Faktor remodelace nukleosomu - Nucleosome remodeling factor - Wikipedia

Faktor remodelace nukleosomu (NURF) je ATP-závislý komplex remodelace chromatinu, který byl poprvé objeven v Drosophila melanogaster (ovocná muška), která katalyzuje nukleosom klouzání za účelem regulace gen transkripce. Obsahuje ISWI ATPáza, čímž se stává součástí rodiny ISWI remodelace chromatinu komplexy. NURF je mezi eukaryoty vysoce konzervativní a podílí se na transkripční regulaci vývojových genů.

Objev

NURF byl nejprve purifikován z modelového organismu Drosophila melanogaster Toshio Tsukiyama a Carl Wu v roce 1995.[1] Tsukiyama a Wu popsali NURF remodelace chromatinu činnost na internetu hsp70 promotér.[1] Později bylo zjištěno, že NURF reguluje transkripci tímto způsobem pro stovky genů.[2] Člověk ortolog NURF s názvem hNURF byl izolován v roce 2003.[3]

Struktura

Komplex NURF v Drosophila obsahuje čtyři podjednotky: NURF301, NURF140, NURF55 a NURF38.[4] NURF140 je ISWI ATPáza, kterou lze odlišit RUKA, SANT, a SLIDE domény (SANT-like, ale s několika vložkami).[4] Komplex NURF v Homo sapiens má tři podjednotky, BPTF, SNF2L a pRBAP46 / 48, homologní s NURF301, NURF140 a NURF55.[4] Pro NURF38 neexistuje žádný lidský homolog.[4]

Funkce

NURF interaguje s chromatinem vazbou na modifikovaný histony nebo interakci s různými transkripční faktory.[4] NURF katalyzuje nukleosomy klouzající v DNA DNA v obou směrech bez zjevných modifikací histonový oktamer sám.[5] NURF je nezbytný pro vyjádření homeotický geny.[6] ISWI ATPáza specificky rozpoznává intaktní N-koncové histonové ocasy.[7] v DrosophilaNURF interaguje s transkripčním faktorem GAGA a remodeluje chromatin na hsp70 promotér,[1] a nulové mutace v podjednotce Nurf301 zabraňují larvám metamorfóza.[2] Jiné mutanty NURF způsobují vývoj melanotických nádorů z krvinek larev.[2] U lidí se hNURF podílí na vývoji neuronů a bylo prokázáno, že zvyšuje neurit růst in vitro.[3]

Reference

  1. ^ A b C Tsukiyama, Toshio; Wu, Carl (1995). "Čištění a vlastnosti faktoru remodelace nukleosomu závislého na ATP". Buňka. 83 (6): 1011–1020. doi:10.1016/0092-8674(95)90216-3. PMID  8521501.
  2. ^ A b C Badenhorst, Paul; Xiao, Hua; Cherbas, Lucy; Kwon, So Yeon; Voas, Matt; Rebay, Ilaria; Cherbas, Peter; Wu, Carl (01.11.2005). „Faktor remodelace nukleosomu Drosophila NURF je vyžadován pro signalizaci a metamorfózu ekdysteroidů“. Geny a vývoj. 19 (21): 2540–2545. doi:10.1101 / gad.1342605. ISSN  0890-9369. PMC  1276728. PMID  16264191.
  3. ^ A b Barak, Orr; Lazzaro, Maribeth A .; Lane, William S .; Speicher, David W .; Picketts, David J .; Shiekhattar, Ramin (17.11.2003). „Izolace lidského NURF: regulátor exprese genu Engrailed“. Časopis EMBO. 22 (22): 6089–6100. doi:10.1093 / emboj / cdg582. ISSN  0261-4189. PMC  275440. PMID  14609955.
  4. ^ A b C d E Alkhatib, Suehyb G .; Landry, Joseph W. (2011-10-20). „Faktor remodelace nukleosomu“. FEBS Dopisy. 585 (20): 3197–3207. doi:10.1016 / j.febslet.2011.09.003. ISSN  1873-3468. PMC  4839296. PMID  21920360.
  5. ^ Hamiche, Ali; Sandaltzopoulos, Raphael; Gdula, David A; Wu, Carl (1999). „Klouzání histonového oktameru závislé na ATP zprostředkované komplexem NURF remodelace chromatinu“. Buňka. 97 (7): 833–842. doi:10.1016 / s0092-8674 (00) 80796-5. PMID  10399912.
  6. ^ Badenhorst, Paul; Voas, Matthew; Rebay, Ilaria; Wu, Carl (2002-12-15). "Biologické funkce komplexu NURF pro remodelaci chromatinu ISWI". Geny a vývoj. 16 (24): 3186–3198. doi:10.1101 / gad.1032202. ISSN  0890-9369. PMC  187504. PMID  12502740.
  7. ^ Vignali, Marissa; Hassan, Ahmed H .; Neely, Kristen E .; Workman, Jerry L. (2000-03-15). „Komplexy remodelační na chromatinu závislé na ATP“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (6): 1899–1910. doi:10.1128 / MCB.20.6.1899-1910.2000. ISSN  0270-7306. PMC  110808. PMID  10688638.