Sarkolipin - Sarcolipin

SLN
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1JDM
Identifikátory
Aliasy	SLN, sarkolipin
Externí ID	OMIM: 602203 Genové karty: SLN
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	107,719,693 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba ATPázy; • GO: 0048551 aktivita inhibitoru enzymu; • GO: 0010576 aktivita regulátoru enzymu; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • endoplazmatické retikulum; • sarkoplazmatická retikulární membrána; • sarkoplazmatické retikulum;
Biologický proces	• pozitivní regulace depolymerizace proteinů; • negativní regulace rozpadu proteinového komplexu; • negativní regulace vazby iontů vápníku; • regulace transportu iontů vápníku; • GO: 0048553 negativní regulace katalytické aktivity; • negativní regulace aktivity transmembránového transportéru iontů vápníku; • transport iontů vápníku; • negativní regulace dovozu iontů vápníku; • transport sarkoplazmatického retikula vápenatých iontů; • regulace uvolnění svalu; • regulace aktivity ATPázy transportující vápník; • pozitivní regulace termogeneze vyvolané chladem;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6588
	n / a
	ENSG00000170290
	n / a
	O00631
	n / a
	NM_003063
	n / a
	NP_003054
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

Sarkolipin je mikropeptid protein že u lidí je kódován SLN gen.^[3]^[4]

Funkce

Sarkoplazmatické retikulum Ca.²⁺-ATPázy jsou transmembránové proteiny, které katalyzují ATP -závislá přeprava Ca.²⁺ z cytosolu do lumenu sarkoplazmatického retikula ve svalových buňkách. Gen SLN kóduje malý transmembránový proteolipid, který reguluje několik sarkoplazmatického retikula Ca²⁺-ATPázy snížením akumulace Ca²⁺ v sarkoplazmatickém retikulu bez ovlivnění rychlosti hydrolýzy ATP.^[4]

Ablace sarkolipinu zvyšuje síňový Ca²⁺ přechodné amplitudy a vylepšené zkušební kontraktilita. Kromě toho, síně ze sarkolipinunulové myši otupili odpověď na isoproterenol stimulace, implikující sarkolipin jako prostředníka beta-adrenergní reakce v síních.^[5]Nedávno bylo prokázáno, že SLN je důležitým mediátorem termogeneze založené na svalech a ztráta sarkolipinu předurčuje myši k obezitě vyvolané stravou, což naznačuje její roli v energetickém metabolismu a regulaci přírůstku hmotnosti ^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že SLN (gen) komunikovat s PLN^[7]^[8] a ATP2A1.^[7]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000170290 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Odermatt A, Taschner PE, Scherer SW, Beatty B, Khanna VK, Cornblath DR, Chaudhry V, Yee WC, Schrank B, Karpati G, Breuning MH, Knoers N, MacLennan DH (listopad 1997). „Charakterizace genu kódujícího lidský sarkolipin (SLN), proteolipid spojený se SERCA1: absence strukturálních mutací u pěti pacientů s Brodyho chorobou“. Genomika. 45 (3): 541–53. doi:10.1006 / geno.1997.4967. hdl:2066/25426. PMID 9367679.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SLN sarkolipin“.
^ Babu GJ, Bhupathy P, Timofeyev V, Petrashevskaya NN, Reiser PJ, Chiamvimonvat N, Periasamy M (listopad 2007). „Ablace sarkolipinu zvyšuje transport vápníku v sarkoplazmatickém retikulu a síňovou kontraktilitu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 104 (45): 17867–72. doi:10.1073 / pnas.0707722104. PMC 2077025. PMID 17971438.
^ Bal NC, Maurya SK, Sopariwala DH, Sahoo SK, Gupta SC, Shaikh SA, Pant M a kol .: Sarkolipin je nově identifikovaný regulátor svalové termogeneze u savců. Nat Med, 2012. http://www.nature.com/nm/journal/vaop/ncurrent/full/nm.2897.html
^ ^A ^b Asahi M, Sugita Y, Kurzydlowski K, De Leon S, Tada M, Toyoshima C, MacLennan DH (duben 2003). „Sarkolipin reguluje sarko (endo) plazmatické retikulum Ca2 + -ATPázu (SERCA) vazbou na transmembránové šroubovice samostatně nebo ve spojení s fosfolambanem“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (9): 5040–5. doi:10.1073 / pnas.0330962100. PMC 154294. PMID 12692302.
^ ^A ^b Asahi M, Kurzydlowski K, Tada M, MacLennan DH (červenec 2002). „Sarkolipin inhibuje polymeraci fosfolambanu k vyvolání superinhibice sarko (endo) plazmatického retikula Ca2 + -ATPázy (SERCA)“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (30): 26725–8. doi:10.1074 / jbc.C200269200. PMID 12032137.

Další čtení

Lanfranchi G, Muraro T, Caldara F, Pacchioni B, Pallavicini A, Pandolfo D, Toppo S, Trevisan S, Scarso S, Valle G (leden 1996). "Identifikace 4370 exprimovaných sekvenčních značek z 3'-koncové specifické cDNA knihovny lidského kosterního svalu sekvenováním DNA a hybridizací filtru". Výzkum genomu. 6 (1): 35–42. doi:10,1101 / gr. 6.1.35. PMID 8681137.
Odermatt A, Becker S, Khanna VK, Kurzydlowski K, Leisner E, Pette D, MacLennan DH (květen 1998). „Sarkolipin reguluje aktivitu SERCA1, sarkoplazmatického retikula Ca2 + -ATPázy rychlého záškubu kosterního svalstva“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (20): 12360–9. doi:10.1074 / jbc.273.20.12360. PMID 9575189.
Smith WS, Broadbridge R, East JM, Lee AG (leden 2002). „Sarkolipin odděluje hydrolýzu ATP z akumulace Ca2 + Ca2 + -ATPázou sarkoplazmatického retikula kosterního svalstva“. The Biochemical Journal. 361 (Pt 2): 277–86. doi:10.1042/0264-6021:3610277. PMC 1222307. PMID 11772399.
Mascioni A, Karim C, Barany G, Thomas DD, Veglia G (leden 2002). "Struktura a orientace sarkolipinu v lipidových prostředích". Biochemie. 41 (2): 475–82. doi:10,1021 / bi011243m. PMID 11781085.
Asahi M, Kurzydlowski K, Tada M, MacLennan DH (červenec 2002). „Sarkolipin inhibuje polymeraci fosfolambanu k vyvolání superinhibice sarko (endo) plazmatického retikula Ca2 + -ATPázy (SERCA)“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (30): 26725–8. doi:10.1074 / jbc.C200269200. PMID 12032137.
Minamisawa S, Wang Y, Chen J, Ishikawa Y, Chien KR, Matsuoka R (březen 2003). „Specifická exprese sarkolipinu v síňové komoře je regulována během vývoje a hypertrofické remodelace“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (11): 9570–5. doi:10,1074 / jbc.M213132200. PMID 12645548.
Asahi M, Sugita Y, Kurzydlowski K, De Leon S, Tada M, Toyoshima C, MacLennan DH (duben 2003). „Sarkolipin reguluje sarko (endo) plazmatické retikulum Ca2 + -ATPázu (SERCA) vazbou na transmembránové šroubovice samostatně nebo ve spojení s fosfolambanem“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (9): 5040–5. doi:10.1073 / pnas.0330962100. PMC 154294. PMID 12692302.
Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, Sakakibara Y, Chiba J, Mizushima-Sugano J, Nakai K, Sugano S (září 2004). „Porovnání sekvencí lidských a myších genů odhaluje homologní blokovou strukturu v promotorových oblastech“. Výzkum genomu. 14 (9): 1711–8. doi:10,1101 / gr. 2435604. PMC 515316. PMID 15342556.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Vittorini S, Storti S, Parri MS, Cerillo AG, Clerico A (2007). „Genová exprese receptorů SERCA2a, fosfolamban, sarkolipin a ryanodin u dětí s vrozenými srdečními vadami“. Molekulární medicína. 13 (1–2): 105–11. doi:10.2119 / 2006-00054.Vittorini. PMC 1869624. PMID 17515962.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000170290 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9367679-3] Odermatt A, Taschner PE, Scherer SW, Beatty B, Khanna VK, Cornblath DR, Chaudhry V, Yee WC, Schrank B, Karpati G, Breuning MH, Knoers N, MacLennan DH (listopad 1997). „Charakterizace genu kódujícího lidský sarkolipin (SLN), proteolipid spojený se SERCA1: absence strukturálních mutací u pěti pacientů s Brodyho chorobou“. Genomika. 45 (3): 541–53. doi:10.1006 / geno.1997.4967. hdl:2066/25426. PMID 9367679.

[entrez-4] A ^b „Entrez Gene: SLN sarkolipin“.

[pmid17971438-5] Babu GJ, Bhupathy P, Timofeyev V, Petrashevskaya NN, Reiser PJ, Chiamvimonvat N, Periasamy M (listopad 2007). „Ablace sarkolipinu zvyšuje transport vápníku v sarkoplazmatickém retikulu a síňovou kontraktilitu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 104 (45): 17867–72. doi:10.1073 / pnas.0707722104. PMC 2077025. PMID 17971438.

[6] Bal NC, Maurya SK, Sopariwala DH, Sahoo SK, Gupta SC, Shaikh SA, Pant M a kol .: Sarkolipin je nově identifikovaný regulátor svalové termogeneze u savců. Nat Med, 2012. http://www.nature.com/nm/journal/vaop/ncurrent/full/nm.2897.html

[pmid12692302-7] A ^b Asahi M, Sugita Y, Kurzydlowski K, De Leon S, Tada M, Toyoshima C, MacLennan DH (duben 2003). „Sarkolipin reguluje sarko (endo) plazmatické retikulum Ca2 + -ATPázu (SERCA) vazbou na transmembránové šroubovice samostatně nebo ve spojení s fosfolambanem“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (9): 5040–5. doi:10.1073 / pnas.0330962100. PMC 154294. PMID 12692302.

[pmid12032137-8] A ^b Asahi M, Kurzydlowski K, Tada M, MacLennan DH (červenec 2002). „Sarkolipin inhibuje polymeraci fosfolambanu k vyvolání superinhibice sarko (endo) plazmatického retikula Ca2 + -ATPázy (SERCA)“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (30): 26725–8. doi:10.1074 / jbc.C200269200. PMID 12032137.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]