PDCD10 - PDCD10
Programovaný protein buněčné smrti 10 je protein že u lidí je kódován PDCD10 gen.[5][6]
Funkce
Tento gen kóduje protein, původně identifikovaný v premyeloidní buněčné linii, s podobností s proteiny, které se účastní apoptózy. Pro tento gen byly identifikovány tři alternativní transkripty kódující stejný protein, které se liší pouze 5 'UTR.[6]
Gen
Ztráta funkčních mutací v PDCD10 vést k nástupu onemocnění mozkových kavernózních malformací (CCM).[5] Proto se tento gen také nazývá CCM3. Mozkové kavernózní malformace (CCM) jsou vaskulární malformace v mozku a míchě vyrobené z rozšířených kapilárních cév.
Interakce
CCM3 kóduje protein nazvaný Programmed Cell Death 10 (PDCD10). Funkce tohoto proteinu se začala chápat teprve nedávno. PDCD10 má role ve vaskulárním vývoji a VEGF signalizaci1,[7] apoptóza[8] a funguje jako součást většího signálního komplexu, který zahrnuje kinázu germinálního centra III.[9][10] Konkrétně se ukázalo, že PDCD10 komunikovat s RP6-213H19.1,[11] STK25,[11][12] STRN,[11] STRN3,[11] MOBKL3,[11] CTTNBP2NL,[11] STK24[11][12][13] a FAM40A.[11]
Modelové organismy
| Charakteristický | Fenotyp |
|---|---|
| Homozygot životaschopnost | Abnormální |
| Recesivní smrtící studie | Abnormální |
| Plodnost | Normální |
| Tělesná hmotnost | Normální |
| Úzkost | Normální |
| Neurologické hodnocení | Normální |
| Síla úchopu | Normální |
| Horký talíř | Normální |
| Dysmorfologie | Normální |
| Nepřímá kalorimetrie | Normální |
| Zkouška tolerance glukózy | Normální |
| Sluchová odezva mozkového kmene | Normální |
| DEXA | Normální |
| Radiografie | Normální |
| Tělesná teplota | Normální |
| Morfologie očí | Normální |
| Klinická chemie | Normální |
| Hematologie | Normální |
| Lymfocyty periferní krve | Normální |
| Mikrojaderný test | Normální |
| Váha srdce | Normální |
| Histopatologie kůže | Normální |
| Oční histopatologie | Normální |
| Salmonella infekce | Normální[14] |
| Citrobacter infekce | Normální[15] |
| Všechny testy a analýzy od[16][17] |
Modelové organismy byly použity při studiu funkce PDCD10. Podmíněný knockout myš linka, tzv Pdcd10tm1a (KOMP) Wtsi[18][19] byl vygenerován jako součást International Knockout Mouse Consortium program - vysoce výkonný projekt mutageneze pro generování a distribuci zvířecích modelů nemocí zainteresovaným vědcům.[20][21][22]
Samci a samice prošli standardizací fenotypová obrazovka k určení účinků vypuštění.[16][23] Bylo provedeno dvacet pět testů mutant myši a byly pozorovány dvě významné abnormality.[16] Ne homozygotní mutant embrya byla identifikována během těhotenství, a proto žádná nepřežila až do odstavení. Zbývající testy byly provedeny dne heterozygotní mutantní dospělé myši; u těchto zvířat nebyly pozorovány žádné další významné abnormality.[16]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000114209 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027835 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b Bergametti F, Denier C, Labauge P, Arnoult M, Boetto S, Clanet M, Coubes P, Echenne B, Ibrahim R, Irthum B, Jacquet G, Lonjon M, Moreau JJ, Neau JP, Parker F, Tremoulet M, Tournier- Lasserve E (leden 2005). „Mutace v rámci naprogramovaného genu buněčné smrti 10 způsobují malformace mozkové kavernózy“. American Journal of Human Genetics. 76 (1): 42–51. doi:10.1086/426952. PMC 1196432. PMID 15543491.
- ^ A b "Entrez Gene: PDCD10 programovaná buněčná smrt 10".
- ^ He Y, Zhang H, Yu L, Gunel M, Boggon TJ, Chen H, Min W (2010). „Stabilizace signalizace VEGFR2 cerebrální kavernózní malformací 3 je rozhodující pro vaskulární vývoj“. Vědecká signalizace. 3 (116): ra26. doi:10.1126 / scisignal.2000722. PMC 3052863. PMID 20371769.
- ^ Guclu B, Ozturk AK, Pricola KL, Bilguvar K, Shin D, O'Roak BJ, Gunel M (listopad 2005). „Mutace v genu souvisejícím s apoptózou, PDCD10, způsobují malformaci mozkové kavernózy 3“. Neurochirurgie. 57 (5): 1008–13. doi:10.1227 / 01.NEU.0000180811.56157.E1. PMID 16284570. S2CID 10303325.
- ^ Fidalgo M, Fraile M, Pires A, Force T, Pombo C, Zalvide J (duben 2010). „CCM3 / PDCD10 stabilizuje proteiny GCKIII pro podporu Golgiho shromáždění a orientace buněk“. Journal of Cell Science. 123 (Pt 8): 1274–84. doi:10.1242 / jcs.061341. PMID 20332113.
- ^ Ceccarelli DF, Laister RC, Mulligan VK, Kean MJ, Goudreault M, Scott IC, Derry WB, Chakrabartty A, Gingras AC, Sicheri F (červenec 2011). „CCM3 / PDCD10 heterodimerizuje s proteiny kinázy germinálního centra III (GCKIII) pomocí mechanismu analogického s CCM3 homodimerizací“. The Journal of Biological Chemistry. 286 (28): 25056–64. doi:10.1074 / jbc.M110.213777. PMC 3137079. PMID 21561863.
- ^ A b C d E F G h Goudreault M, D'Ambrosio LM, Kean MJ, Mullin MJ, Larsen BG, Sanchez A, Chaudhry S, Chen GI, Sicheri F, Nesvizhskii AI, Aebersold R, Raught B, Gingras AC (leden 2009). „Síť s vysokou hustotou interakce fosfatázy PP2A identifikuje nový komplex fosfatázy a kinázy interagující se striatinem spojený s proteinem cerebrální kavernózní malformace 3 (CCM3)“. Molekulární a buněčná proteomika. 8 (1): 157–71. doi:10,1074 / mcp.M800266-MCP200. PMC 2621004. PMID 18782753.
- ^ A b Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- ^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
- ^ "Salmonella data infekce pro Pdcd10 ". Wellcome Trust Sanger Institute.
- ^ "Citrobacter data infekce pro Pdcd10 ". Wellcome Trust Sanger Institute.
- ^ A b C d Gerdin AK (2010). „Genetický program Sanger Mouse: Vysoce výkonná charakterizace knockoutovaných myší“. Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
- ^ Portál myších zdrojů Wellcome Trust Sanger Institute.
- ^ „International Knockout Mouse Consortium“.
- ^ "Myší genomová informatika".
- ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A (červen 2011). „Podmíněný knockoutový zdroj pro celogenomové studium funkce myšího genu“. Příroda. 474 (7351): 337–42. doi:10.1038 / příroda10163. PMC 3572410. PMID 21677750.
- ^ Dolgin E (červen 2011). „Knihovna myší je vyřazena“. Příroda. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
- ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (leden 2007). "Myš ze všech důvodů". Buňka. 128 (1): 9–13. doi:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
- ^ van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (2011). „Sada nástrojů pro genetiku myší: odhalení funkce a mechanismu“. Genome Biology. 12 (6): 224. doi:10.1186 / gb-2011-12-6-224. PMC 3218837. PMID 21722353.
Další čtení
- Craig HD, Günel M, Cepeda O, Johnson EW, Ptacek L, Steinberg GK, Ogilvy CS, Berg MJ, Crawford SC, Scott RM, Steichen-Gersdorf E, Sabroe R, Kennedy CT, Mettler G, Beis MJ, Fryer A, Awad IA, Lifton RP (listopad 1998). „Multilokusová vazba identifikuje dva nové lokusy pro mendelovskou formu cévní mozkové příhody, cerebrální kavernózní malformace, v 7p15-13 a 3q25.2-27“. Lidská molekulární genetika. 7 (12): 1851–8. doi:10,1093 / hmg / 7.12.1851. PMID 9811928.
- Guclu B, Ozturk AK, Pricola KL, Seker A, Ozek M, Gunel M (listopad 2005). „Mozkové žilní malformace mají odlišný genetický původ od malformací mozkových kavernóz“. Mrtvice: Žurnál mozkové cirkulace. 36 (11): 2479–80. doi:10.1161 / 01.STR.0000183616.99139.d3. PMID 16239636.
- Guclu B, Ozturk AK, Pricola KL, Bilguvar K, Shin D, O'Roak BJ, Gunel M (listopad 2005). „Mutace v genu souvisejícím s apoptózou, PDCD10, způsobují malformaci mozkové kavernózy 3“. Neurochirurgie. 57 (5): 1008–13. doi:10.1227 / 01.NEU.0000180811.56157.E1. PMID 16284570. S2CID 10303325.
- Liquori CL, Berg MJ, Squitieri F, Ottenbacher M, Sorlie M, Leedom TP, Cannella M, Maglione V, Ptacek L, Johnson EW, Marchuk DA (leden 2006). "Nízká frekvence mutací PDCD10 v panelu probandů CCM3: potenciál pro čtvrtý CCM lokus". Lidská mutace. 27 (1): 118. doi:10,1002 / humu. 9389. PMID 16329096. S2CID 30609244.
- Verlaan DJ, Roussel J, Laurent SB, Elger CE, Siegel AM, Rouleau GA (prosinec 2005). „CCM3 mutace jsou u cerebrálních kavernózních malformací neobvyklé“. Neurologie. 65 (12): 1982–3. doi:10.1212 / 01.wnl.0000188903,75144,49. PMID 16380626. S2CID 190798.
- Tsang HT, Connell JW, Brown SE, Thompson A, Reid E, Sanderson CM (září 2006). „Systematická analýza interakcí humánního proteinu CHMP: další proteiny obsahující doménu MIT se vážou na více složek lidského komplexu ESCRT III.“ Genomika. 88 (3): 333–46. doi:10.1016 / j.ygeno.2006.04.003. PMID 16730941.
- Labauge P, Krivosic V, Denier C, Tournier-Lasserve E, Gaudric A (červen 2006). „Frekvence kavernomů sítnice u 60 pacientů s familiárními cerebrálními kavernómy: klinická a genetická studie“. Archiv oftalmologie. 124 (6): 885–6. doi:10.1001 / archopht.124.6.885. PMID 16769843.
- Chen PY, Chang WS, Chou RH, Lai YK, Lin SC, Chi CY, Wu CW (2007). „Dva nehomologické geny související s onemocněním mozku, SERPINI1 a PDCD10, jsou úzce spojeny asymetrickým obousměrným promotorem evolučně konzervativním způsobem“. BMC Molekulární biologie. 8: 2. doi:10.1186/1471-2199-8-2. PMC 1796892. PMID 17212813.
- Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
- Ma X, Zhao H, Shan J, Long F, Chen Y, Chen Y, Zhang Y, Han X, Ma D (červen 2007). „PDCD10 interaguje s kinázou MST4 související se Ste20 a podporuje růst a transformaci buněk modulací dráhy ERK“. Molekulární biologie buňky. 18 (6): 1965–78. doi:10,1091 / mbc.E06-07-0608. PMC 1877091. PMID 17360971.