PPP1CB - PPP1CB

PPP1CB
Identifikátory
Aliasy	PPP1CB, HEL-S-80p, PP-1B, PP1B, PP1beta, PPP1CD, proteinová fosfatáza 1, katalytická podjednotka beta, NSLH2, PPP1beta, PP1c, MP
Externí ID	OMIM: 600590 MGI: 104871 HomoloGene: 37659 Genové karty: PPP1CB
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	28,802,940 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	32,517,433 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita fosfoprotein fosfatázy; • aktivita myosin fosfatázy; • aktivita fosfatázy; • aktivita protein serin / threonin fosfatáza; • vazba kovových iontů; • aktivita myosin-lehký řetězec-fosfatáza; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba protein kinázy; • aktivita hydrolázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • ohnisková adheze; • nukleoplazma; • komplex protein fosfatáza typu 1; • glykogenová granule; • Komplex fosfatázy PTW / PP1; • jádro; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • jaderný chromozom, telomerická oblast; • buněčná membrána;
Biologický proces	• rytmický proces; • defosforylace bílkovin; • cirkadiánní regulace genové exprese; • buněčné dělení; • regulace buněčné adheze; • G2 / M přechod mitotického buněčného cyklu; • regulace cirkadiánního rytmu; • metabolický proces glykogenu; • regulace procesu biosyntézy glykogenu; • buněčný cyklus; • regulace glykogenového katabolického procesu; • strhávání cirkadiánních hodin fotoperiodou; • metabolický proces sacharidů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5500
	19046
	ENSG00000213639
	ENSMUSG00000014956
	P62140
	P62141
	NM_206877; NM_002709; NM_206876
	NM_172707
	NP_002700; NP_996759
	NP_766295
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Katalytická podjednotka serin / threonin-protein fosfatáza PP1-beta je enzym že u lidí je kódován PPP1CB gen.^[5]

Protein kódovaný tímto genem je jednou ze tří katalytických podjednotek proteinové fosfatázy 1 (PP1). PP1 je serin / threonin specifická proteinová fosfatáza, o které je známo, že se podílí na regulaci různých buněčných procesů, jako je buněčné dělení, metabolismus glykogenu, svalová kontraktilita, syntéza proteinů a virová transkripce HIV-1. Studie na myších naznačují, že PP1 funguje jako supresor učení a paměti. Byly pozorovány dvě alternativně sestříhané varianty transkriptu kódující odlišné izoformy.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že PPP1CB komunikovat s PPP1R15A,^[7]^[8] Nucleolin,^[9] SMARCB1^[7] a PPP1R9B.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000213639 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000014956 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Barker HM, Brewis ND, Street AJ, Spurr NK, Cohen PT (březen 1994). "Tři geny pro proteinovou fosfatázu 1 mapují různé lidské chromozomy: sekvence, exprese a genová lokalizace proteinové serin / threonin fosfatázy 1 beta (PPP1CB)". Biochim Biophys Acta. 1220 (2): 212–8. doi:10.1016/0167-4889(94)90138-4. PMID 8312365.
^ „Entrez Gene: PPP1CB protein fosfatáza 1, katalytická podjednotka, beta izoforma“.
^ ^A ^b Wu, Daniel Y; Tkachuck Douglas C; Roberson Rachel S; Schubach William H (srpen 2002). „Lidský protein SNF5 / INI1 usnadňuje funkci zastavení růstu a proteinu indukovatelného poškození DNA (GADD34) a moduluje aktivitu proteinu fosfatázy-1 vázaného na GADD34“. J. Biol. Chem. 277 (31): 27706–15. doi:10,1074 / jbc.M200955200. ISSN 0021-9258. PMID 12016208.
^ Connor, JH; Weiser D C; Li S; Hallenbeck J M; Shenolikar S (říjen 2001). „Zastavení růstu a protein indukovatelný poškození DNA GADD34 sestavuje nový signální komplex obsahující protein fosfatázu 1 a inhibitor 1“. Mol. Buňka. Biol. 21 (20): 6841–50. doi:10.1128 / MCB.21.20.6841-6850.2001. ISSN 0270-7306. PMC 99861. PMID 11564868.
^ Morimoto, Hiroyuki; Okamura Hirohiko; Haneji Tatsuji (září 2002). "Interakce delta proteinové fosfatázy 1 s nukleolinem v lidských osteoblastických buňkách". J. Histochem. Cytochem. 50 (9): 1187–93. doi:10.1177/002215540205000905. ISSN 0022-1554. PMID 12185196.
^ Hsieh-Wilson, L C; Allen P B; Watanabe T; Nairn A C; Greengard P (duben 1999). "Charakterizace neuronového cílového proteinu spinofilinu a jeho interakce s proteinovou fosfatázou-1". Biochemie. 38 (14): 4365–73. doi:10,1021 / bi982900m. ISSN 0006-2960. PMID 10194355.

Další čtení

Prochazka M, Mochizuki H, Baier LJ a kol. (1995). „Molekulární a vazebná analýza katalytického beta-podjednotkového genu pro proteinovou fosfatázu typu 1: nedostatek důkazů o jeho hlavní roli v inzulínové rezistenci u indiánů Pima“. Diabetologie. 38 (4): 461–6. doi:10.1007 / BF00410284. PMID 7796987.
Saadat M, Kakinoki Y, Mizuno Y a kol. (1995). „Chromozomální lokalizace genů pro katalytickou podjednotku beta (fosfatázy) typu 1 člověka, potkana a myšího proteinu (PPP1CB) pomocí fluorescenční hybridizace in situ“. Jpn. J. Genet. 69 (6): 697–700. doi:10,1266 / jjg.69.697. PMID 7857673.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Kawabe T, Muslin AJ, Korsmeyer SJ (1997). „HOX11 interaguje s proteinovými fosfatázami PP2A a PP1 a narušuje kontrolní bod buněčného cyklu G2 / M“. Příroda. 385 (6615): 454–8. Bibcode:1997 Natur.385..454K. doi:10.1038 / 385454a0. PMID 9009195. S2CID 608633.
Fujioka M, Takahashi N, Odai H a kol. (1998). "Nová izoforma cílení na lidskou myosin fosfatázu / regulační podjednotka (MYPT2): cDNA klonování, tkáňová exprese a chromozomální mapování". Genomika. 49 (1): 59–68. doi:10.1006 / geno.1998.5222. PMID 9570949.
Verin AD, Csortos C, Durbin SD a kol. (2000). "Charakterizace katalytické podjednotky protein fosfatázy 1 v endotelu: účast na kontraktilních reakcích". J. Cell. Biochem. 79 (1): 113–25. doi:10.1002 / 1097-4644 (2000) 79: 1 <113 :: AID-JCB110> 3.0.CO; 2-9. PMID 10906760.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Tan I, Ng CH, Lim L, Leung T (2001). „Fosforylace nové podjednotky vázající myosin proteinové fosfatázy 1 odhaluje konzervovaný mechanismus regulace cytoskeletu aktinu“. J. Biol. Chem. 276 (24): 21209–16. doi:10,1074 / jbc.M102615200. PMID 11399775.
Fresu M, Bianchi M, Parsons JT, Villa-Moruzzi E (2001). „Sdružení závislé na buněčném cyklu proteinové fosfatázy 1 a kinázy fokální adheze“. Biochem. J. 358 (Pt 2): 407–14. doi:10.1042/0264-6021:3580407. PMC 1222073. PMID 11513739.
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH a kol. (2002). "Řízená proteomická analýza lidského nukleolu". Curr. Biol. 12 (1): 1–11. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID 11790298. S2CID 14132033.
Bharucha DC, Zhou M, Nekhai S a kol. (2002). „Proteinová fosfatáza z lidských T buněk zvyšuje transaktivaci dlouhého terminálního opakování viru lidské imunodeficience typu 1“. Virologie. 296 (1): 6–16. doi:10.1006 / viro.2002.1438. PMID 12036313.
Ceulemans H, Vulsteke V, De Maeyer M a kol. (2003). „Vazba konkávního povrchu superhelixu Sds22 na trojúhelník alfa 4 / alfa 5 / alfa 6 proteinové fosfatázy-1“. J. Biol. Chem. 277 (49): 47331–7. doi:10,1074 / jbc.M206838200. PMID 12226088.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Gevaert K, Goethals M, Martens L a kol. (2004). "Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů". Nat. Biotechnol. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
Galey D, Becker K, Haughey N a kol. (2003). "Diferenciální transkripční regulace pomocí viru lidské imunodeficience typu 1 a gp120 v lidských astrocytech". J. Neurovirol. 9 (3): 358–71. doi:10.1080/13550280390201119. PMID 12775419. S2CID 22016092.
Ammosova T, Jerebtsova M, Beullens M a kol. (2003). „Nukleární protein fosfatáza-1 reguluje transkripci HIV-1“. J. Biol. Chem. 278 (34): 32189–94. doi:10,1074 / jbc.M300521200. PMID 12788939.
Llorian M, Beullens M, Andrés I a kol. (2004). „SIPP1, nový sestřihový faktor pre-mRNA a interagátor proteinové fosfatázy-1“. Biochem. J. 378 (Pt 1): 229–38. doi:10.1042 / BJ20030950. PMC 1223944. PMID 14640981.
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H a kol. (2004). "Fyzická a funkční mapa lidské signální transdukční dráhy TNF-alfa / NF-kappa B". Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. doi:10.1038 / ncb1086. PMID 14743216. S2CID 11683986.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000213639 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000014956 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8312365-5] Barker HM, Brewis ND, Street AJ, Spurr NK, Cohen PT (březen 1994). "Tři geny pro proteinovou fosfatázu 1 mapují různé lidské chromozomy: sekvence, exprese a genová lokalizace proteinové serin / threonin fosfatázy 1 beta (PPP1CB)". Biochim Biophys Acta. 1220 (2): 212–8. doi:10.1016/0167-4889(94)90138-4. PMID 8312365.

[entrez-6] „Entrez Gene: PPP1CB protein fosfatáza 1, katalytická podjednotka, beta izoforma“.

[pmid12016208-7] A ^b Wu, Daniel Y; Tkachuck Douglas C; Roberson Rachel S; Schubach William H (srpen 2002). „Lidský protein SNF5 / INI1 usnadňuje funkci zastavení růstu a proteinu indukovatelného poškození DNA (GADD34) a moduluje aktivitu proteinu fosfatázy-1 vázaného na GADD34“. J. Biol. Chem. 277 (31): 27706–15. doi:10,1074 / jbc.M200955200. ISSN 0021-9258. PMID 12016208.

[pmid11564868-8] Connor, JH; Weiser D C; Li S; Hallenbeck J M; Shenolikar S (říjen 2001). „Zastavení růstu a protein indukovatelný poškození DNA GADD34 sestavuje nový signální komplex obsahující protein fosfatázu 1 a inhibitor 1“. Mol. Buňka. Biol. 21 (20): 6841–50. doi:10.1128 / MCB.21.20.6841-6850.2001. ISSN 0270-7306. PMC 99861. PMID 11564868.

[pmid12185196-9] Morimoto, Hiroyuki; Okamura Hirohiko; Haneji Tatsuji (září 2002). "Interakce delta proteinové fosfatázy 1 s nukleolinem v lidských osteoblastických buňkách". J. Histochem. Cytochem. 50 (9): 1187–93. doi:10.1177/002215540205000905. ISSN 0022-1554. PMID 12185196.

[pmid10194355-10] Hsieh-Wilson, L C; Allen P B; Watanabe T; Nairn A C; Greengard P (duben 1999). "Charakterizace neuronového cílového proteinu spinofilinu a jeho interakce s proteinovou fosfatázou-1". Biochemie. 38 (14): 4365–73. doi:10,1021 / bi982900m. ISSN 0006-2960. PMID 10194355.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]