Vůdce SpeF - SpeF leader
| vůdce speF | |
|---|---|
 Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence speF | |
| Identifikátory | |
| Symbol | speF |
| Rfam | RF00518 |
| Další údaje | |
| RNA typ | Cis-reg; vůdce |
| Domény | Bakterie |
| TAK | SO: 0005836 |
| PDB struktur | PDBe |
SpeF je domnělý cis-účinkový prvek identifikovaný v několika gram negativní alfa proteobakterie. Navrhuje se podílet se na regulaci exprese geny zahrnutý do něčeho, zůčastnit se čeho polyamid biosyntéza.
SpeF je jedním z pěti domnělých regulačních prvků identifikovaných výpočetní obrazovkou Agrobacterium tumefaciens a další alfa-proteobakteriální genomy pro konzervované sekvenční motivy v operon vůdci.[1] U většiny analyzovaných druhů se nachází ve vedoucí části operonu obsahujícího gen speF an ornithin dekarboxyláza enzym, který katalýzy jeden z prvních kroků v biosyntéze polyaminů. Autoři však nezjistili vazbu metabolitů souvisejících s touto cestou (L-ornitin, L-lysin, meso-diaminopimelát, putrescine, mrtvola nebo spermidin ) vedoucímu SpeF.[1]
Mezi další nekódující RNA odhalené ve stejné analýze patří: suhB, ybhL, metA a serC.[1]
Reference
- ^ A b C Corbino KA, Barrick JE, Lim J a kol. (2005). „Důkazy pro druhou třídu S-adenosylmethioninových riboswitchů a dalších regulačních RNA motivů v alfa-proteobakteriích“. Genome Biol. 6 (8): R70. doi:10.1186 / gb-2005-6-8-r70. PMC 1273637. PMID 16086852.
externí odkazy
 | Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |