SEC61B - SEC61B - Wikipedia

SEC61B
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2WWB, 4CG6
Identifikátory
Aliasy	SEC61B, Podjednotka beta translocon Sec61, podjednotka beta translocon SEC61
Externí ID	OMIM: 609214 MGI: 1913462 HomoloGene: 38229 Genové karty: SEC61B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	99,230,615 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	47,483,242 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba na epidermální růstový faktor; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA; • Aktivita výměnného faktoru ARF guanyl-nukleotid; • Aktivita proteinového transmembránového transportéru řízená hydrolýzou vazby PP;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • cytosol; • membrána; • Sec61 translocon komplex; • endoplazmatické retikulum; • membrána endoplazmatického retikula; • endoplazmatické retikulum Sec komplex;
Biologický proces	• retrográdní transport bílkovin, ER na cytosol; • Rozvinutá proteinová reakce zprostředkovaná IRE1; • cesta ERAD závislá na ubikvitinu; • transport bílkovin; • transport intracelulárních proteinů; • SRP-dependentní kotranslační proteinové zacílení na membránu, translokace; • posttranslační cílení proteinu na membránu, translokace; • doprava; • regulace molekulární funkce;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10952
	66212
	ENSG00000106803
	ENSMUSG00000053317
	P60468
	Q9CQS8
	NM_006808
	NM_024171
	NP_006799
	NP_077133
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Proteinový transportní protein Sec61 podjednotka beta je protein že u lidí je kódován SEC61B gen.^[5]^[6]^[7]

Komplex Sec61 je ústřední součástí aparátu translokace proteinů endoplazmatické retikulum (ER) membrána. Oligomery komplexní formy Sec61 a transmembránový kanál kde jsou proteiny translokovány napříč a integrovány do ER membrány. Tento komplex se skládá ze tří membránové proteiny - alfa, beta a gama. Tento gen kóduje protein beta-podjednotky. Podjednotky Sec61 jsou také pozorovány v post-ER kompartmentu, což naznačuje, že tyto proteiny mohou uniknout z ER a recyklovat zpět. Pro tento přepis existují důkazy o více polyadenylovaných stránkách.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000106803 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000053317 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Hartmann E, Sommer T, Prehn S, Gorlich D, Jentsch S, Rapoport TA (březen 1994). "Evoluční ochrana složek komplexu translokace proteinů". Příroda. 367 (6464): 654–7. doi:10.1038 / 367654a0. PMID 8107851. S2CID 4323463.
^ Greenfield JJ, High S (srpen 1999). „Komplex Sec61 se nachází jak v meziprostoru ER, tak v meziprostoru ER-Golgi.“ J Cell Sci. 112 (10): 1477–86. PMID 10212142.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SEC61B Sec61 beta podjednotka“.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Wiertz EJ, Tortorella D, Bogyo M a kol. (1997). "Sec61-zprostředkovaný přenos membránového proteinu z endoplazmatického retikula do proteazomu k destrukci". Příroda. 384 (6608): 432–8. doi:10.1038 / 384432a0. PMID 8945469. S2CID 6276718.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Knight BC, High S (1998). „Membránová integrace Sec61alpha: základní součást translokačního komplexu endoplazmatického retikula“. Biochem. J. 331 (Pt 1): 161–7. doi:10.1042 / bj3310161. PMC 1219334. PMID 9512475.
Chen Y, Le Cahérec F, Chuck SL (1998). „Calnexin a další faktory, které mění translokaci, ovlivňují rychlou vazbu ubikvitinu na apoB v komplexu Sec61“. J. Biol. Chem. 273 (19): 11887–94. doi:10.1074 / jbc.273.19.11887. PMID 9565615.
Kalies KU, Rapoport TA, Hartmann E (1998). „Β podjednotka komplexu Sec61 usnadňuje transport translačního proteinu a během translokace interaguje se signální peptidázou“. J. Cell Biol. 141 (4): 887–94. doi:10.1083 / jcb.141.4.887. PMC 2132780. PMID 9585408.
Bebök Z, Mazzochi C, King SA a kol. (1998). „Mechanismus přenosu transmembránového regulátoru vodivosti cystické fibrózy z endoplazmatického retikula do proteazomu zahrnuje Sec61beta a cytosolický, deglykosylovaný meziprodukt“. J. Biol. Chem. 273 (45): 29873–8. doi:10.1074 / jbc.273.45.29873. PMID 9792704.
Ingley E, Williams JH, Walker CE a kol. (1999). „Nový faktor podobný ADP-ribosylaci (ARL-6) interaguje s podjednotkou kanálu SEC61beta, který vede protein“. FEBS Lett. 459 (1): 69–74. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 01188-6. PMID 10508919. S2CID 30948975.
Yamaguchi A, Hori O, Stern DM a kol. (2000). „Endoplazmatický retikulární protein spojený se stresem Protein 1 (Serp1) / Membránový protein 4 (Ramp4) spojený s ribozomy stabilizuje membránové proteiny během stresu a usnadňuje následnou glykosylaci“. J. Cell Biol. 147 (6): 1195–204. doi:10.1083 / jcb.147.6.1195. PMC 2168098. PMID 10601334.
Meyer HA, Grau H, Kraft R a kol. (2000). „Mammalian Sec61 je spojen s Sec62 a Sec63“. J. Biol. Chem. 275 (19): 14550–7. doi:10.1074 / jbc.275.19.14550. PMID 10799540.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Humphray SJ, Oliver K, Hunt AR a kol. (2004). "DNA sekvence a analýza lidského chromozomu 9". Příroda. 429 (6990): 369–74. doi:10.1038 / nature02465. PMC 2734081. PMID 15164053.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Besemer J, Harant H, Wang S a kol. (2005). „Selektivní inhibice kotranslační translokace adhezní molekuly vaskulární buňky 1“. Příroda. 436 (7048): 290–3. doi:10.1038 / nature03670. PMID 16015337. S2CID 4431610.
Kim JE, Tannenbaum SR, White FM (2005). "Globální fosfoproteom buněk HT-29 humánního adenokarcinomu tlustého střeva". J. Proteome Res. 4 (4): 1339–46. doi:10.1021 / pr050048h. PMID 16083285.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Liao HJ, Carpenter G (2007). „Role Seclonu Translocon při obchodování s receptory EGF na nukleový a genový výraz“. Mol. Biol. Buňka. 18 (3): 1064–72. doi:10,1091 / mbc.E06-09-0802. PMC 1805100. PMID 17215517.

Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000106803 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000053317 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8107851-5] Hartmann E, Sommer T, Prehn S, Gorlich D, Jentsch S, Rapoport TA (březen 1994). "Evoluční ochrana složek komplexu translokace proteinů". Příroda. 367 (6464): 654–7. doi:10.1038 / 367654a0. PMID 8107851. S2CID 4323463.

[pmid10212142-6] Greenfield JJ, High S (srpen 1999). „Komplex Sec61 se nachází jak v meziprostoru ER, tak v meziprostoru ER-Golgi.“ J Cell Sci. 112 (10): 1477–86. PMID 10212142.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: SEC61B Sec61 beta podjednotka“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]