Sterol-snímající doména - Sterol-sensing domain
A doména snímající sterol (SSD) je proteinová doména který se skládá ze 180 aminokyselin tvořících pět transmembránové segmenty schopné vazby sterol skupiny. Tento typ domény je přítomen v proteinech podílejících se na metabolismu a signalizaci cholesterolu.[1]
Funkce
Sterol-detekční domény jsou přítomny v různých proteinech podílejících se na klíčových aspektech homeostázy a signalizace cholesterolu. Více zarovnání sekvence pomocí Clustal W. prokázali, že tyto proteiny lze podle jejich SSD seskupit do sedmi různých rodin.[2] Následující proteiny obsahující SSD představují každou rodinu:
- HMG-CoA reduktáza (HMGCR), účastnící se biosyntézy cholesterolu. Jednalo se o první objevený protein s SSD. Po navázání na cholesterol tento protein prochází degradace proteinu spojená s endoplazmatickým retikulem. SSD není vyžadován pro katalytickou aktivitu HMGCR.
- Protein aktivující štěpení SREBP (SCAP), který reguluje transkripci genů s prvky reakce na sterol proteolytickou aktivací proteiny vázající regulační prvek sterolu (SREBP). Toto byl druhý objevený protein obsahující SSD.
- 7-dehydrocholesterol reduktáza (7DHCR), účastní se posledního kroku biosyntézy cholesterolu.
- Niemann-Pick typ C1 (NPC1), podílí se na intracelulárním transportu cholesterolu.
- Niemann-Pick typ C1 jako 1 (NPC1L1), regulátor absorpce cholesterolu v enterocyty.
- Oprava (PTCH1, PTCH2 ), podílející se na ježková signální dráha a také cytokineze. Jeho SSD váže na cholesterol část ježka a je nezbytný pro jeho činnost.
- Odesláno (DISP1, DISP2, DISP3), také zapojený do signalizace ježka. DISP je vyžadován pro sekreci ježka.
- Opravený protein (PTR), strukturálně podobné opravě. Jeho funkce nejsou plně pochopeny.
Choroba
Mutace v 7DHCR jsou spojeny s Smith – Lemli – Opitzův syndrom (SLOS). Ukázalo se, že mutace v NPC1 způsobují Niemann – Pickova choroba, typ C.. Mutace v patched jsou spojeny s různými druhy rakoviny (bazocelulární karcinom, meduloblastom, rhabdomyosarkom ).[3]
Viz také
Reference
- ^ „Doména snímající steroly“. InterPro. Evropský bioinformatický institut. Citováno 25. března 2015.
- ^ Kuwabara, PE; Labouesse, M (duben 2002). „Doména snímající sterol: více rodin, jedinečná role?“. Trendy v genetice. 18 (4): 193–201. doi:10.1016 / s0168-9525 (02) 02640-9. PMID 11932020.
- ^ Pasca di Magliano, M; Hebrok, M (prosinec 2003). "Ježková signalizace při tvorbě a údržbě rakoviny". Recenze přírody. Rakovina. 3 (12): 903–11. doi:10.1038 / nrc1229. PMID 14737121. S2CID 34050826.