WAPAL - WAPAL - Wikipedia

WAPL
Krystalová struktura lidského WAPL (PDB 4K6J) .png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyWAPL„FOE, KIAA0261, WAPAL, WAPL faktor uvolňování kohezinu
Externí IDOMIM: 610754 MGI: 2675859 HomoloGene: 41002 Genové karty: WAPL
Umístění genu (člověk)
Chromozom 10 (lidský)
Chr.Chromozom 10 (lidský)[1]
Chromozom 10 (lidský)
Genomické umístění pro WAPL
Genomické umístění pro WAPL
Kapela10q23.2Start86,435,256 bp[1]
Konec86,521,792 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE WAPAL 212267 na fs.png

PBB GE WAPAL 212264 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_015045
NM_001318328

NM_001004436
NM_001301330

RefSeq (protein)

NP_001305257
NP_055860

NP_001004436
NP_001288259

Místo (UCSC)Chr 10: 86,44 - 86,52 MbChr 14: 34,67 - 34,75 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Křídlový homolog podobný proteinu (WAPL) je protein že u lidí je kódován WAPAL gen.[5][6][7] WAPL je klíčovým regulátorem Cohesin komplex, který zprostředkovává soudržnost sesterských chromatid, homologní rekombinace a DNA smyčky. Cohesin je tvořen SMC3, SMC1, RAD21 a buď SA1 nebo SA2. [8] Cohesin má prstencové uspořádání a předpokládá se, že se asociuje s chromozomem jeho zachycením, ať už jako smyčky DNA, jednoho řetězce nebo dvojice sesterských chromozomů. WAPL tvoří komplex s PDS5A nebo PDS5B a uvolňuje kohezin z DNA otevřením rozhraní mezi SMC3 a RAD21.

Mezifáze

Struktura PDS5B (modrá), WAPL (zelená) a IP6 (PDB 5HDT) (Ouyang et al., 2016)

Nakládání koesinu začíná v telofáze a je zprostředkováno NIPBL a jeho závazný partner MAU2. v G1 „WAPL tvoří komplex s PDS5 a odstraňuje kohezin z DNA, ale je znovu zaveden pomocí NIPBL-MAU2. Rovnováha mezi naložením a uvolněním poskytuje kohezinu dobu zdržení DNA 20 minut. Během replikace DNA je frakce kohezinu acetylována a váže se na Sororin takže je odolný vůči WAPL a schopný držet sesterské chromatidy pohromadě. To je zásadní pro udržení soudržnosti sesterských chromatid, protože poté jsou sesterské chromatidy odděleny, soudržnost nelze obnovit.

Profázová cesta

Když buňka vstoupí do mitózy, je sororin fosforylován, což způsobí jeho disociaci od kohezinu, což znamená, že WAPL může odstranit kohezin z DNA. Komplex SGOL1 a PP2A defosforyluje kohezin v centromeru a chrání jej před uvolněním zprostředkovaným WAPL. Soudržnost sesterských chromatid se proto udržuje na centromerech, kde je nutná pro mitózu, ale ztrácí se na pažích. Toto odstranění kohezinu je známé jako Prophase Pathway a vede k sesterským chromatidám ve tvaru X pozorovaným v chromozomových spready.

Mechanismus

WAPL uvolňuje cohesin z DNA otevřením rozhraní SMC3-RAD21, čímž umožňuje DNA projít ven z kruhu.[9] Otevření tohoto rozhraní je regulováno vazbou ATP podjednotkami SMC. To způsobí, že hlavové domény ATPázy dimerizují a deformují stočenou cívku SMC3, čímž narušují vazbu RAD21 na stočenou cívku.[10] Není známo, jak WAPL reguluje proces vazby ATP.

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000062650 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000041408 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Nagase T, Seki N, Ishikawa K, Ohira M, Kawarabayasi Y, Ohara O a kol. (Říjen 1996). "Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. VI. Kódující sekvence 80 nových genů (KIAA0201-KIAA0280) odvozené analýzou klonů cDNA z buněčné linie KG-1 a mozku". Výzkum DNA. 3 (5): 321–9, 341–54. doi:10.1093 / dnares / 3.5.321. PMID  9039502.
  6. ^ Gandhi R, Gillespie PJ, Hirano T (prosinec 2006). „Human Wapl je protein vázající kohezin, který podporuje rozlišení sesterských chromatidů v mitotické profáze“. Aktuální biologie. 16 (24): 2406–17. doi:10.1016 / j.cub.2006.10.061. PMC  1850625. PMID  17112726.
  7. ^ „Entrez Gene: WAPAL křídla od sebe podobného homologu (Drosophila)“.
  8. ^ Yatskevich S, Rhodes J, Nasmyth K (prosinec 2019). „Organizace chromozomální DNA komplexy SMC“. Výroční přehled genetiky. 53: 445–482. doi:10.1146 / annurev-genet-112618-043633. PMID  31577909.
  9. ^ Beckouët F, Srinivasan M, Roig MB, Chan KL, Scheinost JC, Batty P a kol. (Únor 2016). „Uvolnění aktivity odpojí Cohesinovo rozhraní Smc3 / Scc1 v procesu blokovaném acetylací“. Molekulární buňka. 61 (4): 563–574. doi:10.1016 / j.molcel.2016.01.026. PMC  4769318. PMID  26895425.
  10. ^ Muir KW, Li Y, Weis F, Panne D (březen 2020). „Struktura kohezinové ATPázy objasňuje mechanismus otevírání kruhu SMC-kleisin“. Přírodní strukturní a molekulární biologie. 27 (3): 233–239. doi:10.1038 / s41594-020-0379-7. PMC  7100847. PMID  32066964.