Vulcanisaeta - Vulcanisaeta
Vulcanisaeta | |
---|---|
Vědecká klasifikace | |
Doména: | |
Království: | |
Kmen: | |
Třída: | |
Objednat: | |
Rodina: | |
Rod: | Vulcanisaeta Itoh, Suzuki & Nakase, 2002 |
Druh | |
v taxonomie, Vulcanisaeta je rod z Thermoproteaceae.
Popis a význam
Vulcanisaeta je anaerobní, heterotrofní, hypertermofilní archeon, který optimálně roste při 85–90 ° C a při pH 4,0–4,5. Organismus je izolován ze vzorků odebraných přímo ze solfatarických polí nebo z horké pramenité vody ve východním Japonsku.
Struktura genomu
Několik Vulcanisaeta genomy byly sekvenovány, viz Seznam sekvenovaných archaeal genomů. Předpokládá se, že obsah G + C v jeho DNA, který se pohybuje mezi 44 a 46%, bude relativně nižší než u ostatních členů Thermoproteaceae rody.
Struktura buněk a metabolismus
Buňky Vulcanisaeta jsou přímé až mírně zakřivené tyče, jejichž šířka se pohybuje od 0,4 do 0,6 μm. V některých případech jsou buňky rozvětvené nebo nesou na svorkách sférická tělesa. Archeon využívá jako zdroje uhlíku maltózu, škrob, malát, kvasnicový extrakt, pepton, hovězí extrakt, kasamino kyseliny a želatinu, nemůže využívat D-arabinóza, D-fruktóza, laktóza, sacharóza, D-xylóza, acetát, butyrát, mravenčan, fumarát, propionát, pyruvát, sukcinát, methanolu, formamid, methylamin nebo trimethylamin. Jako akceptory elektronů používá organismus síru a thiosíran. Na rozdíl od některých jiných geneticky podobných archaea, jako je Termocladium nebo Caldivirga, Vulcanisaeta roste v nepřítomnosti vitamínové směsi nebo roztoku buněčného extraktu z archaealu v médiu.
Ekologie
Kmeny Vulcanisaeta byly nalezeny v oblastech horkých pramenů v Japonsku. Přestože jsou organismy nejběžnější ve tvaru tyčinky crenarchaeote mezi izoláty z horkých pramenů v Japonsku se izoloval od ostatních zemí. To kontrastuje s rody Termoproteus a Pyrobaculum, které jsou distribuovány po celém světě, včetně Azory, Island, Indonésie, Itálie, Japonsko, Filipíny, Rusko a Spojené státy. Proto je možné, že rod Vulcanisaeta má omezenou distribuci, která zahrnuje Japonsko.[1]
Reference
- ^ Viz NCBI webové stránky na Vulcanisaeta. Data extrahovaná z „Zdroje taxonomie NCBI“. Národní centrum pro biotechnologické informace. Citováno 2007-03-19.
Další čtení
Vědecké časopisy
- Jay ZJ; JP. Paprsek; MA. Kozubal; Rdem Jennings; DB. Rusch & Inskeep WP (prosinec 2016). „Distribuce, rozmanitost a funkce převládajících Thermoproteales ve vysokoteplotním prostředí Yellowstonského národního parku“. Mikrobiologie prostředí. 18 (12): 4755–4769. doi:10.1111/1462-2920.13366. PMID 27130276.
- Jay ZJ, Inskeep WP (červenec 2015). „Distribuce, diverzita a význam intronů genu 16S rRNA v pořadí Thermoproteales“. Biology Direct. 10 (35): 35. doi:10.1186 / s13062-015-0065-6. PMC 4496867. PMID 26156036.
- Mavromatis, Konstantinos (2010). „Kompletní genomová sekvence kmene typu Vulcanisaeta distributa (IC-017 (T))“. Standardy v genomických vědách. 3 (2): 117–125. doi:10.4056 / sigs.1113067. PMC 3035369. PMID 21304741.
- Itoh T; Suzuki K; Nakase T (2002). „Vulcanisaeta distributa gen. Nov., Sp. Nov. A Vulcanisaeta souniana sp. Nov., Hypertermofilní, tyčinkovité crenarchaeoty izolované z horkých pramenů v Japonsku“. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52 (Pt 4): 1097–1104. doi:10.1099 / ijs.0.02152-0. PMID 12148613.
- Burggraf S; Huber H; Stetter KO (1997). „Reklasifikace objednávek a rodin crenarchaelů podle 16S rRNA sekvenčních dat“. Int. J. Syst. Bacteriol. 47 (3): 657–660. doi:10.1099/00207713-47-3-657. PMID 9226896.
- Zillig W; Stetter KO; Schafer W; Janekovic D; Wunderl S; Holz I; Palm P (1981). „Thermoproteales: nový typ extrémně termoacidofilních anaerobních archaeobakterií izolovaných z islandských solfatarů“. Zentralbl. Mikrobiol. Parasitenkd. Infektionskr. Hyg. Abt. 1 Orig. C2: 205–227.
Vědecké knihy
Vědecké databáze
- PubMed reference pro Vulcanisaeta
- PubMed Central reference pro Vulcanisaeta
- Reference Google Scholar pro Vulcanisaeta
externí odkazy
- Stránka taxonomie NCBI pro Vulcanisaeta
- Na stránkách taxonomie Tree of Life vyhledejte vulkánskou metodu
- Na stránce Species2000 vyhledejte Vulcanisaeta
- Stránka MicrobeWiki pro Vulcanisaeta
- Stránka LPSN pro Vulcanisaeta
Tento Crenarchaeota související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |