NPEPPS - NPEPPS

Tento článek je o cytosolické alanin aminopeptidáze. Pro buněčnou membránu alanyl aminopeptidáza viz Alaninaminopeptidáza.
NPEPPS
Identifikátory
AliasyNPEPPS, AAP-S, MP100, PSA, citlivé na aminopeptidázu, puromycin
Externí IDOMIM: 606793 MGI: 1101358 HomoloGene: 36199 Genové karty: NPEPPS
Umístění genu (člověk)
Chromozom 17 (lidský)
Chr.Chromozom 17 (lidský)[1]
Chromozom 17 (lidský)
Genomické umístění pro NPEPPS
Genomické umístění pro NPEPPS
Kapela17q21.32Start47,522,942 bp[1]
Konec47,623,276 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

9520

19155

Ensembl

ENSG00000141279

ENSMUSG00000001441

UniProt

P55786

Q11011

RefSeq (mRNA)

NM_006310
NM_001330257

NM_008942

RefSeq (protein)

NP_001317186
NP_006301

NP_032968

Místo (UCSC)Chr 17: 47,52 - 47,62 MbChr 11: 97,21 - 97,28 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Na puromycin citlivou aminopeptidázu také známý jako cytosol alanyl aminopeptidáza nebo alaninaminopeptidáza (AAP) (ES 3.4.11.14 ) je enzym že u lidí je kódován NPEPPS gen.[5][6][7] Používá se jako biomarker detekovat poškození ledviny, a které mohou být použity k diagnostice určitých poruchy ledvin. Vyskytuje se na vysokých úrovních v moč když máte problémy s ledvinami.[8]

Funkce

Tento gen kóduje puromycin-senzitivní aminopeptidázu, metalopeptidázu zinku, která hydrolyzuje aminokyseliny z N-konce jejího substrátu. Protein byl lokalizován jak do cytoplazmy, tak do buněčných membrán. Tento enzym se degraduje enkefaliny v mozku a studie na myších naznačují, že se účastní proteolytických dějů regulujících buněčný cyklus.[7] Byl identifikován jako nový modifikátor TAU -indukovaná neurodegenerace s neuroprotektivními účinky přímým proteolýza proteinu TAU.[9][10] Ztráta funkce NPEPPS se zhoršuje neurodegenerace.[11]

Struktura

Gen

The NPEPPS gen se nachází na chromozom 17q 21, skládající se z 25 exony a přes 40 kb.

Protein

NPEPPS je všudypřítomný, 100 kDa, Zn2+ metalopeptidáza vysoce exprimován v mozku.[12] Dva isozymy byly nalezeny a v nervovém systému jsou vyjádřeny odlišně.[13] Glu 309 je jedním z aktivních webů glutamáty, a jeho mutace mohl přeměnit enzym na neaktivní vazebný protein.[14]

Funkce

Bylo navrženo, že NPEPPS funguje v různých procesech, včetně metabolismu neuropeptidáza, regulace buněčný cyklus, a hydrolýza proteazomálních produktů do aminokyseliny.[15][16][17] NPEPPS je hlavní proteáza k trávení SOD1, podobně jako jeho role v neurodegeneraci vyvolané TAU.[10][18] Uvádí se také, že NPEPPS hraje roli při vytváření a ničení MHC třídy Ⅰ prezentované peptidy a v omezení MHC třídy Ⅰ prezentace Ag v dendritických buňkách.[19]

Klinický význam

NPEPPS je indukován v neuronech exprimujících mutanty huntingtin a je zásadní při prevenci akumulace polyglutamin v normálních buňkách. Bylo popsáno jako hlavní peptidázou štěpící polyglutaminové sekvence u neurodegenerativních onemocnění, jako je např Huntingtonova choroba.[20] Ukázalo se, že zvýšení aktivity NPEPPS in vivo by mohlo účinně blokovat akumulaci hyperfosforylovaného proteinu TAU a tak zpomalit progresi onemocnění, což naznačuje, že zvýšení aktivity NPEPPS může být proveditelným terapeutickým přístupem k eliminaci akumulace toxických substrátů, které se podílejí na neurodegenerativních onemocněních .[21]

Interakce

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000141279 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001441 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Tobler AR, Constam DB, Schmitt-Gräff A, Malipiero U, Schlapbach R, Fontana A (březen 1997). „Klonování lidské puromycin-senzitivní aminopeptidázy a důkaz exprese v neuronech“. Journal of Neurochemistry. 68 (3): 889–97. doi:10.1046 / j.1471-4159.1997.68030889.x. PMID  9048733. S2CID  30408265.
  6. ^ Thompson MW, Tobler A, Fontana A, Hersh LB (květen 1999). "Klonování a analýza genu pro lidskou puromycin citlivou aminopeptidázu". Komunikace pro biochemický a biofyzikální výzkum. 258 (2): 234–40. doi:10.1006 / bbrc.1999.0604. PMID  10329370.
  7. ^ A b "Entrez Gene: NPEPPS citlivý na aminopeptidázu, puromycin".
  8. ^ Holdt B, Peters E, Nagel HR, Steiner M (2008). "Automatizovaný test aktivity alaninaminopeptidázy v moči". Klinická chemie a laboratorní medicína. 46 (4): 537–40. doi:10.1515 / CCLM.2008.103. PMID  18302530. S2CID  45057277.
  9. ^ Sengupta S, Horowitz PM, Karsten SL, Jackson GR, Geschwind DH, Fu Y, Berry RW, Binder LI (prosinec 2006). „Degradace tau proteinu aminopeptidázou citlivou na puromycin in vitro“. Biochemie. 45 (50): 15111–9. doi:10.1021 / bi061830d. PMID  17154549.
  10. ^ A b C Yanagi K, Tanaka T, Kato K, Sadik G, Morihara T, Kudo T, Takeda M (prosinec 2009). „Podíl aminopeptidázy citlivé na puromycin v proteolýze tau proteinu v kultivovaných buňkách a oslabená proteolýza frontotemporální demence a parkinsonismu spojená s mutantní tau chromozomu 17 (FTDP-17)“. Psychogeriatrie. 9 (4): 157–66. doi:10.1111 / j.1479-8301.2010.00307.x. PMID  20377816.
  11. ^ Karsten SL, Sang TK, Gehman LT, Chatterjee S, Liu J, Lawless GM, Sengupta S, Berry RW, Pomakian J, Oh HS, Schulz C, Hui KS, Wiedau-Pazos M, Vinters HV, Binder LI, Geschwind DH, Jackson GR (září 2006). „Genomický screening modifikátorů tauopatie identifikuje aminopeptidázu citlivou na puromycin jako inhibitor neurodegenerace vyvolané tau.“ Neuron. 51 (5): 549–60. doi:10.1016 / j.neuron.2006.07.019. PMID  16950154. S2CID  8389733.
  12. ^ Rawson NS (listopad 2009). „Přístup k propojeným administrativním údajům o využití zdravotní péče pro farmakepidemiologický a farmakoekonomický výzkum v Kanadě: antivirové léky jako příklad“. Farmakoepidemiologie a bezpečnost léčiv. 18 (11): 1072–9. doi:10,1002 / pds.1822. PMID  19650154. S2CID  22999576.
  13. ^ Barton S (1816-01-01). „Některá pozorování týkající se lékařských vlastností Pyrola Umbellata a Arbutus Uva Ursi z Linnae“. Lékařsko-chirurgické transakce. 7: 143–9. doi:10.1177/095952871600700108. PMC  2129051. PMID  20895273.
  14. ^ Thompson MW, Govindaswami M, Hersh LB (květen 2003). „Mutace zbytků aktivního místa puromycin-senzitivní aminopeptidázy: přeměna enzymu na katalyticky neaktivní vazebný protein“. Archivy biochemie a biofyziky. 413 (2): 236–42. doi:10.1016 / s0003-9861 (03) 00123-1. PMID  12729622.
  15. ^ Hersh LB, Smith TE, McKelvy JF (červenec 1980). „Štěpení endorfinů na des-Tyrské endorfiny homogenní aminopeptidázou z hovězího mozku“. Příroda. 286 (5769): 160–2. doi:10.1038 / 286160a0. PMID  7402309. S2CID  4257825.
  16. ^ Constam DB, Tobler AR, Rensing-Ehl A, Kemler I, Hersh LB, Fontana A (listopad 1995). „Aminopeptidáza citlivá na puromycin. Sekvenční analýza, exprese a funkční charakterizace“. The Journal of Biological Chemistry. 270 (45): 26931–9. doi:10.1074 / jbc.270.45.26931. PMID  7592939.
  17. ^ Saric T, Graef CI, Goldberg AL (listopad 2004). „Cesta k degradaci peptidů generovaných proteazomy: klíčová role pro thimet oligopeptidázu a další metalopeptidázy“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (45): 46723–32. doi:10,1074 / jbc.M406537200. PMID  15328361.
  18. ^ A b Ren G, Ma Z, Hui M, Kudo LC, Hui KS, Karsten SL (7. května 2011). „Cu, Zn-superoxiddismutáza 1 (SOD1) je novým cílem puromycin-senzitivní aminopeptidázy (PSA / NPEPPS): PSA / NPEPPS je možným modifikátorem amyotrofické laterální sklerózy“. Molekulární neurodegenerace. 6: 29. doi:10.1186/1750-1326-6-29. PMC  3113298. PMID  21548977.
  19. ^ Towne CF, York IA, Neijssen J, Karow ML, Murphy AJ, Valenzuela DM, Yancopoulos GD, Neefjes JJ, Rock KL (únor 2008). „Aminopeptidáza citlivá na puromycin omezuje prezentaci MHC třídy I v dendritických buňkách, ale neovlivňuje reakce CD8 T buněk během virových infekcí“. Journal of Immunology. 180 (3): 1704–12. doi:10,4049 / jimmunol.180.3.1704. PMID  18209067.
  20. ^ Bhutani N, Venkatraman P, Goldberg AL (březen 2007). „Aminopeptidáza citlivá na puromycin je hlavní peptidáza odpovědná za trávení polyglutaminových sekvencí uvolňovaných proteazomy během degradace proteinu“. Časopis EMBO. 26 (5): 1385–96. doi:10.1038 / sj.emboj.7601592. PMC  1817637. PMID  17318184.
  21. ^ Kudo LC, Parfenova L, Ren G, Vi N, Hui M, Ma Z, Lau K, Gray M, Bardag-Gorce F, Wiedau-Pazos M, Hui KS, Karsten SL (květen 2011). „Aminopeptidáza citlivá na puromycin (PSA / NPEPPS) brání rozvoji neuropatologie u hPSA / TAU (P301L) dvojitě transgenních myší“. Lidská molekulární genetika. 20 (9): 1820–33. doi:10,1093 / hmg / ddr065. PMID  21320871.
  22. ^ Huber RJ, Catalano A, O'Day DH (leden 2013). „Cyklin-dependentní kináza 5 je protein vázající kalmodulin, který se v jádru Dictyostelium asociuje s aminopeptidázou citlivou na puromycin.“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - výzkum molekulárních buněk. 1833 (1): 11–20. doi:10.1016 / j.bbamcr.2012.10.005. PMID  23063531.
  23. ^ Aeluri R, Ganji RJ, Marapaka AK, Pillalamarri V, Alla M, Addlagatta A (prosinec 2015). „Vysoce funkcionalizované tetrahydropyridiny jsou cytotoxické a selektivní inhibitory aminopeptidázy citlivé na lidský puromycin.“ European Journal of Medicinal Chemistry. 106: 26–33. doi:10.1016 / j.ejmech.2015.10.026. PMID  26513642.
  24. ^ Kruppa AJ, Ott S, Chandraratna DS, Irving JA, Page RM, Speretta E, Seto T, Camargo LM, Marciniak SJ, Lomas DA, Crowther DC (prosinec 2013). „Potlačení toxicity Ap pomocí puromycin-senzitivní aminopeptidázy je nezávislé na její proteolytické aktivitě“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molekulární základ choroby. 1832 (12): 2115–26. doi:10.1016 / j.badis.2013.07.019. PMC  3898073. PMID  23911349.

Další čtení