BCR (gen) - BCR (gene) - Wikipedia

BCR
PBB Protein BCR image.jpg
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyBCR, Bcr, 5133400C09Rik, AI561783, AI853148, mKIAA3017, ALL, BCR1, CML, D22S11, D22S662, PHL, RhoGEF a GTPáza aktivující protein, BCR gen, BCR aktivátor RhoGEF a GTPáza
Externí IDOMIM: 151410 MGI: 88141 HomoloGene: 3192 Genové karty: BCR
Umístění genu (člověk)
Chromozom 22 (lidský)
Chr.Chromozom 22 (lidský)[1]
Chromozom 22 (lidský)
Genomická poloha pro BCR
Genomická poloha pro BCR
Kapela22q11.23Start23,179,704 bp[1]
Konec23,318,037 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

613

110279

Ensembl

ENSG00000186716

ENSMUSG00000009681

UniProt

P11274

Q6PAJ1

RefSeq (mRNA)

NM_004327
NM_021574

NM_001081412

RefSeq (protein)

NP_004318
NP_067585

NP_001074881

Místo (UCSC)Chr 22: 23,18 - 23,32 MbChr 10: 75,06 - 75,18 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš
Bcr-Abl onkoproteinová oligomerizační doména
PDB 1k1f EBI.jpg
struktura domény oligomerizace bcr-abl onkoproteinu
Identifikátory
SymbolBcr-Abl_Oligo
PfamPF09036
InterProIPR015123

The breakpoint cluster region protein (BCR) také známý jako antigen ledvinového karcinomu NY-REN-26 je protein že u lidí je kódován BCR gen. BCR je jedním ze dvou genů v BCR-ABL komplex, který je spojen s Philadelphia chromozom. Pro tento gen byly nalezeny dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy.

Funkce

Ačkoli BCR-ABL fúzní protein byl rozsáhle studován, funkce normálního produktu genu BCR není jasná. Protein má serin / threonin kináza činnost a je a guaninový nukleotidový výměnný faktor pro rodinu Rho GTPasy počítaje v to RhoA.[5][6]

Klinický význam

Reciproční translokace mezi chromozomy 22 a 9 produkuje chromozom Philadelphia, který se často vyskytuje u pacientů s chronická myeloidní leukémie. Hraniční bod chromozomu 22 pro tuto translokaci je umístěn uvnitř BCR gen. Translokace produkuje fúzní protein, který je kódován sekvencí z obou BCR a ABL, gen v bodě zlomu chromozomu 9.[7]

Struktura

BCR-ABL onkoproteinová oligomerizační doména nalezená na N-konec BCR je zásadní pro onkogenicita fúzního proteinu BCR-ABL. BCR-ABL onkoproteinová oligomerizační doména se skládá z krátkého N-konce spirála (alfa-1), flexibilní smyčka a dlouhý C-terminální šroubovice (alfa-2). Společně tvoří strukturu ve tvaru písmene N, přičemž smyčka umožňuje tyto dva šroubovice předpokládat paralelní orientaci. Monomerní domén přidružit se k dimer vytvořením antiparalelní svinutá cívka mezi spirálami alfa-2 a výměnou domén dvou spirál alfa-1, kde se jedna spirála alfa-1 otočí zpět a sbalí se proti spirále alfa-2 z druhé monomer. Dva dimery pak přidružit do tetramer.[8]

Interakce

Bylo prokázáno, že protein BCR komunikovat s:

Viz také

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000186716 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000009681 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Dubash, Adi D .; Koetsier, Jennifer L .; Amargo, Evangeline V .; Najor, Nicole A .; Harmon, Robert M .; Green, Kathleen J. (2013-08-19). „GEF Bcr aktivuje signalizaci RhoA / MAL na podporu diferenciace keratinocytů prostřednictvím desmogleinu-1“. The Journal of Cell Biology. 202 (4): 653–666. doi:10.1083 / jcb.201304133. ISSN  0021-9525. PMC  3747303. PMID  23940119.
  6. ^ „Entrez Gene: Breakpoint cluster region“.
  7. ^ „Entrez Gene: BCR breakpoint cluster region“.
  8. ^ Zhao X, Ghaffari S, Lodish H, Malashkevich VN, Kim PS (únor 2002). "Struktura domény oligomerizace onkoproteinů Bcr-Abl". Nat. Struct. Biol. 9 (2): 117–20. doi:10.1038 / nsb747. PMID  11780146.
  9. ^ A b C Puil L, Liu J, Gish G, Mbamalu G, Bowtell D, Pelicci PG, Arlinghaus R, Pawson T (únor 1994). „Bcr-Abl onkoproteiny se vážou přímo na aktivátory Ras signální dráhy“. EMBO J.. 13 (4): 764–73. doi:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06319.x. PMC  394874. PMID  8112292.
  10. ^ Ling X, Ma G, Sun T, Liu J, Arlinghaus RB (leden 2003). "Interakce Bcr a Abl: onkogenní aktivace c-Abl sekvestrací Bcr". Cancer Res. 63 (2): 298–303. PMID  12543778.
  11. ^ Pendergast AM, Muller AJ, Havlik MH, Maru Y, Witte ON (červenec 1991). „BCR sekvence nezbytné pro transformaci onkogenem BCR-ABL se váží na regulační doménu ABL SH2 způsobem nezávislým na fosfotyrosinu“. Buňka. 66 (1): 161–71. doi:10.1016 / 0092-8674 (91) 90148-R. PMID  1712671.
  12. ^ Hallek M, Danhauser-Riedl S, Herbst R, Warmuth M, Winkler A, Kolb HJ, Druker B, Griffin JD, Emmerich B, Ullrich A (červenec 1996). "Interakce receptoru tyrosinkinázy p145c-kit s p210bcr / abl kinázou v myeloidních buňkách". Br. J. Haematol. 94 (1): 5–16. doi:10.1046 / j.1365-2141.1996.6102053.x. PMID  8757502.
  13. ^ A b C d Bai RY, Jahn T, Schrem S, Munzert G, Weidner KM, Wang JY, Duyster J (srpen 1998). "Adaptérový protein GRB10 obsahující SH2 interaguje s BCR-ABL." Onkogen. 17 (8): 941–8. doi:10.1038 / sj.onc.1202024. PMID  9747873.
  14. ^ A b Million RP, Harakawa N, Roumiantsev S, Varticovski L, Van Etten RA (červen 2004). „Přímé vazebné místo pro Grb2 přispívá k transformaci a leukemogenezi pomocí tyrosinkinázy Tel-Abl (ETV6-Abl)“. Mol. Buňka. Biol. 24 (11): 4685–95. doi:10.1128 / MCB.24.11.4685-4695.2004. PMC  416425. PMID  15143164.
  15. ^ Heaney C, Kolibaba K, Bhat A, Oda T, Ohno S, Fanning S, Druker BJ (leden 1997). "Přímá vazba CRKL na BCR-ABL není pro transformaci BCR-ABL vyžadována." Krev. 89 (1): 297–306. doi:10.1182 / krev.V89.1.297. PMID  8978305.
  16. ^ Kolibaba KS, Bhat A, Heaney C, Oda T, Druker BJ (březen 1999). "Vazba CRKL na transformaci BCR-ABL a BCR-ABL". Leuku. Lymfom. 33 (1–2): 119–26. doi:10.3109/10428199909093732. PMID  10194128.
  17. ^ Lionberger JM, Smithgall TE (únor 2000). „Protein-tyrosinkináza c-Fes potlačuje na cytokinech nezávislý růst buněk myeloidní leukémie indukovaný Bcr-Abl.“ Cancer Res. 60 (4): 1097–103. PMID  10706130.
  18. ^ A b C Maru Y, Peters KL, Afar DE, Shibuya M, Witte ON, Smithgall TE (únor 1995). „Tyrosinová fosforylace BCR pomocí FPS / FES protein-tyrosinkinázy indukuje asociaci BCR s GRB-2 / SOS“. Mol. Buňka. Biol. 15 (2): 835–42. doi:10.1128 / MCB.15.2.835. PMC  231961. PMID  7529874.
  19. ^ Million RP, Van Etten RA (červenec 2000). „Vazebné místo Grb2 je nutné pro indukci chronického onemocnění podobného myeloidní leukémii u myší pomocí tyrosinkinázy Bcr / Abl.“ Krev. 96 (2): 664–70. doi:10.1182 / krev.V96.2.664. PMID  10887132.
  20. ^ Ma G, Lu D, Wu Y, Liu J, Arlinghaus RB (květen 1997). "Bcr fosforylován na tyrosinu 177 váže Grb2". Onkogen. 14 (19): 2367–72. doi:10.1038 / sj.onc.1201053. PMID  9178913.
  21. ^ Stanglmaier M, Warmuth M, Kleinlein I, Reis S, Hallek M (únor 2003). „Interakce tyrosinkinázy Bcr-Abl s kinázou Src Hck je zprostředkována několika vazebnými doménami“. Leukémie. 17 (2): 283–9. doi:10.1038 / sj.leu.2402778. PMID  12592324.
  22. ^ Lionberger JM, Wilson MB, Smithgall TE (červen 2000). „Transformace buněk myeloidní leukémie na nezávislost na cytokinech pomocí Bcr-Abl je potlačena kinázovým defektem Hck“. J. Biol. Chem. 275 (24): 18581–5. doi:10,1074 / jbc.C000126200. PMID  10849448.
  23. ^ Radziwill G, Erdmann RA, Margelisch U, Moelling K (červenec 2003). "Bcr kináza downregulates Ras signalizaci fosforylací AF-6 a ​​vazbou na jeho PDZ doménu". Mol. Buňka. Biol. 23 (13): 4663–72. doi:10.1128 / MCB.23.13.4663-4672.2003. PMC  164848. PMID  12808105.
  24. ^ A b Salgia R, Sattler M, Pisick E, Li JL, Griffin JD (únor 1996). „p210BCR / ABL indukuje tvorbu komplexů obsahujících proteiny fokální adheze a protoonkogenní produkt p120c-Cbl“. Exp. Hematol. 24 (2): 310–3. PMID  8641358.
  25. ^ Salgia R, Li JL, Lo SH, Brunkhorst B, Kansas GS, Sobhany ES, Sun Y, Pisick E, Hallek M, Ernst T (březen 1995). "Molekulární klonování lidského paxilinu, proteinu fokální adheze fosforylovaného P210BCR / ABL". J. Biol. Chem. 270 (10): 5039–47. doi:10.1074 / jbc.270.10.5039. PMID  7534286.
  26. ^ Skorski T, Kanakaraj P, Nieborowska-Skorska M, Ratajczak MZ, Wen SC, Zon G, Gewirtz AM, Perussia B, Calabretta B (červenec 1995). „Aktivita fosfatidylinositol-3 kinázy je regulována BCR / ABL a je nezbytná pro růst buněk pozitivních na chromozom Philadelphia.“ Krev. 86 (2): 726–36. PMID  7606002.
  27. ^ Liedtke M, Pandey P, Kumar S, Kharbanda S, Kufe D (říjen 1998). "Regulace Bcr-Abl indukované aktivity SAP kinázy a transformace proteinem SHPTP1 tyrosin fosfatáza". Onkogen. 17 (15): 1889–92. doi:10.1038 / sj.onc.1202117. PMID  9788431.
  28. ^ Park AR, Oh D, Lim SH, Choi J, Moon J, Yu DY, Park SG, Heisterkamp N, Kim E, Myung PK, Lee JR (2012). "Regulace dendritické arborizace BCR Rac1 GTPázou aktivujícím proteinem, substrátem PTPRT". J. Cell Sci. 125 (Pt 19): 4518–31. doi:10.1242 / jcs.105502. PMID  22767509.
  29. ^ Takeda N, Shibuya M, Maru Y (leden 1999). „Onkoprotein BCR-ABL potenciálně interaguje s proteinem skupiny X xeroderma pigmentosum“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 96 (1): 203–7. doi:10.1073 / pnas.96.1.203. PMC  15117. PMID  9874796.

Další čtení

  • Wang L, Seale J, Woodcock BE, Clark RE (2002). "e19a2-pozitivní chronická myeloidní leukémie s transkripty s deletovaným exonem E16 BCR". Leukémie. 16 (8): 1562–3. doi:10.1038 / sj.leu.2402600. PMID  12145699.

externí odkazy


Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR015123