Totiviridae - Totiviridae
| Totiviridae | |
|---|---|
 | |
| Kapsidová struktura Virus Helminthosporium victoriae 190S (HvV190S) | |
 | |
| Cryo-EM HvV190S viriony. | |
Klasifikace virů  | |
| (bez hodnocení): | Virus |
| Oblast: | Riboviria |
| Království: | Orthornavirae |
| Kmen: | Duplornaviricota |
| Třída: | Chrymotiviricetes |
| Objednat: | Ghabrivirales |
| Rodina: | Totiviridae |
Totiviridae je rodina dvouvláknové RNA viry. Giardia lamblia, leishmania, trichomonas vaginalis, a houby slouží jako přirození hostitelé. Název skupiny je odvozen od latinský toti což znamená nerozdělené nebo celé. V současné době existuje v této rodině 28 druhů rozdělených mezi 5 rodů.[1][2]
Struktura
Viry v rodině Totiviridae jsou neobalené, dvouvláknové RNA viry s ikosahedrální geometrií a T = 2 symetrií. Virion se skládá z jediného kapsid bílkovin a je asi 40 nanometry v průměru.[1]
Genom
Genom se skládá z monopartitní lineární dvouvláknové molekuly RNA o velikosti 4,6–6,7 kilobází. Obsahuje dvě překrývající se otevřené čtecí rámce (ORF) - gag a pol - které kódují kapsidový protein a RNA-dependentní RNA polymeráza. Některé totiviry obsahují třetí malý potenciální ORF.[1]
Životní cyklus
Virová replikace je cytoplazmatická. Replikace sleduje model replikace dvouvláknového viru RNA. Transkripce dvouvláknového viru RNA je metoda transkripce. Překlad probíhá -1 posunem ribozomálních rámců, +1 posunem ribozomálních rámců, virovou iniciaci a RNA ukončení-opětovnou iniciaci. Virus opouští hostitelskou buňku pohybem mezi buňkami. Jako přirozený hostitel slouží prvoky Giardia lamblia, prvoky leishmania, prvoky trichomonas vaginalis a houby.[1]
| Rod | Podrobnosti o hostiteli | Tkáňový tropismus | Vstupní údaje | Podrobnosti o vydání | Replikační web | Místo montáže | Přenos |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Giardiavirus | Prvoci | Žádný | Endocytóza buněčných receptorů | Exocytóza | Cytoplazma | Cytoplazma | Pasivní difúze |
| Leishmaniavirus | Protozoa: leishmania | Žádný | Endocytóza buněčných receptorů | Buněčné dělení | Cytoplazma | Cytoplazma | Buněčné dělení |
| Totivirus | Houby: saccharomyces cerevisiae; houby: houby houby | Žádný | Cytoplazmatická výměna, sporogeneze; hyphal anastomóza | Cytoplazmatická výměna, sporogeneze; hyphal anastomóza | Cytoplazma | Cytoplazma | Buněčné dělení; sporogeneze; buněčná fúze |
| Victorivirus | Houby | Žádný | Neznámý | Neznámý | Cytoplazma | Cytoplazma | Neznámý |
| Trichomonasvirus | Prvoci | Endocytóza | Neznámý | Neznámý | Cytoplazma | Cytoplazma | Neznámý |
Taxonomie
Rodina Totiviridae má pět rodů:[2]
Příklady
Příkladem fungálního totiviru je Pomocný virus LA, cytoplazmatický virus vyskytující se primárně v Saccharomyces cerevisiae.[3]
Reference
- ^ A b C d „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 15. června 2015.
- ^ A b ICTV. „Virus Taxonomy: 2014 Release“. Citováno 15. června 2015.
- ^ Rodríguez-Cousiño, Nieves; Esteban, Rosa (9. prosince 2016). „Analýza L-A-2, pomocného viru M2 dsRNA kódujícího toxin K2 toxinu, a variant L-BC z populací kmenů vinných kvasinek poskytuje nový pohled na vztah a vývoj dsRNA virů kvasinek“ (PDF). Appl. Environ. Microbiol. - přes aem.asm.org.