PLXNA4A - PLXNA4A - Wikipedia

PLXNA4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4E74
Identifikátory
Aliasy	PLXNA4, FAYV2820, PLEXA4, PLXNA4A, PLXNA4B, PRO34003, plexin A4
Externí ID	OMIM: 604280 MGI: 2179061 HomoloGene: 77587 Genové karty: PLXNA4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	132,648,688 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	32,588,192 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita receptoru semaforinu;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána; • buněčná membrána; • komplex semaforinového receptoru; • integrální součást plazmatické membrány;
Biologický proces	• morfogeneze glossofaryngeálního nervu; • morfogeneze projekce neuronů; • regulace prodloužení axonu při vedení axonu; • morfogeneze hlavových nervů; • vývoj sympatického nervového systému; • morfogeneze nervu vagus; • morfogeneze trigeminálního nervu; • vývoj nervového systému; • morfogeneze přední komisury; • vývoj postganglionových parasympatických vláken; • pobočkový neuron navádění axonů; • regulace negativní chemotaxe; • strukturální organizace lícního nervu; • vedení motorických neuronů axonem; • strukturální organizace trigeminálního nervu; • semaforin-plexinová signální dráha; • chemorepulze pobočkového axonu; • signální transdukce; • morfogeneze lícního nervu; • axonové vedení; • semaforin-plexinová signální dráha zapojená do vedení axonů; • negativní regulace buněčné adheze; • regulace tvaru buňky; • regulace buněčné migrace; • GO: 0043087, GO: 0032313, GO: 0032319, GO: 0032314, GO: 0043088 regulace aktivity GTPázy; • pozitivní regulace axonogeneze;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	91584
	243743
	ENSG00000221866
	ENSMUSG00000029765
	Q9HCM2
	Q80UG2
	NM_001105543; NM_020911; NM_181775
	NM_175750
	NP_001099013; NP_065962; NP_861440
	NP_786926
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Plexin-A4 je protein že u lidí je kódován PLXNA4 gen.^[5]

Funkce

Plexin A4 se váže na neuropilin 1 (Nrp1) a neuropilin 2 (Nrp2 ) a přenáší signály z Sema3A, Sema6A a Sema6B.^[6] Tyto Nrp-plexin a semaforin komplexy iniciují kaskády, které regulují různé procesy jako např prořezávání axonů a odpuzování, dendritická přitažlivost a větvení, regulace buněčné migrace, vaskulární remodelace a růstový kužel kolaps.^[7]^[8] Byla pozorována upregulace i downregulace plexinu A4 po nervovém poškození, což naznačuje dynamickou roli Sema3A a plexin A4 v nervové údržbě a regeneraci.^[7]^[9] Dodatečně, Sema3A a proto jeho receptor, plexin A4, byl zahrnut jako možná složka rychle unavitelné svalové vlákno denervace v ALS.^[10]

Struktura

Plexin A4 má ~ 1890 aminokyseliny které zahrnují pravděpodobnou signální sekvenci, transmembránová doména a 12 extracelulárních N-vázaná glykosylace stránky. Obsahuje také domény shodné s jinou třídou A. plexiny včetně domény Sema, tři "Se setkal související sekvence "/ cysteinové klastry, tři extracelulární glycin -prolin repetice, intracelulární SP domény a domnělá intracelulární tyrosinkináza fosforylace stránky.^[11]

Distribuce tkání

U dospělé krysy centrální nervový systém (CNS), plexin A4 byl přítomen v neuronech a vláknech v celém mozku a míchě, včetně neokortex, hipokampus, laterální hypotalamus, červené jádro, obličejové jádro a mezencefalické trigeminální jádro. Vlákna exprimovala plexin A4 v boční přepážka, nucleus accumbens, několik thalamová jádra, substantia nigra pars reticulata, zona incerta, pontinní retikulární formace, stejně jako v několika jádra lebečních nervů.^[12] Plexin A4 byl nalezen v hřbetní a ve větší míře ventrální rohy míchy. Oba motorické neurony a interneurony ve ventrálním rohu exprimujte plexin A4. Motorové axony vystupující z ventrální kořeny a vzestupné a sestupné bílá hmota plochy exprimují plexin A4. v hřbetní kořenová ganglia, Plexin A4 je vyjádřen v těla neuronových buněk stejně jako centrální a periferní procesy těchto buněk.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000221866 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029765 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Tamagnone L, Artigiani S, Chen H, He Z, Ming GI, Song H, Chedotal A, Winberg ML, Goodman CS, Poo M, Tessier-Lavigne M, Comoglio PM (říjen 1999). „Plexiny jsou velkou rodinou receptorů pro transmembránové, vylučované a GPI ukotvené semaforiny u obratlovců“. Buňka. 99 (1): 71–80. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80063-X. PMID 10520995. S2CID 17386412.
^ Suto F, Ito K, Uemura M, Shimizu M, Shinkawa Y, Sanbo M, Shinoda T, Tsuboi M, Takashima S, Yagi T, Fujisawa H (duben 2005). „Plexin-a4 zprostředkovává axon-odpudivé aktivity vylučovaných i transmembránových semaforinů a hraje roli ve vedení nervových vláken“. J. Neurosci. 25 (14): 3628–37. doi:10.1523 / JNEUROSCI.4480-04.2005. PMC 6725384. PMID 15814794.
^ ^A ^b ^C Gutekunst CA, Stewart EN, Franz CK, English AW, Gross RE (květen 2012). „Distribuce plexinA4 v míše dospělých a gangliích dorzálních kořenů“. J. Chem. Neuroanat. 44 (1): 1–13. doi:10.1016 / j.jchemneu.2012.03.002. PMC 3367504. PMID 22465808.
^ Bussolino F, Valdembri D, Caccavari F, Serini G (2006). "Semafora vaskulární morfogeneze". Endotel. 13 (2): 81–91. doi:10.1080/10623320600698003. PMID 16728327.
^ Spinelli ED, McPhail LT, Oschipok LW, Teh J, Tetzlaff W (únor 2007). "Exprese plexinu třídy A v axotomizovaném rubrospinálním a obličejovém motoneuronu". Neurovědy. 144 (4): 1266–77. doi:10.1016 / j.neuroscience.2006.10.057. PMID 17197097. S2CID 30980461.
^ De Winter F, Vo T, Stam FJ, Wisman LA, Bär PR, Niclou SP, van Muiswinkel FL, Verhaagen J (2006). „Exprese chemorepellentu Semaphorin 3A je selektivně indukována v terminálních Schwannových buňkách podskupiny neuromuskulárních synapsí, které vykazují omezenou anatomickou plasticitu a zvýšenou zranitelnost při onemocnění motorických neuronů.“ Mol. Buňka. Neurosci. 32 (1–2): 102–17. doi:10.1016 / j.mcn.2006.03.002. PMID 16677822. S2CID 466902.
^ Suto F, Murakami Y, Nakamura F, Goshima Y, Fujisawa H (březen 2003). "Identifikace a charakterizace nového myšího plexinu, plexin-A4". Mech. Dev. 120 (3): 385–96. doi:10.1016 / S0925-4773 (02) 00421-5. PMID 12591607. S2CID 12411422.
^ Gutekunst CA, Stewart EN, Gross RE (2010). "Imunohistochemická distribuce plexinu A4 v centrálním nervovém systému dospělých krys". Přední Neuroanat. 4. doi:10.3389 / fnana.2010.000.000. PMC 2914526. PMID 20700382.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000221866 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029765 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10520995-5] Tamagnone L, Artigiani S, Chen H, He Z, Ming GI, Song H, Chedotal A, Winberg ML, Goodman CS, Poo M, Tessier-Lavigne M, Comoglio PM (říjen 1999). „Plexiny jsou velkou rodinou receptorů pro transmembránové, vylučované a GPI ukotvené semaforiny u obratlovců“. Buňka. 99 (1): 71–80. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80063-X. PMID 10520995. S2CID 17386412.

[Suto_2005-6] Suto F, Ito K, Uemura M, Shimizu M, Shinkawa Y, Sanbo M, Shinoda T, Tsuboi M, Takashima S, Yagi T, Fujisawa H (duben 2005). „Plexin-a4 zprostředkovává axon-odpudivé aktivity vylučovaných i transmembránových semaforinů a hraje roli ve vedení nervových vláken“. J. Neurosci. 25 (14): 3628–37. doi:10.1523 / JNEUROSCI.4480-04.2005. PMC 6725384. PMID 15814794.

[Gutekunst_2012-7] A ^b ^C Gutekunst CA, Stewart EN, Franz CK, English AW, Gross RE (květen 2012). „Distribuce plexinA4 v míše dospělých a gangliích dorzálních kořenů“. J. Chem. Neuroanat. 44 (1): 1–13. doi:10.1016 / j.jchemneu.2012.03.002. PMC 3367504. PMID 22465808.

[pmid16728327-8] Bussolino F, Valdembri D, Caccavari F, Serini G (2006). "Semafora vaskulární morfogeneze". Endotel. 13 (2): 81–91. doi:10.1080/10623320600698003. PMID 16728327.

[pmid17197097-9] Spinelli ED, McPhail LT, Oschipok LW, Teh J, Tetzlaff W (únor 2007). "Exprese plexinu třídy A v axotomizovaném rubrospinálním a obličejovém motoneuronu". Neurovědy. 144 (4): 1266–77. doi:10.1016 / j.neuroscience.2006.10.057. PMID 17197097. S2CID 30980461.

[pmid16677822-10] De Winter F, Vo T, Stam FJ, Wisman LA, Bär PR, Niclou SP, van Muiswinkel FL, Verhaagen J (2006). „Exprese chemorepellentu Semaphorin 3A je selektivně indukována v terminálních Schwannových buňkách podskupiny neuromuskulárních synapsí, které vykazují omezenou anatomickou plasticitu a zvýšenou zranitelnost při onemocnění motorických neuronů.“ Mol. Buňka. Neurosci. 32 (1–2): 102–17. doi:10.1016 / j.mcn.2006.03.002. PMID 16677822. S2CID 466902.

[pmid12591607-11] Suto F, Murakami Y, Nakamura F, Goshima Y, Fujisawa H (březen 2003). "Identifikace a charakterizace nového myšího plexinu, plexin-A4". Mech. Dev. 120 (3): 385–96. doi:10.1016 / S0925-4773 (02) 00421-5. PMID 12591607. S2CID 12411422.

[pmid20700382-12] Gutekunst CA, Stewart EN, Gross RE (2010). "Imunohistochemická distribuce plexinu A4 v centrálním nervovém systému dospělých krys". Přední Neuroanat. 4. doi:10.3389 / fnana.2010.000.000. PMC 2914526. PMID 20700382.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]