CDK5RAP1 - CDK5RAP1

CDK5RAP1
Identifikátory
Aliasy	CDK5RAP1, C20orf34, C42, CGI-05, HSPC167, CDK5 regulační podjednotka asociovaný protein 1
Externí ID	OMIM: 608200 MGI: 1914221 HomoloGene: 9502 Genové karty: CDK5RAP1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	33,401,561 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	154,373,010 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu; • aktivita transferázy; • vazba klastru železo-síra; • katalytická aktivita; • vazba protein kinázy; • vazba kovových iontů; • Aktivita N6-isopentenyladenosin methylthiotransferázy; • 4 vazby železa, 4 síry;
Buněčná složka	• cytoplazma; • mitochondrie; • buněčná složka;
Biologický proces	• regulace neuronové diferenciace; • vývoj mozku; • regulace aktivity cyklin-dependentního proteinu serin / threonin kináza; • negativní regulace aktivity cyklin-dependentního proteinu serin / threonin kinázy; • modifikace tRNA; • pozitivní regulace mitochondriálního překladu; • modifikace mitochondriální tRNA; • pozitivní regulace věrnosti překladu; • Methylthiolace tRNA; • GO: 0016547 RNA modifikace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51654
	66971
	ENSG00000101391
	ENSMUSG00000027487
	Q96SZ6
	Q8BTW8
NM_001278167; NM_001278168; NM_001278169; NM_016082; NM_016408;
	NM_001365728
	NM_025876
NP_001265096; NP_001265097; NP_001265098; NP_057166; NP_057492;
	NP_001352657
	NP_080152
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein spojený s regulační podjednotkou CDK5 1 je protein že u lidí je kódován CDK5RAP1 gen.^[5]^[6]^[7]^[8]

Neuronální CDC2 kináza, který se podílí na regulaci neuronů diferenciace, se skládá z katalytické podjednotky, CDK5 a aktivační podjednotku p25NCK5A. Protein kódovaný tímto genem se váže na p25NCK5A, a proto může být zapojen do neuronální diferenciace. Násobek varianty přepisu pro tento gen existují, ale byly stanoveny přirozenosti všech dvou jedinců.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101391 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027487 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ching YP, Qi Z, Wang JH (duben 2000). "Klonování tří nových neuronálních proteinů vázajících se na aktivátor Cdk5". Gen. 242 (1–2): 285–94. doi:10.1016 / S0378-1119 (99) 00499-0. PMID 10721722.
^ Ching YP, Pang AS, Lam WH, Qi RZ, Wang JH (duben 2002). "Identifikace neuronálního proteinu vázajícího se na aktivátor Cdk5 jako inhibitoru Cdk5". J Biol Chem. 277 (18): 15237–40. doi:10,1074 / jbc.C200032200. PMID 11882646.
^ Zou X, Ji C, Jin F, Liu J, Wu M, Zheng H, Wang Y, Li X, Xu J, Gu S, Xie Y, Mao Y (srpen 2004). "Klonování, charakterizace a exprese CDK5RAP1_v3 a CDK5RAP1_v4, dvou nových variant sestřihu lidského CDK5RAP1". Geny Genet Syst. 79 (3): 177–82. doi:10,1266 / ggs.79,177. PMID 15329498.
^ ^A ^b "Entrez Gene: CDK5RAP1 CDK5 regulační podjednotka asociovaná s proteinem 1".

externí odkazy

Člověk CDK5RAP1 umístění genomu a CDK5RAP1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY a kol. (2000). „Identifikace nových lidských genů evolučně konzervovaných u Caenorhabditis elegans srovnávací proteomikou“. Genome Res. 10 (5): 703–13. doi:10,1101 / gr. 10.703. PMC 310876. PMID 10810093.
Wang X, Ching YP, Lam WH a kol. (2000). "Identifikace společné asociační oblasti proteinu v neuronálním aktivátoru Cdk5". J. Biol. Chem. 275 (41): 31763–9. doi:10,1074 / jbc.M004358200. PMID 10915792.
Zhang QH, Ye M, Wu XY a kol. (2001). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Genome Res. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J a kol. (2002). „Sekvence DNA a komparativní analýza lidského chromozomu 20“. Příroda. 414 (6866): 865–71. doi:10.1038 / 414865a. PMID 11780052.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Lehner B, Sanderson CM (2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Genome Res. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Tento článek o gen na lidský chromozom 20 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101391 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027487 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10721722-5] Ching YP, Qi Z, Wang JH (duben 2000). "Klonování tří nových neuronálních proteinů vázajících se na aktivátor Cdk5". Gen. 242 (1–2): 285–94. doi:10.1016 / S0378-1119 (99) 00499-0. PMID 10721722.

[pmid11882646-6] Ching YP, Pang AS, Lam WH, Qi RZ, Wang JH (duben 2002). "Identifikace neuronálního proteinu vázajícího se na aktivátor Cdk5 jako inhibitoru Cdk5". J Biol Chem. 277 (18): 15237–40. doi:10,1074 / jbc.C200032200. PMID 11882646.

[pmid15329498-7] Zou X, Ji C, Jin F, Liu J, Wu M, Zheng H, Wang Y, Li X, Xu J, Gu S, Xie Y, Mao Y (srpen 2004). "Klonování, charakterizace a exprese CDK5RAP1_v3 a CDK5RAP1_v4, dvou nových variant sestřihu lidského CDK5RAP1". Geny Genet Syst. 79 (3): 177–82. doi:10,1266 / ggs.79,177. PMID 15329498.

[entrez-8] A ^b "Entrez Gene: CDK5RAP1 CDK5 regulační podjednotka asociovaná s proteinem 1".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]