Nitroreduktáza - Nitroreductase

Nitroreduktáza
Identifikátory
SymbolNitroreduktáza
PfamPF00881
InterProIPR000415
CDDcd02062

Nitroreduktázy plocha rodina evolučně příbuzných proteinů podílející se na redukci sloučenin obsahujících dusík, včetně těch, které obsahují nitro funkční skupina. Členové této rodiny využívají flavin mononukleotid jako kofaktor a často se zjistí, že jsou homodimery.[1][2]

Mezi členy této rodiny patří NAD (P) H nitroreduktáza necitlivá na kyslík (nitroreduktáza závislá na flavonmononukleotidu) (6,7-dihydropteridin reduktáza ) (ES 1.5.1.34 ) a NADH dehydrogenáza (ES 1.6.99.3 ). Řada těchto proteinů je popsána jako oxidoreduktázy. Primárně se vyskytují v bakteriálních liniích, ačkoli byla identifikována řada eukaryotických homologů: C. elegans P34273, D. melanogaster Q8T3Q0, Q9VTE7, myš Q9DCX8 a lidské O75989. Tento protein se nenachází ve fotosyntetických eukaryotech. Sekvence obsahující tuto položku ve fotosyntetických organismech jsou možné falešně pozitivní výsledky.

Nitroreduktáza z Enterobacter cloacae byl identifikován Bryantem a Delucou[3] v kmenu izolovaném z muničního zařízení na základě jeho schopnosti metabolizovat TNT (trinitrotoluen). Od té doby bylo identifikováno mnoho homologů a je známo, že rodina zahrnuje členy různých organismů, které katalizují různé reakce. The jodotyrosin deiodenase savců je dehalogenáza, BluB of Sinorhizobium meliloti kanibalizuje navázaný mononukleotid flavinu, aby poskytl kritický meziprodukt v biosyntéze vitaminu B12.

Krystalové struktury z E. cloacae a E-coli enzymy byly publikovány s řadou vázaných substrátů a analogů.

Byl popsán příklad potenciálního za studena aktivního enzymu pro proléčivou terapii s použitím za studena aktivní nitroreduktázy, Ssap-NtrB[4] (Çelik a Yetis, 2012). Navzdory Ssap-NtrB odvozenému z mezofilní bakterie vykazoval při 20 ° C optimální aktivitu proti proléčivům rakoviny. Autoři poznamenávají, že chladová aktivita tohoto nového enzymu bude užitečná pro terapie v kombinaci s kryoterapií, vystavením cílové tkáně nízkým teplotám, aby se aktivovala enzymová aktivita k aktivaci léčiva pouze tam, kde je to nutné. Enzym lze navíc použít také pro bioremediace sloučenin výbušné a těkavé povahy v oblastech, kde je nutná vysoká aktivita při nízkých teplotách.

Podskupiny

Lidské proteiny obsahující tuto doménu

IYD;

Reference

  1. ^ Hecht HJ, Erdmann H, Park HJ, Sprinzl M, Schmid RD (prosinec 1995). "Krystalová struktura NADH oxidázy z Thermus thermophilus". Nat. Struct. Biol. 2 (12): 1109–14. doi:10.1038 / nsb1295-1109. PMID  8846223. S2CID  8384273.
  2. ^ de Oliveira IM, Henriques JA, Bonatto D (duben 2007). "In silico identifikace nové skupiny specifických bakteriálních a plísňových proteinů podobných nitroreduktázám". Biochem. Biophys. Res. Commun. 355 (4): 919–25. doi:10.1016 / j.bbrc.2007.02.049. PMID  17331467.
  3. ^ Bryant, C .; DeLuca, M. (05.03.1991). "Čištění a charakterizace kyslíkově necitlivé NAD (P) H nitroreduktázy z Enterobacter cloacae". Journal of Biological Chemistry. 266 (7): 4119–4125. ISSN  0021-9258. PMID  1999405.
  4. ^ Çelik, Ayhan; Yetiş, Gülden (01.06.2012). "Neobvykle studená aktivní nitroreduktáza pro aktivaci proléčiv". Bioorganická a léčivá chemie. 20 (11): 3540–3550. doi:10.1016 / j.bmc.2012.04.004. PMID  22546205.
Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR000415