Regulátor biosyntézy sfingolipidů Ormdl 3 - Ormdl sphingolipid biosynthesis regulator 3

ORMDL3
Identifikátory
AliasyORMDL3Regulátor biosyntézy sfingolipidů ORMDL 3
Externí IDOMIM: 610075 MGI: 1913862 HomoloGene: 57032 Genové karty: ORMDL3
Umístění genu (člověk)
Chromozom 17 (lidský)
Chr.Chromozom 17 (lidský)[1]
Chromozom 17 (lidský)
Genomické umístění pro ORMDL3
Genomické umístění pro ORMDL3
Kapela17q21.1Start39,921,041 bp[1]
Konec39,927,601 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

94103

66612

Ensembl

ENSG00000172057

ENSMUSG00000038150

UniProt

Q8N138

Q9CPZ6

RefSeq (mRNA)

NM_139280
NM_001320801
NM_001320802
NM_001320803
NM_016471

NM_025661

RefSeq (protein)

NP_001307730
NP_001307731
NP_001307732
NP_644809

NP_079937

Místo (UCSC)Chr 17: 39,92 - 39,93 MbChr 11: 98,58 - 98,59 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Regulátor biosyntézy sfingolipidů ORMDL 3 je protein že u lidí je kódován ORMDL3 gen.[5] Tento gen je spojován s astmatem v dětství.[6] Transgenní myši které nadměrně exprimují lidské ORMDL3 mají zvýšené hladiny IgE. To souviselo se zvýšeným počtem makrofágy, neutrofily, eosinofily, CD4 + a vylepšené Th2 cytokin hladiny v plicní tkáni.[7]

Lokalizace

Myší a lidský gen ORMDL3 kóduje 153 aa. Rodina ORMDL se skládá ze tří členů (ORMDL1-3), které jsou lokalizovány v membráně endoplazmatické retikulum (ER)[8]. Lidské ORMDL1, ORMDL2 a ORMDL3 jsou lokalizovány v chromozomy 2q32, 12q13.2 a 17q21.[9]

Funkce

ORMDL3 hraje roli v sfingolipid syntéza jako negativní regulátory.[8][10] Rovněž hraje roli při regulaciCa.2+ hladiny v endoplazmatickém retikulu. ER je velmi důležitý pro generování, signalizaci, fungování a ukládáníintracelulární Ca2+. Existují kanály, které řídí výstup Ca2+ z pohotovosti do cytoplazma a také čerpadla (sarko-endoplazmatické retikulum Ca2+ ATPáza (SERCA )) které vracejí Ca2+ zpět na pohotovost.[11] Dysregulace Ca2+ má klíčovou roli v několika patologických stavech, jako je dysfunkce SERCA, astma,[12]a Alzheimerova choroba[13]

Klinický význam

Mutace v ORMDL3 jsou spojeny s zánětlivé nemoc jako Crohnova nemoc, zadejte 1 cukrovka,[14] a revmatoidní artritida.[15]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000172057 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038150 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ "Entrez Gene: ORMDL sfingolipidový regulátor biosyntézy 3".
  6. ^ Moffatt MF, Kabesch M, Liang L, Dixon AL, Strachan D, Heath S a kol. (Červenec 2007). „Genetické varianty regulující expresi ORMDL3 přispívají k riziku dětského astmatu“ (PDF). Příroda. 448 (7152): 470–3. Bibcode:2007 Natur.448..470M. doi:10.1038 / nature06014. hdl:2027.42/62682. PMID  17611496. S2CID  4373589.
  7. ^ Miller M, Rosenthal P, Beppu A, Mueller JL, Hoffman HM, Tam AB a kol. (Duben 2014). „Transgenní myši ORMDL3 mají zvýšenou remodelaci dýchacích cest a citlivost dýchacích cest charakteristickou pro astma“. Journal of Immunology. 192 (8): 3475–87. doi:10,4049 / jimmunol. 1303047. PMC  3981544. PMID  24623133.
  8. ^ A b Davis D, Kannan M, Wattenberg B (prosinec 2018). „Proteiny Orm / ORMDL: Gate Guardians a Master Regulators“. Pokroky v biologické regulaci. Sfingolipidová signalizace u chronické nemoci. 70: 3–18. doi:10.1016 / j.jbior.2018.08.002. PMC  6251742. PMID  30193828.
  9. ^ Hjelmqvist L, Tuson M, Marfany G, Herrero E, Balcells S, Gonzàlez-Duarte R (2002). „ORMDL proteiny jsou konzervativní novou rodinou membránových proteinů endoplazmatického retikula“. Genome Biology. 3 (6): RESEARCH0027. doi:10.1186 / gb-2002-3-6-research0027. PMC  116724. PMID  12093374.
  10. ^ Breslow DK, Collins SR, Bodenmiller B, Aebersold R, Simons K, Shevchenko A a kol. (Únor 2010). „Orm rodinné proteiny zprostředkovávají homeostázu sfingolipidů“. Příroda. 463 (7284): 1048–53. Bibcode:2010Natur.463.1048B. doi:10.1038 / nature08787. PMC  2877384. PMID  20182505.
  11. ^ Berridge MJ, Lipp P, Bootman MD (říjen 2000). "Všestrannost a univerzálnost signalizace vápníku". Recenze přírody. Molekulární buněčná biologie. 1 (1): 11–21. doi:10.1038/35036035. PMID  11413485. S2CID  13150466.
  12. ^ Mahn K, Hirst SJ, Ying S, Holt MR, Lavender P, Ojo OO a kol. (Červen 2009). „Snížená exprese Ca2 + ATPázy (SERCA) v sarko / endoplazmatickém retikulu přispívá k remodelaci dýchacích cest u bronchiálního astmatu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 106 (26): 10775–80. Bibcode:2009PNAS..10610775M. doi:10.1073 / pnas.0902295106. PMC  2699374. PMID  19541629.
  13. ^ Green KN, LaFerla FM (červenec 2008). "Spojení vápníku s Abetou a Alzheimerovou chorobou". Neuron. 59 (2): 190–4. doi:10.1016 / j.neuron.2008.07.013. PMID  18667147. S2CID  17020942.
  14. ^ Verlaan DJ, Berlivet S, Hunninghake GM, Madore AM, Larivière M, Moussette S a kol. (Září 2009). „Remodelace alel-specifického chromatinu v lokusu ZPBP2 / GSDMB / ORMDL3 spojená s rizikem astmatu a autoimunitního onemocnění“. American Journal of Human Genetics. 85 (3): 377–93. doi:10.1016 / j.ajhg.2009.08.007. PMC  2771592. PMID  19732864.
  15. ^ Kurreeman FA, Stahl EA, Okada Y, Liao K, Diogo D, Raychaudhuri S a kol. (Březen 2012). „Použití multietnického přístupu k identifikaci lokusů náchylnosti k revmatoidní artritidě, 1p36 a 17q12“. American Journal of Human Genetics. 90 (3): 524–32. doi:10.1016 / j.ajhg.2012.01.010. PMC  3309197. PMID  22365150.

Další čtení

  • Hirota T, Harada M, Sakashita M, Doi S, Miyatake A, Fujita K a kol. (Březen 2008). „Genetický polymorfismus regulující expresi ORM1 podobného 3 (Saccharomyces cerevisiae) je spojen s dětským atopickým astmatem v japonské populaci“. The Journal of Allergy and Clinical Immunology. 121 (3): 769–70. doi:10.1016 / j.jaci.2007.09.038. PMID  18155279.
  • Galanter J, Choudhry S, Eng C, Nazario S, Rodríguez-Santana JR, Casal J a kol. (Červen 2008). „Gen ORMDL3 je spojen s astmatem ve třech etnicky odlišných populacích“. American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine. 177 (11): 1194–200. doi:10.1164 / rccm.200711-1644OC. PMC  2408437. PMID  18310477.
  • Tavendale R, Macgregor DF, Mukhopadhyay S, Palmer CN (duben 2008). „Polymorfismus kontrolující expresi ORMDL3 je spojen s astmatem, které je současnými léky špatně kontrolováno“. The Journal of Allergy and Clinical Immunology. 121 (4): 860–3. doi:10.1016 / j.jaci.2008.01.015. PMID  18395550.
  • Sleiman PM, Annaiah K, Imielinski M, Bradfield JP, Kim CE, Frackelton EC a kol. (Prosinec 2008). „Varianty ORMDL3 spojené s náchylností k astmatu u severoameričanů evropského původu“. The Journal of Allergy and Clinical Immunology. 122 (6): 1225–7. doi:10.1016 / j.jaci.2008.06.041. PMID  18760456.