CDK5RAP2 - CDK5RAP2

CDK5RAP2
Identifikátory
AliasyCDK5RAP2, C48, Cep215, MCPH3, CDK5 regulační podjednotka asociovaný protein 2
Externí IDOMIM: 608201 MGI: 2384875 HomoloGene: 49533 Genové karty: CDK5RAP2
Umístění genu (člověk)
Chromozom 9 (lidský)
Chr.Chromozom 9 (lidský)[1]
Chromozom 9 (lidský)
Genomické umístění pro CDK5RAP2
Genomické umístění pro CDK5RAP2
Kapela9q33.2Start120,388,869 bp[1]
Konec120,580,170 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE CDK5RAP2 gnf1h09333 s na fs.png

PBB GE CDK5RAP2 220935 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

55755

214444

Ensembl

ENSG00000136861

ENSMUSG00000039298

UniProt

Q96SN8

P68254
Q8K389

RefSeq (mRNA)

NM_001011649
NM_001272039
NM_018249

NM_145990
NM_001313762

RefSeq (protein)

NP_001011649
NP_001258968
NP_060719

NP_035869
NP_001300691
NP_666102

Místo (UCSC)Chr 9: 120,39 - 120,58 MbChr 4: 70,22 - 70,41 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Protein sdružený s regulační podjednotkou CDK5 2 je protein že u lidí je kódován CDK5RAP2 gen. Má nezbytné role v formace a stabilita mikrotubuly z centrosome[5] a bylo zjištěno, že souvisí s variací velikosti lidského mozku u mužů.[6] Pro tento gen existuje několik variant transkriptu, ale byla stanovena celovečerní povaha pouze dvou.[7][8]

CDK5RAP2 je homologní do Drosophila protein centrosomin (CNN)[9] a paralogní na myomegalin, který u savců obsahuje Olduvai doména, doména zapojená do vývoje velikosti lidského mozku.[10][11]

Funkce

CDK5RAP2 je nezbytný pro správné použití formace, ukotvení a orientace mikrotubuly z centrosome. To se váže na y-tubulin prsten komplex (γTuRC), a to je nutné, aby se γTuRC připojil k centrosomu.[5] CDK5RAP2 se také váže na p25, formu CDK5R1 který slouží jako aktivační podjednotka CDK5, který se podílí na regulaci neuronů diferenciace. CDK5RAP2 proto hraje roli v neuronální diferenciaci.[8] CDK5RAP2 je také nezbytný jako a lešení protein v centrosomální korona z Dictyostelium.[12]

Klinický význam

Variace velikosti lidského mozku

An MRI studie prokázala souvislost mezi běžnou lidskou variací v genu CDK5RAP2 a strukturou mozku. Přesněji řečeno, asociace byly nalezeny mezi několika jednonukleotidové polymorfismy (SNP) a mozek kortikální povrch a celkový objem mozku. Tyto asociace byly nalezeny výhradně u mužských subjektů a všechny SNP byly lokalizovány buď v posledních 7 introny nebo po proudu genu. Jejich funkční význam loci zatím není známa. Vzhledem k jejich umístění blízko k regulační prvky, je možné, že jsou zapojeni do genová regulace, což naznačuje, že společná odchylka ve struktuře mozku může být spojena spíše s rozdíly v regulaci genů než ve struktuře proteinů, což odpovídá nálezům v jiných komplexních lidských vlastnostech.[6] CDK5RAP2 je paralog z myomegalin, který u savců obsahuje Olduvai doména, doména s duplikacemi specifickými pro člověka, které se podílejí na vývoji velikosti lidského mozku.[10][11]

Autosomálně recesivní primární mikrocefalie

Mutace v CDK5RAP2 způsobují autozomálně recesivní primární mikrocefalie typ 3.[13][5]

Interakce

CDK5RAP2 bylo prokázáno komunikovat s CDK5R1[14] a pericentrin (PCTN).[8]

Dějiny

Gen byl objeven v roce 2000[15] a byla poprvé charakterizována v roce 2007.[5]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136861 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000039298 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b C d Fong KW, Choi YK, Rattner JB, Qi RZ (leden 2008). „CDK5RAP2 je pericentriolární protein, který funguje při centrosomálním připojení komplexu gama-tubulinového kruhu“. Molekulární biologie buňky. 19 (1): 115–25. doi:10,1091 / mbc.E07-04-0371. PMC  2174194. PMID  17959831.
  6. ^ A b Rimol LM, Agartz I, Djurovic S, Brown AA, Roddey JC, Kähler AK a kol. (Leden 2010). „Na pohlaví závislá asociace běžných variant genů mikrocefalie se strukturou mozku“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 107 (1): 384–8. doi:10.1073 / pnas.0908454107. PMC  2806758. PMID  20080800.
  7. ^ Ching YP, Qi Z, Wang JH (leden 2000). "Klonování tří nových neuronálních proteinů vázajících se na aktivátor Cdk5". Gen. 242 (1–2): 285–94. doi:10.1016 / S0378-1119 (99) 00499-0. PMID  10721722.
  8. ^ A b C "Entrez Gene: CDK5RAP2 CDK5 regulační podjednotka asociovaný protein 2".
  9. ^ Barr AR, Kilmartin JV, Gergely F (duben 2010). „CDK5RAP2 funguje v připojení centrosomu k vřetenovému pólu a reakci na poškození DNA“. The Journal of Cell Biology. 189 (1): 23–39. doi:10.1083 / jcb.200912163. PMC  2854379. PMID  20368616.
  10. ^ A b Dumas L, Kim YH, Karimpour-Fard A, Cox M, Hopkins J, Pollack JR, Sikela JM (září 2007). „Variace počtu genových kopií trvající 60 milionů let vývoje člověka a primátů“. Výzkum genomu. 17 (9): 1266–77. doi:10,1101 / gr. 657307. PMC  1950895. PMID  17666543.
  11. ^ A b O'Bleness MS, Dickens CM, Dumas LJ, Kehrer-Sawatzki H, Wyckoff GJ, Sikela JM (září 2012). „Evoluční historie a organizace genomu proteinových domén DUF1220“. G3. 2 (9): 977–86. doi:10,1534 / g3,112.003061. PMC  3429928. PMID  22973535.
  12. ^ Pitzen V, Askarzada S, Gräf R, Meyer I (duben 2018). „CDK5RAP2 je základní protein lešení korony centrozomu Dictyostelium“. Buňky. 7 (4): 32. doi:10,3390 / buňky7040032. PMC  5946109. PMID  29690637.
  13. ^ „OMIM Entry - # 604804 - MICROCEPHALY 3, PRIMARY, AUTOSOMAL RECESSIVE; MCPH3“. www.omim.org. Citováno 2020-01-06.
  14. ^ Wang X, Ching YP, Lam WH, Qi Z, Zhang M, Wang JH (říjen 2000). "Identifikace společné asociační oblasti proteinu v neuronálním aktivátoru Cdk5". The Journal of Biological Chemistry. 275 (41): 31763–9. doi:10,1074 / jbc.M004358200. PMID  10915792.
  15. ^ Ching YP, Qi Z, Wang JH (leden 2000). "Klonování tří nových neuronálních proteinů vázajících se na aktivátor Cdk5". Gen. 242 (1–2): 285–94. doi:10.1016 / S0378-1119 (99) 00499-0. PMID  10721722.

Další čtení

externí odkazy