PDS5B - PDS5B

PDS5B
Struktura PDS5B (modrá), WAPL (zelená) a IP6 (PDB 5HDT) (Ouyang et al., 2016) .png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyPDS5B, APRIN, AS3, CG008, PDS5 faktor spojený s kohezinem B
Externí IDOMIM: 605333 MGI: 2140945 HomoloGene: 41001 Genové karty: PDS5B
Umístění genu (člověk)
Chromozom 13 (lidský)
Chr.Chromozom 13 (lidský)[1]
Chromozom 13 (lidský)
Genomické umístění pro PDS5B
Genomické umístění pro PDS5B
Kapela13q13.1Start32,586,452 bp[1]
Konec32,778,019 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_015032
NM_015928

NM_175310
NM_001346503

RefSeq (protein)

NP_055847

NP_001333432
NP_780519

Místo (UCSC)Chr 13: 32,59 - 32,78 MbChr 5: 150,67 - 150,81 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Sesterský chromatidový kohezní protein PDS5 homolog B (PDS5B) je protein že u lidí je kódován PDS5B gen.[5][6][7] Jedná se o regulační podjednotku Cohesin komplex, který zprostředkovává soudržnost sesterských chromatid, homologní rekombinace a DNA smyčky. Komplex jádra kohezinu je tvořen SMC3, SMC1, RAD21 a buď SA1 nebo SA2. PDS5 se přidruží k WAPL stimulovat uvolňování cohesinu z DNA, ale během replikace DNA PDS5 podporuje acetylaci SMC3 ESCO1 a ESCO2.

Modelové organismy

Modelové organismy byly použity při studiu funkce PDS5B. Podmíněný knockout myš linka, tzv Pds5btm1a (EUCOMM) Wtsi[11][12] byl vygenerován jako součást International Knockout Mouse Consortium program - vysoce výkonný projekt mutageneze pro generování a distribuci zvířecích modelů nemocí zainteresovaným vědcům - na Wellcome Trust Sanger Institute.[13][14][15]

Samci a samice prošli standardizací fenotypová obrazovka k určení účinků vypuštění.[9][16] Bylo provedeno dvacet tři testů a dva fenotypy byly hlášeny. Téměř všechny homozygotní mutant zvířata zemřela před narozením, a proto přežila až odstavení. Zbývající testy byly provedeny dne heterozygotní mutantní myši a nebyly pozorovány žádné významné abnormality.[9]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000083642 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034021 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Couch FJ, Rommens JM, Neuhausen SL, Belanger C, Dumont M, Abel K, Bell R, Berry S, Bogden R, Cannon-Albright L, Farid L, Frye C, Hattier T, Janecki T, Jiang P, Kehrer R, Leblanc JF, McArthur-Morrison J, Meney D, Miki Y, Peng Y, Samson C, Schroeder M, Snyder SC, Simard J a kol. (Únor 1997). "Generování integrované transkripční mapy oblasti BRCA2 na chromozomu 13q12-q13". Genomika. 36 (1): 86–99. doi:10.1006 / geno.1996.0428. PMID  8812419.
  6. ^ Geck P, Szelei J, Jimenez J, Sonnenschein C, Soto AM (květen 1999). „Časná genová exprese během androgenem indukované inhibice proliferace buněk rakoviny prostaty: nový kandidát na supresor na chromozomu 13 v lokusu BRCA2-Rb1“. J Steroid Biochem Mol Biol. 68 (1–2): 41–50. doi:10.1016 / S0960-0760 (98) 00165-4. PMID  10215036.
  7. ^ "Entrez Gene: APRIN inhibitor proliferace vyvolaný androgeny".
  8. ^ "Citrobacter data infekce pro Pds5b ". Wellcome Trust Sanger Institute.
  9. ^ A b C Gerdin AK (2010). „Genetický program Sanger Mouse: Vysoce výkonná charakterizace knockoutovaných myší“. Acta Ophthalmologica. 88 (S248). doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x.
  10. ^ Portál myších zdrojů Wellcome Trust Sanger Institute.
  11. ^ „International Knockout Mouse Consortium“.
  12. ^ "Myší genomová informatika".
  13. ^ Skarnes, W. C .; Rosen, B .; West, A. P .; Koutsourakis, M .; Bushell, W .; Iyer, V .; Mujica, A.O .; Thomas, M .; Harrow, J .; Cox, T .; Jackson, D .; Severin, J .; Biggs, P .; Fu, J .; Nefedov, M .; De Jong, P. J .; Stewart, A. F .; Bradley, A. (2011). „Podmíněný knockoutový zdroj pro celogenomové studium funkce myšího genu“. Příroda. 474 (7351): 337–342. doi:10.1038 / příroda10163. PMC  3572410. PMID  21677750.
  14. ^ Dolgin E (červen 2011). „Knihovna myší je vyřazena“. Příroda. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  15. ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (leden 2007). "Myš ze všech důvodů". Buňka. 128 (1): 9–13. doi:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247.
  16. ^ van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (2011). „Sada nástrojů pro genetiku myší: odhalení funkce a mechanismu“. Genome Biol. 12 (6): 224. doi:10.1186 / gb-2011-12-6-224. PMC  3218837. PMID  21722353.