STRN3 - STRN3

STRN3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4N6J
Identifikátory
Aliasy	STRN3, SG2NA, PPP2R6B, striatin 3, S / G2NA
Externí ID	OMIM: 614766 MGI: 2151064 HomoloGene: 82078 Genové karty: STRN3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 14 (lidský)
Konec	31,026,401 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 12 (myš)
Konec	51,691,897 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • vazba proteinové fosfatázy 2A; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • kalmodulinová vazba; • vazba opakované domény pásovce; • Vazba Rho GTPázy; • GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • tělo neuronových buněk; • buněčná membrána; • Golgiho aparát; • dendrit; • komplex proteinové fosfatázy typu 2A; • membrána; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • makromolekulární komplex; • Komplex FAR / SIN / STRIPAK;
Biologický proces	• odpověď na estradiol; • negativní regulace signalizační dráhy intracelulárního estrogenového receptoru; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • negativní regulace transkripce, DNA-šablony; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	29966
	94186
	ENSG00000196792
	ENSMUSG00000020954
	Q13033
	Q9ERG2
	NM_001083893; NM_014574
	NM_001172098; NM_052973; NM_001364437
	NP_001077362; NP_055389
	NP_001165569; NP_443205; NP_001351366
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Striatin-3 je protein že u lidí je kódován STRN3 gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

STRN3 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000196792 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020954 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Muro Y, Chan EK, Landberg G, Tan EM (březen 1995). „Jaderný autoantigen buněčného cyklu obsahující motivy WD-40 exprimovaný hlavně v buňkách fáze S a G2“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 207 (3): 1029–37. doi:10.1006 / bbrc.1995.1288. PMID 7864889.
^ Moreno CS, Park S, Nelson K, Ashby D, Hubalek F, Lane WS, Pallas DC (březen 2000). „Opakující se proteiny WD40 striatin a nukleární autoantigen S / G (2) jsou členy nové rodiny proteinů vázajících kalmodulin, které se asociují s proteinovou fosfatázou 2A“. J. Biol. Chem. 275 (8): 5257–63. doi:10.1074 / jbc.275.8.5257. PMC 3505218. PMID 10681496.
^ „Entrez Gene: STRN3 striatin, protein vázající kalmodulin 3“.
^ ^A ^b ^C ^d ^E ^F ^G ^h ⁱ ^j Goudreault M, D'Ambrosio LM, Kean MJ, Mullin MJ, Larsen BG, Sanchez A, Chaudhry S, Chen GI, Sicheri F, Nesvizhskii AI, Aebersold R, Raught B, Gingras AC (leden 2009). „Síť s vysokou hustotou interakce fosfatázy PP2A identifikuje nový komplex fosfatázy a kinázy interagující se striatinem spojený s proteinem cerebrální kavernózní malformace 3 (CCM3)“. Mol. Buňka. Proteomika. 8 (1): 157–71. doi:10,1074 / mcp.M800266-MCP200. PMC 2621004. PMID 18782753.
^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3: 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Další čtení

Landberg G, Tan EM (1994). „Charakterizace nukleárního autoantigenu vázajícího DNA převážně spojeného s S fází a buňkami G2“. Exp. Cell Res. 212 (2): 255–61. doi:10.1006 / excr.1994.1141. PMID 7910562.
Castets F, Rakitina T, Gaillard S, Moqrich A, Mattei MG, Monneron A (2000). „Zinedin, SG2NA a striatin se váží na kalmodulin, WD opakující se proteiny převážně exprimované v mozku“. J. Biol. Chem. 275 (26): 19970–7. doi:10,1074 / jbc.M909782199. PMID 10748158.
Moreno CS, Lane WS, Pallas DC (2001). „Savčí homolog kvasinkové MOB1 je členem i domnělým substrátem komplexů striatinové rodiny a proteinové fosfatázy 2A.“. J. Biol. Chem. 276 (26): 24253–60. doi:10,1074 / jbc.M102398200. PMC 3503316. PMID 11319234.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Foster LJ, Rudich A, Talior I, Patel N, Huang X, Furtado LM, Bilan PJ, Mann M, Klip A (2006). „Na inzulínu závislé interakce proteinů s GLUT4 odhalené stabilním značením izotopů aminokyselinami v buněčné kultuře (SILAC)“. J. Proteome Res. 5 (1): 64–75. doi:10.1021 / pr0502626. PMID 16396496.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (2006). „Přístup založený na pravděpodobnosti pro vysoce výkonnou analýzu fosforylace proteinů a lokalizaci místa“. Nat. Biotechnol. 24 (10): 1285–92. doi:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 14 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000196792 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020954 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7864889-5] Muro Y, Chan EK, Landberg G, Tan EM (březen 1995). „Jaderný autoantigen buněčného cyklu obsahující motivy WD-40 exprimovaný hlavně v buňkách fáze S a G2“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 207 (3): 1029–37. doi:10.1006 / bbrc.1995.1288. PMID 7864889.

[pmid10681496-6] Moreno CS, Park S, Nelson K, Ashby D, Hubalek F, Lane WS, Pallas DC (březen 2000). „Opakující se proteiny WD40 striatin a nukleární autoantigen S / G (2) jsou členy nové rodiny proteinů vázajících kalmodulin, které se asociují s proteinovou fosfatázou 2A“. J. Biol. Chem. 275 (8): 5257–63. doi:10.1074 / jbc.275.8.5257. PMC 3505218. PMID 10681496.

[entrez-7] „Entrez Gene: STRN3 striatin, protein vázající kalmodulin 3“.

[pmid18782753-8] A ^b ^C ^d ^E ^F ^G ^h ⁱ ^j Goudreault M, D'Ambrosio LM, Kean MJ, Mullin MJ, Larsen BG, Sanchez A, Chaudhry S, Chen GI, Sicheri F, Nesvizhskii AI, Aebersold R, Raught B, Gingras AC (leden 2009). „Síť s vysokou hustotou interakce fosfatázy PP2A identifikuje nový komplex fosfatázy a kinázy interagující se striatinem spojený s proteinem cerebrální kavernózní malformace 3 (CCM3)“. Mol. Buňka. Proteomika. 8 (1): 157–71. doi:10,1074 / mcp.M800266-MCP200. PMC 2621004. PMID 18782753.

[pmid17353931-9] Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3: 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]