Sec61 - Sec61
| SecE / Sec61γ | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | SecE | ||||||||
| Pfam | PF00584 | ||||||||
| InterPro | IPR001901 | ||||||||
| STRÁNKA | PS01067 | ||||||||
| SCOP2 | 1rhz / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| TCDB | 3.A.5 | ||||||||
| OPM protein | 1rhz | ||||||||
| |||||||||
| SecG / Sec61β, archeoeukaryotický | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Sec61_beta | ||||||||
| Pfam | PF03911 | ||||||||
| InterPro | IPR016482 | ||||||||
| SCOP2 | 1rhz / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
| SecG, bakteriální | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | SecG | ||||||||
| Pfam | PF03840 | ||||||||
| InterPro | IPR004692 | ||||||||
| OPM protein | 5aww | ||||||||
| |||||||||
Sec61 nebo SecYEG je membrána proteinový komplex lze nalézt ve všech oblastech života. Jako hlavní součást translocon, transportuje proteiny do endoplazmatické retikulum u eukaryot a ven z buňky u prokaryot. Jedná se o pór ve tvaru koblihy přes membránu se 3 různými podjednotkami (heterotrimerní), SecY (α), SecE (γ) a SecG (β). Má oblast zvanou zástrčka, která blokuje transport do nebo z ER. Tato zátka je přemístěna, když je hydrofobní oblast rodícího se polypeptid interaguje s jinou oblastí Sec61 zvanou šev, což umožňuje translokaci polypeptidu do lumenu ER.[1]
Ačkoli SecY a SecE jsou konzervovány ve všech třech doménách života, bakteriální SecG není homologní s eukaryotickým Sec61β. Eukaryotický Sec61β je však homologní s archaeal SecG, což vede některé autory k označení archaeal komplexu jako SecYEβ místo SecYEG.[2]
Struktura
Velká část znalostí o struktuře pórů SecY pochází z jejich rentgenové krystalografické struktury archaeal verze.[2] Velká podjednotka SecY se skládá ze dvou polovin, trans-membránových segmentů 1-5 a trans-membránových segmentů 6-10. Jsou spojeny na extracelulární straně smyčkou mezi trans-membránovými segmenty 5 a 6. SecY se může otevírat bočně vpředu (boční brána). SecE je u většiny druhů jediný membránový protein. Sedí na zadní straně SecY a obklopuje obě poloviny SecY. Secβ (SecG) není nezbytný. Sedí na straně SecY a navazuje s ní jen málo kontaktů. V bočním pohledu má kanál tvar přesýpacích hodin, s cytoplazmatickou nálevkou, která je prázdná, a extracelulární nálevkou, která je naplněna malou šroubovicí, která se nazývá zátka. Ve středu membrány je konstrukce, vytvořená z pórovitého prstence šesti hydrofobních aminokyseliny které promítají své postranní řetězce dovnitř Během translokace proteinu je zátka přesunuta z cesty a polypeptidový řetězec je přesunut z cytoplazmatické nálevky přes pórový kruh, extracelulární nálevku, do extracelulárního prostoru. Hydrofobní segmenty membránových proteinů vystupují bočně bočním vstupem do lipidové fáze a stávají se segmenty překlenujícími membránu.[2]
Eubakteriální protein SecY interaguje se signálními sekvencemi sekrečních proteinů a se dvěma dalšími složkami systému translokace proteinů: SecA a SecE. SecY je integrální plazmatická membrána membránový protein se 419 až 492 aminokyselinovými zbytky, který zjevně obsahuje 10 transmembránových (TM), 6 cytoplazmatických a 5 periplazmatických oblastí.[3]
Druhová specifika
Lidské bílkoviny:
Pekařské droždí mají dva takové homologní komplexy; ten zásadní se jmenuje Sec61 a ten nepodstatný se jmenuje Ssh1. Stejně jako Sec61, i Ssh1 se připojí k ribozomu.[4]
Viz také
Reference
- ^ Osborne AR, Rapoport TA, van den Berg B (2005). "Translokace proteinů kanálem Sec61 / SecY". Roční přehled buněčné a vývojové biologie. 21: 529–50. doi:10.1146 / annurev.cellbio.21.012704.133214. PMID 16212506.
- ^ A b C Van den Berg B, Clemons WM, Collinson I, Modis Y, Hartmann E, Harrison SC, Rapoport TA (leden 2004). "Rentgenová struktura kanálu vedoucího protein". Příroda. 427 (6969): 36–44. Bibcode:2004 Natur.427 ... 36B. doi:10.1038 / nature02218. PMID 14661030.
- ^ Ito K (září 1992). „SecY a integrální membránové komponenty translokačního systému proteinu Escherichia coli“. Molekulární mikrobiologie. 6 (17): 2423–8. doi:10.1111 / j.1365-2958.1992.tb01417.x. PMID 1406280.
- ^ Harty C, Römisch K (březen 2013). „Analýza interakcí Sec61p a Ssh1p v membráně ER pomocí systému split-ubiquitin“. Buněčná biologie BMC. 14: 14. doi:10.1186/1471-2121-14-14. PMC 3618304. PMID 23497013.
- Alberts, Bruce a kol. Molekulární biologie buňky. Garland, 2002. ISBN 0-8153-3218-1
externí odkazy
- Protein SEC61 + v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)