S100A11 - S100A11

S100A11
Protein S100A11 PDB 1V4Z.png
Dostupné struktury
PDBLidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyS100A11, HEL-S-43, MLN70, S100C, S100 protein vázající vápník A11
Externí IDOMIM: 603114 MGI: 3645720 HomoloGene: 55916 Genové karty: S100A11
Umístění genu (člověk)
Chromozom 1 (lidský)
Chr.Chromozom 1 (lidský)[1]
Chromozom 1 (lidský)
Genomic location for S100A11
Genomic location for S100A11
Kapela1q21.3Start152,032,506 bp[1]
Konec152,047,907 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE S100A11 200660 at fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

6282

277089

Ensembl

ENSG00000163191

ENSMUSG00000066457

UniProt

P31949

n / a

RefSeq (mRNA)

NM_005620

n / a

RefSeq (protein)

NP_005611

n / a

Místo (UCSC)Chr 1: 152,03 - 152,05 Mbn / a
PubMed Vyhledávání[2][3]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

S100 protein vázající vápník A11 (S100A11) je protein že u lidí je kódován S100A11 gen.[4][5]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny proteinů S100 obsahující 2 EF ruka motivy vázající vápník. S100A11, také známý jako kalgizzarin nebo 100 ° C, je malý kyselý protein. Spolu se všemi 13 členy rodiny S100 jsou umístěny jako cluster na chromozóm 1q21. [6] Poprvé byl nalezen v roce 1989 a později izolován ze svalů kuřecího žaludku.[7]

Protein může fungovat v motilitě, invazi a tubulin polymerizace. Chromozomální přesmyky a změněná exprese tohoto genu byly zahrnuty v nádoru metastáza.[5]

Jeho vysoká exprese byla nalezena v mnoha tkáních, včetně plic, slinivky břišní, srdce, placenty, ledvin a nízké hladiny v kosterním svalu, játrech a mozkové tkáni.[8]

S100A11 se podílí na membránové a cytoskeletární dynamice, vezikulárním transportu a procesech endo a exocytóza. Bylo prokázáno, že S100A11 interaguje s mnoha cytoskeletálními strukturami jako tubulin, aktin, mezilehlá vlákna také s anexin I a anexin II.[9][10] S100A11 je schopen řídit reorganizaci aktinu a je důležitý při tvorbě výčnělku metastatickými buňkami.[11]

Postrádá enzymatickou aktivitu, funguje vazbou na jiné proteiny, reguluje aktivitu ostatních enzymy.[12] Je spojena s buněčný cyklus, růst, přežití a apoptóza. Byl identifikován jako duální růstový mediátor.[13][6] Potlačení S100A11 pomocí malá interferující RNA způsobil apoptózu buněk a bylo zjištěno, že nadměrná exprese S100A11 inhibuje apoptózu v nádorových buňkách. [6]Dále eliminace S100A11 pomocí siRNA snižuje výměnu sesterských chromatidů a životaschopnost buněk.

S100A11 v patologických stavech

IL-8 a TNF-alfa vyvolat expresi a uvolnění S100A11 v chondrocyty v kultuře a exogenní S100A11 způsobuje chondrocyty hypertrofie.[14] S100A11 by mohl hrát roli při udržování nízkého stupně zánětu artróza a v jeho průběhu.[15]

Jeho buněčná lokalizace je spojena s regulací buněčného růstu a proliferace. Tento protein se běžně vyskytuje přísně v jádro, ale objevuje se v cytoplazmě v rakovinných buňkách. S100A11 byl lokalizován v cytoplazmě odpočívajícího člověka keratinocyty in vitro.[16]

Bylo prokázáno, že interaguje s RAGE receptor, který je také receptorem pro další proteiny S100.[17]

Je spojena s nízkou nebo vysokou produkcí u mnoha různých typů rakoviny. Jeho nadprodukce byla zjištěna například v prsu, slinivce břišní nebo v kolektivu karcinom a jeho hladiny mohou být použity jako klinický marker u těchto onemocnění.[18]

Bylo prokázáno, že S100A11 zvyšuje rekombinační aktivitu člověka RAD51 in vitro. Porážka vede k difúzní distribuci RAD54B.[19]Tato zjištění naznačují potenciální roli S100A11 v procesu homologní rekombinace oprava dvouvláknové zlomy.[20]

Obvykle S100A11 vytváří homodimery, ale ukázalo se, že S100A11 heterodimerizuje s S100B[21] a také interaguje s Nucleolin,[22] a RAD54B.[19]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000163191 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  3. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ Wicki R, Marenholz I, Mischke D, Schäfer BW, Heizmann CW (prosinec 1996). „Charakterizace lidského genu S100A12 (kalgranulin C, p6, CAAF1, CGRP), nového člena klastru genu S100 na chromozomu 1q21“. Buněčný vápník. 20 (6): 459–64. doi:10.1016 / S0143-4160 (96) 90087-1. PMID  8985590.
  5. ^ A b „Entrez Gene: S100A11 S100 protein vázající vápník A11“.
  6. ^ A b C Kanamori T, Takakura K, Mandai M, Kariya M, Fukuhara K, Sakaguchi M a kol. (Říjen 2004). „Zvýšená exprese proteinu S100 vázajícího vápník v nádorech hladkého svalstva lidské dělohy“. Molekulární lidská reprodukce. 10 (10): 735–42. doi:10,1093 / mol / gah100. PMID  15322223.
  7. ^ Sakaguchi M, Sonegawa H, Murata H, Kitazoe M, Futami J, Kataoka K a kol. (Leden 2008). „S100A11, duální mediátor pro regulaci růstu lidských keratinocytů“. Molekulární biologie buňky. 19 (1): 78–85. doi:10.1091 / mbc.e07-07-0682. PMC  2174196. PMID  17978094.
  8. ^ Inada H, Naka M, Tanaka T, Davey GE, Heizmann CW (září 1999). „Human S100A11 vykazuje rozdílné hladiny RNA v ustáleném stavu v různých tkáních a odlišnou subcelulární lokalizaci“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 263 (1): 135–8. doi:10.1006 / bbrc.1999.1319. PMID  10486266.
  9. ^ Sakaguchi M, Huh NH (říjen 2011). „S100A11, duální regulátor růstu epidermálních keratinocytů“. Aminokyseliny. 41 (4): 797–807. doi:10.1007 / s00726-010-0747-4. PMID  20872027.
  10. ^ Réty S, Osterloh D, Arié JP, Tabaries S, Seeman J, Russo-Marie F a kol. (Únor 2000). "Strukturální základ asociace závislé na Ca (2 +) mezi S100C (S100A11) a jejím cílem, N-koncovou částí anexinu I". Struktura. 8 (2): 175–84. doi:10.1016 / s0969-2126 (00) 00093-9. PMID  10673436.
  11. ^ Shankar J, Messenberg A, Chan J, Underhill TM, Foster LJ, Nabi IR (květen 2010). „Pseudopodiální aktinová dynamika řídí epiteliálně-mezenchymální přechod v metastatických rakovinných buňkách“. Výzkum rakoviny. 70 (9): 3780–90. doi:10.1158 / 0008-5472.can-09-4439. PMID  20388789.
  12. ^ Zhao XQ, Naka M, Muneyuki M, Tanaka T (leden 2000). „Ca (2 +) - závislá inhibice aktinem aktivované aktivity myosin ATPázy S100C (S100A11), nový člen rodiny proteinů S100“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 267 (1): 77–9. doi:10.1006 / bbrc.1999.1918. PMID  10623577.
  13. ^ He H, Li J, Weng S, Li M, Yu Y (2009). "S100A11: různorodá funkce a patologie odpovídající různým cílovým proteinům". Buněčná biochemie a biofyzika. 55 (3): 117–26. doi:10.1007 / s12013-009-9061-8. PMID  19649745.
  14. ^ Cecil DL, Johnson K, Rediske J, Lotz M, Schmidt AM, Terkeltaub R (prosinec 2005). „Hypertrofie chondrocytů vyvolaná zánětem je poháněna receptorem pro konečné produkty pokročilé glykace“. Journal of Immunology. 175 (12): 8296–302. doi:10,4049 / jimmunol.175.12.8296. PMID  16339570.
  15. ^ Cecil DL, Terkeltaub R (červen 2008). „Transamidace transglutaminázou 2 transformuje kalgranulin S100A11 na prokatabolický cytokin pro chondrocyty“. Journal of Immunology. 180 (12): 8378–85. doi:10,4049 / jimmunol.180.12.8378. PMC  2577366. PMID  18523305.
  16. ^ Sakaguchi M, Huh NH (říjen 2011). „S100A11, duální regulátor růstu epidermálních keratinocytů“. Aminokyseliny. 41 (4): 797–807. doi:10.1007 / s00726-010-0747-4. PMID  20872027.
  17. ^ Cecil DL, Johnson K, Rediske J, Lotz M, Schmidt AM, Terkeltaub R (prosinec 2005). „Hypertrofie chondrocytů vyvolaná zánětem je řízena receptorem pro konečné produkty pokročilé glykace“. Journal of Immunology. 175 (12): 8296–302. doi:10,4049 / jimmunol.175.12.8296. PMID  16339570.
  18. ^ Sakaguchi M, Sonegawa H, Murata H, Kitazoe M, Futami J, Kataoka K a kol. (Leden 2008). „S100A11, duální mediátor pro regulaci růstu lidských keratinocytů“. Molekulární biologie buňky. 19 (1): 78–85. doi:10.1091 / mbc.e07-07-0682. PMC  2174196. PMID  17978094.
  19. ^ A b Murzik U, Hemmerich P, Weidtkamp-Peters S, Ulbricht T, Bussen W, Hentschel J a kol. (Červenec 2008). „Cílení Rad54B na místa opravy dvouvláknových zlomů DNA vyžaduje komplexní tvorbu pomocí S100A11“. Molekulární biologie buňky. 19 (7): 2926–35. doi:10,1091 / mbc.e07-11-1167. PMC  2441681. PMID  18463164.
  20. ^ Foertsch F, Szambowska A, Weise A, Zielinski A, Schlott B, Kraft F a kol. (Říjen 2016). „S100A11 hraje roli v homologní rekombinaci a udržování genomu ovlivňováním perzistence RAD51 v ohniscích opravy DNA“. Buněčný cyklus. 15 (20): 2766–79. doi:10.1080/15384101.2016.1220457. PMC  5053559. PMID  27590262.
  21. ^ Deloulme JC, Assard N, Mbele GO, Mangin C, Kuwano R, Baudier J (listopad 2000). „S100A6 a S100A11 jsou specifické cíle proteinu S100B vázajícího vápník a zinek in vivo“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (45): 35302–10. doi:10,1074 / jbc.M003943200. PMID  10913138.
  22. ^ Sakaguchi M, Miyazaki M, Takaishi M, Sakaguchi Y, Makino E, Kataoka N a kol. (Listopad 2003). „S100C / A11 je klíčovým mediátorem Ca (2 +) indukované inhibice růstu lidských epidermálních keratinocytů“. The Journal of Cell Biology. 163 (4): 825–35. doi:10.1083 / jcb.200304017. PMC  2173690. PMID  14623863.

Další čtení