RNF144A - RNF144A

RNF144A
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyRNF144A, RNF144, UBCE7IP4, protein prstového prstence 144A, hUIP4
Externí IDMGI: 1344401 HomoloGene: 40982 Genové karty: RNF144A
Umístění genu (člověk)
Chromozom 2 (lidský)
Chr.Chromozom 2 (lidský)[1]
Chromozom 2 (lidský)
Genomické umístění pro RNF144A
Genomické umístění pro RNF144A
Kapela2p25.1Start6,917,412 bp[1]
Konec7,068,286 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

9781

108089

Ensembl

ENSG00000151692

ENSMUSG00000020642

UniProt

P50876

Q925F3

RefSeq (mRNA)

NM_001081977
NM_080563

RefSeq (protein)

NP_001075446
NP_542130

Místo (UCSC)Chr 2: 6,92 - 7,07 MbChr 12: 26,3 - 26,42 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

RNF144A je E3 ubikvitinová ligáza patřící do rodiny RING-between RING (RBR) ubikvitin ligázy, jejichž specifické členy fungují jako hybridní E3 ligázy RING-HECT.[5][6][7] RNF144A nejvíce souvisí s RNF144B na úrovni proteinu a tyto dva proteiny společně tvoří subdoménu v rámci rodiny proteinů RBR.[8][9][10] Aktivita ubikvitinové ligázy RNF144A katalyzuje ubikvitinové vazby v polohách K6-, K11- a K48- ubikvitinu in vitro a je regulována vlastní asociací prostřednictvím své transmembránové domény.[11][12]

Biologické funkce RNF144A jsou / jsou relativně neznámé nad rámec své vlastní enzymatická aktivita. Somatické mutace RNF144A byly katalogizovány v genetická rakovina databáze v několika primárních lidských nádory, počítaje v to prsa, žaludek, lymfom, glioblastom, děložní a rakoviny plic. S ostatními členy rodiny RBR jsou spojováni neurologický a imunologické nemoci zaparkovat, HOIL-1L a HOIP (RNF31).[13][14][15][16]

Aktuální známý substráty RNF144A zaměřených na degradaci jsou proteiny, kterých se účastní Oprava DNA, funkce a signalizace tepelného šoku / chaperonu, v souladu s převládající asociací tohoto proteinu s rakovinou, a zahrnují (DNA-PKcs ), PARP1, HSPA2, BMI1, a RAF1.[17][18][19][20][21]

Viz také

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000151692 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020642 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Wenzel DM, Lissounov A, Brzovic PS, Klevit RE (červen 2011). „Profil reaktivity UBCH7 odhaluje, že Parkin a HHARI jsou hybridy RING / HECT“. Příroda. 474 (7349): 105–8. doi:10.1038 / nature09966. PMC  3444301. PMID  21532592.
  6. ^ „RNF144A protein prstového prstu 144A [Homo sapiens (člověk)] - gen - NCBI“. www.ncbi.nlm.nih.gov. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna. Citováno 2019-10-27.
  7. ^ „RNF144A - E3 ubikvitin-proteinová ligáza RNF144A - Homo sapiens (člověk) - gen a protein RNF144A“. www.uniprot.org. UniProt. Citováno 2019-10-27.
  8. ^ Dove KK, Klevit RE (listopad 2017). „RING-Between-RING E3 Ligases: Emerging Themes amid the Variations“. Journal of Molecular Biology. 429 (22): 3363–3375. doi:10.1016 / j.jmb.2017.08.008. PMC  5675740. PMID  28827147.
  9. ^ Spratt DE, Walden H, Shaw GS (březen 2014). „Ubikvitinové ligázy RBR E3: nové struktury, nové poznatky, nové otázky“. The Biochemical Journal. 458 (3): 421–37. doi:10.1042 / BJ20140006. PMC  3940038. PMID  24576094.
  10. ^ Eisenhaber B, Chumak N, Eisenhaber F, Hauser MT (2007). „Proteinová rodina prstenu mezi prsteníčky (RBR)“. Genome Biology. 8 (3): 209. doi:10.1186 / gb-2007-8-3-209. PMC  1868946. PMID  17367545.
  11. ^ Michel MA, Swatek KN, Hospenthal MK, Komander D (říjen 2017). „Affimery specifické pro ubikvitinové vazby odhalují pohledy na signalizaci ubikvitinu spojenou s K6“. Molekulární buňka. 68 (1): 233–246.e5. doi:10.1016 / j.molcel.2017.08.020. PMC  5640506. PMID  28943312.
  12. ^ Ho SR, Lee YJ, Lin WC (září 2015). „Regulace aktivity ubikvitinové ligasy RNF144A E3 samo-asociací prostřednictvím její transmembránové domény“. The Journal of Biological Chemistry. 290 (38): 23026–38. doi:10,1074 / jbc.M115,645499. PMC  4645615. PMID  26216882.
  13. ^ Pickrell AM, Youle RJ (leden 2015). „Role PINK1, parkinu a mitochondriální věrnosti u Parkinsonovy choroby“. Neuron. 85 (2): 257–73. doi:10.1016 / j.neuron.2014.12.007. PMC  4764997. PMID  25611507.
  14. ^ Oda H, Beck DB, Kuehn HS, Sampaio Moura N, Hoffmann P, Ibarra M a kol. (2019-03-18). „Druhý případ nedostatku HOIP rozšiřuje klinické vlastnosti a definuje zánětlivý transkriptom regulovaný LUBAC“. Hranice v imunologii. 10: 479. doi:10.3389 / fimmu.2019.00479. PMC  6431612. PMID  30936877.
  15. ^ Boisson B, Laplantine E, Dobbs K, Cobat A, Tarantino N, Hazen M a kol. (Červen 2015). „Nedostatek lidského HOIP a LUBAC je základem autoinflamace, imunodeficience, amylopektinózy a lymfangiektázie.“. The Journal of Experimental Medicine. 212 (6): 939–51. doi:10.1084 / jem.20141130. PMC  4451137. PMID  26008899.
  16. ^ Boisson B, Laplantine E, Prando C, Giliani S, Israelsson E, Xu Z a kol. (Prosinec 2012). „Imunodeficience, autozánět a amylopektinóza u lidí se zděděným nedostatkem HOIL-1 a LUBAC“. Přírodní imunologie. 13 (12): 1178–86. doi:10.1038 / ni.2457. PMC  3514453. PMID  23104095.
  17. ^ Ho SR, Mahanic CS, Lee YJ, Lin WC (červenec 2014). „RNF144A, ubikvitinová ligáza E3 pro DNA-PKcs, podporuje apoptózu během poškození DNA“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 111 (26): E2646-55. Bibcode:2014PNAS..111E2646H. doi:10.1073 / pnas.1323107111. PMC  4084471. PMID  24979766.
  18. ^ Zhang Y, Liao XH, Xie HY, Shao ZM, Li DQ (listopad 2017). „RBR typ E3 ubikvitinová ligáza RNF144A cílí na PARP1 pro degradaci závislou na ubikvitinu a reguluje citlivost inhibitoru PARP v buňkách rakoviny prsu“. Cílový cíl. 8 (55): 94505–94518. doi:10,18632 / oncotarget.21784. PMC  5706891. PMID  29212245.
  19. ^ Yang YL, Zhang Y, Li DD, Zhang FL, Liu HY, Liao XH a kol. (Srpen 2019). „RNF144A funguje jako tumor supresor u rakoviny prsu prostřednictvím regulace stability a onkogenních funkcí HSPA2 závislé na aktivitě ubikvitin ligázy“. Buněčná smrt a diferenciace. 27 (3): 1105–1118. doi:10.1038 / s41418-019-0400-z. PMC  7205990. PMID  31406303.
  20. ^ Jin X, Kim LJ, Wu Q, Wallace LC, Prager BC, Sanvoranart T a kol. (Listopad 2017). „Cílení na gliomové kmenové buňky prostřednictvím kombinované inhibice BMI1 a EZH2“. Přírodní medicína. 23 (11): 1352–1361. doi:10,1038 / nm. 4415. PMC  5679732. PMID  29035367.
  21. ^ Afzali B, Kim S, West E, Nova-Lamperti E, Cheru N, Nagashima H a kol. (2019-09-26). „RNF144A utváří hierarchii cytokinové signalizace, aby poskytla ochrannou imunitu proti chřipce“. doi:10.1101/782680. Citovat deník vyžaduje | deník = (Pomoc)