Protein aktivující štěpení SREBP - SREBP cleavage-activating protein

SCAP
Identifikátory
Aliasy	SCAP, entrez: 22937, chaperon SREBF
Externí ID	OMIM: 601510 MGI: 2135958 HomoloGene: 8160 Genové karty: SCAP
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	47,477,126 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 9 (myš)
Konec	110,384,950 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba na cholesterol; • rozložená vazba na bílkoviny; • GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu; • sterolová vazba;
Buněčná složka	• membrána endoplazmatického retikula; • ER na Golgiho transportní membránu vezikul; • integrální součást membrány; • Golgiho aparát; • membrána; • intracelulární membránou vázaná organela; • Golgiho membrána; • endoplazmatické retikulum; • cytoplazmatický váček; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• reakce na hypoxii; • stárnutí; • metabolický proces cholesterolu; • reakce na inzulín; • regulace procesu biosyntézy mastných kyselin; • negativní regulace procesu biosyntézy cholesterolu; • metabolický proces steroidů; • metabolismus lipidů; • regulace metabolického procesu mastných kyselin; • SREBP signalizační cesta; • regulace procesu biosyntézy cholesterolu; • imunitní odpověď; • buněčný metabolismus lipidů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	22937
	235623
	ENSG00000114650
	ENSMUSG00000032485
	Q12770
	Q6GQT6
	NM_012235; NM_001320044
	NM_001001144; NM_001103162
	NP_001306973; NP_036367
	NP_001001144; NP_001096632
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Sterol regulační prvek vázající protein aktivující protein štěpení, také známý jako Protein aktivující štěpení SREBP nebo SCAP je protein že u lidí je kódován SCAP gen.^[5]^[6]^[7]^[8]

SCAP obsahuje a doména snímající sterol (SSD) a sedm WD domény. V buňkách zbavených cholesterolu se tento protein váže na proteiny vázající regulační prvek sterolu (SREBP) a zprostředkovává jejich přepravu z ER do Golgiho aparát. SREBP se poté proteolyticky štěpí a stimulují sterol biosyntéza.^[5]

Funkce

SCAP je regulační protein, který je vyžadován pro proteolytický štěpení proteinu vázajícího regulační prvek na sterol (SREBP ). SCAP je integrální membránový protein nacházející se v endoplazmatické retikulum (ER). Jedna z cytosolických oblastí SCAP obsahuje a hexapeptid aminokyselinová sekvence, MELADL, která slouží k detekci buněčného cholesterolu. Pokud je přítomen cholesterol, SCAP prochází konformační změnou, která mu brání v aktivaci SREBP a nedochází k syntéze cholesterolu.^[9]

Struktura

Scap má 8 transmembránových domén a obě N-terminál a C-terminál čelit cytoplazma. Rovněž váže SREBP řadou po sobě jdoucích opakování WD na svém C-konci.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000114650 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032485 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: chaperon SREBF“.
^ Nagase T, Seki N, Ishikawa K, Tanaka A, Nomura N (únor 1996). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. V. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0161-KIAA0200) odvozené analýzou klonů cDNA z lidské buněčné linie KG-1“. DNA Res. 3 (1): 17–24. doi:10.1093 / dnares / 3.1.17. PMID 8724849.
^ Hua X, Nohturfft A, Goldstein JL, Brown MS (listopad 1996). "Sterolová rezistence v buňkách CHO byla sledována až k bodové mutaci proteinu aktivujícího štěpení SREBP". Buňka. 87 (3): 415–26. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81362-8. PMID 8898195. S2CID 1963192.
^ Nakajima T, Hamakubo T, Kodama T, Inazawa J, Emi M (1999). „Genomová struktura a chromozomální mapování genu štěpícího proteinu aktivujícího lidský sterol regulační prvek (SREBP) (SCAP)“. J. Hum. Genet. 44 (6): 402–7. doi:10,1007 / s100380050187. PMID 10570913.
^ Sun LP, Seemann J, Goldstein JL, Brown MS (2007). „Sterolem regulovaný transport SREBP z endoplazmatického retikula do Golgiho: Insig vykresluje třídicí signál ve Scapu nepřístupný pro proteiny COPII“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 104 (16): 6519–26. doi:10.1073 / pnas.0700907104. PMC 1851663. PMID 17428919.
^ Brown MS, Goldstein JL (1999). „Proteolytická cesta, která řídí obsah cholesterolu v membránách, buňkách a krvi“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 96 (20): 11041–8. doi:10.1073 / pnas.96.20.11041. PMC 34238. PMID 10500120.

Další čtení

Le Hellard S, Theisen FM, Haberhausen M a kol. (2009). „Souvislost mezi inzulinem indukovaným genem 2 (INSIG2) a přírůstkem hmotnosti v německém vzorku schizofrenních pacientů léčených antipsychotiky: narušení lipogeneze kontrolované SREBP v metabolických nežádoucích účincích souvisejících s drogami?“. Mol. Psychiatrie. 14 (3): 308–17. doi:10.1038 / sj.mp.4002133. PMID 18195716.
McGeachie M, Ramoni RL, Mychaleckyj JC a kol. (2009). „Integrativní prediktivní model kalcifikace koronárních tepen u aterosklerózy“. Oběh. 120 (24): 2448–54. doi:10.1161 / CIRCULATIONAHA.109.865501. PMC 2810344. PMID 19948975.
Friedlander Y, Schwartz SM, Durst R a kol. (2008). "Izoformy SREBP-2 a SCAP a riziko časného nástupu infarktu myokardu". Ateroskleróza. 196 (2): 896–904. doi:10.1016 / j.atheroskleróza.2007.02.006. PMID 17383658.
Otsuki T, Ota T, Nishikawa T a kol. (2005). "Signální sekvence a klíčové slovo trap in silico pro výběr lidských cDNA plné délky kódujících sekreci nebo membránové proteiny z knihoven cDNA opatřených oligo". DNA Res. 12 (2): 117–26. doi:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID 16303743.
Javitt NB (2002). "Cholesterol, hydroxycholesteroly a žlučové kyseliny". Biochem. Biophys. Res. Commun. 292 (5): 1147–53. doi:10.1006 / bbrc.2001.2013. PMID 11969205.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Lee JN, Gong Y, Zhang X, Ye J (2006). „Proteazomální degradace ubikvitinovaných proteinů Insig je stanovena serinovými zbytky lemujícími ubikvitinované lysiny“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 103 (13): 4958–63. doi:10.1073 / pnas.0600422103. PMC 1405624. PMID 16549805.
Lu Y, Dollé ME, Imholz S a kol. (2008). „Několik genetických variant podél kandidátských drah ovlivňuje plazmatické koncentrace lipoproteinů s vysokou hustotou cholesterolu. J. Lipid Res. 49 (12): 2582–9. doi:10.1194 / ml. M800232-JLR200. PMID 18660489.
Suchanek M, Radzikowska A, Thiele C (2005). „Foto-leucin a foto-methionin umožňují identifikaci interakcí protein-protein v živých buňkách“. Nat. Metody. 2 (4): 261–7. doi:10.1038 / nmeth752. PMID 15782218.
Irisawa M, Inoue J, Ozawa N a kol. (2009). „Membránový protein TRC8 snímající endoplazmatické retikulum (ER) brání transportu ER-Golgiho proteinu aktivovaného štěpením regulačního prvku vázajícího protein 2 (SREBP-2) / SREBP a snižuje štěpení SREBP-2“. J. Biol. Chem. 284 (42): 28995–9004. doi:10.1074 / jbc.M109.041376. PMC 2781446. PMID 19706601.
Yang LH, Chen DF (2007). "[Účinky TNF alfa na expresi obsahu SCAP a triglyceridů v kultivovaných steatotických hepatocytech]". Zhonghua Gan Zang Bing Za Zhi. 15 (10): 767–70. PMID 17963605.
Voora D, Shah SH, Reed CR a kol. (2008). „Farmakogenetické prediktory redukce cholesterolu lipoproteinů s nízkou hustotou a odezvy na dávku zprostředkované statiny“. Circ Cardiovasc Genet. 1 (2): 100–6. doi:10.1161 / CIRCGENETICS.108.795013. PMC 2995295. PMID 20031551.
Fan YM, Karhunen PJ, Levula M a kol. (2008). „Exprese sterolového regulačního prvku vázajícího transkripčního faktoru (SREBF) 2 a proteinu aktivujícího štěpení SREBF (SCAP) v lidském ateromu a asociace jejich alelických variant s náhlou srdeční smrtí“. Thromb J.. 6: 17. doi:10.1186/1477-9560-6-17. PMC 2645360. PMID 19116028.
Vasseur F, Caeyseele T, Barat-Houari M a kol. (2010). „Shoda dvou různých analytických přístupů ukazuje, že interakce mezi BMI a haplotypy ADIPOQ je určujícím činitelem LDL cholesterolu v obecné francouzské populaci“. J. Hum. Genet. 55 (4): 227–31. doi:10.1038 / jhg.2010.10. PMID 20186155.
Durst R, Jansen A, Erez G a kol. (2006). „Diskrétní a kombinovaný účinek izoforem SREBP-2 a SCAP na kontrolu plazmatických lipidů u pacientů s familiární hypercholesterolemií“. Ateroskleróza. 189 (2): 443–50. doi:10.1016 / j.atheroskleróza.2006.01.001. PMID 16466730.
Liu X, Li Y, Lu X a kol. (2010). „Interakce mezi genetickými variantami z dráhy aktivace SREBP2 související s rizikem ischemické choroby srdeční v čínské populaci Han“. Ateroskleróza. 208 (2): 421–6. doi:10.1016 / j.atheroskleróza.2009.08.011. PMID 19740467.
Chen SN, Cilingiroglu M, Todd J a kol. (2009). „Kandidátská genetická analýza plazmatického lipoproteinu s vysokou hustotou a cholesterolu a závažnosti koronární aterosklerózy“. BMC Med. Genet. 10: 111. doi:10.1186/1471-2350-10-111. PMC 2775733. PMID 19878569.
Lee JN, Zhang X, Feramisco JD a kol. (2008). „Nenasycené mastné kyseliny inhibují proteazomální degradaci Insig-1 v postubikvitinačním kroku“. J. Biol. Chem. 283 (48): 33772–83. doi:10,1074 / jbc.M806108200. PMC 2586246. PMID 18835813.
Nieminen T, Matinheikki J, Nenonen A a kol. (2007). „Vztah proteinu aktivujícího štěpení regulačního prvku vázajícího se na protein a polymorfismu genu apolipoproteinu E s metabolickými změnami během redukce hmotnosti“. Metab. Clin. Exp. 56 (7): 876–80. doi:10.1016 / j.metabol.2007.02.003. PMID 17570245.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000114650 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032485 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: chaperon SREBF“.

[pmid8724849-6] Nagase T, Seki N, Ishikawa K, Tanaka A, Nomura N (únor 1996). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. V. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0161-KIAA0200) odvozené analýzou klonů cDNA z lidské buněčné linie KG-1“. DNA Res. 3 (1): 17–24. doi:10.1093 / dnares / 3.1.17. PMID 8724849.

[pmid8898195-7] Hua X, Nohturfft A, Goldstein JL, Brown MS (listopad 1996). "Sterolová rezistence v buňkách CHO byla sledována až k bodové mutaci proteinu aktivujícího štěpení SREBP". Buňka. 87 (3): 415–26. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81362-8. PMID 8898195. S2CID 1963192.

[pmid10570913-8] Nakajima T, Hamakubo T, Kodama T, Inazawa J, Emi M (1999). „Genomová struktura a chromozomální mapování genu štěpícího proteinu aktivujícího lidský sterol regulační prvek (SREBP) (SCAP)“. J. Hum. Genet. 44 (6): 402–7. doi:10,1007 / s100380050187. PMID 10570913.

[Brown_2007-9] Sun LP, Seemann J, Goldstein JL, Brown MS (2007). „Sterolem regulovaný transport SREBP z endoplazmatického retikula do Golgiho: Insig vykresluje třídicí signál ve Scapu nepřístupný pro proteiny COPII“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 104 (16): 6519–26. doi:10.1073 / pnas.0700907104. PMC 1851663. PMID 17428919.

[pmid10500120-10] Brown MS, Goldstein JL (1999). „Proteolytická cesta, která řídí obsah cholesterolu v membránách, buňkách a krvi“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 96 (20): 11041–8. doi:10.1073 / pnas.96.20.11041. PMC 34238. PMID 10500120.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]