SRRM2 - SRRM2

SRRM2
Identifikátory
Aliasy	SRRM2, 300-KD, CWF21, Cwc21, SRL300, SRm300, HSPC075, serin / arginin repetitivní matice 2
Externí ID	OMIM: 606032 HomoloGene: 130678 Genové karty: SRRM2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 16 (lidský)
Konec	2,772,538 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba domény C2H2 na zinkový prst; • vazba N-konce proteinu; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• Cajal tělo; • jaderná skvrna; • katalytický krok 2 spliceosom; • spliceosomální komplex; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • Spliceosom katalytického kroku 2 typu U2; • Prekatalytický spliceosom typu U2;
Biologický proces	• Zpracování mRNA; • Sestřih RNA; • Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	23524
	n / a
	ENSG00000167978
	n / a
	Q9UQ35
	n / a
	NM_016333
	n / a
	NP_057417
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

Serin / arginin repetitivní matrix protein 2 je protein že u lidí je kódován SRRM2 gen.^[3]^[4]^[5]

Interakce

SRRM2 bylo prokázáno komunikovat s Pinin.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000167978 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Blencowe BJ, Baurén G, Eldridge AG, Issner R, Nickerson JA, Rosonina E, Sharp PA (únor 2000). „Spojovací podjednotky SRm160 / 300 spojující“. RNA. 6 (1): 111–20. doi:10.1017 / S1355838200991982. PMC 1369899. PMID 10668804.
^ Sawada Y, Miura Y, Umeki K, Tamaoki T, Fujinaga K, Ohtaki S (září 2000). "Klonování a charakterizace nového proteinu SRL300 vázajícího RNA s doménami RS". Biochim. Biophys. Acta. 1492 (1): 191–5. doi:10.1016 / s0167-4781 (00) 00065-8. PMID 11004489.
^ "Entrez Gene: SRRM2 serin / arginin repetitive matrix 2".
^ Zimowska G, Shi J, Munguba G, Jackson MR, Alpatov R, Simmons MN, Shi Y, Sugrue SP (listopad 2003). „Pinin / DRS / memA interaguje s SRp75, SRm300 a SRrp130 v epitelových buňkách rohovky“. Investovat. Oftalmol. Vis. Sci. 44 (11): 4715–23. doi:10.1167 / iovs.03-0240. PMID 14578391.

Další čtení

Nagase T, Ishikawa K, Nakajima D, Ohira M, Seki N, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (1997). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. VII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro“. DNA Res. 4 (2): 141–50. doi:10.1093 / dnares / 4.2.141. PMID 9205841.
Blencowe BJ, Issner R, Nickerson JA, Sharp PA (1998). „Koaktivátor sestřihu pre-mRNA“. Genes Dev. 12 (7): 996–1009. doi:10,1101 / gad 12. 7. 996. PMC 316672. PMID 9531537.
McGarvey T, Rosonina E, McCracken S, Li Q, Arnaout R, Mientjes E, Nickerson JA, Awrey D, Greenblatt J, Grosveld G, Blencowe BJ (2000). „Akutní protein spojený s akutní myeloidní leukémií, DEK, tvoří interakci závislou na sestřihu s komplexy exon-produkt“. J. Cell Biol. 150 (2): 309–20. doi:10.1083 / jcb.150.2.309. PMC 2180225. PMID 10908574.
Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Moore MJ (2002). „Čištění a charakterizace nativních spliceosomů vhodných pro trojrozměrnou strukturní analýzu“. RNA. 8 (4): 426–39. doi:10.1017 / S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638.
Zimowska G, Shi J, Munguba G, Jackson MR, Alpatov R, Simmons MN, Shi Y, Sugrue SP (2003). „Pinin / DRS / memA interaguje s SRp75, SRm300 a SRrp130 v epitelových buňkách rohovky“. Investovat. Oftalmol. Vis. Sci. 44 (11): 4715–23. doi:10.1167 / iovs.03-0240. PMID 14578391.
Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (2004). „Robustní fosfoproteomické profilování míst fosforylace tyrosinu z lidských T buněk pomocí imobilizované kovové afinitní chromatografie a tandemové hmotnostní spektrometrie“. Anální. Chem. 76 (10): 2763–72. doi:10.1021 / ac035352d. PMID 15144186.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (2004). "Proteomická, funkční a doménová analýza in vivo 14-3-3 vazebných proteinů zapojených do cytoskeletální regulace a buněčné organizace". Curr. Biol. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660. S2CID 2371325.
Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA, Schwartz D, Gygi SP (2004). „Fosfoproteomická analýza vyvíjejícího se myšího mozku“. Mol. Buňka. Proteomika. 3 (11): 1093–101. doi:10,1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID 15345747.
Benzinger A, Muster N, Koch HB, Yates JR, Hermeking H (2005). „Cílená proteomická analýza 14-3-3 sigma, efektoru p53 běžně umlčeného při rakovině“. Mol. Buňka. Proteomika. 4 (6): 785–95. doi:10,1074 / mcp.M500021-MCP200. PMID 15778465.
Kim JE, Tannenbaum SR, White FM (2005). "Globální fosfoproteom buněk HT-29 humánního adenokarcinomu tlustého střeva". J. Proteome Res. 4 (4): 1339–46. doi:10.1021 / pr050048h. PMID 16083285.
Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, Nigg EA, Körner R (2006). „Fosfoproteomová analýza lidského mitotického vřetena“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 103 (14): 5391–6. doi:10.1073 / pnas.0507066103. PMC 1459365. PMID 16565220.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (2006). „Přístup založený na pravděpodobnosti pro vysoce výkonnou analýzu fosforylace proteinů a lokalizaci místa“. Nat. Biotechnol. 24 (10): 1285–92. doi:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 16 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000167978 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10668804-3] Blencowe BJ, Baurén G, Eldridge AG, Issner R, Nickerson JA, Rosonina E, Sharp PA (únor 2000). „Spojovací podjednotky SRm160 / 300 spojující“. RNA. 6 (1): 111–20. doi:10.1017 / S1355838200991982. PMC 1369899. PMID 10668804.

[pmid11004489-4] Sawada Y, Miura Y, Umeki K, Tamaoki T, Fujinaga K, Ohtaki S (září 2000). "Klonování a charakterizace nového proteinu SRL300 vázajícího RNA s doménami RS". Biochim. Biophys. Acta. 1492 (1): 191–5. doi:10.1016 / s0167-4781 (00) 00065-8. PMID 11004489.

[entrez-5] "Entrez Gene: SRRM2 serin / arginin repetitive matrix 2".

[pmid14578391-6] Zimowska G, Shi J, Munguba G, Jackson MR, Alpatov R, Simmons MN, Shi Y, Sugrue SP (listopad 2003). „Pinin / DRS / memA interaguje s SRp75, SRm300 a SRrp130 v epitelových buňkách rohovky“. Investovat. Oftalmol. Vis. Sci. 44 (11): 4715–23. doi:10.1167 / iovs.03-0240. PMID 14578391.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]