RANBP9 - RANBP9

RANBP9
Identifikátory
Aliasy	RANBP9, Ranbp9, IBAP-1, Ibap1, RanBPM, BPM-L, BPM90, RanBP7, RAN vazebný protein 9
Externí ID	OMIM: 603854 MGI: 1928741 HomoloGene: 38057 Genové karty: RANBP9
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	13,711,835 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	43,481,282 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba enzymu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Proběhla vazba GTPázy; • Aktivita faktoru výměny ras guanyl-nukleotidů;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • buněčná membrána; • membrána; • buněčné jádro; • komplex spojený s mikrotubuly; • komplex ubikvitin ligázy;
Biologický proces	• negativní regulace kaskády ERK1 a ERK2; • mikrotubulová nukleace; • axonové vedení; • Kaskáda MAPK; • sestava makromolekulárního komplexu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10048
	56705
	ENSG00000010017
	ENSMUSG00000038546
	Q96S59
	P69566
	NM_005493
	NM_019930
	NP_005484
	NP_064314
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Ran vázající protein 9 je protein že u lidí je kódován RANBP9 gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen kóduje protein, který váže RAN, malý protein vázající GTP patřící do nadrodiny RAS, který je nezbytný pro translokaci RNA a proteinů komplexem jaderných pórů. Ukázalo se také, že protein kódovaný tímto genem interaguje s několika dalšími proteiny, včetně met protoonkogenu, proteinové kinázy 2 interagující s homeodoménou, androgenového receptoru a kinázy 11 závislé na cyklinu.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že RANBP9 komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000010017 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038546 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Nakamura M, Masuda H, Horii J, Kuma Ki, Yokoyama N, Ohba T, Nishitani H, Miyata T, Tanaka M, Nishimoto T (prosinec 1998). „Při nadměrné expresi způsobuje nový centrosomální protein RanBPM ektopickou mikrotubulární nukleaci podobnou γ-tubulinu“. J Cell Biol. 143 (4): 1041–52. doi:10.1083 / jcb.143.4.1041. PMC 2132962. PMID 9817760.
^ ^A ^b „Entrez Gene: RANBP9 RAN binding protein 9“.
^ ^A ^b Rao MA, Cheng H, Quayle AN, Nishitani H, Nelson CC, Rennie PS (prosinec 2002). „RanBPM, jaderný protein, který interaguje s a reguluje transkripční aktivitu androgenového receptoru a glukokortikoidového receptoru“. J. Biol. Chem. 277 (50): 48020–7. doi:10,1074 / jbc.M209741200. PMID 12361945.
^ Wang D, Li Z, Messing EM, Wu G (září 2002). „Aktivace dráhy Ras / Erk novým proteinem RanBPM interagujícím s MET“. J. Biol. Chem. 277 (39): 36216–22. doi:10,1074 / jbc.M205111200. PMID 12147692.
^ Morris JA, Kandpal G, Ma L, Austin CP (červenec 2003). „DISC1 (Disrupted-In-Schizophrenia 1) je protein související s centrosomy, který interaguje s MAP1A, MIPT3, ATF4 / 5 a NUDEL: regulace a ztráta interakce s mutací“. Hučení. Mol. Genet. 12 (13): 1591–608. doi:10,1093 / hmg / ddg162. PMID 12812986.
^ Zou Y, Lim S, Lee K, Deng X, Friedman E (prosinec 2003). „Serin / threonin kináza Mirk / Dyrk1B je inhibitor migrace epitelových buněk a je negativně regulován Met adaptérem Ran-binding protein M“. J. Biol. Chem. 278 (49): 49573–81. doi:10,1074 / jbc.M307556200. PMID 14500717.
^ Wang Y, Marion Schneider E, Li X, Duttenhöfer I, Debatin K, Hug H (září 2002). Msgstr "HIPK2 se přidruží k RanBPM". Biochem. Biophys. Res. Commun. 297 (1): 148–53. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 02020-X. PMID 12220523.
^ Umeda M, Nishitani H, Nishimoto T (leden 2003). „Nový jaderný protein, Twa1 a Muskelin tvoří komplex s RanBPM.“ Gen. 303: 47–54. doi:10.1016 / s0378-1119 (02) 01153-8. PMID 12559565.
^ Emberley ED, Gietz RD, Campbell JD, HayGlass KT, Murphy LC, Watson PH (listopad 2002). „RanBPM interaguje s psoriasinem in vitro a jejich exprese koreluje se specifickými klinickými rysy in vivo u rakoviny prsu“. Rakovina BMC. 2: 28. doi:10.1186/1471-2407-2-28. PMC 137593. PMID 12421467.
^ Ideguchi H, Ueda A, Tanaka M, Yang J, Tsuji T, Ohno S, Hagiwara E, Aoki A, Ishigatsubo Y (říjen 2002). „Strukturální a funkční charakterizace deubikvitinačního enzymu USP11, který interaguje s proteinem RanBPM asociovaným s RanGTP“. Biochem. J. 367 (Pt 1): 87–95. doi:10.1042 / BJ20011851. PMC 1222860. PMID 12084015.

Další čtení

Nishimoto T (1999). Msgstr "Nová role spuštěné GTPázy". Biochem. Biophys. Res. Commun. 262 (3): 571–4. doi:10.1006 / bbrc.1999.1252. PMID 10471364.
Kozak M (2003). "Vznikající vazby mezi zahájením translace a lidskými chorobami". Mamm. Genom. 13 (8): 401–10. doi:10.1007 / s00335-002-4002-5. PMID 12226704. S2CID 25690586.
Nishitani H, Hirose E, Uchimura Y, Nakamura M, Umeda M, Nishii K, Mori N, Nishimoto T (2001). „RanBPM cDNA plné velikosti kóduje protein mající dlouhý úsek prolin a glutamin v N-koncové oblasti, zahrnující velký proteinový komplex“. Gen. 272 (1–2): 25–33. doi:10.1016 / S0378-1119 (01) 00553-4. PMID 11470507.
Caballero OL, Resto V, Patturajan M, Meerzaman D, Guo MZ, Engles J, Yochem R, Ratovitski E, Sidransky D, Jen J (2002). „Interakce a kolokace PGP9.5 s JAB1 a p27 (Kip1)“. Onkogen. 21 (19): 3003–10. doi:10.1038 / sj.onc.1205390. PMID 12082530.
Ideguchi H, Ueda A, Tanaka M, Yang J, Tsuji T, Ohno S, Hagiwara E, Aoki A, Ishigatsubo Y (2003). „Strukturální a funkční charakterizace deubikvitinačního enzymu USP11, který interaguje s proteinem RanBPM asociovaným s RanGTP“. Biochem. J. 367 (Pt 1): 87–95. doi:10.1042 / BJ20011851. PMC 1222860. PMID 12084015.
Wang D, Li Z, Messing EM, Wu G (2002). „Aktivace dráhy Ras / Erk novým proteinem RanBPM interagujícím s MET“. J. Biol. Chem. 277 (39): 36216–22. doi:10,1074 / jbc.M205111200. PMID 12147692.
Wang Y, Marion Schneider E, Li X, Duttenhöfer I, Debatin K, Hug H (2002). Msgstr "HIPK2 se přidruží k RanBPM". Biochem. Biophys. Res. Commun. 297 (1): 148–53. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 02020-X. PMID 12220523.
Rao MA, Cheng H, Quayle AN, Nishitani H, Nelson CC, Rennie PS (2003). „RanBPM, jaderný protein, který interaguje s a reguluje transkripční aktivitu androgenového receptoru a glukokortikoidového receptoru“. J. Biol. Chem. 277 (50): 48020–7. doi:10,1074 / jbc.M209741200. PMID 12361945.
Emberley ED, Gietz RD, Campbell JD, HayGlass KT, Murphy LC, Watson PH (2003). „RanBPM interaguje s psoriasinem in vitro a jejich exprese koreluje se specifickými klinickými rysy in vivo u rakoviny prsu“. Rakovina BMC. 2: 28. doi:10.1186/1471-2407-2-28. PMC 137593. PMID 12421467.
Hafizi S, Alindri F, Karlsson R, Dahlbäck B (2003). „Interakce tyrosinkinázy receptoru Axl s C1-TEN, novým proteinem obsahujícím doménu C1 s homologií s tensinem“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 299 (5): 793–800. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 02718-3. PMID 12470648.
Umeda M, Nishitani H, Nishimoto T (2003). „Nový jaderný protein, Twa1 a Muskelin tvoří komplex s RanBPM.“ Gen. 303: 47–54. doi:10.1016 / S0378-1119 (02) 01153-8. PMID 12559565.
Lutz W, Frank EM, Craig TA, Thompson R, Venters RA, Kojetin D, Cavanagh J, Kumar R (2003). „Calbindin D28K interaguje s Ran-binding protein M: identifikace interagujících domén pomocí NMR spektroskopie“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 303 (4): 1186–92. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 00499-6. PMID 12684061.
Yao X, Wang HL, Shi ZX, Yan XY, Feng EL, Yang BL, Huang LY (2003). "Identifikace RanBMP interagující s Shigella flexneri IpaCvasin pomocí dvouhybridního systému kvasinek". Svět J. Gastroenterol. 9 (6): 1347–51. doi:10,3748 / wjg.v9.i6.1347. PMC 4611814. PMID 12800254.
Morris JA, Kandpal G, Ma L, Austin CP (2004). „DISC1 (Disrupted-In-Schizophrenia 1) je protein související s centrosomy, který interaguje s MAP1A, MIPT3, ATF4 / 5 a NUDEL: regulace a ztráta interakce s mutací“. Hučení. Mol. Genet. 12 (13): 1591–608. doi:10,1093 / hmg / ddg162. PMID 12812986.
Zou Y, Lim S, Lee K, Deng X, Friedman E (2004). „Serin / threonin kináza Mirk / Dyrk1B je inhibitor migrace epitelových buněk a je negativně regulován Met adaptérem Ran-binding protein M“. J. Biol. Chem. 278 (49): 49573–81. doi:10,1074 / jbc.M307556200. PMID 14500717.
Mikolajczyk M, Shi J, Vaillancourt RR, Sachs NA, Nelson M (2003). „Izoforma cyklin-dependentní kinázy 11 (p46) interaguje s RanBPM“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 310 (1): 14–8. doi:10.1016 / j.bbrc.2003.08.116. PMID 14511641.

externí odkazy

RANBP9 umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
RANBP9 podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000010017 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038546 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9817760-5] Nakamura M, Masuda H, Horii J, Kuma Ki, Yokoyama N, Ohba T, Nishitani H, Miyata T, Tanaka M, Nishimoto T (prosinec 1998). „Při nadměrné expresi způsobuje nový centrosomální protein RanBPM ektopickou mikrotubulární nukleaci podobnou γ-tubulinu“. J Cell Biol. 143 (4): 1041–52. doi:10.1083 / jcb.143.4.1041. PMC 2132962. PMID 9817760.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: RANBP9 RAN binding protein 9“.

[pmid12361945-7] A ^b Rao MA, Cheng H, Quayle AN, Nishitani H, Nelson CC, Rennie PS (prosinec 2002). „RanBPM, jaderný protein, který interaguje s a reguluje transkripční aktivitu androgenového receptoru a glukokortikoidového receptoru“. J. Biol. Chem. 277 (50): 48020–7. doi:10,1074 / jbc.M209741200. PMID 12361945.

[pmid12147692-8] Wang D, Li Z, Messing EM, Wu G (září 2002). „Aktivace dráhy Ras / Erk novým proteinem RanBPM interagujícím s MET“. J. Biol. Chem. 277 (39): 36216–22. doi:10,1074 / jbc.M205111200. PMID 12147692.

[pmid12812986-9] Morris JA, Kandpal G, Ma L, Austin CP (červenec 2003). „DISC1 (Disrupted-In-Schizophrenia 1) je protein související s centrosomy, který interaguje s MAP1A, MIPT3, ATF4 / 5 a NUDEL: regulace a ztráta interakce s mutací“. Hučení. Mol. Genet. 12 (13): 1591–608. doi:10,1093 / hmg / ddg162. PMID 12812986.

[pmid14500717-10] Zou Y, Lim S, Lee K, Deng X, Friedman E (prosinec 2003). „Serin / threonin kináza Mirk / Dyrk1B je inhibitor migrace epitelových buněk a je negativně regulován Met adaptérem Ran-binding protein M“. J. Biol. Chem. 278 (49): 49573–81. doi:10,1074 / jbc.M307556200. PMID 14500717.

[pmid12220523-11] Wang Y, Marion Schneider E, Li X, Duttenhöfer I, Debatin K, Hug H (září 2002). Msgstr "HIPK2 se přidruží k RanBPM". Biochem. Biophys. Res. Commun. 297 (1): 148–53. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 02020-X. PMID 12220523.

[pmid12559565-12] Umeda M, Nishitani H, Nishimoto T (leden 2003). „Nový jaderný protein, Twa1 a Muskelin tvoří komplex s RanBPM.“ Gen. 303: 47–54. doi:10.1016 / s0378-1119 (02) 01153-8. PMID 12559565.

[pmid12421467-13] Emberley ED, Gietz RD, Campbell JD, HayGlass KT, Murphy LC, Watson PH (listopad 2002). „RanBPM interaguje s psoriasinem in vitro a jejich exprese koreluje se specifickými klinickými rysy in vivo u rakoviny prsu“. Rakovina BMC. 2: 28. doi:10.1186/1471-2407-2-28. PMC 137593. PMID 12421467.

[pmid12084015-14] Ideguchi H, Ueda A, Tanaka M, Yang J, Tsuji T, Ohno S, Hagiwara E, Aoki A, Ishigatsubo Y (říjen 2002). „Strukturální a funkční charakterizace deubikvitinačního enzymu USP11, který interaguje s proteinem RanBPM asociovaným s RanGTP“. Biochem. J. 367 (Pt 1): 87–95. doi:10.1042 / BJ20011851. PMC 1222860. PMID 12084015.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]