A chromodoména (chromatin Óorganizace moodlišný[2]) je proteinstrukturální doména asi 40–50 aminokyselina zbytky běžně se vyskytující v proteinech spojených s remodelací a manipulací s chromatin. Doména je vysoce konzervovaný mezi rostlinami i zvířaty a v mnoha je zastoupen ve velkém množství různých proteinů genomy, jako je například myš. Některé obsahující chromodoménu geny mít více alternativní sestřih izoformy, které zcela vynechávají chromodoménu.[3] v savci, proteiny obsahující chromodoménu jsou zodpovědné za aspekty genová regulace související s remodelací chromatinu a tvorbou heterochromatin regionech.[4] Rovněž se vážou proteiny obsahující chromodoménu methylovanýhistony[5][6] a objeví se v Tlumení transkripce vyvolané RNA komplex.[7] U histonových modifikací jsou chromodomény velmi konzervované. Fungují identifikací a vazbou na methylovanou lysin zbytky, které existují na povrchu proteinů chromatinu, a tím regulují genovou transkripci.[8]
