Tubby protein - Tubby protein

Tubby Protein
Tubby-1c8z-pymol.png
Tubby protein exprimovaný v myším mozku
Identifikátory
SymbolVana
PfamPF01167
InterProIPR000007
STRÁNKAPDOC00923
SCOP21c8z / Rozsah / SUPFAM
OPM nadčeleď104
OPM protein1i7e

The tubby protein je kódován VANA gen. Je to proti proudu buněčná signalizace protein společné mnohobuněčným eukaryoty. První buclatý gen byl identifikován v myši a proteiny, které jsou homologní tubby jsou známé jako „tubby podobné proteiny“ (TULP). Sdílejí společné a charakteristické terciární struktura který se skládá z a beta barel zabalený kolem alfa šroubovice v centrálním póru. Gen odvozuje svůj název od své role v metabolismu; u myší s mutovaným tubby genem se rozvine opožděný nástup obezita, senzorineurální ztráta sluchu a degenerace sítnice.[1][2][3]

Struktura

Tubby proteiny jsou klasifikovány jako α + β bílkoviny a mají 12-beta lanko hlaveň obklopující centrální alfa šroubovici. Tubby proteiny mohou vázat malé buněčná signalizace molekula fosfatidylinositol, který je obvykle lokalizován do buněčná membrána. Podobný strukturální záhyb jako Tubby podobné proteiny byl identifikován v Scramblase rodina proteinů.[4]

Funkce

Tubby proteiny byly zahrnuty jako transkripční faktory[5] a jako potenciální signalizační faktory spojené s G-protein aktivita.[6] Jsou spojeni s neuronální diferenciace a rozvoj a v savci jsou zapojeny do tří chorobných procesů, když zmutovaný: obezita, sítnice degenerace a ztráta sluchu.[5] Je známo, že u myší ovlivňují mutace tubby proteinů životnost a Tlustý úložný prostor[7] stejně jako uhlohydrát metabolismus.[8] Tubby domény se spojují s cytoplazmatickou stranou buněčné membrány prostřednictvím vazby různých fosfoinositidy[9]

Lidské proteiny obsahující tuto doménu

VANA; TULP1; TULP2; TULP3; TULP4;

externí odkazy

Reference

  1. ^ Noben-Trauth, K .; Naggert, J. K .; North, M. A .; Nishina, P. M. (1996). "Kandidátský gen pro myší mutaci tubby". Příroda. 380 (6574): 534–538. Bibcode:1996Natur.380..534N. doi:10.1038 / 380534a0. PMID  8606774. S2CID  4272027.
  2. ^ Kleyn, P. W .; Fan, W .; Kovats, S. G .; Lee, J. J .; Pulido, J. C .; Wu, Y .; Berkemeier, L. R .; Misumi, D. J .; Holmgren, L .; Charlat, O .; Woolf, E. A .; Tayber, O .; Brody, T .; Shu, P .; Hawkins, F .; Kennedy, B .; Baldini, L .; Ebeling, C .; Alperin, G. D .; Deeds, J .; Lakey, N. D .; Culpepper, J .; Chen, H .; Glücksmann-Kuis, M. A .; Carlson, G. A .; Duyk, G. M .; Moore, K. J. (1996). "Identifikace a charakterizace myšího genu obezity u myší: člen nové genové rodiny". Buňka. 85 (2): 281–290. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81104-6. PMID  8612280. S2CID  15670925.
  3. ^ Ohlemiller, KK; Hughes, RM; Mosinger-Ogilvie, J; Speck, JD; Grosof, DH; Silverman, MS (1995). "Kochleární a retinální degenerace u houbovité myši". NeuroReport. 6 (6): 845–9. doi:10.1097/00001756-199504190-00005. PMID  7612867. S2CID  8311280.
  4. ^ Bateman A, Finn RD, Sims PJ, Wiedmer T, Biegert A, Söding J (leden 2009). „Fosfolipidové scramblasy a tubby podobné proteiny patří do nové nadrodiny transkripčních faktorů vázaných na membránu“. Bioinformatika. 25 (2): 159–62. doi:10.1093 / bioinformatika / btn595. PMC  2639001. PMID  19010806.
  5. ^ A b Boggon, TJ; Shan, WS; Santagata, S; Myers, SC; Shapiro, L (1999). „Implikace tubby proteinů jako transkripčních faktorů strukturní funkční analýzou“. Věda. 286 (5447): 2119–25. doi:10.1126 / science.286.5447.2119. PMID  10591637.
  6. ^ Carroll, K; Gomez, C; Shapiro, L (2004). "Tubby proteiny: děj se zahušťuje". Nat Rev Mol Cell Biol. 5 (1): 55–63. doi:10.1038 / nrm1278. PMID  14708010. S2CID  7065010.
  7. ^ Mukhopadhyay, A; Deplancke, B; Walhout, AJ; Tissenbaum, HA (2005). „C. elegans tubby reguluje délku života a ukládání tuku dvěma nezávislými mechanismy“. Cell Metab. 2 (1): 35–42. doi:10.1016 / j.cmet.2005.06.004. PMID  16054097.
  8. ^ Wang, Y; Seburn, K; Bechtel, L; Lee, BY; Szatkiewicz, JP; Nishina, PM; Naggert, JK (2006). „Vadný metabolismus sacharidů u myší homozygotních pro tubby mutaci“. Fyziol. Genomika. 27 (2): 131–40. doi:10.1152 / physiolgenomics.00239.2005. PMID  16849632.
  9. ^ Cho, W. & Stahelin, R.V. (Červen 2005). "Interakce membrána-protein v buněčné signalizaci a přenosu na membránu". Roční přehled biofyziky a biomolekulární struktury. 34: 119–151. doi:10.1146 / annurev.biophys.33.110502.133337. PMID  15869386.