RNPS1 - RNPS1
Protein vázající RNA s doménou bohatou na serin 1 je protein že u lidí je kódován RNPS1 gen.[5][6][7]
Funkce
Tento gen kóduje protein, který je součástí post-sestřihového multiproteinového komplexu, komplex exonových spojů, podílející se jak na jaderném exportu mRNA, tak na sledování mRNA. Sledování mRNA detekuje exportované mRNA pomocí zkrácených otevřených čtecích rámců a iniciuje nesmyslně zprostředkovaný rozpad mRNA (NMD). Když translace končí upstream od posledního spojení exon-exon, spustí se tím NMD k degradaci mRNA obsahujících předčasné stop kodony. Tento protein se váže na mRNA a po nukleárním exportu zůstává vázán a působí jako nukleocytoplazmatický pendlovací protein. Tento protein obsahuje mnoho serinových zbytků. Pro tento gen byly nalezeny dvě varianty sestřihu; obě varianty kódují stejný protein.[7]
Interakce
Bylo prokázáno, že RNPS1 komunikovat s SART3[8] a Pinin.[9][10]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000205937 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034681 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Loyer P, Trembley JH, Lahti JM, Kidd VJ (červen 1998). „Protein RNP, RNPS1, se asociuje se specifickými izoformami proteinové kinázy PITSLRE související s p34cdc2 in vivo.“ Journal of Cell Science. 111 (Pt 11) (11): 1495–506. PMID 9580558.
- ^ Badolato J, Gardiner E, Morrison N, Eisman J (prosinec 1995). "Identifikace a charakterizace nového lidského proteinu vázajícího RNA". Gen. 166 (2): 323–7. doi:10.1016/0378-1119(95)00571-4. PMID 8543184.
- ^ A b "Entrez Gene: RNPS1 RNA binding protein S1, serin-rich domain".
- ^ Harada K, Yamada A, Yang D, Itoh K, Shichijo S (září 2001). „Vazba antigenu odmítajícího nádory SART3 na sestřihový faktor pre-mRNA RNPS1: možná regulace sestřihu prostřednictvím tvorby komplexu“. International Journal of Cancer. 93 (5): 623–8. doi:10.1002 / ijc.1391. PMID 11477570. S2CID 24724555.
- ^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
- ^ Li C, Lin RI, Lai MC, Ouyang P, Tarn WY (říjen 2003). „Nukleární Pnn / DRS protein se váže na sestříhané mRNP a podílí se na zpracování a exportu mRNA prostřednictvím interakce s RNPS1“. Molekulární a buněčná biologie. 23 (20): 7363–76. doi:10.1128 / MCB.23.20.7363-7376.2003. PMC 230327. PMID 14517304.
Další čtení
- Burn TC, Connors TD, Van Raay TJ, Dackowski WR, Millholland JM, Klinger KW, Landes GM (červen 1996). „Generování transkripční mapy pro oblast 700 kb obklopující geny onemocnění polycystických onemocnění ledvin typu 1 (PKD1) a tuberózní sklerózy typu 2 (TSC2) na lidském chromozomu 16p3.3“. Výzkum genomu. 6 (6): 525–37. doi:10,1101 / gr. 6.6.525. PMID 8828041.
- Wilson KF, Fortes P, Singh USA, Ohno M, Mattaj IW, Cerione RA (únor 1999). „Komplex vázající nukleární čepici je novým cílem transdukce signálu spojeného s receptorem růstového faktoru“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (7): 4166–73. doi:10.1074 / jbc.274.7.4166. PMID 9933612.
- Mayeda A, Badolato J, Kobayashi R, Zhang MQ, Gardiner EM, Krainer AR (srpen 1999). „Čištění a charakterizace lidského RNPS1: obecný aktivátor sestřihu pre-mRNA“. Časopis EMBO. 18 (16): 4560–70. doi:10.1093 / emboj / 18.16.4560. PMC 1171530. PMID 10449421.
- Le Hir H, Izaurralde E, Maquat LE, Moore MJ (prosinec 2000). „Spliceosom ukládá více proteinů 20–24 nukleotidů před mRNA exon-exonové spoje“. Časopis EMBO. 19 (24): 6860–9. doi:10.1093 / emboj / 19.24.6860. PMC 305905. PMID 11118221.
- Harada K, Yamada A, Yang D, Itoh K, Shichijo S (září 2001). „Vazba antigenu odmítajícího nádor SART3 na sestřihový faktor pre-mRNA RNPS1: možná regulace sestřihu prostřednictvím tvorby komplexu“. International Journal of Cancer. 93 (5): 623–8. doi:10.1002 / ijc.1391. PMID 11477570. S2CID 24724555.
- Kim VN, Kataoka N, Dreyfuss G (září 2001). „Role nesmyslně zprostředkovaného faktoru rozpadu hUpf3 ve spojovacím komplexu exon-exon závislý na sestřihu“. Věda. 293 (5536): 1832–6. doi:10.1126 / science.1062829. PMID 11546873. S2CID 12018200.
- Lykke-Andersen J, MD Shu, Steitz JA (září 2001). "Sdělení polohy spojení exon-exon do sledovacího zařízení mRNA proteinem RNPS1". Věda. 293 (5536): 1836–9. doi:10.1126 / science.1062786. PMID 11546874. S2CID 389385.
- Lejeune F, Ishigaki Y, Li X, Maquat LE (červenec 2002). „Komplex exonového spojení je detekován na mRNA vázané na CBP80, ale ne na eIF4E v savčích buňkách: dynamika remodelace mRNP“. Časopis EMBO. 21 (13): 3536–45. doi:10.1093 / emboj / cdf345. PMC 126094. PMID 12093754.
- McCracken S, Longman D, Johnstone IL, Cáceres JF, Blencowe BJ (listopad 2003). „Evolučně konzervovaná role SRm160 při zpracování na 3'-konci, která funguje nezávisle na tvorbě komplexu exonového spojení“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (45): 44153–60. doi:10,1074 / jbc.M306856200. PMID 12944400.
- Li C, Lin RI, Lai MC, Ouyang P, Tarn WY (říjen 2003). „Nukleární Pnn / DRS protein se váže na sestříhané mRNP a podílí se na zpracování a exportu mRNA prostřednictvím interakce s RNPS1“. Molekulární a buněčná biologie. 23 (20): 7363–76. doi:10.1128 / MCB.23.20.7363-7376.2003. PMC 230327. PMID 14517304.
- Kataoka N, Dreyfuss G (únor 2004). „Jednoduchý cely-buněčný lyzátový systém pro in vitro sestřih odhaluje postupné sestavování komplexu spojení exon-exon“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (8): 7009–13. doi:10,1074 / jbc.M307692200. PMID 14625303.
- Sakashita E, Tatsumi S, Werner D, Endo H, Mayeda A (únor 2004). „Lidský RNPS1 a související faktory: univerzální alternativní regulátor sestřihu pre-mRNA in vivo“. Molekulární a buněčná biologie. 24 (3): 1174–87. doi:10.1128 / MCB.24.3.1174-1187.2004. PMC 321435. PMID 14729963.
- Nott A, Le Hir H, Moore MJ (leden 2004). „Spojování zvyšuje translaci v savčích buňkách: další funkce komplexu exonového spojení“. Geny a vývoj. 18 (2): 210–22. doi:10.1101 / gad.1163204. PMC 324426. PMID 14752011.
- Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (srpen 2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
- Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (srpen 2004) . "Proteomická, funkční a doménová analýza in vivo 14-3-3 vazebných proteinů zapojených do cytoskeletální regulace a buněčné organizace". Aktuální biologie. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660. S2CID 2371325.
externí odkazy
- Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q15287 (Protein vázající RNA s doménou bohatou na serin 1) na PDBe-KB.
Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |