SecY protein - SecY protein - Wikipedia
| SecY protein / Sec61α | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Struktura kanálu vedoucího protein.[1] | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | SecY | ||||||||
| Pfam | PF00344 | ||||||||
| InterPro | IPR002208 | ||||||||
| STRÁNKA | PDOC00612 | ||||||||
| SCOP2 | 1rh5 / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| TCDB | 3.A.5 | ||||||||
| OPM nadčeleď | 19 | ||||||||
| OPM protein | 1rh5 | ||||||||
| Membranome | 165 | ||||||||
| |||||||||
The SecY protein je hlavní transmembránový podjednotka bakteriálního Sec nebo typu II sekreční cesta a a ATPáza vylučující bílkoviny komplex, známý také jako a SecYEG translocon. Homology komplexu SecYEG se nacházejí v eukaryoty, kde je podjednotka známá jako Sec61α, a v archaeách.[2]
Sekrece některých proteinů nesoucích a signální peptid přes vnitřní membrána v Gramnegativní bakterie dochází přes preproteinovou translokázovou cestu. Proteiny se produkují v cytoplazmě jako prekurzory a pro jejich směrování k translokázové složce v membráně je zapotřebí chaperonová podjednotka.[3] Odtud jsou zralé proteiny buď zaměřeny na vnější membránu, nebo zůstávají jako periplazmatické proteiny. Translokázové proteinové podjednotky jsou kódovány na bakteriálním chromozomu.
Translocase dráha obsahuje 7 proteinů, včetně a chaperonový protein (SecB ), ATPáza (SecA ), integrální membránový komplex (SecY, SecE a SecG) a dva další membránové proteiny, které podporují uvolňování zralého peptidu do periplazmy (SecD a SecF).[3] Chaperonový protein SecB[4] je vysoce kyselý homotetramerický protein, který existuje jako "dimer dimerů" v bakteriální cytoplazmě. SecB udržuje preproteiny v rozloženém stavu po translaci a za účelem sekrece je zacílí na protein periferní membrány ATPázy SecA.[5] Struktura SecYEG sestavy Escherichia coli odhalila sendvič dvou membrán interagujících prostřednictvím rozsáhlých cytoplazmatických domén.[6] Každá membrána je složena z dimerů SecYEG. Monomerní komplex obsahuje 15 transmembránových šroubovic.
Eubakteriální protein SecY interaguje se signálními sekvencemi sekrečních proteinů a se dvěma dalšími složkami systému translokace proteinů: SecA a SecE. SecY je integrální plazmatický membránový protein obsahující 419 až 492 aminokyselinových zbytků, který zjevně obsahuje 10 transmembránových (TM), 6 cytoplazmatických a 5 periplazmatických oblastí.[7]
Cytoplazmatické oblasti 2 a 3 a domény TM 1, 2, 4, 5, 7 a 10 jsou dobře konzervované: předpokládá se, že konzervované cytoplazmatické oblasti interagují s cytoplazmatickými sekrečními faktory, zatímco domény TM se mohou podílet na exportu proteinů.[8] SecY je také kódován v chloroplastovém genomu některých řas, kde by mohl být zapojen do systému exportu proteinu podobného prokaryotům přes dvě membrány chloroplastového endoplazmatického retikula (CER), který je přítomen v chromofytových a kryptofytových řasách.[9]
Podskupiny
Lidské proteiny obsahující tuto doménu
Reference
- ^ Van den Berg B, Clemons WM, Collinson I, Modis Y, Hartmann E, Harrison SC, Rapoport TA (leden 2004). "Rentgenová struktura kanálu vedoucího protein". Příroda. 427 (6969): 36–44. Bibcode:2004 Natur.427 ... 36B. doi:10.1038 / nature02218. PMID 14661030. S2CID 4360143.
- ^ Auer J, Spicker G, Böck A (červen 1991). "Přítomnost genu v archaebacterium Methanococcus vannielii homologní s secY eubakterií". Biochimie. 73 (6): 683–8. doi:10.1016/0300-9084(91)90048-6. PMID 1764515.
- ^ A b Bieker KL, Phillips GJ, Silhavy TJ (červen 1990). "Sekundární a prl geny Escherichia coli". Journal of Bioenergetics and Biomembranes. 22 (3): 291–310. doi:10.1007 / BF00763169. PMID 2202721. S2CID 10694864.
- ^ Driessen AJ (květen 2001). „SecB, molekulární chaperon se dvěma tvářemi“ (PDF). Trendy v mikrobiologii. 9 (5): 193–6. doi:10.1016 / S0966-842X (01) 01980-1. PMID 11336818.
- ^ Müller JP (červenec 1999). "Účinky nadproteinové nadměrné exprese na syntézu SecB v Escherichia coli". Mikrobiologické dopisy FEMS. 176 (1): 219–27. doi:10.1016 / s0378-1097 (99) 00239-6. PMID 10418149.
- ^ Breyton C, Haase W, Rapoport TA, Kühlbrandt W, Collinson I (srpen 2002). "Trojrozměrná struktura bakteriálního proteinu-translokačního komplexu SecYEG". Příroda. 418 (6898): 662–5. Bibcode:2002 Natur.418..662B. doi:10.1038 / nature00827. PMID 12167867. S2CID 4347664.
- ^ Ito K (září 1992). „SecY a integrální membránové komponenty translokačního systému proteinu Escherichia coli“. Molekulární mikrobiologie. 6 (17): 2423–8. doi:10.1111 / j.1365-2958.1992.tb01417.x. PMID 1406280. S2CID 37452721.
- ^ Suh JW, Boylan SA, Thomas SM, Dolan KM, Oliver DB, Price CW (únor 1990). „Isolation of a secY homologue from Bacillus subtilis: evidence for a common protein export path in eubacteria“. Molekulární mikrobiologie. 4 (2): 305–14. doi:10.1111 / j.1365-2958.1990.tb00597.x. PMID 2110998. S2CID 27373166.
- ^ Douglas SE (únor 1992). „SecY homolog se nachází v plastidovém genomu Cryptomonas phi“. FEBS Dopisy. 298 (1): 93–6. doi:10.1016 / 0014-5793 (92) 80029-G. PMID 1544427. S2CID 22351990.