TUB (gen) - TUB (gene)

VANA
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1S31
Identifikátory
Aliasy	VANA, rd5, RDOB, tubby bipartitní transkripční faktor, TUB bipartitní transkripční faktor
Externí ID	OMIM: 601197 MGI: 2651573 HomoloGene: 31147 Genové karty: VANA
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	8,106,112 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	109,034,460 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba fosfatidylinositolu; • GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu; • Vazba na receptor spojený s G-proteinem; • vazba intraciliary transportní částice A.;
Buněčná složka	• cytoplazma; • extracelulární oblast; • cytosol; • buněčná membrána; • cilium; • membrána; • buněčné jádro;
Biologický proces	• fagocytóza, rozpoznávání; • lokalizace receptoru na nepohyblivé cilium; • reakce na hormon; • pozitivní regulace fagocytózy; • údržba fotoreceptorových buněk; • smyslové vnímání zvuku; • vývoj sítnice v oku kamerového typu; • lokalizace proteinu do vnějšího segmentu fotoreceptoru; • reakce na podnět; • fagocytóza; • lokalizace proteinu do cilium; • regulace signální dráhy receptorového proteinu spřaženého s G-proteinem; • intraciliary transport;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	7275
	22141
	ENSG00000166402
	ENSMUSG00000031028
	P50607
	P50586
	NM_003320; NM_177972
	NM_021885
	NP_003311; NP_813977
	NP_068685
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Tubby proteinový homolog je protein že u lidí je kódován VANA gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje člena rodiny Tubby bipartitních transkripčních faktorů. Kódovaný protein může hrát roli při obezitě a senzorineurální degradaci. Krystalová struktura byla stanovena pro podobný protein u myší a funguje jako regulátor transkripce vázaný na membránu, který se translokuje do jádra v reakci na hydrolýzu fosfoinositidu. Pro tento gen byly identifikovány dvě varianty transkriptu kódující odlišné izoformy.^[6]

Interakce

Ukázalo se, že TUB (gen) komunikovat s PLCG1.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000166402 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031028 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Kleyn PW, Fan W, Kovats SG, Lee JJ, Pulido JC, Wu Y, Berkemeier LR, Misumi DJ, Holmgren L, Charlat O, Woolf EA, Tayber O, Brody T, Shu P, Hawkins F, Kennedy B, Baldini L , Ebeling C, Alperin GD, Deeds J, Lakey ND, Culpepper J, Chen H, Glucksmann-Kuis MA, Carlson GA, Duyk GM, Moore KJ (červen 1996). "Identifikace a charakterizace myšího genu obezity u myší: člen nové genové rodiny". Buňka. 85 (2): 281–90. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81104-6. PMID 8612280. S2CID 15670925.
^ ^A ^b "Entrez Gene: TUB tubby homolog (myš)".
^ Kapeller, R; Moriarty A; Strauss A; Stubdal H; Theriault K; Siebert E; Chickering T; Morgenstern J P; Tartaglia LA; Lillie J (srpen 1999). „Tyrosinová fosforylace vany a její asociace s proteiny obsahujícími 2 doménu Src implikuje vanu v intracelulární signalizaci inzulínem“. J. Biol. Chem. SPOJENÉ STÁTY. 274 (35): 24980–6. doi:10.1074 / jbc.274.35.24980. ISSN 0021-9258. PMID 10455176.

Další čtení

Ikeda A, Nishina PM, Naggert JK (2002). "Tubby podobné proteiny, rodina s rolemi ve vývoji a funkci neuronů". J. Cell Sci. 115 (Pt 1): 9–14. PMID 11801719.
Jones JM, Meisler MH, Seldin MF a kol. (1992). „Lokalizace inzulínu-2 (Ins-2) a obezity mutantní tubby (tub) do odlišných oblastí myšího chromozomu 7“. Genomika. 14 (1): 197–9. doi:10.1016 / S0888-7543 (05) 80308-8. hdl:2027.42/29864. PMID 1358794.
North MA, Naggert JK, Yan Y a kol. (1997). „Molekulární charakterizace TUB, TULP1 a TULP2, členů nové rodiny genů tubby a jejich možný vztah k očním chorobám“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (7): 3128–33. Bibcode:1997PNAS ... 94.3128N. doi:10.1073 / pnas.94.7.3128. PMC 20333. PMID 9096357.
Kapeller R, Moriarty A, Strauss A a kol. (1999). „Tyrosinová fosforylace vany a její asociace s proteiny obsahujícími 2 doménu Src implikuje vanu v intracelulární signalizaci inzulínem“. J. Biol. Chem. 274 (35): 24980–6. doi:10.1074 / jbc.274.35.24980. PMID 10455176.
Boggon TJ, Shan WS, Santagata S a kol. (1999). „Implikace tubby proteinů jako transkripčních faktorů strukturní funkční analýzou“. Věda. 286 (5447): 2119–25. doi:10.1126 / science.286.5447.2119. PMID 10591637. S2CID 33506220.
He W, Ikeda S, Bronson RT a kol. (2001). "Exprese značená GFP a imunohistochemické studie ke stanovení subcelulární lokalizace členů rodiny tubby genů". Brain Res. Mol. Brain Res. 81 (1–2): 109–17. doi:10.1016 / S0169-328X (00) 00164-9. PMID 11000483.
Santagata S, Boggon TJ, Baird CL a kol. (2001). "Signalizace G-proteinu přes tubby proteiny". Věda. 292 (5524): 2041–50. doi:10.1126 / science.1061233. PMID 11375483. S2CID 29856557.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Shiri-Sverdlov R, Custers A, van Vliet-Ostaptchouk JV, et al. (2006). „Identifikace TUB jako nového kandidátského genu ovlivňujícího tělesnou hmotnost u lidí“. Cukrovka. 55 (2): 385–9. doi:10.2337 / diabetes.55.02.06.db05-0997. PMID 16443771.
Giannaccini G, Giusti L, Santini F a kol. (2007). "Tubby protein v lidských lymfocytech od pacientů s normální hmotností a obézních". Clin. Biochem. 40 (11): 806–9. doi:10.1016 / j.clinbiochem.2007.03.020. PMID 17498679.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P50607 (Homolog lidského tubby proteinu) na PDBe-KB.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P50586 (Mouse Tubby protein) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000166402 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031028 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8612280-5] Kleyn PW, Fan W, Kovats SG, Lee JJ, Pulido JC, Wu Y, Berkemeier LR, Misumi DJ, Holmgren L, Charlat O, Woolf EA, Tayber O, Brody T, Shu P, Hawkins F, Kennedy B, Baldini L , Ebeling C, Alperin GD, Deeds J, Lakey ND, Culpepper J, Chen H, Glucksmann-Kuis MA, Carlson GA, Duyk GM, Moore KJ (červen 1996). "Identifikace a charakterizace myšího genu obezity u myší: člen nové genové rodiny". Buňka. 85 (2): 281–90. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81104-6. PMID 8612280. S2CID 15670925.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: TUB tubby homolog (myš)".

[pmid10455176-7] Kapeller, R; Moriarty A; Strauss A; Stubdal H; Theriault K; Siebert E; Chickering T; Morgenstern J P; Tartaglia LA; Lillie J (srpen 1999). „Tyrosinová fosforylace vany a její asociace s proteiny obsahujícími 2 doménu Src implikuje vanu v intracelulární signalizaci inzulínem“. J. Biol. Chem. SPOJENÉ STÁTY. 274 (35): 24980–6. doi:10.1074 / jbc.274.35.24980. ISSN 0021-9258. PMID 10455176.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]