SUV39H1 - SUV39H1

SUV39H1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3MTS
Identifikátory
Aliasy	SUV39H1, H3-K9-HMTáza 1, KMT1A, MG44, SUV39H, potlačující variegation 3-9 homolog 1
Externí ID	OMIM: 300254 MGI: 1099440 HomoloGene: 2388 Genové karty: SUV39H1
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	48,709,012 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	X chromozom (myš)
Konec	8,074,760 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita methyltransferázy; • aktivita transferázy; • aktivita histonmethyltransferázy; • aktivita histonmethyltransferázy (specifická pro H3-K9); • Aktivita methyltransferázy závislá na S-adenosylmethioninu; • vazba N-konce proteinu; • vazba iontů zinku; • vazba chromatinu; • transkripce regulační oblasti sekvenčně specifické vazby DNA; • vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita histon-lysin N-methyltransferázy;
Buněčná složka	• jaderná vrstva; • nukleoplazma; • chromozóm; • heterochromatin; • kondenzovaný jaderný chromozom; • rDNA heterochromatin; • komplex umlčování chromatinu; • chromozom, centromerická oblast; • buněčné jádro;
Biologický proces	• diferenciace buněk; • regulace transkripce, DNA-šablony; • histon H3-K9 dimethylace; • rytmický proces; • negativní regulace cirkadiánního rytmu; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • trimethylace histonu H3-K9; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • methylace; • umlčování chromatinu při rDNA; • zpracování rRNA; • methylace histon-lysin; • buněčný cyklus; • GO: virový proces 0022415; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • buněčná odpověď na hypoxii; • organizace chromatinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6839
	20937
	ENSG00000101945
	ENSMUSG00000039231
	O43463
	O54864
	NM_003173; NM_001282166
	NM_001290716; NM_011514; NM_001358237
	NP_001269095; NP_003164
	NP_001277645; NP_035644; NP_001345166
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Histon-lysin N-methyltransferáza SUV39H1 je enzym že u lidí je kódován SUV39H1 gen.^[5]

Funkce

Tento gen je členem supresoru rodiny homologů variegation 3-9 a kóduje protein s chromodoména a C-koncová doména SET. Tento jaderný protein se během mitózy přesouvá do centromér a funguje jako histonmethyltransferáza, metylace Lys-9 histonu H3. Celkově hraje zásadní roli v organizaci heterochromatinu, segregaci chromozomů a mitotické progresi.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že SUV39H1 komunikovat s:

PIN1^[16]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101945 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000039231 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Aagaard L, Laible G, Selenko P, Schmid M, Dorn R, Schotta G, Kuhfittig S, Wolf A, Lebersorger A, Singh PB, Reuter G, Jenuwein T (červen 1999). „Funkční savčí homology Drosophila PEV-modifikátoru Su (var) 3-9 kódují proteiny asociované s centromérou, které se komplexují s heterochromatinovou složkou M31“. EMBO J.. 18 (7): 1923–38. doi:10.1093 / emboj / 18.7.1923. PMC 1171278. PMID 10202156.
^ „Entrez Gene: SUV39H1 potlačující rozmanitý homolog 1–9 (Drosophila)“.
^ ^A ^b Zhang CL, McKinsey TA, Olson EN (říjen 2002). „Sdružení histonových deacetyláz třídy II s heterochromatinovým proteinem 1: potenciální role methylace histonu při kontrole diferenciace svalů“. Mol. Buňka. Biol. 22 (20): 7302–12. doi:10.1128 / mcb.22.20.7302-7312.2002. PMC 139799. PMID 12242305.
^ ^A ^b Fujita N, Watanabe S, Ichimura T, Tsuruzoe S, Shinkai Y, Tachibana M, Chiba T, Nakao M (červen 2003). „Methyl-CpG vazebná doména 1 (MBD1) interaguje s heterochromatickým komplexem Suv39h1-HP1 pro transkripční represi založenou na methylaci DNA“. J. Biol. Chem. 278 (26): 24132–8. doi:10,1074 / jbc.M302283200. PMID 12711603.
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ Fuks F, Hurd PJ, Deplus R, Kouzarides T (květen 2003). „DNA methyltransferázy se asociují s HP1 a SUV39H1 histonmethyltransferázou“. Nucleic Acids Res. 31 (9): 2305–12. doi:10.1093 / nar / gkg332. PMC 154218. PMID 12711675.
^ ^A ^b ^C Vaute O, Nicolas E, Vandel L, Trouche D (leden 2002). „Funkční a fyzikální interakce mezi histon-methyltransferázou Suv39H1 a histon-deacetylázami“. Nucleic Acids Res. 30 (2): 475–81. doi:10.1093 / nar / 30.2.475. PMC 99834. PMID 11788710.
^ Chakraborty S, Sinha KK, Senyuk V, Nucifora G (srpen 2003). „SUV39H1 interaguje s AML1 a ruší AML1 transaktivitu. AML1 je methylován in vivo“. Onkogen. 22 (34): 5229–37. doi:10.1038 / sj.onc.1206600. PMID 12917624.
^ Nielsen SJ, Schneider R, Bauer UM, Bannister AJ, Morrison A, O'Carroll D, Firestein R, Cleary M, Jenuwein T, Herrera RE, Kouzarides T (srpen 2001). "Rb cílí na methylaci histonem H3 a HP1 na promotory". Příroda. 412 (6846): 561–5. Bibcode:2001 Natur.412..561N. doi:10.1038/35087620. PMID 11484059. S2CID 4378296.
^ Vandel L, Nicolas E, Vaute O, Ferreira R, Ait-Si-Ali S, Trouche D (říjen 2001). „Transkripční represe proteinem retinoblastomu prostřednictvím náboru histonmethyltransferázy“. Mol. Buňka. Biol. 21 (19): 6484–94. doi:10.1128 / mcb.21.19.6484-6494.2001. PMC 99795. PMID 11533237.
^ Firestein R, Cui X, Huie P, Cleary ML (červenec 2000). "Nastavit na doméně závislou regulaci umlčení transkripce a řízení růstu pomocí SUV39H1, savčího ortologu Drosophila Su (var) 3-9". Mol. Buňka. Biol. 20 (13): 4900–9. doi:10.1128 / mcb.20.13.4900-4909.2000. PMC 85941. PMID 10848615.
^ Khanal, Prem; Kim, Garam; Lim, Sung-Chul; Yun, Hyo-Jeong; Lee, Kwang Youl; Choi, Hoo-Kyun; Choi, Hong Seok (2013). „Prolyl izomeráza Pin1 negativně reguluje stabilitu SUV39H1 na podporu tumorigeneze u rakoviny prsu“. FASEB Journal. 27 (11): 4606–4618. doi:10.1096 / fj.13-236851. PMID 23934277. S2CID 5259616.

Další čtení

Schotta G, Ebert A, Reuter G (2003). „SU (VAR) 3-9 je konzervovaná klíčová funkce při umlčování heterochromatických genů“. Genetica. 117 (2–3): 149–58. doi:10.1023 / A: 1022923508198. PMID 12723694. S2CID 39517859.
Hijmans EM, Voorhoeve PM, Beijersbergen RL, van 't Veer LJ, Bernards R (1995). „E2F-5, nový člen rodiny E2F, který interaguje s p130 in vivo“. Mol. Buňka. Biol. 15 (6): 3082–9. doi:10,1128 / mcb.15.6.3082. PMC 230539. PMID 7760804.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace cDNA knihovny obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Aagaard L, Schmid M, Warburton P, Jenuwein T (2000). „Mitotická fosforylace SUV39H1, nové složky aktivních centromer, se shoduje s přechodnou akumulací v savčích centromerech“. J. Cell Sci. 113 (5): 817–29. PMID 10671371.
Melcher M, Schmid M, Aagaard L, Selenko P, Laible G, Jenuwein T (2000). „Analýza struktury a funkce SUV39H1 odhaluje dominantní roli v organizaci heterochromatinu, segregaci chromozomů a mitotické progresi“. Mol. Buňka. Biol. 20 (10): 3728–41. doi:10.1128 / MCB.20.10.3728-3741.2000. PMC 85674. PMID 10779362.
Firestein R, Cui X, Huie P, Cleary ML (2000). „Nastavit na doméně závislou regulaci umlčení transkripce a řízení růstu pomocí SUV39H1, savčího ortologu Drosophila Su (var) 3-9“. Mol. Buňka. Biol. 20 (13): 4900–9. doi:10.1128 / MCB.20.13.4900-4909.2000. PMC 85941. PMID 10848615.
Fraser ME, James MN, Bridger WA, Wolodko WT (2000). „Fosforylované a defosforylované struktury vepřového srdce, GTP-specifická sukcinyl-CoA syntetáza“. J. Mol. Biol. 299 (5): 1325–39. doi:10.1006 / jmbi.2000.3807. PMID 10873456.
Rea S, Eisenhaber F, O'Carroll D, Strahl BD, Sun ZW, Schmid M, Opravil S, Mechtler K, Ponting CP, Allis CD, Jenuwein T (2000). "Regulace chromatinové struktury místně specifickými histonovými H3 methyltransferázami". Příroda. 406 (6796): 593–9. Bibcode:2000Natur.406..593R. doi:10.1038/35020506. PMID 10949293. S2CID 205008015.
Lachner M, O'Carroll D, Rea S, Mechtler K, Jenuwein T (2001). „Methylace histonu H3 lysinu 9 vytváří vazebné místo pro proteiny HP1“. Příroda. 410 (6824): 116–20. Bibcode:2001 Natur.410..116L. doi:10.1038/35065132. PMID 11242053. S2CID 4331863.
Vandel L, Trouche D (2001). "Fyzická asociace mezi histon acetyl transferázou CBP a histon methyl transferázou". EMBO Rep. 2 (1): 21–6. doi:10.1093 / embo-reports / kve002. PMC 1083799. PMID 11252719.
Nielsen SJ, Schneider R, Bauer UM, Bannister AJ, Morrison A, O'Carroll D, Firestein R, Cleary M, Jenuwein T, Herrera RE, Kouzarides T (2001). "Rb cílí na methylaci histonem H3 a HP1 na promotory". Příroda. 412 (6846): 561–5. Bibcode:2001 Natur.412..561N. doi:10.1038/35087620. PMID 11484059. S2CID 4378296.
Vandel L, Nicolas E, Vaute O, Ferreira R, Ait-Si-Ali S, Trouche D (2001). „Transkripční represe proteinem retinoblastomu prostřednictvím náboru histonmethyltransferázy“. Mol. Buňka. Biol. 21 (19): 6484–94. doi:10.1128 / MCB.21.19.6484-6494.2001. PMC 99795. PMID 11533237.
Vaute O, Nicolas E, Vandel L, Trouche D (2002). „Funkční a fyzikální interakce mezi histon-methyltransferázou Suv39H1 a histon-deacetylázami“. Nucleic Acids Res. 30 (2): 475–81. doi:10.1093 / nar / 30.2.475. PMC 99834. PMID 11788710.
Schotta G, Ebert A, Krauss V, Fischer A, Hoffmann J, Rea S, Jenuwein T, Dorn R, Reuter G (2002). „Ústřední role Drosophila SU (VAR) 3-9 v methylaci histonu H3-K9 a umlčení heterochromatického genu“. EMBO J.. 21 (5): 1121–31. doi:10.1093 / emboj / 21.5.1121. PMC 125909. PMID 11867540.
Sewalt RG, Lachner M, Vargas M, Hamer KM, den Blaauwen JL, Hendrix T, Melcher M, Schweizer D, Jenuwein T, Otte AP (2002). „Selektivní interakce mezi homology polycombů obratlovců a SUV39H1 histon-lysinmethyltransferázou naznačují, že methylace histonu H3-K9 přispívá k chromozomálnímu cílení proteinů skupiny Polycomb.“. Mol. Buňka. Biol. 22 (15): 5539–53. doi:10.1128 / MCB.22.15.5539-5553.2002. PMC 133945. PMID 12101246.
Zhang CL, McKinsey TA, Olson EN (2002). „Sdružení histonových deacetyláz třídy II s heterochromatinovým proteinem 1: potenciální role methylace histonu při kontrole diferenciace svalů“. Mol. Buňka. Biol. 22 (20): 7302–12. doi:10.1128 / MCB.22.20.7302-7312.2002. PMC 139799. PMID 12242305.
Yamamoto K, Sonoda M (2003). „Pro přímou vazbu na histonmethyltransferázu, SUV39H1 je nutná vlastní interakce heterochromatinového proteinu 1“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 301 (2): 287–92. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 03021-8. PMID 12565857.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101945 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000039231 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10202156-5] A ^b Aagaard L, Laible G, Selenko P, Schmid M, Dorn R, Schotta G, Kuhfittig S, Wolf A, Lebersorger A, Singh PB, Reuter G, Jenuwein T (červen 1999). „Funkční savčí homology Drosophila PEV-modifikátoru Su (var) 3-9 kódují proteiny asociované s centromérou, které se komplexují s heterochromatinovou složkou M31“. EMBO J.. 18 (7): 1923–38. doi:10.1093 / emboj / 18.7.1923. PMC 1171278. PMID 10202156.

[entrez-6] „Entrez Gene: SUV39H1 potlačující rozmanitý homolog 1–9 (Drosophila)“.

[pmid12242305-7] A ^b Zhang CL, McKinsey TA, Olson EN (říjen 2002). „Sdružení histonových deacetyláz třídy II s heterochromatinovým proteinem 1: potenciální role methylace histonu při kontrole diferenciace svalů“. Mol. Buňka. Biol. 22 (20): 7302–12. doi:10.1128 / mcb.22.20.7302-7312.2002. PMC 139799. PMID 12242305.

[pmid12711603-8] A ^b Fujita N, Watanabe S, Ichimura T, Tsuruzoe S, Shinkai Y, Tachibana M, Chiba T, Nakao M (červen 2003). „Methyl-CpG vazebná doména 1 (MBD1) interaguje s heterochromatickým komplexem Suv39h1-HP1 pro transkripční represi založenou na methylaci DNA“. J. Biol. Chem. 278 (26): 24132–8. doi:10,1074 / jbc.M302283200. PMID 12711603.

[pmid16189514-9] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid12711675-10] Fuks F, Hurd PJ, Deplus R, Kouzarides T (květen 2003). „DNA methyltransferázy se asociují s HP1 a SUV39H1 histonmethyltransferázou“. Nucleic Acids Res. 31 (9): 2305–12. doi:10.1093 / nar / gkg332. PMC 154218. PMID 12711675.

[pmid11788710-11] A ^b ^C Vaute O, Nicolas E, Vandel L, Trouche D (leden 2002). „Funkční a fyzikální interakce mezi histon-methyltransferázou Suv39H1 a histon-deacetylázami“. Nucleic Acids Res. 30 (2): 475–81. doi:10.1093 / nar / 30.2.475. PMC 99834. PMID 11788710.

[pmid12917624-12] Chakraborty S, Sinha KK, Senyuk V, Nucifora G (srpen 2003). „SUV39H1 interaguje s AML1 a ruší AML1 transaktivitu. AML1 je methylován in vivo“. Onkogen. 22 (34): 5229–37. doi:10.1038 / sj.onc.1206600. PMID 12917624.

[pmid11484059-13] Nielsen SJ, Schneider R, Bauer UM, Bannister AJ, Morrison A, O'Carroll D, Firestein R, Cleary M, Jenuwein T, Herrera RE, Kouzarides T (srpen 2001). "Rb cílí na methylaci histonem H3 a HP1 na promotory". Příroda. 412 (6846): 561–5. Bibcode:2001 Natur.412..561N. doi:10.1038/35087620. PMID 11484059. S2CID 4378296.

[pmid11533237-14] Vandel L, Nicolas E, Vaute O, Ferreira R, Ait-Si-Ali S, Trouche D (říjen 2001). „Transkripční represe proteinem retinoblastomu prostřednictvím náboru histonmethyltransferázy“. Mol. Buňka. Biol. 21 (19): 6484–94. doi:10.1128 / mcb.21.19.6484-6494.2001. PMC 99795. PMID 11533237.

[pmid10848615-15] Firestein R, Cui X, Huie P, Cleary ML (červenec 2000). "Nastavit na doméně závislou regulaci umlčení transkripce a řízení růstu pomocí SUV39H1, savčího ortologu Drosophila Su (var) 3-9". Mol. Buňka. Biol. 20 (13): 4900–9. doi:10.1128 / mcb.20.13.4900-4909.2000. PMC 85941. PMID 10848615.

[16] Khanal, Prem; Kim, Garam; Lim, Sung-Chul; Yun, Hyo-Jeong; Lee, Kwang Youl; Choi, Hoo-Kyun; Choi, Hong Seok (2013). „Prolyl izomeráza Pin1 negativně reguluje stabilitu SUV39H1 na podporu tumorigeneze u rakoviny prsu“. FASEB Journal. 27 (11): 4606–4618. doi:10.1096 / fj.13-236851. PMID 23934277. S2CID 5259616.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]