Nucleolin - Nucleolin

NCL
Protein NCL PDB 2fc8.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyNCL, C23, nukleolin, Nsr1
Externí IDOMIM: 164035 MGI: 97286 HomoloGene: 136488 Genové karty: NCL
Umístění genu (člověk)
Chromozom 2 (lidský)
Chr.Chromozom 2 (lidský)[1]
Chromozom 2 (lidský)
Genomic location for NCL
Genomic location for NCL
Kapela2q37.1Start231,453,531 bp[1]
Konec231,483,641 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE NCL 200610 s at fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

4691

17975

Ensembl

ENSG00000115053

ENSMUSG00000026234

UniProt

P19338

P09405

RefSeq (mRNA)

NM_005381

NM_010880

RefSeq (protein)

NP_005372

NP_035010

Místo (UCSC)Chr 2: 231,45 - 231,48 MbChr 1: 86,34 - 86,36 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Nucleolin je protein že u lidí je kódován NCL gen.[5][6]

Gen

Lidský NCL gen je lokalizován na chromozom 2 a skládá se ze 14 exony s 13 introny a zabírá přibližně 11 kB. Intron 11 genu NCL kóduje a malá nukleolární RNA označované jako U20.[7]

Funkce

Nukleolin je hlavním nukleolárním proteinem rostoucích eukaryotických buněk. Bylo zjištěno, že je spojena s intranukleolárním chromatinem a pre-ribozomálními částicemi. Indukuje kondenzaci chromatinu vazbou na histon H1. Předpokládá se, že hraje roli v transkripci pre-rRNA a sestavení ribozomu. Může hrát roli v procesu transkripčního prodloužení. Váže RNA oligonukleotidy s 5'-UUAGGG-3 'repetice těsněji než telomerní jednořetězcová DNA 5'-TTAGGG-3' repetice.

Nucleolin je také schopen působit jako transkripční koaktivátor s transkripčním faktorem kuřecího ovalbuminu proti směru transkripce II (COUP-TFII ).[8]

Klinický význam

Midkine a pleiotrofin se váží na nukleolin na povrchu buněk jako receptor s nízkou afinitou. Tato vazba může inhibovat infekci HIV.[9][10]

Nukleolin na povrchu buňky je receptorem pro Respirační syncytiální virus (RSV) fúzní protein.[11] Interference s interakcí fúzního proteinu nukleolin - RSV byla prokázána jako terapeutická proti infekci RSV v buněčných kulturách a na zvířecích modelech.[12][13][14][15]

Interakce

Bylo prokázáno, že nukleolin komunikovat s:

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115053 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026234 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Srivastava M, McBride OW, Fleming PJ, Pollard HB, Burns AL (září 1990). "Genomická organizace a chromozomální lokalizace genu lidského nukleolinu". The Journal of Biological Chemistry. 265 (25): 14922–31. PMID  2394707.
  6. ^ Erard MS, Belenguer P, Caizergues-Ferrer M, Pantaloni A, Amalric F (srpen 1988). „Hlavní nukleolární protein, nukleolin, indukuje dekondenzaci chromatinu vazbou na histon H1“. European Journal of Biochemistry / FEBS. 175 (3): 525–30. doi:10.1111 / j.1432-1033.1988.tb14224.x. PMID  3409881.
  7. ^ „Entrez Gene: NCL nukleolin“.
  8. ^ Litchfield LM, Riggs KA, Hockenberry AM, Oliver LD, Barnhart KG, Cai J, Pierce WM, Ivanova MM, Bates PJ, Appana SN, Datta S, Kulesza P, McBryan J, Young LS, Klinge CM (květen 2012). "Identifikace a charakterizace nukleolinu jako COUP-TFII koaktivátoru transkripce beta receptoru kyseliny retinové v buňkách rakoviny prsu". PLOS ONE. 7 (5): e38278. Bibcode:2012PLoSO ... 738278L. doi:10.1371 / journal.pone.0038278. PMC  3365040. PMID  22693611.
  9. ^ Řekli EA, Krust B, Nisole S, Svab J, Briand JP, Hovanessian AG (říjen 2002). „Anti-HIV cytokin midkin se váže na povrchově exprimovaný nukleolin jako receptor s nízkou afinitou“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (40): 37492–502. doi:10,1074 / jbc.M201194200. PMID  12147681. S2CID  41621217.
  10. ^ Řekli EA, Courty J, Svab J, Delbé J, Krust B, Hovanessian AG (září 2005). „Pleiotrophin inhibuje infekci HIV vazbou nukleolinu exprimovaného na povrchu buňky“. FEBS Journal. 272 (18): 4646–59. doi:10.1111 / j.1742-4658.2005.04870.x. PMID  16156786. S2CID  21153881.
  11. ^ Tayyari F, Marchant D, Moraes TJ, Duan W, Mastrangelo P, Hegele RG (září 2011). "Identifikace nukleolinu jako buněčného receptoru pro lidský respirační syncyciální virus". Přírodní medicína. 17 (9): 1132–5. doi:10,1038 / nm.2444. PMID  21841784. S2CID  205388029.
  12. ^ Bilawchuk LM, Griffiths CD, Jensen LD, Elawar F, Marchant DJ (srpen 2017). „Citlivost respiračního syncyciálního viru na blokování nukleolinových receptorů a neutralizaci protilátek závisí na způsobu čištění viru“. Viry. 9 (8): 207. doi:10,3390 / v9080207. PMC  5580464. PMID  28771197.
  13. ^ Mastrangelo P, Hegele RG (listopad 2012). „Fúzní receptor RSV: ne takový, jaký každý očekával.“ Mikrobi a infekce / Institut Pasteur. 14 (13): 1205–10. doi:10.1016 / j.micinf.2012.07.015. PMID  22884716.
  14. ^ Mastrangelo P, Hegele RG (březen 2013). „RSV fúze: čas na nový model“. Viry. 5 (3): 873–85. doi:10,3390 / v5030873. PMC  3705301. PMID  23518574.
  15. ^ Shakeri A, Mastrangelo P, Griffin JK, Moraes TJ, Hegele RG (listopad 2014). "Exprese receptoru respiračního syncyciálního viru v myším a virovém tropismu". Histologie a histopatologie. 30 (30): 401–411. doi:10,14670 / HH-30,401. PMID  25374027.
  16. ^ Li D, Dobrowolska G, Krebs EG (červen 1996). "Fyzikální asociace kasein kinázy 2 s nukleolinem". The Journal of Biological Chemistry. 271 (26): 15662–8. doi:10.1074 / jbc.271.26.15662. PMID  8663258. S2CID  10750338.
  17. ^ Dubois T, Zemličková E, Howell S, Aitken A (únor 2003). "Centaurin-alfa 1 se asociuje in vitro a in vivo s nukleolinem". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 301 (2): 502–8. doi:10.1016 / s0006-291x (02) 03010-3. PMID  12565890.
  18. ^ Tominaga K, Srikantan S, Lee EK, Subaran SS, Martindale JL, Abdelmohsen K, Gorospe M (říjen 2011). „Kompetitivní regulace exprese nukleolinu pomocí HuR a miR-494“. Molekulární a buněčná biologie. 31 (20): 4219–31. doi:10.1128 / MCB.05955-11. PMC  3187287. PMID  21859890.
  19. ^ Li YP, Busch RK, Valdez BC, Busch H (duben 1996). „C23 interaguje s B23, domnělým proteinem vázajícím nukleolární lokalizaci-signál“. European Journal of Biochemistry / FEBS. 237 (1): 153–8. doi:10.1111 / j.1432-1033.1996.0153n.x. PMID  8620867.
  20. ^ Daniely Y, Dimitrova DD, Borowiec JA (srpen 2002). „Stresově závislá mobilizace nukleolinu zprostředkovaná tvorbou komplexu p53-nukleolin“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (16): 6014–22. doi:10.1128 / mcb.22.16.6014-6022.2002. PMC  133981. PMID  12138209.
  21. ^ Morimoto H, Okamura H, Haneji T (září 2002). "Interakce delta proteinové fosfatázy 1 s nukleolinem v lidských osteoblastických buňkách". The Journal of Histochemistry and Cytochemistry. 50 (9): 1187–93. doi:10.1177/002215540205000905. PMID  12185196. S2CID  24950287.
  22. ^ Sakaguchi M, Miyazaki M, Takaishi M, Sakaguchi Y, Makino E, Kataoka N, Yamada H, Namba M, Huh NH (listopad 2003). „S100C / A11 je klíčovým mediátorem Ca (2 +) indukované inhibice růstu lidských epidermálních keratinocytů“. The Journal of Cell Biology. 163 (4): 825–35. doi:10.1083 / jcb.200304017. PMC  2173690. PMID  14623863.
  23. ^ Fouraux MA, Bouvet P, Verkaart S, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (červenec 2002). „Nukleolin se asociuje s podmnožinou komplexů lidského Ro ribonukleoproteinu“. Journal of Molecular Biology. 320 (3): 475–88. doi:10.1016 / s0022-2836 (02) 00518-1. PMID  12096904.
  24. ^ Haluska P, Saleem A, Edwards TK, Rubin EH (duben 1998). "Interakce mezi N-koncem lidské topoizomerázy I a velkým T antigenem SV40". Výzkum nukleových kyselin. 26 (7): 1841–7. doi:10.1093 / nar / 26.7.1841. PMC  147454. PMID  9512561.
  25. ^ Bharti AK, Olson MO, Kufe DW, Rubin EH (leden 1996). "Identifikace vazebného místa pro nukleolin v lidské topoizomeráze I". The Journal of Biological Chemistry. 271 (4): 1993–7. doi:10.1074 / jbc.271.4.1993. PMID  8567649. S2CID  25059254.
  26. ^ Khurts S, Masutomi K, Delgermaa L, Arai K, Oishi N, Mizuno H, Hayashi N, Hahn WC, Murakami S (prosinec 2004). "Nukleolin interaguje s telomerázou". The Journal of Biological Chemistry. 279 (49): 51508–15. doi:10,1074 / jbc.M407643200. PMID  15371412. S2CID  41394148.

Další čtení