Lim HY, Cheung NS, Li R, Wang JH, Qi RZ (březen 2002). „Proteinový SET váže neuronový aktivátor Cdk5 p35nck5a a moduluje aktivitu Cdk5 / p35nck5a“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (9): 7324–32. doi:10,1074 / jbc.M107270200. PMID 11741927.
Fan Z, Beresford PJ, Zhang D, Lieberman J (duben 2002). „HMG2 interaguje s proteinem SET nukleosomu a je cílem cytotoxické T-lymfocytární proteázy granzymu A“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (8): 2810–20. doi:10.1128 / MCB.22.8.2810-2820.2002. PMC 133744. PMID 11909973.
Cervoni N, Detich N, Seo SB, Chakravarti D, Szyf M (červenec 2002). „Sada onkoproteinů / TAF-1 beta, inhibitor histon acetyltransferázy, inhibuje aktivní demetylaci DNA, integruje methylaci DNA a umlčování transkripce.“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (28): 25026–31. doi:10,1074 / jbc.M202256200. PMID 11978794.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000119335 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000054766 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1630450-5] von Lindern M, van Baal S, Wiegant J, Raap A, Hagemeijer A, Grosveld G (srpen 1992). „Can, domnělý onkogen spojený s myeloidní leukemogenezí, může být aktivován fúzí jeho 3 'poloviny s různými geny: charakterizace nastaveného genu“. Molekulární a buněčná biologie. 12 (8): 3346–55. doi:10,1128 / mcb. 12.8.3346. PMC 364582. PMID 1630450.

[pmid8626647-6] Li M, Makkinje A, Damuni Z (květen 1996). „Protein SET spojený s myeloidní leukémií je silným inhibitorem proteinové fosfatázy 2A“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (19): 11059–62. doi:10.1074 / jbc.271.19.11059. PMID 8626647.

[entrez-7] "Entrez Gene: SET SET translocation (myeloid leukemia-associated)".

[pmid11163245-8] A ^b Seo SB, McNamara P, Heo S, Turner A, Lane WS, Chakravarti D (leden 2001). "Regulace acetylace a transkripce histonu pomocí INHAT, lidského buněčného komplexu obsahujícího onkoprotein". Buňka. 104 (1): 119–30. doi:10.1016 / s0092-8674 (01) 00196-9. PMID 11163245. S2CID 11144887.

[pmid11909973-9] Fan Z, Beresford PJ, Zhang D, Lieberman J (duben 2002). „HMG2 interaguje s proteinem SET nukleosomu a je cílem cytotoxické T-lymfocytární proteázy granzymu A“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (8): 2810–20. doi:10.1128 / mcb.22.8.2810-2820.2002. PMC 133744. PMID 11909973.

[pmid11741927-10] Qu D, Li Q, Lim HY, Cheung NS, Li R, Wang JH, Qi RZ (březen 2002). „Protein SET váže neuronový aktivátor Cdk5 p35nck5a a moduluje aktivitu Cdk5 / p35nck5a“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (9): 7324–32. doi:10,1074 / jbc.M107270200. PMID 11741927.

[pmid14612398-11] Miyamoto S, Suzuki T, Muto S, Aizawa K, Kimura A, Mizuno Y, Nagino T, Imai Y, Adachi N, Horikoshi M, Nagai R (prosinec 2003). „Pozitivní a negativní regulace kardiovaskulárního transkripčního faktoru KLF5 pomocí p300 a onkogenního regulátoru SET prostřednictvím interakce a acetylace na doméně vázající DNA“. Molekulární a buněčná biologie. 23 (23): 8528–41. doi:10.1128 / mcb.23.23.8528-8541.2003. PMC 262669. PMID 14612398.

[pmid12628186-12] Fan Z, Beresford PJ, Oh DY, Zhang D, Lieberman J (březen 2003). „Nádorový supresor NM23-H1 je DNáza aktivovaná granzymem A během apoptózy zprostředkované CTL a protein SET nukleosomu je jeho inhibitorem“. Buňka. 112 (5): 659–72. doi:10.1016 / s0092-8674 (03) 00150-8. PMID 12628186. S2CID 14019153.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]